Genes within 1Mb (chr12:93420867:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 1.54e-01 0.0831 0.0581 0.229 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0314 0.0578 0.229 B L1
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 6.27e-01 0.0426 0.0875 0.229 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00701 0.0651 0.229 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 2.58e-01 -0.065 0.0573 0.229 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 718024 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0452 0.0648 0.229 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 5.17e-06 -0.399 0.0853 0.229 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 954416 sc-eQTL 1.73e-01 0.0602 0.044 0.229 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 421649 sc-eQTL 7.37e-01 -0.03 0.0892 0.229 B L1
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 9.05e-01 0.00721 0.0604 0.229 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -148947 sc-eQTL 1.60e-01 0.0818 0.0581 0.229 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0202 0.0613 0.229 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 7.65e-01 -0.03 0.1 0.229 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 9.17e-04 -0.19 0.0565 0.229 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0364 0.0537 0.229 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 5.46e-07 -0.456 0.0881 0.229 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00685 0.067 0.229 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -148947 sc-eQTL 2.03e-01 0.098 0.0767 0.229 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 2.38e-01 0.0934 0.079 0.229 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0199 0.0932 0.229 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 1.45e-03 -0.174 0.054 0.229 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 5.48e-02 -0.132 0.0683 0.229 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 8.60e-04 -0.323 0.0956 0.229 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00773 0.0897 0.23 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 2.24e-01 -0.118 0.0965 0.23 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0744 0.109 0.23 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 7.03e-02 -0.162 0.0892 0.23 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 1.85e-01 0.12 0.0904 0.23 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 2.21e-02 -0.238 0.103 0.23 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 954416 sc-eQTL 4.78e-01 0.0654 0.0921 0.23 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0509 0.0523 0.229 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 4.39e-03 -0.169 0.0587 0.229 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0815 0.11 0.229 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 2.74e-04 -0.272 0.0736 0.229 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0134 0.057 0.229 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 3.33e-04 -0.271 0.0744 0.229 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0978 0.0743 0.227 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -148947 sc-eQTL 2.53e-01 0.0796 0.0695 0.227 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0216 0.0728 0.227 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 4.20e-01 0.0843 0.104 0.227 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 5.87e-02 -0.127 0.067 0.227 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 5.17e-01 0.0433 0.0668 0.227 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 2.44e-04 -0.345 0.0926 0.227 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -150901 sc-eQTL 7.39e-01 0.0363 0.109 0.227 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 5.67e-01 0.0541 0.0942 0.229 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -148947 sc-eQTL 6.03e-02 0.164 0.0867 0.229 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 4.14e-01 -0.067 0.0819 0.229 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 1.19e-01 -0.154 0.0986 0.229 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 2.96e-02 -0.153 0.07 0.229 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 4.01e-02 0.134 0.065 0.229 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 9.84e-02 -0.128 0.0772 0.229 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0268 0.114 0.237 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 5.87e-02 -0.181 0.0953 0.237 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 8.57e-01 0.0203 0.113 0.237 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 7.13e-03 0.268 0.0984 0.237 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 6.41e-01 0.0582 0.125 0.237 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 718024 sc-eQTL 2.10e-01 -0.132 0.105 0.237 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 5.55e-02 -0.231 0.12 0.237 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 954416 sc-eQTL 9.36e-01 0.00881 0.11 0.237 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 421649 sc-eQTL 1.94e-01 0.152 0.117 0.237 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 5.18e-01 0.0582 0.0898 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 6.39e-01 0.0418 0.089 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 9.10e-02 0.179 0.105 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0388 0.0882 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0541 0.0898 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 718024 sc-eQTL 6.37e-01 -0.047 0.0995 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 2.91e-03 -0.323 0.107 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 954416 sc-eQTL 8.96e-01 0.00962 0.0736 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 421649 sc-eQTL 8.48e-02 -0.186 0.107 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 9.91e-01 0.000983 0.0915 0.224 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 1.43e-01 -0.126 0.0857 0.224 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 2.24e-01 0.137 0.112 0.224 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0743 0.0805 0.224 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0519 0.0721 0.224 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 718024 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0472 0.0919 0.224 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 4.23e-01 -0.086 0.107 0.224 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 954416 sc-eQTL 6.96e-01 0.0349 0.0892 0.224 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 421649 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0553 0.107 0.224 