Genes within 1Mb (chr12:93389222:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0445 0.0546 0.216 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 7.83e-01 0.0149 0.0542 0.216 B L1
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 1.75e-01 -0.111 0.0817 0.216 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 5.01e-01 0.0411 0.0609 0.216 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 1.34e-01 -0.0806 0.0535 0.216 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 686379 sc-eQTL 5.16e-01 0.0395 0.0607 0.216 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 3.72e-15 0.616 0.0725 0.216 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 922771 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0217 0.0414 0.216 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 390004 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00802 0.0836 0.216 B L1
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 8.63e-01 -0.00985 0.0568 0.216 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -180592 sc-eQTL 2.93e-01 0.0577 0.0548 0.216 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 4.42e-01 0.0443 0.0576 0.216 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 9.83e-01 0.00199 0.0945 0.216 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 4.46e-01 0.0416 0.0545 0.216 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0339 0.0506 0.216 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 8.81e-18 0.695 0.0739 0.216 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 1.27e-01 0.0975 0.0636 0.216 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -180592 sc-eQTL 7.34e-01 -0.025 0.0735 0.216 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 1.80e-01 0.101 0.0753 0.216 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0672 0.0889 0.216 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 7.49e-01 0.0169 0.0528 0.216 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 9.60e-01 -0.0033 0.0657 0.216 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 6.82e-12 0.609 0.0837 0.216 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 2.05e-01 0.107 0.0838 0.212 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 2.55e-01 -0.103 0.0906 0.212 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 6.56e-01 0.0457 0.103 0.212 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 3.19e-01 0.084 0.0841 0.212 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 9.26e-01 0.00797 0.0852 0.212 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 2.32e-04 0.355 0.0946 0.212 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 922771 sc-eQTL 4.60e-01 -0.064 0.0864 0.212 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0174 0.0497 0.216 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00467 0.0567 0.216 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0179 0.104 0.216 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 5.83e-01 0.0395 0.0719 0.216 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0203 0.054 0.216 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 5.23e-09 0.408 0.067 0.216 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 3.81e-01 -0.061 0.0696 0.215 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -180592 sc-eQTL 9.66e-01 0.00277 0.0651 0.215 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 2.57e-01 0.0771 0.0678 0.215 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 4.32e-01 0.0768 0.0975 0.215 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 5.59e-01 -0.037 0.0631 0.215 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0607 0.0624 0.215 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 9.44e-06 0.387 0.0852 0.215 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -182546 sc-eQTL 9.15e-01 0.0109 0.102 0.215 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 5.27e-01 0.057 0.0899 0.216 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -180592 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0755 0.0832 0.216 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 4.90e-01 -0.054 0.0781 0.216 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 1.94e-01 0.123 0.0942 0.216 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0347 0.0675 0.216 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 9.92e-01 0.000652 0.0626 0.216 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 6.80e-03 0.199 0.0728 0.216 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 7.60e-01 0.0333 0.109 0.209 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 6.25e-01 0.045 0.0918 0.209 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0943 0.108 0.209 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 1.80e-01 -0.128 0.0955 0.209 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 9.09e-02 0.201 0.118 0.209 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 686379 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0903 0.1 0.209 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 1.10e-02 0.291 0.113 0.209 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 922771 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0232 0.105 0.209 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 390004 sc-eQTL 2.78e-02 -0.245 0.11 0.209 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0971 0.0833 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 9.93e-02 -0.136 0.0822 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0407 0.0983 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0521 0.0819 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 1.47e-01 -0.121 0.0831 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 686379 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0286 0.0925 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 1.12e-05 0.437 0.0972 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 922771 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0388 0.0684 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 390004 sc-eQTL 7.56e-01 0.0313 0.1 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 1.84e-01 -0.112 0.0839 0.216 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 8.37e-01 0.0163 0.0792 0.216 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 4.92e-01 0.0712 0.104 0.216 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 7.14e-01 0.0273 0.0743 0.216 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 5.56e-02 -0.127 0.0659 0.216 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 