Genes within 1Mb (chr12:93413101:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0391 0.067 0.173 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 1.22e-01 0.103 0.0661 0.173 B L1
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 6.16e-01 0.0505 0.101 0.173 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 1.49e-01 -0.108 0.0745 0.173 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 1.02e-01 0.108 0.0656 0.173 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 710258 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0521 0.0744 0.173 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 8.46e-02 0.177 0.102 0.173 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 946650 sc-eQTL 1.54e-01 -0.0724 0.0506 0.173 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 413883 sc-eQTL 4.54e-01 0.0768 0.102 0.173 B L1
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 5.74e-01 0.0392 0.0695 0.173 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -156713 sc-eQTL 7.83e-01 0.0186 0.0672 0.173 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 4.18e-01 0.0572 0.0705 0.173 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 8.31e-01 0.0248 0.116 0.173 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0661 0.0666 0.173 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 6.00e-01 0.0326 0.062 0.173 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 2.11e-01 0.135 0.107 0.173 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0227 0.0778 0.173 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -156713 sc-eQTL 8.06e-01 -0.022 0.0894 0.173 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0694 0.0919 0.173 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 5.72e-01 0.0612 0.108 0.173 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 4.60e-02 -0.128 0.0636 0.173 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 4.55e-01 0.0598 0.0799 0.173 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 1.44e-02 0.277 0.112 0.173 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0118 0.101 0.176 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 7.15e-01 0.0398 0.109 0.176 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 9.07e-01 0.0143 0.123 0.176 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00348 0.101 0.176 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0726 0.102 0.176 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0408 0.117 0.176 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 946650 sc-eQTL 1.87e-02 -0.242 0.102 0.176 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 3.63e-03 0.177 0.0602 0.173 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 2.09e-01 0.088 0.0699 0.173 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 2.91e-01 -0.136 0.129 0.173 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 5.50e-01 0.0533 0.0889 0.173 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 9.00e-01 0.00837 0.0668 0.173 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 8.59e-01 0.016 0.0899 0.173 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0532 0.0864 0.174 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -156713 sc-eQTL 8.73e-01 -0.013 0.0809 0.174 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 9.27e-01 0.00774 0.0844 0.174 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 1.98e-01 0.156 0.121 0.174 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 5.22e-02 -0.152 0.0777 0.174 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 2.22e-01 0.0948 0.0774 0.174 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 8.74e-03 0.289 0.109 0.174 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -158667 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0653 0.126 0.174 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 5.31e-01 0.069 0.11 0.173 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -156713 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0523 0.102 0.173 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 7.69e-01 0.0282 0.0957 0.173 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 2.19e-01 0.142 0.115 0.173 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0598 0.0826 0.173 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0318 0.0766 0.173 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 5.24e-01 0.0579 0.0906 0.173 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 6.20e-01 0.0669 0.135 0.163 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 6.73e-01 -0.048 0.113 0.163 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0681 0.133 0.163 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 6.65e-02 -0.217 0.117 0.163 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 8.18e-01 0.0338 0.147 0.163 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 710258 sc-eQTL 4.71e-01 0.0897 0.124 0.163 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 2.80e-01 0.154 0.142 0.163 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 946650 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0601 0.129 0.163 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 413883 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0222 0.138 0.163 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0589 0.103 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 6.26e-01 0.0496 0.102 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0257 0.121 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 6.43e-01 0.0468 0.101 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 8.59e-01 0.0183 0.103 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 710258 sc-eQTL 8.63e-01 0.0196 0.114 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 5.17e-01 0.0811 0.125 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 946650 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0583 0.0839 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 413883 sc-eQTL 3.63e-01 0.112 0.123 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0144 0.105 0.175 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 5.31e-01 0.0619 0.0986 0.175 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0398 0.129 0.175 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 5.97e-01 0.0489 0.0925 0.175 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 5.88e-02 0.156 0.0821 0.175 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 710258 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0914 0.105 0.175 