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 2.48e-01 0.0986 0.085 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0821 0.0884 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 7.21e-01 0.0398 0.111 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0684 0.0794 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 2.24e-01 -0.104 0.0853 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 718024 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0711 0.0944 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 9.28e-06 -0.429 0.0943 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 954416 sc-eQTL 1.71e-01 0.0788 0.0573 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 421649 sc-eQTL 4.92e-01 0.072 0.105 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 8.29e-01 0.0222 0.103 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 3.65e-01 0.0863 0.095 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0621 0.107 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 4.98e-01 0.0602 0.0886 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 6.23e-01 0.0427 0.0867 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 718024 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0463 0.0752 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 5.27e-02 -0.217 0.111 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 954416 sc-eQTL 4.88e-01 0.0375 0.054 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 421649 sc-eQTL 4.16e-01 0.0879 0.108 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 3.51e-02 -0.225 0.106 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -148947 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00753 0.108 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0749 0.103 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 2.72e-01 -0.115 0.104 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 2.94e-01 -0.107 0.102 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 7.84e-02 -0.183 0.104 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 1.28e-01 -0.177 0.116 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 3.68e-01 0.0573 0.0634 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -148947 sc-eQTL 1.37e-01 0.0892 0.0597 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 7.44e-01 0.0222 0.0679 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 6.64e-01 0.0451 0.104 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 8.29e-04 -0.201 0.0593 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0385 0.0584 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 5.78e-07 -0.477 0.0925 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0631 0.088 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -148947 sc-eQTL 1.59e-01 0.0965 0.0683 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0528 0.0814 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 8.55e-02 -0.189 0.109 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 6.35e-02 -0.128 0.0684 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0429 0.0662 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 1.48e-02 -0.245 0.0997 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 1.70e-01 -0.139 0.101 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -148947 sc-eQTL 1.58e-01 0.106 0.0746 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 2.13e-01 -0.112 0.0894 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0391 0.11 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 7.75e-02 -0.153 0.0865 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 7.80e-01 0.025 0.0895 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 8.18e-04 -0.325 0.0958 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0066 0.0903 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -148947 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0206 0.0877 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 2.33e-01 -0.106 0.0886 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 7.75e-01 -0.031 0.108 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0478 0.08 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 9.59e-02 -0.154 0.0923 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 9.34e-04 -0.349 0.104 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 2.96e-01 -0.088 0.084 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -148947 sc-eQTL 3.17e-01 0.0829 0.0828 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 4.82e-01 0.0653 0.0927 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0279 0.107 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 1.75e-04 -0.275 0.0719 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0782 0.0809 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 2.02e-02 -0.239 0.102 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 7.11e-01 0.0419 0.113 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -148947 sc-eQTL 5.55e-01 0.0574 0.097 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 3.02e-01 0.113 0.109 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 8.62e-01 0.0201 0.115 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0231 0.0917 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0967 0.109 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 3.68e-01 -0.101 0.112 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 6.68e-01 0.047 0.109 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -148947 sc-eQTL 4.36e-01 0.0792 0.101 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 1.62e-02 0.256 0.105 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 1.75e-01 -0.153 0.113 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 8.55e-01 0.0191 0.104 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0386 0.0997 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 2.53e-02 -0.23 0.102 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00958 0.109 0.225 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -148947 sc-eQTL 7.22e-01 0.0354 0.0992 0.225 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 9.20e-01 0.00916 0.0914 0.225 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 2.62e-01 -0.13 0.116 0.225 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0787 0.0841 0.225 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 1.55e-01 0.147 0.103 0.225 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 2.67e-01 -0.117 0.105 0.225 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0783 0.102 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -148947 sc-eQTL 1.49e-01 -0.137 0.0948 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 2.12e-01 -0.116 0.0925 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 3.56e-01 -0.104 0.113 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 2.27e-02 -0.228 0.0993 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 2.32e-01 -0.127 0.106 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 2.95e-01 -0.111 0.106 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -150901 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0159 0.0991 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 1.77e-01 -0.12 0.0885 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -148947 sc-eQTL 2.21e-01 0.0963 0.0784 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 9.48e-01 0.00563 0.0855 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 2.81e-01 0.12 0.111 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0391 0.0789 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 3.48e-01 0.0712 0.0757 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 1.39e-01 -0.155 0.105 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -150901 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0456 0.108 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 7.13e-01 0.0385 0.104 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -148947 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0358 0.103 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 2.21e-01 -0.115 0.0938 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 9.74e-02 -0.191 0.115 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 2.42e-02 -0.216 0.0952 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 5.44e-01 0.0657 0.108 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 1.97e-02 -0.28 0.119 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -150901 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0205 0.0975 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 6.39e-01 -0.043 0.0915 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -148947 sc-eQTL 7.61e-01 0.0266 0.0874 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 2.35e-01 0.105 0.0883 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 6.32e-01 0.0475 0.0989 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0585 0.0777 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 1.60e-01 0.126 0.0891 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 3.10e-03 -0.304 0.102 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -150901 sc-eQTL 2.05e-01 0.131 0.103 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 7.08e-01 0.048 0.128 0.211 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0637 0.119 0.211 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 7.68e-01 0.0327 0.11 0.211 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 3.80e-01 0.0906 0.103 0.211 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 2.18e-01 -0.112 0.0902 0.211 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 718024 sc-eQTL 1.65e-01 -0.177 0.127 0.211 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 1.88e-02 -0.29 0.122 0.211 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 954416 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0773 0.0985 0.211 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 421649 sc-eQTL 2.55e-01 0.138 0.12 0.211 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 1.56e-01 0.149 0.104 0.23 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -148947 sc-eQTL 4.72e-02 0.19 0.0954 0.23 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 1.56e-01 0.145 0.102 0.23 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 1.88e-01 0.132 0.0997 0.23 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 7.83e-03 -0.214 0.0797 0.23 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 4.00e-01 0.0629 0.0746 0.23 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0296 0.0898 0.23 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0918 0.0989 0.229 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -148947 sc-eQTL 9.58e-01 0.00518 0.0977 0.229 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 6.98e-01 -0.04 0.103 0.229 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 4.98e-01 0.0807 0.119 0.229 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 5.33e-02 -0.162 0.0835 0.229 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0769 0.0908 0.229 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 1.66e-02 -0.272 0.113 0.229 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 2.67e-01 0.106 0.0948 0.224 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 3.68e-01 -0.088 0.0976 0.224 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 1.60e-01 -0.152 0.108 0.224 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 1.30e-01 -0.166 0.109 0.224 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 2.45e-01 0.111 0.0952 0.224 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 2.80e-01 -0.118 0.109 0.224 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 954416 sc-eQTL 9.82e-01 0.00147 0.0667 0.224 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0533 0.0609 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 1.61e-02 -0.172 0.0709 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0392 0.107 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 5.35e-03 -0.216 0.0768 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0245 0.0613 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 2.28e-04 -0.309 0.0823 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0312 0.0777 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 8.25e-02 -0.129 0.0738 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 2.95e-01 -0.119 0.113 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 1.63e-02 -0.213 0.0882 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0203 0.0778 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 4.81e-03 -0.25 0.0876 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0525 0.133 0.218 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -148947 sc-eQTL 3.99e-01 0.104 0.123 0.218 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 7.32e-01 0.0443 0.129 0.218 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 1.78e-01 -0.171 0.126 0.218 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0453 0.121 0.218 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 1.09e-02 0.333 0.129 0.218 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 9.88e-01 0.00189 0.129 0.218 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0564 0.0939 0.229 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00892 0.0915 0.229 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 