686379 sc-eQTL 6.11e-01 0.0431 0.0846 0.216 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 1.84e-01 0.131 0.0983 0.216 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 922771 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0688 0.082 0.216 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 390004 sc-eQTL 1.20e-01 0.153 0.0981 0.216 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00847 0.0787 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 8.44e-01 0.0161 0.0817 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 9.17e-02 -0.173 0.102 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 6.72e-02 0.134 0.0728 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 1.73e-01 -0.108 0.0786 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 686379 sc-eQTL 2.99e-01 0.0905 0.087 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 3.31e-11 0.575 0.0821 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 922771 sc-eQTL 1.41e-01 -0.078 0.0528 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 390004 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0742 0.0965 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0812 0.0943 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 2.60e-01 0.0982 0.087 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0643 0.0982 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 3.10e-02 -0.174 0.0803 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 5.52e-02 -0.152 0.0788 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 686379 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0325 0.069 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 1.21e-06 0.487 0.0974 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 922771 sc-eQTL 3.67e-01 0.0447 0.0494 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 390004 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0705 0.0988 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 3.92e-01 0.0848 0.0989 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -180592 sc-eQTL 3.04e-01 0.102 0.0995 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0969 0.0949 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00524 0.0965 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0671 0.0944 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00793 0.0965 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 4.21e-01 0.0868 0.108 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 7.45e-01 0.0194 0.0596 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -180592 sc-eQTL 5.07e-01 0.0374 0.0562 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 7.68e-01 0.0188 0.0636 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0508 0.0971 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 6.02e-01 0.0298 0.057 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0131 0.0548 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 8.70e-16 0.687 0.0789 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 5.74e-01 0.0462 0.0821 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -180592 sc-eQTL 6.15e-01 0.0323 0.064 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 1.80e-01 0.102 0.0757 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 6.29e-01 0.0497 0.102 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 7.44e-01 0.0211 0.0643 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0465 0.0617 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 1.19e-12 0.633 0.0837 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 7.82e-01 0.0259 0.0934 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -180592 sc-eQTL 1.70e-01 0.0945 0.0687 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0273 0.0827 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 4.67e-01 0.0741 0.102 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 5.79e-01 0.0446 0.0802 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 4.31e-01 -0.065 0.0824 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 2.56e-03 0.271 0.0887 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 6.36e-01 0.0399 0.0841 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -180592 sc-eQTL 7.90e-01 0.0218 0.0817 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 3.12e-01 0.0839 0.0827 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0686 0.101 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 3.62e-01 0.068 0.0745 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0723 0.0865 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 5.35e-04 0.34 0.0965 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 3.21e-03 0.234 0.0783 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -180592 sc-eQTL 7.14e-01 0.0289 0.0787 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 1.75e-01 0.119 0.0878 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 3.21e-01 -0.101 0.102 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00605 0.0706 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 3.98e-01 0.0651 0.0769 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 6.09e-09 0.55 0.0907 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 4.58e-02 -0.205 0.102 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -180592 sc-eQTL 4.09e-01 0.0729 0.0881 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 1.11e-01 0.158 0.0986 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 6.10e-01 0.0536 0.105 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0727 0.0832 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 7.32e-01 0.0339 0.0991 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 1.35e-03 0.322 0.0989 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0284 0.103 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -180592 sc-eQTL 1.89e-01 -0.125 0.0949 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 4.07e-01 0.0832 0.1 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00855 0.106 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 6.31e-02 0.181 0.097 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0564 0.0935 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 2.89e-04 0.346 0.0937 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 8.12e-01 0.0236 0.0992 0.219 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -180592 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0677 0.0902 0.219 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 6.31e-02 -0.154 0.0824 0.219 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 