logo

Genes within 1Mb (chr12:93428120:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0413 0.0656 0.175 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 1.36e-01 0.0969 0.0648 0.175 B L1
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 4.91e-01 0.0679 0.0985 0.175 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0887 0.073 0.175 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 7.49e-02 0.115 0.0642 0.175 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 725277 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0404 0.0729 0.175 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 1.04e-01 0.164 0.1 0.175 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 961669 sc-eQTL 1.67e-01 -0.0687 0.0496 0.175 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 428902 sc-eQTL 4.30e-01 0.0793 0.1 0.175 B L1
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 6.59e-01 0.0302 0.0681 0.175 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -141694 sc-eQTL 9.50e-01 0.00411 0.0659 0.175 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 5.37e-01 0.0427 0.0691 0.175 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 8.33e-01 0.0239 0.113 0.175 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0579 0.0653 0.175 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 5.87e-01 0.033 0.0607 0.175 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 2.17e-01 0.13 0.105 0.175 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0155 0.0762 0.175 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -141694 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0106 0.0875 0.175 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0733 0.09 0.175 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 6.26e-01 0.0517 0.106 0.175 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 4.76e-02 -0.124 0.0623 0.175 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 4.32e-01 0.0616 0.0782 0.175 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 1.61e-02 0.267 0.11 0.175 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00993 0.0989 0.178 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 8.14e-01 0.0251 0.107 0.178 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 9.64e-01 0.00542 0.121 0.178 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 9.81e-01 0.00239 0.0991 0.178 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0903 0.0999 0.178 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0674 0.115 0.178 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 961669 sc-eQTL 4.38e-02 -0.204 0.101 0.178 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 3.73e-03 0.173 0.0589 0.175 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 1.96e-01 0.0888 0.0684 0.175 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 2.94e-01 -0.132 0.126 0.175 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 5.57e-01 0.0511 0.087 0.175 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 8.42e-01 0.013 0.0653 0.175 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 8.21e-01 0.0199 0.088 0.175 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0387 0.0851 0.176 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -141694 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0245 0.0796 0.176 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 9.29e-01 0.00742 0.0831 0.176 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 1.58e-01 0.168 0.119 0.176 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 6.68e-02 -0.141 0.0766 0.176 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 2.44e-01 0.089 0.0762 0.176 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 9.44e-03 0.281 0.107 0.176 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -143648 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0741 0.124 0.176 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 6.02e-01 0.0562 0.108 0.175 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -141694 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0526 0.0999 0.175 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 7.04e-01 0.0357 0.0937 0.175 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 1.60e-01 0.159 0.113 0.175 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0569 0.0809 0.175 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0416 0.075 0.175 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 7.16e-01 0.0324 0.0888 0.175 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 6.55e-01 0.0587 0.131 0.166 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0546 0.111 0.166 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0793 0.13 0.166 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 4.23e-02 -0.234 0.114 0.166 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 8.07e-01 0.0352 0.143 0.166 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 725277 sc-eQTL 5.02e-01 0.0815 0.121 0.166 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 2.91e-01 0.147 0.139 0.166 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 961669 sc-eQTL 8.49e-01 -0.024 0.126 0.166 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 428902 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0456 0.135 0.166 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0618 0.101 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 6.14e-01 0.0503 0.0997 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0427 0.118 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 5.25e-01 0.0629 0.0987 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 9.22e-01 0.0098 0.101 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 725277 sc-eQTL 8.09e-01 0.027 0.111 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 3.89e-01 0.106 0.122 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 961669 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0563 0.0823 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 428902 sc-eQTL 2.48e-01 0.14 0.121 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 8.38e-01 -0.021 0.103 0.177 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 4.61e-01 0.0714 0.0966 0.177 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 8.00e-01 -0.032 0.127 0.177 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 5.49e-01 0.0544 0.0906 0.177 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 4.91e-02 0.159 0.0804 0.177 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 725277 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0876 0.103 0.177 