5.08e-02 0.205 0.104 0.229 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0617 0.0958 0.229 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 1.00e-01 0.15 0.0907 0.229 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00182 0.0984 0.229 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0441 0.0823 0.229 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 7.40e-02 -0.122 0.0681 0.229 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 9.68e-01 0.00428 0.107 0.229 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 2.27e-01 -0.114 0.0936 0.229 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0899 0.0913 0.229 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 4.72e-01 0.0683 0.0948 0.229 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 1.29e-01 -0.186 0.122 0.212 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 5.17e-01 0.0768 0.118 0.212 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 3.30e-01 -0.117 0.119 0.212 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 7.27e-01 0.036 0.103 0.212 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 7.04e-01 0.0466 0.122 0.212 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 6.31e-02 -0.234 0.125 0.212 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 954416 sc-eQTL 4.76e-01 0.079 0.111 0.212 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 3.11e-01 0.0769 0.0757 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0168 0.0678 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 3.92e-02 0.237 0.114 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 8.30e-01 0.0147 0.0682 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0205 0.0622 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 718024 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0389 0.0801 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 2.18e-04 -0.369 0.0981 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 954416 sc-eQTL 2.26e-01 0.0854 0.0702 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 421649 sc-eQTL 1.62e-01 -0.147 0.105 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 3.98e-01 0.0698 0.0824 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0344 0.0806 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00762 0.107 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 6.09e-01 -0.04 0.078 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0616 0.0799 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 718024 sc-eQTL 7.29e-01 -0.034 0.0977 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 1.82e-05 -0.414 0.0943 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 954416 sc-eQTL 3.07e-01 0.0476 0.0465 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 421649 sc-eQTL 4.19e-01 0.0819 0.101 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0595 0.0562 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 8.90e-03 -0.173 0.0657 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0998 0.107 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 2.16e-04 -0.281 0.0746 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 8.85e-01 -0.00843 0.0581 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 4.48e-05 -0.322 0.0773 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0461 0.0751 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 1.02e-01 -0.102 0.0625 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 2.09e-01 0.143 0.113 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 2.79e-01 -0.092 0.0848 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 8.76e-01 0.0133 0.0851 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 8.27e-01 0.0196 0.0898 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 491536 sc-eQTL 2.03e-01 -0.0982 0.0768 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -148947 sc-eQTL 3.10e-01 0.0722 0.071 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -727710 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0175 0.0778 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -256508 sc-eQTL 3.41e-01 0.105 0.11 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 42984 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0753 0.0696 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -21080 sc-eQTL 1.10e-01 0.108 0.0671 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 sc-eQTL 6.28e-04 -0.34 0.098 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -150901 sc-eQTL 7.57e-01 0.0343 0.111 0.228 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000173598 NUDT4 42984 eQTL 2.73e-05 -0.0896 0.0213 0.0 0.0 0.238
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 eQTL 5.79e-32 -0.257 0.0211 0.0 0.0 0.238


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000102189 \N 491536 4.37e-07 1.92e-07 6.99e-08 2.49e-07 1.02e-07 1.25e-07 2.86e-07 6.75e-08 1.94e-07 1.11e-07 2.18e-07 1.57e-07 3.4e-07 8.42e-08 6.6e-08 1.01e-07 6.17e-08 2.33e-07 7.27e-08 8e-08 1.33e-07 1.89e-07 1.81e-07 3.83e-08 2.99e-07 1.56e-07 1.33e-07 1.47e-07 1.4e-07 1.69e-07 1.39e-07 7.6e-08 4.23e-08 9.09e-08 1.29e-07 5.05e-08 5.45e-08 5.71e-08 5.95e-08 7.04e-08 4.89e-08 1.79e-07 3.53e-08 1.58e-08 9.79e-08 9.65e-09 8.21e-08 2.8e-09 4.68e-08
ENSG00000186076 \N -220719 1.28e-06 1.09e-06 2.14e-07 1.16e-06 3.58e-07 5.83e-07 1.52e-06 4.01e-07 1.5e-06 5.11e-07 1.89e-06 7.79e-07 2.46e-06 2.68e-07 5.17e-07 9.14e-07 8.89e-07 8e-07 8.18e-07 6.36e-07 7.68e-07 1.59e-06 8.94e-07 5.54e-07 2.26e-06 5.15e-07 9.29e-07 7.19e-07 1.46e-06 1.19e-06 7.41e-07 2.71e-07 1.97e-07 6e-07 5.67e-07 5.06e-07 7.09e-07 2.74e-07 4.52e-07 2.91e-07 2.87e-07 1.6e-06 9.66e-08 9e-08 2.99e-07 1.37e-07 2.15e-07 1.15e-07 1.82e-07
ENSG00000198015 MRPL42 -46621 7.94e-06 9.5e-06 1.33e-06 4.56e-06 2.35e-06 4.07e-06 1.01e-05 1.55e-06 7.4e-06 4.62e-06 1.05e-05 5.02e-06 1.36e-05 3.87e-06 2.01e-06 6.03e-06 3.75e-06 6.61e-06 2.58e-06 2.76e-06 4.6e-06 7.99e-06 7.18e-06 3.15e-06 1.28e-05 3.35e-06 4.48e-06 3.37e-06 9.27e-06 8.95e-06 4.69e-06 8.22e-07 1.23e-06 3.1e-06 3.64e-06 2.66e-06 1.72e-06 1.9e-06 2e-06 9.79e-07 1.01e-06 1.13e-05 1.32e-06 1.47e-07 8.03e-07 1.32e-06 1.23e-06 7.47e-07 4.14e-07
ENSG00000258035 \N -765177 2.74e-07 1.25e-07 4.91e-08 1.81e-07 9.24e-08 9.76e-08 1.49e-07 5.4e-08 1.44e-07 4.74e-08 1.57e-07 8.55e-08 1.45e-07 6.76e-08 6.02e-08 7.3e-08 3.87e-08 1.26e-07 5.39e-08 4.16e-08 1.13e-07 1.27e-07 1.39e-07 2.95e-08 1.46e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.65e-08 1.09e-07 1.07e-07 9.7e-08 3.99e-08 3.16e-08 8e-08 5.99e-08 3.04e-08 5.04e-08 8.93e-08 6.55e-08 3.87e-08 5.13e-08 1.35e-07 5.22e-08 1.32e-08 2.82e-08 1.83e-08 1.21e-07 1.89e-09 5.04e-08