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 2.01e-01 0.157 0.122 0.175 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 946650 sc-eQTL 6.25e-01 -0.05 0.102 0.175 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 413883 sc-eQTL 9.09e-01 0.014 0.123 0.175 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 7.32e-02 -0.182 0.101 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 1.11e-01 0.168 0.105 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 6.06e-01 0.0684 0.132 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 1.02e-01 -0.155 0.0943 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 1.77e-01 0.138 0.102 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 710258 sc-eQTL 2.63e-01 -0.126 0.112 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 3.07e-02 0.254 0.117 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 946650 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0264 0.0686 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 413883 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0623 0.125 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 2.28e-01 0.143 0.118 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0674 0.11 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 2.72e-01 0.136 0.123 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 5.15e-01 0.0666 0.102 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 1.83e-01 0.133 0.0996 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 710258 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0649 0.0867 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 7.26e-01 0.0454 0.13 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 946650 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0115 0.0623 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 413883 sc-eQTL 8.37e-01 0.0256 0.124 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 6.53e-01 0.0533 0.118 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -156713 sc-eQTL 6.93e-01 0.0472 0.119 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 9.43e-02 0.19 0.113 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 1.42e-01 0.169 0.115 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 1.85e-01 -0.149 0.112 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0326 0.115 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 2.65e-01 0.143 0.128 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 7.29e-01 0.0253 0.0728 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -156713 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0237 0.0688 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00638 0.0778 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 8.88e-01 0.0167 0.119 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 6.16e-01 0.0351 0.0698 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 3.97e-01 0.0568 0.0669 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 2.41e-01 0.132 0.112 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 7.37e-01 -0.034 0.101 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -156713 sc-eQTL 5.55e-01 0.0465 0.0787 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 8.36e-01 0.0193 0.0935 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 9.66e-01 0.00535 0.126 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 5.42e-02 -0.152 0.0784 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 5.37e-01 0.047 0.076 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 7.85e-01 0.0317 0.116 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0835 0.116 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -156713 sc-eQTL 6.76e-01 0.036 0.086 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 1.28e-01 0.156 0.102 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 6.88e-01 0.0509 0.127 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 4.56e-02 -0.199 0.0991 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 4.47e-01 0.0781 0.103 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 4.81e-01 0.0796 0.113 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 8.64e-01 -0.018 0.105 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -156713 sc-eQTL 6.89e-01 0.0407 0.102 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 3.66e-01 0.0933 0.103 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 6.49e-01 0.0571 0.125 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 2.07e-01 -0.117 0.0925 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 8.47e-01 0.0209 0.108 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 9.94e-02 0.203 0.123 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0899 0.0948 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -156713 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0998 0.0933 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0145 0.105 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 9.03e-01 0.0148 0.121 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0585 0.0837 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 2.84e-01 0.0979 0.0912 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 3.52e-02 0.245 0.116 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 8.18e-01 0.0289 0.125 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -156713 sc-eQTL 9.52e-02 -0.179 0.107 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0493 0.121 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 5.86e-01 0.0697 0.128 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0578 0.101 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 8.02e-01 0.0303 0.121 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0276 0.124 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 8.17e-01 0.0303 0.131 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -156713 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0974 0.121 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 7.77e-02 -0.225 0.127 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 4.99e-01 0.0916 0.135 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 1.49e-02 -0.302 0.123 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 7.96e-01 0.0309 0.119 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 3.00e-01 0.128 0.123 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 7.79e-01 0.0341 0.122 0.173 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -156713 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00368 0.111 0.173 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 