Genes within 1Mb (chr12:93420126:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0391 0.067 0.173 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 1.22e-01 0.103 0.0661 0.173 B L1
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 6.16e-01 0.0505 0.101 0.173 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 1.49e-01 -0.108 0.0745 0.173 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 1.02e-01 0.108 0.0656 0.173 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 717283 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0521 0.0744 0.173 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 8.46e-02 0.177 0.102 0.173 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 953675 sc-eQTL 1.54e-01 -0.0724 0.0506 0.173 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 420908 sc-eQTL 4.54e-01 0.0768 0.102 0.173 B L1
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 5.74e-01 0.0392 0.0695 0.173 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -149688 sc-eQTL 7.83e-01 0.0186 0.0672 0.173 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 4.18e-01 0.0572 0.0705 0.173 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 8.31e-01 0.0248 0.116 0.173 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0661 0.0666 0.173 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 6.00e-01 0.0326 0.062 0.173 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 2.11e-01 0.135 0.107 0.173 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0227 0.0778 0.173 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -149688 sc-eQTL 8.06e-01 -0.022 0.0894 0.173 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0694 0.0919 0.173 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 5.72e-01 0.0612 0.108 0.173 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 4.60e-02 -0.128 0.0636 0.173 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 4.55e-01 0.0598 0.0799 0.173 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 1.44e-02 0.277 0.112 0.173 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0118 0.101 0.176 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 7.15e-01 0.0398 0.109 0.176 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 9.07e-01 0.0143 0.123 0.176 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00348 0.101 0.176 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0726 0.102 0.176 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0408 0.117 0.176 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 953675 sc-eQTL 1.87e-02 -0.242 0.102 0.176 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 3.63e-03 0.177 0.0602 0.173 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 2.09e-01 0.088 0.0699 0.173 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 2.91e-01 -0.136 0.129 0.173 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 5.50e-01 0.0533 0.0889 0.173 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 9.00e-01 0.00837 0.0668 0.173 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 8.59e-01 0.016 0.0899 0.173 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0532 0.0864 0.174 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -149688 sc-eQTL 8.73e-01 -0.013 0.0809 0.174 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 9.27e-01 0.00774 0.0844 0.174 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 1.98e-01 0.156 0.121 0.174 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 5.22e-02 -0.152 0.0777 0.174 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 2.22e-01 0.0948 0.0774 0.174 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 8.74e-03 0.289 0.109 0.174 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -151642 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0653 0.126 0.174 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 5.31e-01 0.069 0.11 0.173 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -149688 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0523 0.102 0.173 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 7.69e-01 0.0282 0.0957 0.173 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 2.19e-01 0.142 0.115 0.173 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0598 0.0826 0.173 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0318 0.0766 0.173 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 5.24e-01 0.0579 0.0906 0.173 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 6.20e-01 0.0669 0.135 0.163 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 6.73e-01 -0.048 0.113 0.163 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0681 0.133 0.163 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 6.65e-02 -0.217 0.117 0.163 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 8.18e-01 0.0338 0.147 0.163 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 717283 sc-eQTL 4.71e-01 0.0897 0.124 0.163 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 2.80e-01 0.154 0.142 0.163 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 953675 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0601 0.129 0.163 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 420908 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0222 0.138 0.163 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0589 0.103 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 6.26e-01 0.0496 0.102 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0257 0.121 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 6.43e-01 0.0468 0.101 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 8.59e-01 0.0183 0.103 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 717283 sc-eQTL 8.63e-01 0.0196 0.114 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 5.17e-01 0.0811 0.125 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 953675 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0583 0.0839 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 420908 sc-eQTL 3.63e-01 0.112 0.123 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0144 0.105 0.175 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 5.31e-01 0.0619 0.0986 0.175 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0398 0.129 0.175 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 5.97e-01 0.0489 0.0925 0.175 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 5.88e-02 0.156 0.0821 0.175 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 717283 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0914 0.105 