logo

Genes within 1Mb (chr12:93411631:T:TA):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0701 0.0539 0.263 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 9.04e-01 0.00647 0.0536 0.263 B L1
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 4.62e-02 -0.161 0.0804 0.263 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 8.17e-01 -0.014 0.0604 0.263 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0783 0.053 0.263 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 708788 sc-eQTL 6.57e-01 0.0268 0.0601 0.263 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 3.46e-23 0.738 0.0658 0.263 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 945180 sc-eQTL 9.63e-01 -0.0019 0.041 0.263 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 412413 sc-eQTL 9.41e-01 0.00616 0.0827 0.263 B L1
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0285 0.0568 0.263 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -158183 sc-eQTL 8.42e-01 0.0109 0.055 0.263 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 2.71e-01 0.0635 0.0576 0.263 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0127 0.0946 0.263 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00241 0.0546 0.263 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0456 0.0506 0.263 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 1.18e-24 0.803 0.0687 0.263 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 3.19e-01 0.0636 0.0637 0.263 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -158183 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0657 0.0731 0.263 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 2.86e-01 0.0805 0.0752 0.263 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 2.41e-01 -0.104 0.0885 0.263 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 9.52e-01 0.00314 0.0526 0.263 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0134 0.0655 0.263 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 1.99e-14 0.668 0.0812 0.263 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 5.30e-01 0.0527 0.0836 0.261 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 6.49e-02 -0.166 0.0896 0.261 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0546 0.102 0.261 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 6.35e-01 0.0399 0.0839 0.261 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0263 0.0847 0.261 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 2.74e-05 0.4 0.0932 0.261 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 945180 sc-eQTL 8.71e-01 -0.014 0.086 0.261 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00589 0.0491 0.263 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 6.85e-01 0.0228 0.0561 0.263 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 9.76e-01 -0.0031 0.103 0.263 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 3.46e-01 0.0672 0.0711 0.263 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0323 0.0534 0.263 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 6.24e-14 0.506 0.0629 0.263 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0685 0.0696 0.264 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -158183 sc-eQTL 3.99e-01 0.055 0.0651 0.264 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 2.39e-01 0.0801 0.0679 0.264 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 1.41e-01 0.144 0.0973 0.264 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0375 0.0632 0.264 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 2.25e-01 -0.0759 0.0624 0.264 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 1.96e-07 0.451 0.0839 0.264 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -160137 sc-eQTL 5.41e-01 0.0623 0.102 0.264 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 7.91e-01 0.0237 0.0894 0.263 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -158183 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0984 0.0826 0.263 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0143 0.0778 0.263 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 4.04e-01 0.0784 0.0939 0.263 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0808 0.0669 0.263 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0449 0.0622 0.263 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 6.00e-04 0.25 0.0716 0.263 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 8.11e-01 -0.026 0.108 0.26 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 1.90e-01 0.12 0.0909 0.26 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0077 0.107 0.26 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 9.00e-02 -0.161 0.0946 0.26 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 2.87e-01 0.126 0.118 0.26 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 708788 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0682 0.0999 0.26 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 7.90e-02 0.201 0.114 0.26 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 945180 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0477 0.104 0.26 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 412413 sc-eQTL 6.50e-02 -0.205 0.11 0.26 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 1.09e-01 -0.134 0.0831 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 1.34e-01 -0.124 0.0825 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 1.37e-01 -0.146 0.098 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0997 0.0819 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 1.23e-02 -0.208 0.0824 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 708788 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0405 0.0926 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 6.44e-09 0.569 0.094 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 945180 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00256 0.0685 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 412413 sc-eQTL 4.02e-01 0.0843 0.1 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 6.31e-02 -0.156 0.0835 0.263 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 3.98e-01 0.067 0.0791 0.263 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 6.36e-01 0.0491 0.104 0.263 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0708 0.0741 0.263 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 6.56e-02 -0.122 0.0659 0.263 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 708788 sc-eQTL 9.99e-01 9.73e-05 0.0846 0.263 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 1.33e-02 0.243 0.0973 0.263 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 945180 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0192 