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 1.91e-01 0.157 0.12 0.177 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 961669 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0307 0.1 0.177 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 428902 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00412 0.12 0.177 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 9.77e-02 -0.164 0.0988 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 1.53e-01 0.147 0.103 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 4.86e-01 0.0903 0.129 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 1.39e-01 -0.137 0.0923 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 1.91e-01 0.13 0.0994 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 725277 sc-eQTL 2.21e-01 -0.135 0.11 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 6.50e-02 0.212 0.114 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 961669 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0155 0.0671 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 428902 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0594 0.122 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 3.01e-01 0.12 0.116 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0643 0.107 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 2.27e-01 0.146 0.121 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 4.74e-01 0.0716 0.1 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 2.00e-01 0.125 0.0976 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 725277 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0681 0.0849 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 6.81e-01 0.0523 0.127 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 961669 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0226 0.061 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 428902 sc-eQTL 9.44e-01 0.00861 0.122 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 6.43e-01 0.0538 0.116 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -141694 sc-eQTL 7.12e-01 0.0431 0.117 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 1.18e-01 0.174 0.11 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 1.63e-01 0.157 0.112 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 2.11e-01 -0.138 0.11 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0228 0.113 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 2.95e-01 0.132 0.126 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 8.57e-01 0.0128 0.0714 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -141694 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0373 0.0674 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0177 0.0762 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 8.80e-01 0.0176 0.116 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 5.48e-01 0.0411 0.0683 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 3.84e-01 0.0571 0.0655 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 2.53e-01 0.126 0.11 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0359 0.0989 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -141694 sc-eQTL 6.84e-01 0.0314 0.077 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 9.92e-01 0.000943 0.0915 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 8.74e-01 0.0196 0.123 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 6.85e-02 -0.141 0.0768 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 5.96e-01 0.0395 0.0744 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 7.28e-01 0.0396 0.114 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 3.53e-01 -0.106 0.114 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -141694 sc-eQTL 8.47e-01 0.0163 0.0843 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 1.22e-01 0.156 0.1 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 8.04e-01 0.0308 0.124 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 4.00e-02 -0.201 0.0971 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 3.58e-01 0.0927 0.101 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 4.00e-01 0.0932 0.111 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0271 0.103 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -141694 sc-eQTL 7.13e-01 0.0366 0.0996 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 3.80e-01 0.0887 0.101 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 6.23e-01 0.0604 0.123 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 2.04e-01 -0.116 0.0907 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 8.96e-01 0.0138 0.106 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 9.33e-02 0.203 0.12 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0824 0.0929 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -141694 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0863 0.0915 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 6.68e-01 -0.044 0.103 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00914 0.119 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 4.29e-01 -0.065 0.082 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 2.22e-01 0.109 0.0893 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 3.76e-02 0.237 0.113 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 9.26e-01 0.0114 0.123 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -141694 sc-eQTL 1.73e-01 -0.143 0.105 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0738 0.118 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 5.65e-01 0.0721 0.125 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0765 0.0993 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 7.88e-01 0.0318 0.118 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0502 0.121 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 7.32e-01 0.0438 0.128 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -141694 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0771 0.118 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 9.66e-02 -0.207 0.124 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 5.46e-01 0.0799 0.132 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 1.88e-02 -0.285 0.12 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 7.85e-01 0.0317 0.116 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 3.71e-01 0.108 0.12 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 7.91e-01 0.0317 0.119 0.175 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -141694 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00959 