Genes within 1Mb (chr12:93402882:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 1.23e-02 0.152 0.0604 0.22 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00668 0.0608 0.22 B L1
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0362 0.092 0.22 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0211 0.0684 0.22 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0348 0.0603 0.22 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 700039 sc-eQTL 9.13e-01 0.00745 0.0681 0.22 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 2.85e-05 -0.387 0.0904 0.22 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 936431 sc-eQTL 8.15e-02 0.0807 0.0461 0.22 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 403664 sc-eQTL 4.00e-01 0.079 0.0936 0.22 B L1
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0076 0.0627 0.22 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -166932 sc-eQTL 9.67e-01 0.00252 0.0606 0.22 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0507 0.0635 0.22 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0967 0.104 0.22 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 2.21e-04 -0.219 0.0583 0.22 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 9.91e-02 -0.092 0.0555 0.22 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 4.82e-06 -0.434 0.0925 0.22 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0524 0.0696 0.22 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -166932 sc-eQTL 8.42e-01 -0.016 0.08 0.22 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 4.58e-01 0.0612 0.0823 0.22 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0519 0.0968 0.22 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 2.13e-03 -0.175 0.0562 0.22 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 3.75e-03 -0.206 0.0701 0.22 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 1.99e-03 -0.312 0.0997 0.22 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 2.50e-01 -0.106 0.0922 0.223 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 1.52e-01 -0.143 0.0994 0.223 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0318 0.113 0.223 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 5.08e-02 -0.181 0.0919 0.223 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 1.66e-01 0.13 0.0933 0.223 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 9.50e-02 -0.179 0.107 0.223 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 936431 sc-eQTL 2.73e-01 0.104 0.0948 0.223 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00249 0.0541 0.22 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 4.59e-04 -0.214 0.06 0.22 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 6.91e-01 0.0452 0.114 0.22 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 3.32e-04 -0.278 0.0761 0.22 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0278 0.0588 0.22 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 3.54e-03 -0.229 0.0776 0.22 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 6.75e-01 0.0324 0.0772 0.221 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -166932 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0109 0.0722 0.221 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 6.69e-01 0.0322 0.0754 0.221 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 3.58e-01 0.0996 0.108 0.221 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 3.74e-02 -0.145 0.0693 0.221 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0794 0.0691 0.221 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 3.69e-03 -0.285 0.097 0.221 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -168886 sc-eQTL 3.48e-01 0.106 0.113 0.221 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 5.14e-01 0.0634 0.097 0.22 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -166932 sc-eQTL 7.81e-01 0.0251 0.09 0.22 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 5.63e-01 0.0489 0.0844 0.22 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 3.06e-01 -0.104 0.102 0.22 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 3.68e-03 -0.21 0.0715 0.22 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 3.44e-01 0.064 0.0675 0.22 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 1.70e-01 -0.11 0.0796 0.22 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0926 0.118 0.235 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 1.74e-01 -0.136 0.0994 0.235 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 1.25e-01 0.179 0.116 0.235 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 3.63e-02 0.217 0.103 0.235 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 6.09e-01 0.0663 0.129 0.235 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 700039 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0784 0.109 0.235 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 6.97e-02 -0.227 0.125 0.235 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 936431 sc-eQTL 4.19e-01 0.0922 0.114 0.235 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 403664 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0504 0.122 0.235 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 3.26e-01 0.0917 0.0931 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00352 0.0925 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00524 0.11 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0954 0.0914 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 2.22e-01 -0.114 0.093 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 700039 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0313 0.103 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 1.31e-02 -0.28 0.112 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 936431 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00941 0.0764 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 403664 sc-eQTL 2.79e-01 -0.121 0.112 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 7.29e-01 0.0327 0.0942 0.216 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 1.15e-01 -0.14 0.0881 0.216 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 9.24e-01 0.0111 0.116 0.216 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 2.23e-01 -0.101 0.0828 0.216 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0191 0.0743 0.216 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 