0.175 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 2.01e-01 0.157 0.122 0.175 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 953675 sc-eQTL 6.25e-01 -0.05 0.102 0.175 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 420908 sc-eQTL 9.09e-01 0.014 0.123 0.175 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 7.32e-02 -0.182 0.101 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 1.11e-01 0.168 0.105 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 6.06e-01 0.0684 0.132 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 1.02e-01 -0.155 0.0943 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 1.77e-01 0.138 0.102 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 717283 sc-eQTL 2.63e-01 -0.126 0.112 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 3.07e-02 0.254 0.117 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 953675 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0264 0.0686 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 420908 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0623 0.125 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 2.28e-01 0.143 0.118 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0674 0.11 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 2.72e-01 0.136 0.123 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 5.15e-01 0.0666 0.102 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 1.83e-01 0.133 0.0996 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 717283 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0649 0.0867 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 7.26e-01 0.0454 0.13 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 953675 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0115 0.0623 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 420908 sc-eQTL 8.37e-01 0.0256 0.124 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 6.53e-01 0.0533 0.118 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -149688 sc-eQTL 6.93e-01 0.0472 0.119 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 9.43e-02 0.19 0.113 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 1.42e-01 0.169 0.115 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 1.85e-01 -0.149 0.112 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0326 0.115 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 2.65e-01 0.143 0.128 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 7.29e-01 0.0253 0.0728 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -149688 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0237 0.0688 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00638 0.0778 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 8.88e-01 0.0167 0.119 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 6.16e-01 0.0351 0.0698 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 3.97e-01 0.0568 0.0669 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 2.41e-01 0.132 0.112 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 7.37e-01 -0.034 0.101 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -149688 sc-eQTL 5.55e-01 0.0465 0.0787 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 8.36e-01 0.0193 0.0935 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 9.66e-01 0.00535 0.126 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 5.42e-02 -0.152 0.0784 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 5.37e-01 0.047 0.076 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 7.85e-01 0.0317 0.116 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0835 0.116 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -149688 sc-eQTL 6.76e-01 0.036 0.086 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 1.28e-01 0.156 0.102 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 6.88e-01 0.0509 0.127 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 4.56e-02 -0.199 0.0991 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 4.47e-01 0.0781 0.103 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 4.81e-01 0.0796 0.113 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 8.64e-01 -0.018 0.105 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -149688 sc-eQTL 6.89e-01 0.0407 0.102 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 3.66e-01 0.0933 0.103 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 6.49e-01 0.0571 0.125 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 2.07e-01 -0.117 0.0925 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 8.47e-01 0.0209 0.108 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 9.94e-02 0.203 0.123 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0899 0.0948 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -149688 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0998 0.0933 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0145 0.105 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 9.03e-01 0.0148 0.121 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0585 0.0837 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 2.84e-01 0.0979 0.0912 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 3.52e-02 0.245 0.116 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 8.18e-01 0.0289 0.125 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -149688 sc-eQTL 9.52e-02 -0.179 0.107 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0493 0.121 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 5.86e-01 0.0697 0.128 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0578 0.101 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 8.02e-01 0.0303 0.121 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0276 0.124 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 8.17e-01 0.0303 0.131 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -149688 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0974 0.121 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 7.77e-02 -0.225 0.127 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 4.99e-01 0.0916 0.135 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 1.49e-02 -0.302 0.123 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 7.96e-01 0.0309 0.119 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 3.00e-01 0.128 0.123 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 7.79e-01 0.0341 0.122 0.173 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -149688 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00368 