6.26e-01 0.0515 0.106 0.219 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0857 0.0765 0.219 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 9.26e-01 0.0088 0.0941 0.219 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 1.85e-02 0.225 0.0948 0.219 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 3.20e-01 -0.097 0.0973 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -180592 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000603 0.0911 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 4.16e-01 0.0722 0.0885 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 2.18e-01 0.133 0.107 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 2.59e-01 0.108 0.0958 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0306 0.102 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 5.24e-03 0.281 0.0996 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -182546 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0216 0.0947 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0166 0.0824 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -180592 sc-eQTL 6.11e-01 0.0371 0.0729 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 2.34e-01 0.0944 0.0791 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 3.27e-01 0.101 0.103 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 9.37e-02 -0.123 0.0728 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0472 0.0703 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 1.02e-02 0.249 0.096 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -182546 sc-eQTL 6.01e-01 0.0525 0.1 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 4.77e-01 0.0679 0.0952 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -180592 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0675 0.094 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 3.18e-01 0.0859 0.0858 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 8.70e-01 0.0172 0.105 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0518 0.088 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0377 0.0987 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 2.35e-04 0.399 0.106 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -182546 sc-eQTL 9.02e-01 -0.011 0.089 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 1.33e-01 -0.128 0.0848 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -180592 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0123 0.0814 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0325 0.0825 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 4.79e-01 0.0654 0.0921 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 9.04e-01 0.00871 0.0725 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 1.57e-01 -0.118 0.083 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 1.37e-02 0.237 0.0952 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -182546 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0082 0.0966 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0297 0.119 0.233 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 7.87e-01 0.0302 0.111 0.233 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 5.61e-02 0.195 0.101 0.233 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 7.96e-01 0.0248 0.096 0.233 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 8.91e-01 0.0116 0.0846 0.233 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 686379 sc-eQTL 7.53e-01 0.0376 0.119 0.233 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 2.63e-01 0.13 0.116 0.233 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 922771 sc-eQTL 2.59e-01 0.104 0.0915 0.233 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 390004 sc-eQTL 2.38e-01 -0.133 0.112 0.233 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0465 0.0998 0.215 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -180592 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0966 0.0913 0.215 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 5.25e-01 0.062 0.0974 0.215 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0749 0.095 0.215 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 8.48e-01 0.0148 0.0772 0.215 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0391 0.0711 0.215 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 5.00e-01 0.0577 0.0853 0.215 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0576 0.0886 0.216 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -180592 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0794 0.0872 0.216 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 3.59e-01 0.0845 0.092 0.216 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0356 0.106 0.216 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 9.26e-01 0.00699 0.0754 0.216 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 6.82e-01 0.0334 0.0813 0.216 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 8.73e-07 0.49 0.0966 0.216 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 2.67e-02 0.195 0.0875 0.215 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 4.52e-02 -0.182 0.0901 0.215 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0492 0.101 0.215 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 2.93e-01 0.108 0.102 0.215 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 4.98e-01 0.0604 0.0889 0.215 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 1.00e-02 0.261 0.1 0.215 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 922771 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00397 0.0622 0.215 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0308 0.057 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0207 0.0671 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 5.92e-01 0.0536 0.0998 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00495 0.0731 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 1.57e-01 -0.081 0.057 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 3.70e-05 0.322 0.0763 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 8.33e-01 0.0155 0.0736 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00821 0.0703 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 7.89e-01 0.0288 0.108 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 2.98e-01 0.0881 0.0844 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 3.02e-01 0.076 0.0734 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 1.91e-07 0.427 0.0792 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 3.69e-01 0.107 0.119 