logo

Genes within 1Mb (chr12:93404922:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 4.12e-01 -0.054 0.0657 0.177 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 1.95e-01 0.0844 0.065 0.177 B L1
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 7.27e-01 0.0346 0.0987 0.177 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0779 0.0732 0.177 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 1.55e-01 0.0919 0.0644 0.177 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 702079 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0809 0.0729 0.177 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 9.83e-02 0.167 0.1 0.177 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 938471 sc-eQTL 9.28e-02 -0.0836 0.0495 0.177 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 405704 sc-eQTL 4.85e-01 0.0702 0.1 0.177 B L1
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 6.04e-01 0.0354 0.0681 0.177 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -164892 sc-eQTL 6.35e-01 0.0313 0.0658 0.177 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 4.04e-01 0.0578 0.0691 0.177 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 7.64e-01 0.0341 0.113 0.177 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 1.68e-01 -0.0902 0.0651 0.177 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 7.72e-01 0.0176 0.0607 0.177 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 1.74e-01 0.143 0.105 0.177 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00752 0.0763 0.177 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -164892 sc-eQTL 5.69e-01 -0.05 0.0876 0.177 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0807 0.0901 0.177 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 9.66e-01 0.00457 0.106 0.177 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 4.79e-02 -0.124 0.0624 0.177 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 3.96e-01 0.0666 0.0783 0.177 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 2.60e-02 0.247 0.11 0.177 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0114 0.1 0.178 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 6.87e-01 0.0437 0.108 0.178 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0251 0.122 0.178 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0264 0.101 0.178 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0662 0.102 0.178 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0366 0.117 0.178 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 938471 sc-eQTL 2.81e-02 -0.225 0.102 0.178 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 9.00e-03 0.156 0.059 0.177 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 1.97e-01 0.0884 0.0683 0.177 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 3.95e-01 -0.107 0.126 0.177 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 7.89e-01 0.0233 0.087 0.177 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 9.74e-01 0.00211 0.0653 0.177 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 8.41e-01 0.0176 0.0878 0.177 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 6.71e-01 -0.036 0.0848 0.178 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -164892 sc-eQTL 7.64e-01 0.0238 0.0793 0.178 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 9.67e-01 0.00347 0.0828 0.178 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 3.15e-01 0.119 0.119 0.178 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 1.68e-01 -0.106 0.0766 0.178 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 1.97e-01 0.0982 0.0758 0.178 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 1.57e-02 0.261 0.107 0.178 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -166846 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0352 0.124 0.178 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 4.90e-01 0.0743 0.107 0.177 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -164892 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0371 0.0996 0.177 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 9.06e-01 0.0111 0.0935 0.177 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 4.61e-01 0.0834 0.113 0.177 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0605 0.0806 0.177 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0402 0.0748 0.177 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 5.84e-01 0.0486 0.0885 0.177 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 4.75e-01 0.0936 0.131 0.168 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0677 0.11 0.168 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0544 0.129 0.168 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 1.46e-01 -0.167 0.114 0.168 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 9.15e-01 0.0153 0.143 0.168 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 702079 sc-eQTL 4.00e-01 0.102 0.121 0.168 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 6.07e-01 0.0713 0.139 0.168 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 938471 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0967 0.125 0.168 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 405704 sc-eQTL 7.51e-01 0.0426 0.134 0.168 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0597 0.1 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 6.30e-01 0.0481 0.0995 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0289 0.118 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 5.31e-01 0.0618 0.0986 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 7.95e-01 0.0261 0.1 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 702079 sc-eQTL 9.91e-01 0.0013 0.111 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 4.06e-01 0.102 0.122 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 938471 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0557 0.0822 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 405704 sc-eQTL 3.18e-01 0.12 0.12 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0734 0.103 0.179 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 4.64e-01 0.0709 0.0965 0.179 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0854 0.126 0.179 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 6.06e-01 0.0467 0.0905 0.179 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 8.09e-02 0.141 0.0805 0.179 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 702079 sc-eQTL 2.42e-01 -0.121 0.103 0.179 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 2.08e-01 0.151 0.12 0.179 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 938471 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0604 