0.109 0.175 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 5.35e-01 0.062 0.0998 0.175 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 9.50e-02 0.212 0.126 0.175 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 6.41e-01 -0.043 0.0922 0.175 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 3.97e-01 0.0958 0.113 0.175 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 2.83e-01 0.124 0.115 0.175 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 9.63e-01 0.00531 0.115 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -141694 sc-eQTL 1.46e-01 0.155 0.107 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0287 0.104 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 7.65e-01 0.0379 0.127 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 3.11e-01 -0.115 0.113 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 2.23e-01 0.146 0.119 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0493 0.119 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -143648 sc-eQTL 4.33e-01 0.0874 0.111 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 6.53e-01 -0.046 0.102 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -141694 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0519 0.0903 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 9.68e-01 0.00399 0.0983 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 3.63e-01 0.117 0.128 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 2.40e-01 -0.107 0.0905 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 6.94e-01 0.0343 0.0872 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 1.65e-02 0.288 0.119 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -143648 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0136 0.124 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0202 0.116 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -141694 sc-eQTL 9.33e-01 0.00969 0.114 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 7.30e-01 0.0361 0.104 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 3.67e-01 0.115 0.128 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0722 0.107 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 7.23e-01 0.0425 0.12 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 6.56e-03 0.36 0.131 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -143648 sc-eQTL 7.76e-01 0.0307 0.108 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 6.57e-01 0.0462 0.104 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -141694 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0177 0.0992 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 7.09e-01 0.0375 0.101 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 9.01e-01 -0.014 0.112 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 7.66e-02 -0.156 0.0876 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 9.30e-01 0.00899 0.102 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 1.43e-01 0.172 0.117 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -143648 sc-eQTL 2.89e-01 -0.125 0.117 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 2.00e-01 -0.211 0.164 0.156 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000317 0.154 0.156 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00166 0.142 0.156 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 7.18e-02 -0.238 0.131 0.156 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 4.18e-01 0.0946 0.117 0.156 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 725277 sc-eQTL 7.41e-01 0.0546 0.165 0.156 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 6.79e-01 0.0666 0.16 0.156 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 961669 sc-eQTL 6.02e-01 0.0665 0.127 0.156 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 428902 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00966 0.156 0.156 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 9.73e-02 0.203 0.122 0.174 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -141694 sc-eQTL 6.21e-02 -0.209 0.111 0.174 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0541 0.119 0.174 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 2.10e-01 -0.146 0.116 0.174 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0107 0.0947 0.174 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0845 0.0871 0.174 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 5.31e-01 0.0657 0.105 0.174 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 6.47e-01 0.0481 0.105 0.175 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -141694 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0375 0.103 0.175 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 3.36e-01 0.105 0.109 0.175 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 2.36e-01 -0.149 0.126 0.175 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 6.87e-02 -0.162 0.0886 0.175 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 8.21e-01 0.0218 0.0963 0.175 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 6.41e-01 0.0566 0.121 0.175 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0402 0.104 0.188 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0232 0.107 0.188 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 5.25e-01 0.0755 0.119 0.188 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 6.34e-01 0.0575 0.121 0.188 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 2.45e-01 -0.122 0.104 0.188 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 3.87e-01 -0.104 0.12 0.188 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 961669 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0666 0.0731 0.188 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 7.51e-03 0.184 0.0682 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 1.26e-01 0.125 0.0812 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 1.34e-01 -0.182 0.121 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0126 0.0889 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 5.51e-01 0.0416 0.0696 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 1.85e-01 0.128 0.0962 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0147 0.0899 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00348 0.0859 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0663 0.131 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 9.07e-01 0.0121 0.103 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 9.75e-01 0.0028 0.0899 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0531 0.103 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 