0.111 0.173 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 6.34e-01 0.0485 0.102 0.173 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 1.07e-01 0.209 0.129 0.173 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0401 0.094 0.173 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 3.54e-01 0.107 0.115 0.173 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 2.12e-01 0.147 0.117 0.173 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 9.46e-01 0.00799 0.117 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -149688 sc-eQTL 1.55e-01 0.155 0.109 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0296 0.106 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 8.92e-01 0.0176 0.129 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 2.71e-01 -0.127 0.115 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 2.36e-01 0.145 0.122 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0586 0.122 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -151642 sc-eQTL 4.29e-01 0.0898 0.113 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0731 0.103 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -149688 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0396 0.0917 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 9.64e-01 0.0045 0.0997 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 3.87e-01 0.112 0.13 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 2.03e-01 -0.117 0.0917 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 6.46e-01 0.0406 0.0884 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 1.41e-02 0.299 0.121 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -151642 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00679 0.126 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0353 0.118 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -149688 sc-eQTL 8.17e-01 0.027 0.117 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 7.46e-01 0.0345 0.106 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 3.44e-01 0.123 0.13 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0765 0.109 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 7.53e-01 0.0385 0.122 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 7.09e-03 0.364 0.134 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -151642 sc-eQTL 8.36e-01 0.0228 0.11 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 5.92e-01 0.0568 0.106 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -149688 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0197 0.101 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 8.36e-01 0.0213 0.103 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 9.74e-01 0.00369 0.115 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 7.12e-02 -0.162 0.0893 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 9.27e-01 0.00951 0.104 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 1.04e-01 0.194 0.119 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -151642 sc-eQTL 2.69e-01 -0.132 0.12 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 2.00e-01 -0.211 0.164 0.156 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000317 0.154 0.156 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00166 0.142 0.156 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 7.18e-02 -0.238 0.131 0.156 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 4.18e-01 0.0946 0.117 0.156 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 717283 sc-eQTL 7.41e-01 0.0546 0.165 0.156 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 6.79e-01 0.0666 0.16 0.156 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 953675 sc-eQTL 6.02e-01 0.0665 0.127 0.156 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 420908 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00966 0.156 0.156 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 8.80e-02 0.213 0.124 0.172 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -149688 sc-eQTL 4.40e-02 -0.23 0.114 0.172 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0348 0.122 0.172 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 1.49e-01 -0.172 0.119 0.172 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0184 0.0967 0.172 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0759 0.089 0.172 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 5.49e-01 0.0642 0.107 0.172 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 6.01e-01 0.056 0.107 0.173 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -149688 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0417 0.105 0.173 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 3.46e-01 0.105 0.111 0.173 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 2.48e-01 -0.148 0.128 0.173 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 8.99e-02 -0.154 0.0903 0.173 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 8.17e-01 0.0227 0.0981 0.173 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 6.02e-01 0.0645 0.123 0.173 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0437 0.107 0.185 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00781 0.11 0.185 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 5.03e-01 0.0813 0.121 0.185 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 5.81e-01 0.068 0.123 0.185 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 3.14e-01 -0.108 0.107 0.185 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0818 0.123 0.185 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 953675 sc-eQTL 1.42e-01 -0.11 0.0743 0.185 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 6.91e-03 0.19 0.0697 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 1.40e-01 0.123 0.083 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 1.71e-01 -0.169 0.123 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00687 0.0908 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 5.81e-01 0.0394 0.0711 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 1.63e-01 0.137 0.0982 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0224 0.0919 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0104 0.0878 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0682 0.134 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 8.91e-01 0.0144 0.106 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 9.98e-01 0.000248 0.0919 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 4.26e-01 -0.084 0.105 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 