0.0821 0.263 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 412413 sc-eQTL 1.02e-01 0.161 0.098 0.263 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0047 0.0788 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0383 0.0817 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 8.38e-02 -0.177 0.102 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 1.43e-01 0.108 0.0731 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0966 0.0787 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 708788 sc-eQTL 7.42e-01 0.0288 0.0873 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 1.13e-14 0.658 0.0792 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 945180 sc-eQTL 1.69e-01 -0.073 0.0529 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 412413 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0472 0.0967 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 2.32e-01 -0.113 0.0943 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 6.59e-01 0.0386 0.0873 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0993 0.0982 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 6.05e-03 -0.222 0.0799 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 8.68e-02 -0.136 0.0791 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 708788 sc-eQTL 8.99e-01 0.00875 0.0691 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 1.99e-08 0.559 0.0958 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 945180 sc-eQTL 4.99e-01 0.0335 0.0495 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 412413 sc-eQTL 3.48e-01 -0.093 0.0989 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 6.11e-01 0.0503 0.0987 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -158183 sc-eQTL 5.72e-01 0.0563 0.0994 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 9.71e-01 0.00348 0.0948 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 6.08e-01 0.0493 0.0961 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 2.57e-01 -0.107 0.0939 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 3.45e-01 0.0909 0.0959 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 2.51e-02 0.239 0.106 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 9.67e-01 0.00247 0.06 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -158183 sc-eQTL 8.69e-01 0.00938 0.0566 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 4.56e-01 0.0478 0.064 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 1.96e-01 -0.126 0.0974 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0419 0.0574 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0295 0.0551 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 3.66e-21 0.79 0.0749 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00588 0.0819 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -158183 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0138 0.0638 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 3.08e-01 0.0771 0.0756 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 1.90e-01 0.134 0.102 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0495 0.064 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 2.14e-01 -0.0766 0.0614 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 7.21e-17 0.725 0.0797 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0483 0.093 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -158183 sc-eQTL 5.59e-01 0.0402 0.0687 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 9.48e-01 0.00534 0.0823 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00494 0.101 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 2.50e-01 0.092 0.0797 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 1.63e-01 -0.114 0.0817 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 1.12e-04 0.343 0.0871 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 7.17e-01 0.0304 0.0838 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -158183 sc-eQTL 8.87e-01 0.0115 0.0814 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 1.93e-01 0.107 0.0822 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0977 0.1 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 6.82e-01 0.0305 0.0743 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0336 0.0863 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 1.53e-06 0.463 0.0937 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 3.70e-02 0.164 0.0781 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -158183 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00621 0.0777 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 5.33e-01 0.0543 0.0869 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 8.45e-02 -0.173 0.0999 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0406 0.0696 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 5.65e-01 0.0438 0.0759 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 3.59e-09 0.55 0.0893 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0657 0.103 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -158183 sc-eQTL 3.64e-01 0.08 0.0879 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 3.13e-02 0.212 0.0979 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 6.86e-01 0.0424 0.105 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0738 0.083 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 9.73e-01 0.00332 0.099 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 4.82e-05 0.404 0.0971 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0342 0.101 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -158183 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0787 0.0933 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 7.45e-01 0.0321 0.0984 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0272 0.104 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 9.04e-01 0.0115 0.096 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000578 0.0917 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 2.69e-04 0.341 0.0919 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 7.51e-01 0.0317 0.0995 0.266 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -158183 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0884 0.0904 0.266 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 8.52e-02 -0.143 0.0828 0.266 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 7.27e-01 -0.037 0.106 0.266 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 1.15e-02 -0.193 0.0757 0.266 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0544 0.0943 0.266 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 8.51e-03 0.252 0.0948 0.266 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 