5.17e-01 0.0908 0.14 0.185 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -141694 sc-eQTL 5.94e-01 0.0692 0.13 0.185 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 6.25e-02 -0.252 0.134 0.185 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 1.92e-01 -0.174 0.132 0.185 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0831 0.126 0.185 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 3.75e-01 -0.123 0.138 0.185 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 2.99e-02 0.291 0.133 0.185 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 8.38e-03 0.283 0.106 0.176 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 8.75e-01 0.0166 0.105 0.176 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 2.81e-01 -0.131 0.121 0.176 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0972 0.11 0.176 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0683 0.105 0.176 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 3.60e-01 -0.104 0.113 0.176 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 2.25e-01 0.11 0.0905 0.181 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 1.65e-01 0.105 0.0754 0.181 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 7.76e-01 0.0336 0.118 0.181 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 3.95e-01 0.0883 0.103 0.181 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 3.07e-01 0.103 0.101 0.181 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 5.93e-01 0.0561 0.105 0.181 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00439 0.131 0.184 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 2.76e-01 0.138 0.126 0.184 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 3.43e-01 0.122 0.128 0.184 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0751 0.11 0.184 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 6.13e-01 0.0663 0.131 0.184 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 7.57e-01 0.042 0.135 0.184 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 961669 sc-eQTL 2.49e-02 -0.265 0.117 0.184 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0503 0.0847 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 7.74e-01 0.0218 0.0758 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 3.69e-01 -0.116 0.129 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 9.44e-01 0.00533 0.0762 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 6.64e-02 0.127 0.0689 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 725277 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0319 0.0895 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 7.32e-02 0.202 0.112 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 961669 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0512 0.0787 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 428902 sc-eQTL 4.93e-01 0.0808 0.118 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0847 0.0937 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 1.85e-01 0.121 0.0913 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 3.23e-01 0.12 0.121 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0605 0.0886 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 8.57e-02 0.156 0.0904 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 725277 sc-eQTL 1.26e-01 -0.17 0.111 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 1.51e-01 0.161 0.111 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 961669 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0293 0.0529 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 428902 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0215 0.115 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 3.17e-02 0.137 0.0636 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 3.61e-01 0.0696 0.076 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 1.27e-01 -0.187 0.122 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 9.48e-01 0.00576 0.0879 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 8.87e-01 0.00946 0.0662 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 6.47e-01 0.042 0.0917 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 8.82e-03 0.22 0.0832 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 4.39e-01 0.0548 0.0707 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0313 0.128 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 6.50e-01 0.0435 0.0956 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00895 0.0958 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 9.18e-01 0.0104 0.101 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 498789 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0181 0.0877 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -141694 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0713 0.0808 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -720457 sc-eQTL 8.62e-01 0.0154 0.0885 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -249255 sc-eQTL 2.91e-01 0.132 0.125 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 50237 sc-eQTL 3.48e-02 -0.167 0.0785 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -13827 sc-eQTL 6.41e-01 0.0359 0.0767 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 sc-eQTL 4.54e-03 0.323 0.112 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -143648 sc-eQTL 3.24e-01 -0.124 0.126 0.177 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000173598 NUDT4 50237 eQTL 0.000441 -0.0809 0.0229 0.0 0.0 0.2
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 eQTL 1.18e-25 0.248 0.023 0.0118 0.0 0.2

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000173598 NUDT4 50237 1.09e-05 1.24e-05 1.98e-06 6.69e-06 2.41e-06 5.16e-06 1.28e-05 2.2e-06 1.06e-05 5.92e-06 1.5e-05 6.06e-06 1.86e-05 3.99e-06 3.67e-06 6.93e-06 5.99e-06 9.73e-06 3.17e-06 3.14e-06 6.81e-06 1.12e-05 1.07e-05 3.73e-06 1.85e-05 4.6e-06 6.5e-06 5.13e-06 1.29e-05 1.08e-05 7.35e-06 9.89e-07 1.3e-06 3.69e-06 5.12e-06 2.84e-06 1.77e-06 2e-06 2.01e-06 1.21e-06 1.1e-06 1.51e-05 1.63e-06 1.96e-07 1.02e-06 1.96e-06 1.82e-06 6.59e-07 4.59e-07
ENSG00000198015 MRPL42 -39368 1.33e-05 1.43e-05 2.5e-06 8.31e-06 2.45e-06 6.19e-06 1.85e-05 2.45e-06 1.4e-05 6.93e-06 1.82e-05 6.86e-06 2.44e-05 5.19e-06 4.38e-06 9.08e-06 7.74e-06 1.19e-05 3.74e-06 3.86e-06 7.18e-06 1.35e-05 1.37e-05 4.81e-06 2.35e-05 5.12e-06 7.6e-06 6.24e-06 1.51e-05 1.38e-05 9.27e-06 1.03e-06 1.4e-06 3.99e-06 6.02e-06 3.58e-06 1.79e-06 2.4e-06 2.7e-06 1.88e-06 1.34e-06 1.82e-05 2.24e-06 2.64e-07 1.59e-06 2.36e-06 2.21e-06 1.02e-06 6.76e-07