700039 sc-eQTL 7.36e-01 -0.032 0.0946 0.216 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 5.11e-02 -0.215 0.109 0.216 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 936431 sc-eQTL 2.68e-01 0.102 0.0916 0.216 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 403664 sc-eQTL 9.18e-01 0.0114 0.11 0.216 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 1.23e-01 0.137 0.0884 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0803 0.0922 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 9.31e-01 -0.01 0.116 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0874 0.0828 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0501 0.0892 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 700039 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0913 0.0984 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 6.25e-05 -0.405 0.0992 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 936431 sc-eQTL 1.69e-01 0.0825 0.0598 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 403664 sc-eQTL 1.78e-01 0.147 0.109 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 7.49e-01 0.0341 0.106 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00498 0.0984 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0534 0.111 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 4.50e-02 0.183 0.0908 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 2.46e-01 0.104 0.0894 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 700039 sc-eQTL 7.39e-01 0.0259 0.0778 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 1.65e-01 -0.161 0.116 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 936431 sc-eQTL 2.30e-01 0.067 0.0557 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 403664 sc-eQTL 6.13e-01 0.0564 0.112 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 4.58e-02 -0.216 0.108 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -166932 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0363 0.109 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 9.32e-01 0.00889 0.104 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 7.34e-01 -0.036 0.106 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0834 0.104 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 1.02e-01 -0.173 0.105 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0657 0.118 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 5.45e-01 0.0398 0.0657 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -166932 sc-eQTL 9.52e-01 0.00375 0.0621 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0103 0.0702 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00364 0.107 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 6.77e-05 -0.247 0.0607 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 4.75e-02 -0.119 0.0599 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 1.99e-06 -0.471 0.0963 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0368 0.0919 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -166932 sc-eQTL 9.65e-01 0.00311 0.0716 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0886 0.0848 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 3.71e-02 -0.238 0.114 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 5.24e-02 -0.139 0.0713 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0553 0.0691 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 1.22e-02 -0.263 0.104 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 6.42e-02 -0.192 0.103 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -166932 sc-eQTL 6.41e-01 0.036 0.077 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0905 0.092 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0996 0.113 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 1.31e-01 -0.135 0.0891 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 4.15e-01 -0.075 0.0919 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 1.95e-02 -0.235 0.0998 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 6.09e-01 0.0478 0.0934 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -166932 sc-eQTL 9.45e-01 0.00623 0.0907 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0846 0.0918 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0192 0.112 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0914 0.0826 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 5.02e-02 -0.188 0.0953 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 1.55e-02 -0.265 0.109 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 5.76e-02 -0.166 0.087 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -166932 sc-eQTL 8.81e-01 -0.013 0.0864 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 9.89e-01 0.00134 0.0967 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0218 0.112 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 1.85e-04 -0.285 0.0749 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 8.72e-03 -0.22 0.0831 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 9.12e-03 -0.279 0.106 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 3.41e-01 0.111 0.117 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -166932 sc-eQTL 1.29e-01 -0.152 0.0998 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 5.83e-01 0.062 0.113 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 8.96e-02 -0.202 0.118 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0478 0.0947 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 8.96e-03 -0.292 0.111 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 2.58e-01 -0.131 0.115 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 2.46e-01 0.13 0.112 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -166932 sc-eQTL 2.02e-01 0.133 0.104 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 6.09e-02 0.205 0.109 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0998 0.116 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0426 0.107 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0418 0.102 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 1.45e-01 -0.154 0.105 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00954 0.113 0.219 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -166932 sc-eQTL 2.98e-01 -0.107 0.102 0.219 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 3.41e-01 0.09 0.0944 0.219 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 3.31e-01 -0.117 0.12 0.219 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 6.90e-02 -0.158 0.0865 0.219 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 7.44e-01 0.0349 0.107 0.219 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 2.78e-01 -0.119 0.109 0.219 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 1.76e-01 -0.142 0.105 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -166932 sc-eQTL 1.00e-01 -0.161 0.0974 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0396 0.0954 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0614 0.116 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 2.06e-02 -0.238 0.102 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 2.44e-01 -0.128 0.109 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 4.50e-02 -0.218 0.108 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -168886 sc-eQTL 5.81e-01 0.0563 0.102 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 8.10e-01 -0.022 0.0912 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -166932 sc-eQTL 9.29e-01 0.00723 0.0807 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 5.70e-01 0.0499 0.0877 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 1.96e-01 0.148 0.114 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 5.54e-01 -0.048 0.081 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0352 0.0778 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 2.99e-01 -0.112 0.108 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -168886 sc-eQTL 4.83e-01 0.0779 0.111 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 4.86e-01 0.0746 0.107 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -166932 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00368 0.106 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0845 0.0963 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0931 0.118 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 2.35e-02 -0.223 0.0976 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 6.59e-01 -0.049 0.111 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 2.77e-03 -0.366 0.121 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -168886 sc-eQTL 6.29e-01 0.0484 0.0998 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 2.18e-01 0.116 0.094 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -166932 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0801 0.0899 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 1.79e-01 0.123 0.0909 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 9.94e-01 0.000751 0.102 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 9.07e-02 -0.135 0.0796 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0259 0.0922 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 1.76e-02 -0.252 0.105 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -168886 sc-eQTL 7.41e-01 0.0354 0.107 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0823 0.139 0.193 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0341 0.13 0.193 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00445 0.12 0.193 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 9.05e-01 0.0134 0.112 0.193 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 1.48e-01 -0.142 0.0975 0.193 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 700039 sc-eQTL 9.12e-01 0.0153 0.139 0.193 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 2.44e-01 -0.157 0.134 0.193 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 936431 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0136 0.107 0.193 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 403664 sc-eQTL 9.69e-01 0.00518 0.131 0.193 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 3.80e-01 0.0947 0.108 0.224 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -166932 sc-eQTL 4.65e-01 0.0723 0.0988 0.224 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 6.66e-01 0.0455 0.105 0.224 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 1.68e-01 0.142 0.102 0.224 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0836 0.0832 0.224 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00854 0.0768 0.224 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0341 0.0923 0.224 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 8.83e-02 -0.174 0.102 0.22 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -166932 sc-eQTL 4.52e-01 0.076 0.101 0.22 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 1.97e-01 -0.137 0.106 0.22 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0345 0.123 0.22 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 1.16e-01 -0.137 0.0866 0.22 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0136 0.094 0.22 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 3.35e-01 -0.114 0.118 0.22 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 9.76e-01 0.00293 0.0978 0.22 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 2.64e-01 -0.112 0.1 0.22 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00965 0.111 0.22 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 8.81e-02 -0.192 0.112 0.22 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 4.56e-01 0.0733 0.0981 0.22 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0256 0.113 0.22 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 936431 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0213 0.0686 0.22 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 6.08e-01 0.0322 0.0626 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 1.40e-03 -0.233 0.072 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 8.30e-01 0.0236 0.11 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 7.81e-04 -0.266 0.0782 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0258 0.0629 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 1.54e-03 -0.273 0.0852 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 6.66e-01 0.0347 0.0803 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 1.57e-02 -0.184 0.0757 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0341 0.118 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 1.17e-02 -0.231 0.091 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0374 0.0803 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 3.37e-02 -0.195 0.0912 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 7.20e-01 0.0486 0.135 0.212 