0.1 0.179 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 405704 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0427 0.12 0.179 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 3.96e-02 -0.204 0.0985 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 3.06e-01 0.106 0.103 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 6.09e-01 0.0663 0.13 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 1.49e-01 -0.134 0.0924 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 2.17e-01 0.123 0.0995 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 702079 sc-eQTL 2.37e-01 -0.13 0.11 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 2.87e-02 0.251 0.114 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 938471 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0201 0.0672 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 405704 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0639 0.122 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 1.31e-01 0.176 0.116 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0988 0.107 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 3.72e-01 0.108 0.121 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 3.43e-01 0.095 0.0999 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 2.10e-01 0.123 0.0976 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 702079 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0732 0.0849 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 9.94e-01 0.000975 0.127 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 938471 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0271 0.061 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 405704 sc-eQTL 7.66e-01 0.0364 0.122 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 8.77e-01 0.0179 0.116 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -164892 sc-eQTL 6.94e-01 0.0461 0.117 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 4.68e-02 0.221 0.11 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 2.68e-01 0.125 0.113 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 2.06e-01 -0.14 0.11 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0528 0.113 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 3.58e-01 0.116 0.126 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 8.67e-01 0.0119 0.0713 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -164892 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0198 0.0673 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0161 0.0761 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 5.90e-01 0.0627 0.116 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 8.75e-01 0.0107 0.0683 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 4.48e-01 0.0498 0.0654 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 2.29e-01 0.132 0.11 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0259 0.0991 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -164892 sc-eQTL 4.51e-01 0.0582 0.0771 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 8.18e-01 0.0211 0.0917 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 9.98e-01 0.000339 0.124 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 3.06e-02 -0.167 0.0767 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 5.22e-01 0.0478 0.0745 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 7.38e-01 0.0381 0.114 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0854 0.114 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -164892 sc-eQTL 5.10e-01 0.0556 0.0842 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 9.50e-02 0.168 0.1 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 8.13e-01 0.0295 0.124 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 2.05e-02 -0.226 0.0968 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 4.85e-01 0.0703 0.101 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 4.29e-01 0.0876 0.11 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 8.54e-01 0.0189 0.102 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -164892 sc-eQTL 9.43e-01 0.00707 0.0994 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 3.81e-01 0.0885 0.101 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 9.21e-01 0.0121 0.123 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 2.48e-01 -0.105 0.0905 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 7.28e-01 0.0367 0.105 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 2.42e-01 0.141 0.121 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 1.56e-01 -0.132 0.0929 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -164892 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0959 0.0917 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0203 0.103 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 7.31e-01 0.0409 0.119 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0356 0.0824 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 3.48e-01 0.0843 0.0897 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 2.10e-02 0.264 0.113 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 6.89e-01 0.0499 0.125 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -164892 sc-eQTL 1.10e-01 -0.171 0.106 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0643 0.12 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 7.23e-01 0.0452 0.127 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0361 0.101 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 7.53e-01 0.038 0.12 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0164 0.123 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00922 0.128 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -164892 sc-eQTL 3.63e-01 -0.108 0.119 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 9.36e-02 -0.21 0.125 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 8.85e-01 0.0193 0.133 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 9.04e-03 -0.317 0.12 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 7.01e-01 0.0449 0.117 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 2.04e-01 0.154 0.121 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 8.20e-01 0.0271 0.119 0.177 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -164892 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000461 0.109 0.177 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 7.04e-01 0.038 0.0999 0.177 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 1.22e-01 0.196 0.126 0.177 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0346 0.0921 0.177 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 4.01e-01 0.0951 