1.22e-01 -0.151 0.0972 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -158183 sc-eQTL 6.63e-01 0.0398 0.0912 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 1.88e-01 0.117 0.0885 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 9.64e-02 0.179 0.107 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 2.03e-01 0.122 0.0959 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 6.03e-01 0.0533 0.102 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 3.03e-03 0.299 0.0996 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -160137 sc-eQTL 4.27e-01 0.0754 0.0947 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0189 0.0824 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -158183 sc-eQTL 2.93e-01 0.0766 0.0727 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 1.64e-01 0.11 0.0789 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 3.33e-01 0.1 0.103 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 1.52e-01 -0.105 0.0728 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0135 0.0703 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 2.66e-03 0.29 0.0953 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -160137 sc-eQTL 3.61e-01 0.0916 0.1 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 3.24e-01 0.0962 0.0972 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -158183 sc-eQTL 7.35e-01 0.0325 0.0962 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 4.26e-01 0.0701 0.0878 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 4.09e-01 0.0889 0.108 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0642 0.0899 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0404 0.101 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 1.22e-03 0.359 0.11 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -160137 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0168 0.091 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0994 0.0852 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -158183 sc-eQTL 8.06e-01 0.02 0.0816 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0595 0.0826 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 3.33e-01 0.0894 0.0922 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 9.65e-01 0.00317 0.0726 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 5.15e-03 -0.232 0.082 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 5.57e-03 0.266 0.0951 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -160137 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0296 0.0968 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0427 0.122 0.281 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 8.33e-01 -0.024 0.114 0.281 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 3.73e-01 0.0936 0.105 0.281 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0463 0.0981 0.281 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0324 0.0865 0.281 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 708788 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0318 0.122 0.281 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 1.10e-01 0.189 0.117 0.281 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 945180 sc-eQTL 5.61e-01 0.0548 0.094 0.281 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 412413 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0711 0.115 0.281 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0621 0.0995 0.261 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -158183 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0755 0.0912 0.261 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 8.30e-01 0.0209 0.0972 0.261 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 8.60e-01 0.0168 0.0949 0.261 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 7.97e-01 0.0198 0.0769 0.261 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 1.62e-01 -0.099 0.0706 0.261 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 4.93e-01 0.0585 0.0851 0.261 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 8.27e-01 0.0193 0.0883 0.263 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -158183 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0606 0.0869 0.263 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 3.31e-01 0.0893 0.0915 0.263 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 8.43e-01 0.021 0.106 0.263 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 7.26e-01 0.0263 0.075 0.263 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 8.72e-01 0.013 0.081 0.263 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 7.20e-07 0.491 0.0961 0.263 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 1.17e-01 0.137 0.0871 0.268 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 4.66e-02 -0.179 0.0892 0.268 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 2.81e-01 -0.107 0.0993 0.268 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 2.52e-01 0.116 0.101 0.268 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0114 0.0881 0.268 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 6.12e-04 0.341 0.0978 0.268 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 945180 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00801 0.0615 0.268 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 1.00e+00 3.22e-05 0.0567 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0277 0.0668 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 6.10e-01 0.0507 0.0992 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 6.47e-01 0.0334 0.0727 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0766 0.0567 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 4.49e-08 0.418 0.0736 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 8.80e-01 0.011 0.0728 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 4.79e-01 0.0493 0.0695 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 9.14e-01 0.0115 0.107 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 2.93e-01 0.0881 0.0835 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 6.63e-01 0.0318 0.0728 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 3.62e-09 0.474 0.077 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 8.09e-01 0.0292 0.12 0.252 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -158183 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0512 0.111 0.252 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 3.60e-01 0.107 0.116 0.252 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 5.38e-01 0.0706 0.114 0.252 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 2.63e-01 0.122 0.108 0.252 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0868 