6.34e-01 0.0485 0.102 0.173 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 1.07e-01 0.209 0.129 0.173 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0401 0.094 0.173 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 3.54e-01 0.107 0.115 0.173 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 2.12e-01 0.147 0.117 0.173 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 9.46e-01 0.00799 0.117 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -156713 sc-eQTL 1.55e-01 0.155 0.109 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0296 0.106 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 8.92e-01 0.0176 0.129 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 2.71e-01 -0.127 0.115 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 2.36e-01 0.145 0.122 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0586 0.122 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -158667 sc-eQTL 4.29e-01 0.0898 0.113 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0731 0.103 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -156713 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0396 0.0917 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 9.64e-01 0.0045 0.0997 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 3.87e-01 0.112 0.13 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 2.03e-01 -0.117 0.0917 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 6.46e-01 0.0406 0.0884 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 1.41e-02 0.299 0.121 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -158667 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00679 0.126 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0353 0.118 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -156713 sc-eQTL 8.17e-01 0.027 0.117 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 7.46e-01 0.0345 0.106 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 3.44e-01 0.123 0.13 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0765 0.109 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 7.53e-01 0.0385 0.122 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 7.09e-03 0.364 0.134 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -158667 sc-eQTL 8.36e-01 0.0228 0.11 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 5.92e-01 0.0568 0.106 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -156713 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0197 0.101 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 8.36e-01 0.0213 0.103 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 9.74e-01 0.00369 0.115 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 7.12e-02 -0.162 0.0893 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 9.27e-01 0.00951 0.104 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 1.04e-01 0.194 0.119 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -158667 sc-eQTL 2.69e-01 -0.132 0.12 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 2.00e-01 -0.211 0.164 0.156 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000317 0.154 0.156 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00166 0.142 0.156 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 7.18e-02 -0.238 0.131 0.156 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 4.18e-01 0.0946 0.117 0.156 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 710258 sc-eQTL 7.41e-01 0.0546 0.165 0.156 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 6.79e-01 0.0666 0.16 0.156 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 946650 sc-eQTL 6.02e-01 0.0665 0.127 0.156 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 413883 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00966 0.156 0.156 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 8.80e-02 0.213 0.124 0.172 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -156713 sc-eQTL 4.40e-02 -0.23 0.114 0.172 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0348 0.122 0.172 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 1.49e-01 -0.172 0.119 0.172 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0184 0.0967 0.172 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0759 0.089 0.172 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 5.49e-01 0.0642 0.107 0.172 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 6.01e-01 0.056 0.107 0.173 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -156713 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0417 0.105 0.173 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 3.46e-01 0.105 0.111 0.173 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 2.48e-01 -0.148 0.128 0.173 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 8.99e-02 -0.154 0.0903 0.173 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 8.17e-01 0.0227 0.0981 0.173 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 6.02e-01 0.0645 0.123 0.173 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0437 0.107 0.185 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00781 0.11 0.185 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 5.03e-01 0.0813 0.121 0.185 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 5.81e-01 0.068 0.123 0.185 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 3.14e-01 -0.108 0.107 0.185 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0818 0.123 0.185 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 946650 sc-eQTL 1.42e-01 -0.11 0.0743 0.185 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 6.91e-03 0.19 0.0697 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 1.40e-01 0.123 0.083 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 1.71e-01 -0.169 0.123 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00687 0.0908 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 5.81e-01 0.0394 0.0711 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 1.63e-01 0.137 0.0982 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0224 0.0919 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0104 0.0878 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0682 0.134 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 8.91e-01 0.0144 0.106 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 9.98e-01 0.000248 0.0919 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 4.26e-01 -0.084 0.105 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 4.25e-01 0.115 0.144 0.182 