4.25e-01 0.115 0.144 0.182 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -149688 sc-eQTL 6.33e-01 0.0638 0.133 0.182 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 6.19e-02 -0.259 0.138 0.182 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 1.49e-01 -0.197 0.136 0.182 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0915 0.13 0.182 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 4.58e-01 -0.106 0.142 0.182 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 1.66e-02 0.33 0.136 0.182 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 1.04e-02 0.281 0.109 0.173 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 7.88e-01 0.029 0.108 0.173 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 2.47e-01 -0.143 0.123 0.173 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 3.22e-01 -0.112 0.113 0.173 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0742 0.107 0.173 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 4.12e-01 -0.095 0.115 0.173 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 2.04e-01 0.118 0.0924 0.179 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 1.48e-01 0.112 0.077 0.179 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 8.83e-01 0.0177 0.121 0.179 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 4.78e-01 0.0751 0.106 0.179 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 3.21e-01 0.103 0.103 0.179 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 5.19e-01 0.0691 0.107 0.179 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00439 0.131 0.184 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 2.76e-01 0.138 0.126 0.184 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 3.43e-01 0.122 0.128 0.184 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0751 0.11 0.184 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 6.13e-01 0.0663 0.131 0.184 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 7.57e-01 0.042 0.135 0.184 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 953675 sc-eQTL 2.49e-02 -0.265 0.117 0.184 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0426 0.0864 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 8.47e-01 0.0149 0.0773 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 4.10e-01 -0.109 0.131 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0064 0.0778 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 7.87e-02 0.124 0.0704 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 717283 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0368 0.0913 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 9.88e-02 0.19 0.115 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 953675 sc-eQTL 4.26e-01 -0.064 0.0802 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 420908 sc-eQTL 5.28e-01 0.076 0.12 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0854 0.0956 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 1.39e-01 0.138 0.0931 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 4.18e-01 0.1 0.124 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0752 0.0904 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 7.74e-02 0.164 0.0922 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 717283 sc-eQTL 1.56e-01 -0.161 0.113 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 1.08e-01 0.183 0.114 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 953675 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0286 0.054 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 420908 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0165 0.117 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 3.14e-02 0.141 0.0649 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 4.08e-01 0.0643 0.0776 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 1.54e-01 -0.178 0.125 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 8.95e-01 0.0119 0.0898 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 9.11e-01 0.00753 0.0676 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 7.10e-01 0.0348 0.0937 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 8.69e-03 0.225 0.0849 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 3.86e-01 0.0626 0.0721 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0488 0.131 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 7.86e-01 0.0265 0.0976 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0166 0.0977 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 8.13e-01 0.0244 0.103 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 490795 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0391 0.089 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -149688 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0576 0.0821 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -728451 sc-eQTL 8.92e-01 0.0123 0.0898 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -257249 sc-eQTL 3.12e-01 0.128 0.127 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 42243 sc-eQTL 3.02e-02 -0.174 0.0797 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -21821 sc-eQTL 6.25e-01 0.0381 0.0779 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 sc-eQTL 4.03e-03 0.332 0.114 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -151642 sc-eQTL 3.55e-01 -0.118 0.128 0.175 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000173598 NUDT4 42243 eQTL 0.000441 -0.0808 0.0229 0.0 0.0 0.2
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 eQTL 1.21e-25 0.248 0.023 0.0118 0.0 0.2


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000173598 NUDT4 42243 1.21e-05 1.24e-05 1.29e-06 5.82e-06 2.22e-06 4.8e-06 1.17e-05 1.75e-06 9.65e-06 5.09e-06 1.28e-05 5.47e-06 1.71e-05 3.69e-06 2.94e-06 6.1e-06 4.98e-06 6.9e-06 2.61e-06 2.91e-06 4.7e-06 9.57e-06 7.47e-06 3.15e-06 1.3e-05 3.11e-06 4.87e-06 3.57e-06 9.77e-06 8.64e-06 5.45e-06 5.64e-07 1.24e-06 2.74e-06 4.48e-06 2.04e-06 1.55e-06 1.74e-06 1.62e-06 9.71e-07 6.35e-07 1.3e-05 1.48e-06 1.59e-07 6.91e-07 1.2e-06 9.05e-07 6.92e-07 5.87e-07
ENSG00000198015 MRPL42 -47362 1.1e-05 1.16e-05 1.31e-06 5.14e-06 1.9e-06 4.24e-06 1.06e-05 1.64e-06 8.5e-06 4.2e-06 1.21e-05 5.25e-06 1.5e-05 3.85e-06 2.55e-06 5.46e-06 4.26e-06 6.03e-06 2.65e-06 2.81e-06 4.39e-06 8.66e-06 6.89e-06 2.87e-06 1.24e-05 2.8e-06 4.54e-06 3.19e-06 8.33e-06 7.97e-06 4.81e-06 4.81e-07 1.22e-06 2.54e-06 3.81e-06 2.03e-06 1.33e-06 1.3e-06 1.38e-06 1.02e-06 5.18e-07 1.25e-05 1.4e-06 1.64e-07 7.85e-07 9.57e-07 1.05e-06 6.71e-07 5.97e-07