0.119 0.252 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 4.30e-01 0.0917 0.116 0.252 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0355 0.089 0.264 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 8.15e-01 0.0203 0.0866 0.264 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 7.57e-01 0.031 0.0997 0.264 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 2.95e-01 0.0952 0.0906 0.264 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 8.56e-01 0.0157 0.0865 0.264 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 2.45e-02 0.208 0.092 0.264 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 5.68e-01 0.0446 0.078 0.265 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 6.63e-01 0.0284 0.0651 0.265 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0789 0.101 0.265 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0503 0.089 0.265 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 7.64e-01 0.0261 0.0868 0.265 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 6.25e-03 0.244 0.0883 0.265 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0859 0.112 0.274 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 1.81e-02 -0.254 0.106 0.274 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0404 0.11 0.274 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 2.37e-01 -0.111 0.0938 0.274 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 6.30e-01 -0.054 0.112 0.274 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 2.50e-03 0.345 0.112 0.274 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 945180 sc-eQTL 6.93e-01 0.04 0.101 0.274 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 6.48e-02 -0.128 0.0689 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 9.30e-01 0.00548 0.0621 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 1.34e-01 -0.158 0.105 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 9.10e-02 -0.105 0.0621 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 7.17e-03 -0.152 0.056 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 708788 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0317 0.0734 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 4.82e-10 0.553 0.0847 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 945180 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0283 0.0645 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 412413 sc-eQTL 2.89e-01 0.103 0.0964 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0397 0.076 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0196 0.0743 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 7.88e-02 -0.173 0.0979 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00385 0.0719 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 8.47e-02 -0.127 0.0733 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 708788 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0263 0.0901 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 1.16e-20 0.767 0.0739 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 945180 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0206 0.0429 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 412413 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0757 0.0932 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 6.92e-01 0.0208 0.0524 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 8.14e-01 0.0146 0.0621 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 6.48e-01 0.0457 0.1 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 3.44e-01 0.0679 0.0715 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0298 0.054 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 4.21e-13 0.511 0.066 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0334 0.0708 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 6.45e-01 0.0274 0.0593 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 3.07e-01 -0.109 0.107 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 6.92e-01 0.0318 0.0801 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 9.94e-01 0.000557 0.0802 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 1.24e-03 0.27 0.0825 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 482300 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0582 0.0713 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -158183 sc-eQTL 5.24e-01 0.042 0.0658 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -736946 sc-eQTL 2.54e-01 0.0821 0.0718 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -265744 sc-eQTL 1.67e-01 0.14 0.101 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 33748 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0616 0.0644 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -30316 sc-eQTL 9.00e-02 -0.106 0.062 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 sc-eQTL 7.59e-07 0.449 0.0879 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -160137 sc-eQTL 6.36e-01 0.0485 0.102 0.263 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000177889 UBE2N -30316 eQTL 0.0165 -0.0321 0.0134 0.0 0.0 0.242
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 eQTL 3.49e-51 0.329 0.0205 0.0 0.00222 0.242

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000177889 UBE2N -30316 0.00012 4.88e-05 1.07e-05 1.6e-05 6.08e-06 2.28e-05 5.89e-05 3.51e-06 3.23e-05 1.12e-05 4.22e-05 2.01e-05 6.15e-05 1.54e-05 7.14e-06 2.07e-05 1.96e-05 2.28e-05 1.06e-05 5.18e-06 1.41e-05 4.41e-05 4.56e-05 9.68e-06 3.96e-05 7.01e-06 1.27e-05 8.12e-06 4.8e-05 2.71e-05 1.76e-05 9.73e-07 3.02e-06 5.74e-06 9.92e-06 4.55e-06 1.84e-06 2.71e-06 2.84e-06 2.44e-06 1.67e-06 7.52e-05 7.04e-06 2.22e-07 2.73e-06 4.04e-06 4.53e-06 1.48e-06 1.5e-06
ENSG00000187510 \N 708788 2.64e-07 1.1e-07 3.35e-08 1.79e-07 1.02e-07 9.65e-08 1.42e-07 5.24e-08 1.42e-07 4.24e-08 1.62e-07 7.58e-08 1.27e-07 6.21e-08 4.89e-08 8.01e-08 4.94e-08 1.1e-07 5.19e-08 3.74e-08 1.06e-07 1.33e-07 1.3e-07 4.82e-08 1.29e-07 1.09e-07 1.1e-07 8.45e-08 9.88e-08 1.1e-07 9.58e-08 3.29e-08 2.74e-08 8.21e-08 9.14e-08 4.02e-08 5.1e-08 8.75e-08 8.14e-08 3.8e-08 2.6e-08 1.39e-07 4.04e-08 2.24e-08 1.12e-07 1.7e-08 1.46e-07 4.96e-09 4.72e-08
ENSG00000198015 MRPL42 -55857 6.14e-05 1.71e-05 4.29e-06 1.03e-05 2.35e-06 8.4e-06 2.75e-05 1.76e-06 1.53e-05 5.89e-06 1.82e-05 7.38e-06 2.53e-05 7.27e-06 4.19e-06 9.23e-06 7.02e-06 1.16e-05 6.32e-06 2.82e-06 6.44e-06 1.41e-05 1.98e-05 4.8e-06 1.73e-05 4.73e-06 7.06e-06 3.99e-06 2.05e-05 1.5e-05 8.88e-06 8.91e-07 1.38e-06 3.59e-06 6.46e-06 2.81e-06 1.44e-06 1.95e-06 1.59e-06 9.76e-07 9.74e-07 2.6e-05 3.5e-06 1.55e-07 1.87e-06 2.64e-06 2.03e-06 7.5e-07 4.55e-07