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -166932 sc-eQTL 4.89e-01 0.0868 0.125 0.212 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0569 0.131 0.212 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0954 0.128 0.212 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 2.85e-01 -0.131 0.122 0.212 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 1.30e-02 0.33 0.131 0.212 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0846 0.13 0.212 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 2.22e-01 -0.117 0.0957 0.222 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0205 0.0934 0.222 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 1.86e-01 0.142 0.107 0.222 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0282 0.098 0.222 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 1.60e-02 0.223 0.092 0.222 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 6.91e-01 0.04 0.1 0.222 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 9.73e-01 0.0029 0.0858 0.226 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0695 0.0714 0.226 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 5.69e-01 0.0636 0.111 0.226 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 2.40e-01 -0.115 0.0976 0.226 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 1.81e-02 -0.224 0.0941 0.226 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 2.86e-01 0.106 0.0987 0.226 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 2.27e-01 -0.149 0.123 0.201 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 6.94e-01 0.0472 0.12 0.201 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 1.47e-01 -0.175 0.12 0.201 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0418 0.104 0.201 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 9.89e-02 0.203 0.122 0.201 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 1.65e-01 -0.177 0.127 0.201 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 936431 sc-eQTL 1.03e-01 0.182 0.111 0.201 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 1.97e-01 0.101 0.0783 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0519 0.0702 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 4.16e-01 0.0973 0.12 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0323 0.0707 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0042 0.0645 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 700039 sc-eQTL 9.33e-01 -0.007 0.0831 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 1.94e-04 -0.386 0.102 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 936431 sc-eQTL 2.80e-01 0.0789 0.0729 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 403664 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0765 0.109 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 1.29e-01 0.13 0.0856 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0706 0.0839 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0481 0.111 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00525 0.0813 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 8.57e-01 0.015 0.0834 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 700039 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00685 0.102 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 2.61e-04 -0.369 0.0995 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 936431 sc-eQTL 2.20e-01 0.0595 0.0484 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 403664 sc-eQTL 1.15e-01 0.166 0.105 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 9.46e-01 0.00395 0.058 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 5.88e-04 -0.233 0.0669 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 9.19e-01 0.0113 0.111 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 1.33e-04 -0.299 0.0767 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0392 0.0597 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 4.94e-04 -0.285 0.0805 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0988 0.0774 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0791 0.0648 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 2.24e-01 0.143 0.117 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0691 0.0878 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0494 0.088 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 6.93e-01 0.0367 0.0928 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 473551 sc-eQTL 5.10e-01 0.0527 0.0799 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -166932 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00557 0.0738 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -745695 sc-eQTL 8.13e-01 0.0191 0.0806 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -274493 sc-eQTL 3.36e-01 0.11 0.114 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 24999 sc-eQTL 1.51e-01 -0.104 0.072 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -39065 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0155 0.07 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 sc-eQTL 7.59e-03 -0.277 0.103 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -168886 sc-eQTL 5.37e-01 0.0709 0.115 0.222 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000173598 NUDT4 24999 eQTL 2.46e-05 -0.0899 0.0212 0.0 0.0 0.242
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 eQTL 2.69e-17 -0.188 0.0218 0.0 0.0 0.242


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000198015 MRPL42 -64606 1.63e-05 2.22e-05 3.51e-06 1.15e-05 3.78e-06 8.67e-06 2.88e-05 3.42e-06 2.07e-05 1.02e-05 2.71e-05 1.01e-05 3.51e-05 8.97e-06 5.38e-06 1.17e-05 9.88e-06 1.74e-05 5.8e-06 4.45e-06 9.16e-06 2.08e-05 2.15e-05 6.06e-06 3.21e-05 5.51e-06 8.36e-06 8.79e-06 2.07e-05 1.64e-05 1.34e-05 1.61e-06 1.91e-06 5.41e-06 7.79e-06 4.37e-06 2.05e-06 2.73e-06 3.25e-06 2.18e-06 1.63e-06 2.7e-05 2.69e-06 3.62e-07 1.91e-06 2.7e-06 3.18e-06 1.24e-06 9.75e-07
ENSG00000258035 \N -783162 5.85e-07 3.12e-07 8.55e-08 3.57e-07 1.07e-07 2.54e-07 5.28e-07 8.11e-08 2.66e-07 1.78e-07 4.97e-07 3.68e-07 6.77e-07 1.07e-07 2.86e-07 1.92e-07 1.01e-07 3.58e-07 2.65e-07 8.31e-08 1.89e-07 2.76e-07 2.56e-07 3.83e-08 6.18e-07 2.32e-07 1.87e-07 1.97e-07 2.57e-07 5.56e-07 1.95e-07 5.08e-08 5.64e-08 1.52e-07 3.3e-07 7.68e-08 1.08e-07 6.67e-08 5.4e-08 7.92e-08 5.39e-08 3.43e-07 3.55e-08 1.3e-07 5.49e-08 1.5e-08 9.1e-08 1.28e-08 4.83e-08