0.113 0.177 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 2.20e-01 0.141 0.115 0.177 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0314 0.115 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -164892 sc-eQTL 1.64e-01 0.149 0.106 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 8.48e-01 -0.02 0.104 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 8.53e-01 0.0235 0.127 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 2.75e-01 -0.123 0.113 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 3.63e-01 0.109 0.12 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 7.38e-01 -0.04 0.119 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -166846 sc-eQTL 4.73e-01 0.08 0.111 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0538 0.102 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -164892 sc-eQTL 9.55e-01 0.00513 0.09 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0169 0.0979 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 5.84e-01 0.0699 0.127 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0914 0.0902 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 4.80e-01 0.0614 0.0867 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 4.55e-02 0.24 0.119 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -166846 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00832 0.124 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0114 0.116 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -164892 sc-eQTL 6.72e-01 0.0485 0.114 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 8.12e-01 0.0249 0.104 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 5.70e-01 0.0728 0.128 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0665 0.107 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 6.34e-01 0.0571 0.12 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 4.55e-03 0.376 0.131 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -166846 sc-eQTL 6.26e-01 0.0527 0.108 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 3.86e-01 0.09 0.104 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -164892 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00268 0.099 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 7.24e-01 0.0354 0.1 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0117 0.112 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 1.69e-01 -0.121 0.0878 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0133 0.101 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 1.62e-01 0.164 0.117 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -166846 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0885 0.117 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 2.28e-01 -0.191 0.158 0.159 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 8.96e-01 0.0193 0.148 0.159 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 6.69e-01 0.0585 0.136 0.159 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 5.80e-02 -0.241 0.126 0.159 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 4.85e-01 0.0786 0.112 0.159 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 702079 sc-eQTL 7.29e-01 0.0549 0.158 0.159 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 7.31e-01 0.0532 0.154 0.159 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 938471 sc-eQTL 6.86e-01 0.0496 0.122 0.159 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 405704 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0122 0.15 0.159 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 4.53e-02 0.245 0.122 0.176 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -164892 sc-eQTL 8.00e-02 -0.197 0.112 0.176 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0218 0.12 0.176 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 1.10e-01 -0.187 0.116 0.176 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0366 0.0948 0.176 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0754 0.0872 0.176 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 6.49e-01 0.0478 0.105 0.176 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 6.41e-01 0.049 0.105 0.177 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -164892 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0433 0.103 0.177 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 2.75e-01 0.119 0.109 0.177 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 1.95e-01 -0.163 0.126 0.177 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 3.63e-02 -0.186 0.0884 0.177 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 9.43e-01 0.00689 0.0963 0.177 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 4.03e-01 0.101 0.121 0.177 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0394 0.106 0.188 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00241 0.109 0.188 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 7.35e-01 0.0409 0.121 0.188 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 6.07e-01 0.063 0.122 0.188 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0952 0.106 0.188 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0803 0.122 0.188 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 938471 sc-eQTL 1.33e-01 -0.112 0.074 0.188 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 6.98e-03 0.186 0.0681 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 1.74e-01 0.111 0.0812 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 2.22e-01 -0.148 0.121 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0156 0.0888 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 7.13e-01 0.0256 0.0696 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 1.99e-01 0.124 0.0961 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0459 0.0898 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0148 0.0859 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 3.58e-01 -0.121 0.131 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0164 0.103 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 7.77e-01 0.0255 0.0899 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0828 0.103 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 4.69e-01 0.101 0.139 0.185 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -164892 sc-eQTL 6.70e-01 0.0549 0.129 0.185 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 8.47e-03 -0.351 0.132 0.185 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 1.40e-01 -0.195 0.131 0.185 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 2.50e-01 -0.144 0.125 0.185 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 3.84e-01 -0.12 0.137 0.185 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 