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -156713 sc-eQTL 6.33e-01 0.0638 0.133 0.182 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 6.19e-02 -0.259 0.138 0.182 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 1.49e-01 -0.197 0.136 0.182 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0915 0.13 0.182 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 4.58e-01 -0.106 0.142 0.182 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 1.66e-02 0.33 0.136 0.182 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 1.04e-02 0.281 0.109 0.173 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 7.88e-01 0.029 0.108 0.173 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 2.47e-01 -0.143 0.123 0.173 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 3.22e-01 -0.112 0.113 0.173 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0742 0.107 0.173 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 4.12e-01 -0.095 0.115 0.173 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 2.04e-01 0.118 0.0924 0.179 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 1.48e-01 0.112 0.077 0.179 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 8.83e-01 0.0177 0.121 0.179 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 4.78e-01 0.0751 0.106 0.179 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 3.21e-01 0.103 0.103 0.179 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 5.19e-01 0.0691 0.107 0.179 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00439 0.131 0.184 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 2.76e-01 0.138 0.126 0.184 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 3.43e-01 0.122 0.128 0.184 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0751 0.11 0.184 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 6.13e-01 0.0663 0.131 0.184 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 7.57e-01 0.042 0.135 0.184 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 946650 sc-eQTL 2.49e-02 -0.265 0.117 0.184 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0426 0.0864 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 8.47e-01 0.0149 0.0773 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 4.10e-01 -0.109 0.131 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0064 0.0778 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 7.87e-02 0.124 0.0704 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 710258 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0368 0.0913 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 9.88e-02 0.19 0.115 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 946650 sc-eQTL 4.26e-01 -0.064 0.0802 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 413883 sc-eQTL 5.28e-01 0.076 0.12 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0854 0.0956 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 1.39e-01 0.138 0.0931 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 4.18e-01 0.1 0.124 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0752 0.0904 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 7.74e-02 0.164 0.0922 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 710258 sc-eQTL 1.56e-01 -0.161 0.113 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 1.08e-01 0.183 0.114 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 946650 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0286 0.054 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 413883 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0165 0.117 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 3.14e-02 0.141 0.0649 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 4.08e-01 0.0643 0.0776 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 1.54e-01 -0.178 0.125 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 8.95e-01 0.0119 0.0898 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 9.11e-01 0.00753 0.0676 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 7.10e-01 0.0348 0.0937 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 8.69e-03 0.225 0.0849 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 3.86e-01 0.0626 0.0721 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0488 0.131 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 7.86e-01 0.0265 0.0976 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0166 0.0977 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 8.13e-01 0.0244 0.103 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 483770 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0391 0.089 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -156713 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0576 0.0821 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -735476 sc-eQTL 8.92e-01 0.0123 0.0898 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -264274 sc-eQTL 3.12e-01 0.128 0.127 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 35218 sc-eQTL 3.02e-02 -0.174 0.0797 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -28846 sc-eQTL 6.25e-01 0.0381 0.0779 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 sc-eQTL 4.03e-03 0.332 0.114 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -158667 sc-eQTL 3.55e-01 -0.118 0.128 0.175 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000169372 CRADD -264274 eQTL 0.0455 0.0337 0.0168 0.0 0.0 0.199
ENSG00000173598 NUDT4 35218 eQTL 0.000457 -0.0808 0.023 0.0 0.0 0.199
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 eQTL 1.33e-25 0.248 0.023 0.00883 0.0 0.199


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000173598 NUDT4 35218 3.04e-05 2.79e-05 5.11e-06 1.55e-05 4.31e-06 1.36e-05 3.81e-05 4.07e-06 2.82e-05 1.4e-05 3.47e-05 1.37e-05 4.23e-05 1.26e-05 6.04e-06 1.48e-05 1.43e-05 2.25e-05 6.64e-06 6.05e-06 1.32e-05 2.74e-05 2.73e-05 7.95e-06 3.7e-05 7.01e-06 1.14e-05 1.16e-05 2.78e-05 2.09e-05 1.78e-05 1.59e-06 2.45e-06 6.67e-06 1.11e-05 5.04e-06 3.13e-06 3.19e-06 4.25e-06 3.04e-06 1.77e-06 3.51e-05 2.95e-06 3.57e-07 2.16e-06 3.41e-06 3.71e-06 1.45e-06 1.53e-06
ENSG00000198015 MRPL42 -54387 2.22e-05 2.1e-05 3.38e-06 1.55e-05 2.96e-06 1.17e-05 2.77e-05 3.72e-06 2.29e-05 1.13e-05 2.86e-05 8.78e-06 3.56e-05 1e-05 5.15e-06 1.03e-05 1.02e-05 1.81e-05 4.42e-06 5.17e-06 9.95e-06 2.06e-05 2.13e-05 6.27e-06 2.96e-05 5.73e-06 8.21e-06 9.35e-06 2.16e-05 1.54e-05 1.46e-05 1.58e-06 2.29e-06 5.67e-06 9.92e-06 4.4e-06 3.03e-06 2.98e-06 3.56e-06 2.37e-06 1.7e-06 3.06e-05 2.63e-06 2.85e-07 1.97e-06 2.96e-06 2.93e-06 1.52e-06 1.51e-06