0.203 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -180592 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0591 0.11 0.203 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 9.10e-01 0.0131 0.115 0.203 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 4.60e-01 0.0836 0.113 0.203 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 2.26e-01 0.13 0.107 0.203 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 2.47e-01 -0.136 0.117 0.203 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 3.99e-01 0.0968 0.114 0.203 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0221 0.0895 0.216 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 8.42e-01 0.0174 0.0871 0.216 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0159 0.1 0.216 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 2.77e-01 0.0993 0.0911 0.216 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 4.21e-01 0.07 0.0868 0.216 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 5.19e-02 0.181 0.0928 0.216 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 5.88e-01 0.0423 0.078 0.215 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 7.94e-01 0.017 0.0651 0.215 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0751 0.101 0.215 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0851 0.0889 0.215 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0416 0.0868 0.215 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 2.91e-03 0.265 0.0881 0.215 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0803 0.112 0.22 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0912 0.108 0.22 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 8.68e-01 0.0183 0.109 0.22 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0513 0.094 0.22 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 3.17e-01 -0.112 0.111 0.22 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 4.10e-03 0.327 0.112 0.22 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 922771 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0438 0.101 0.22 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0709 0.0693 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0412 0.0621 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 2.92e-01 -0.111 0.105 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0235 0.0625 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 2.68e-02 -0.126 0.0563 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 686379 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0289 0.0734 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 2.83e-06 0.424 0.0881 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 922771 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0567 0.0644 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 390004 sc-eQTL 4.83e-01 0.0678 0.0966 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0331 0.0762 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 5.85e-01 0.0406 0.0744 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 1.30e-01 -0.149 0.0982 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 6.83e-01 0.0294 0.072 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 5.13e-02 -0.143 0.0732 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 686379 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0169 0.0902 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 5.11e-15 0.663 0.0786 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 922771 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0151 0.043 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 390004 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0973 0.0932 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000306 0.0528 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0139 0.0625 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 5.36e-01 0.0624 0.101 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 5.70e-01 0.041 0.0722 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00381 0.0544 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 1.44e-08 0.412 0.0698 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 9.61e-01 0.00349 0.071 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 7.94e-01 0.0155 0.0594 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 2.09e-01 -0.135 0.107 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 8.10e-01 0.0193 0.0803 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 8.73e-01 0.0129 0.0804 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 1.53e-03 0.266 0.0827 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 459891 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0574 0.0712 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -180592 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0133 0.0658 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -759355 sc-eQTL 1.61e-01 0.101 0.0716 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -288153 sc-eQTL 3.96e-01 0.0863 0.101 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 11339 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0572 0.0644 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -52725 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0637 0.0622 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 sc-eQTL 1.72e-05 0.392 0.0891 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -182546 sc-eQTL 8.81e-01 0.0153 0.102 0.213 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 eQTL 2.39e-29 0.261 0.0224 0.0 0.0 0.213


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000187510 \N 686379 2.95e-07 1.42e-07 5.35e-08 2.05e-07 1.03e-07 8.21e-08 1.81e-07 5.62e-08 1.44e-07 6.75e-08 1.62e-07 1.15e-07 1.87e-07 7.64e-08 5.82e-08 7.89e-08 4.31e-08 1.64e-07 6.92e-08 4.92e-08 1.25e-07 1.31e-07 1.58e-07 2.68e-08 1.85e-07 1.26e-07 1.12e-07 1.04e-07 1.31e-07 1.05e-07 1.06e-07 3.99e-08 3.59e-08 9.3e-08 3.52e-08 2.69e-08 5.42e-08 8.63e-08 6.67e-08 3.6e-08 5.28e-08 1.59e-07 5.24e-08 7.72e-09 3.41e-08 1.8e-08 1e-07 1.89e-09 4.81e-08
ENSG00000198015 MRPL42 -78266 5.61e-06 5.76e-06 5.93e-07 3.39e-06 1.66e-06 1.56e-06 8.05e-06 1.24e-06 4.65e-06 3.09e-06 7.6e-06 2.83e-06 9.98e-06 2.07e-06 9.49e-07 3.93e-06 2.72e-06 3.74e-06 1.62e-06 1.63e-06 2.73e-06 6.28e-06 4.76e-06 1.99e-06 8.96e-06 2.2e-06 2.75e-06 1.75e-06 5.98e-06 6.77e-06 3.25e-06 4.82e-07 8.41e-07 2.5e-06 2.03e-06 1.59e-06 1.23e-06 5.55e-07 1.35e-06 7.61e-07 8.23e-07 8.22e-06 6.14e-07 1.67e-07 7.74e-07 1.1e-06 9.99e-07 6.81e-07 5.81e-07