1.66e-02 0.319 0.131 0.185 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 1.67e-02 0.257 0.107 0.178 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 8.53e-01 0.0195 0.105 0.178 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 4.02e-01 -0.102 0.121 0.178 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 2.00e-01 -0.141 0.11 0.178 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0961 0.105 0.178 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 3.21e-01 -0.112 0.113 0.178 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 3.00e-01 0.0952 0.0917 0.183 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 1.20e-01 0.119 0.0762 0.183 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 6.58e-01 0.053 0.119 0.183 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 5.62e-01 0.0609 0.105 0.183 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 4.01e-01 0.0859 0.102 0.183 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 5.23e-01 0.0677 0.106 0.183 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 9.52e-01 0.00784 0.13 0.186 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 3.42e-01 0.12 0.126 0.186 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 5.28e-01 0.0805 0.127 0.186 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0934 0.109 0.186 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 6.64e-01 0.0566 0.13 0.186 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 8.95e-01 0.0177 0.134 0.186 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 938471 sc-eQTL 3.81e-02 -0.243 0.116 0.186 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0571 0.0846 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 7.27e-01 0.0264 0.0757 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 3.09e-01 -0.131 0.129 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 9.36e-01 0.00616 0.0761 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 7.77e-02 0.122 0.0689 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 702079 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0638 0.0893 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 7.99e-02 0.198 0.112 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 938471 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0915 0.0784 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 405704 sc-eQTL 6.45e-01 0.0543 0.118 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0901 0.0937 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 3.71e-01 0.0822 0.0916 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 4.52e-01 0.0916 0.122 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0479 0.0888 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 1.06e-01 0.147 0.0905 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 702079 sc-eQTL 1.42e-01 -0.163 0.111 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 1.48e-01 0.162 0.112 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 938471 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0366 0.0529 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 405704 sc-eQTL 1.00e+00 2.3e-05 0.115 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 5.86e-02 0.121 0.0636 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 3.86e-01 0.066 0.0759 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 1.52e-01 -0.175 0.122 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00569 0.0878 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 8.88e-01 0.00933 0.0661 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 7.78e-01 0.0259 0.0916 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 7.68e-03 0.225 0.0836 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 3.22e-01 0.0704 0.071 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 9.77e-01 0.00377 0.129 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00302 0.0961 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0349 0.0962 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 7.50e-01 0.0324 0.101 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 475591 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0217 0.0874 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -164892 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0184 0.0806 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -743655 sc-eQTL 9.61e-01 0.00431 0.0882 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -272453 sc-eQTL 5.23e-01 0.0797 0.124 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 27039 sc-eQTL 1.07e-01 -0.127 0.0786 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -37025 sc-eQTL 5.03e-01 0.0513 0.0764 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 sc-eQTL 8.86e-03 0.297 0.112 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -166846 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0904 0.125 0.179 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000169372 CRADD -272453 eQTL 0.0293 0.0368 0.0169 0.0 0.0 0.203
ENSG00000173598 NUDT4 27039 eQTL 0.0004 -0.0819 0.0231 0.0 0.0 0.203
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 eQTL 2.89e-25 0.247 0.0231 0.00512 0.0 0.203

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000169372 CRADD -272453 1.01e-06 6.81e-07 3.32e-07 7.82e-07 1.38e-07 4.11e-07 7.53e-07 1.38e-07 8.92e-07 3.85e-07 1.07e-06 5.53e-07 1.05e-06 2.72e-07 2.77e-07 4.11e-07 5.56e-07 5.67e-07 4.54e-07 4.06e-07 2.97e-07 5.69e-07 6.11e-07 2.22e-07 1.94e-06 2.9e-07 4.25e-07 5.31e-07 7.07e-07 7.39e-07 4.59e-07 1.55e-07 5.89e-08 4.04e-07 4.49e-07 1.28e-07 3.65e-07 3.15e-07 1.71e-07 4.28e-08 3.54e-07 1.13e-06 6.3e-08 8.04e-08 1.49e-07 7.5e-08 2.42e-07 7.28e-08 5.81e-08
ENSG00000173598 NUDT4 27039 1.6e-05 1.93e-05 3.3e-06 1.27e-05 4.43e-06 8.2e-06 2.7e-05 3.5e-06 1.81e-05 8.97e-06 2.06e-05 1.02e-05 2.88e-05 9.51e-06 5.19e-06 1.03e-05 9.72e-06 1.74e-05 5.45e-06 4.78e-06 8.58e-06 1.81e-05 1.85e-05 5.03e-06 3.17e-05 5.34e-06 8.03e-06 7.92e-06 2.16e-05 1.52e-05 1.25e-05 1.67e-06 1.53e-06 4.39e-06 8.64e-06 4.02e-06 1.89e-06 2.97e-06 2.99e-06 2.38e-06 1.7e-06 2.19e-05 2.66e-06 3.6e-07 1.97e-06 2.74e-06 3.36e-06 1.14e-06 1.06e-06
ENSG00000198015 MRPL42 -62566 8.39e-06 9.51e-06 1.33e-06 8.26e-06 2.42e-06 4.47e-06 1.11e-05 1.97e-06 1e-05 5.11e-06 1.07e-05 5.55e-06 1.23e-05 4.45e-06 2.36e-06 6.54e-06 3.81e-06 8.13e-06 2.69e-06 2.83e-06 5.05e-06 8.57e-06 7.99e-06 2.82e-06 1.67e-05 3.55e-06 4.74e-06 4.45e-06 1.14e-05 7.58e-06 5.65e-06 1.04e-06 1.31e-06 3.03e-06 5.39e-06 2.36e-06 1.84e-06 2.39e-06 1.57e-06 1.02e-06 1.36e-06 1.31e-05 1.39e-06 1.97e-07 7.77e-07 1.72e-06 1.93e-06 6.93e-07 4.65e-07