Genes within 1Mb (chr12:93386518:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0417 0.0545 0.22 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 7.46e-01 0.0175 0.0541 0.22 B L1
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 1.67e-01 -0.113 0.0816 0.22 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 5.38e-01 0.0376 0.0609 0.22 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 7.91e-02 -0.0941 0.0534 0.22 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 683675 sc-eQTL 4.85e-01 0.0424 0.0606 0.22 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 1.45e-14 0.603 0.0729 0.22 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 920067 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0287 0.0413 0.22 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 387300 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00484 0.0835 0.22 B L1
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0154 0.057 0.22 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -183296 sc-eQTL 1.93e-01 0.0716 0.0549 0.22 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 4.06e-01 0.048 0.0577 0.22 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0111 0.0948 0.22 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 3.97e-01 0.0463 0.0546 0.22 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0356 0.0507 0.22 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 8.24e-17 0.68 0.0749 0.22 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 1.19e-01 0.0997 0.0637 0.22 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -183296 sc-eQTL 9.66e-01 0.0031 0.0736 0.22 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 1.16e-01 0.119 0.0753 0.22 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0742 0.089 0.22 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 6.72e-01 0.0224 0.0528 0.22 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0161 0.0658 0.22 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 1.41e-10 0.574 0.085 0.22 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 1.57e-01 0.119 0.0836 0.216 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 1.69e-01 -0.125 0.0903 0.216 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 8.86e-01 0.0147 0.102 0.216 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 3.66e-01 0.0761 0.0841 0.216 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 9.02e-01 0.0105 0.0851 0.216 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 3.70e-04 0.343 0.0947 0.216 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 920067 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0647 0.0862 0.216 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0111 0.0497 0.22 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 8.46e-01 -0.011 0.0567 0.22 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0163 0.104 0.22 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 5.35e-01 0.0447 0.0719 0.22 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0208 0.054 0.22 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 1.54e-08 0.397 0.0674 0.22 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0579 0.0697 0.219 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -183296 sc-eQTL 6.38e-01 0.0307 0.0652 0.219 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 3.09e-01 0.0693 0.068 0.219 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 4.25e-01 0.0781 0.0977 0.219 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0369 0.0633 0.219 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0514 0.0626 0.219 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 9.44e-06 0.388 0.0854 0.219 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -185250 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00194 0.102 0.219 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 5.32e-01 0.0562 0.0898 0.22 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -183296 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0469 0.0832 0.22 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0476 0.0781 0.22 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 1.94e-01 0.123 0.0941 0.22 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0293 0.0675 0.22 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 9.56e-01 0.00344 0.0626 0.22 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 6.07e-03 0.202 0.0727 0.22 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 8.66e-01 0.0184 0.109 0.214 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 5.49e-01 0.055 0.0916 0.214 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0816 0.107 0.214 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 1.97e-01 -0.123 0.0953 0.214 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 7.98e-02 0.208 0.118 0.214 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 683675 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0816 0.1 0.214 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 8.99e-03 0.299 0.113 0.214 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 920067 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0478 0.104 0.214 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 387300 sc-eQTL 3.56e-02 -0.234 0.11 0.214 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 1.15e-01 -0.131 0.083 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 9.93e-02 -0.136 0.0822 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0144 0.0983 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0698 0.0818 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 1.02e-01 -0.136 0.0829 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 683675 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0497 0.0924 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 1.41e-05 0.432 0.0972 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 920067 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0429 0.0683 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 387300 sc-eQTL 6.66e-01 0.0434 0.1 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 1.74e-01 -0.114 0.0839 0.22 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00643 0.0793 0.22 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 4.68e-01 0.0754 0.104 0.22 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 9.10e-01 0.00843 0.0743 0.22 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 4.53e-02 -0.133 0.0658 0.22 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 683675 sc-eQTL 5.02e-01 0.0568 0.0846 0.22 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 1.85e-01 0.131 0.0984 0.22 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 920067 sc-eQTL 2.18e-01 -0.101 0.0819 0.22 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 387300 sc-eQTL 1.27e-01 0.15 0.0982 0.22 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 9.40e-01 0.00594 0.0786 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 8.94e-01 0.0109 0.0817 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 6.92e-02 -0.186 0.102 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 9.10e-02 0.124 0.0729 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 1.28e-01 -0.12 0.0785 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 683675 sc-eQTL 1.96e-01 0.113 0.0868 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 7.86e-11 0.565 0.0824 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 920067 sc-eQTL 1.12e-01 -0.0843 0.0528 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 387300 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0795 0.0965 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0826 0.0943 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 2.09e-01 0.11 0.087 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0627 0.0982 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 1.78e-02 -0.192 0.0802 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 2.86e-02 -0.173 0.0786 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 683675 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0427 0.069 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 1.83e-06 0.48 0.0977 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 920067 sc-eQTL 5.54e-01 0.0294 0.0495 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 387300 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0777 0.0988 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 3.72e-01 0.088 0.0983 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -183296 sc-eQTL 2.77e-01 0.108 0.0989 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0829 0.0943 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0226 0.0959 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 6.17e-01 -0.047 0.0939 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00984 0.0959 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 4.09e-01 0.0885 0.107 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 8.38e-01 0.0122 0.0597 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -183296 sc-eQTL 3.62e-01 0.0514 0.0563 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 7.47e-01 0.0206 0.0638 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0588 0.0973 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 5.85e-01 0.0313 0.0572 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0106 0.0549 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 6.59e-15 0.671 0.0798 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 6.73e-01 0.0348 0.0824 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -183296 sc-eQTL 4.91e-01 0.0442 0.0641 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 1.70e-01 0.105 0.0759 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 6.93e-01 0.0406 0.103 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 6.72e-01 0.0273 0.0645 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0547 0.0619 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 1.06e-12 0.636 0.0839 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 6.34e-01 0.0446 0.0935 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -183296 sc-eQTL 1.04e-01 0.112 0.0687 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0161 0.0828 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 5.38e-01 0.0628 0.102 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 5.89e-01 0.0435 0.0803 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0652 0.0825 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 4.08e-03 0.258 0.089 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 8.44e-01 0.0167 0.0844 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -183296 sc-eQTL 7.60e-01 0.0251 0.0819 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 2.84e-01 0.089 0.0829 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 3.02e-01 -0.104 0.101 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 2.11e-01 0.0937 0.0746 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0602 0.0868 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 1.52e-03 0.313 0.0973 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 2.41e-03 0.24 0.0782 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -183296 sc-eQTL 5.55e-01 0.0465 0.0786 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 1.31e-01 0.133 0.0876 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 3.41e-01 -0.097 0.102 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 9.62e-01 0.00335 0.0705 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 4.50e-01 0.0582 0.0768 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 2.39e-08 0.529 0.0912 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 8.44e-02 -0.177 0.102 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -183296 sc-eQTL 2.77e-01 0.0961 0.0882 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 1.09e-01 0.159 0.0987 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 7.74e-01 0.0302 0.105 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0725 0.0833 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 7.76e-01 0.0283 0.0993 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 2.20e-03 0.308 0.0993 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0315 0.103 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -183296 sc-eQTL 2.79e-01 -0.103 0.0953 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 4.33e-01 0.0789 0.1 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0261 0.107 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 5.21e-02 0.19 0.0972 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0432 0.0938 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 8.30e-04 0.321 0.0944 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 9.43e-01 0.00715 0.0994 0.223 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -183296 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0306 0.0905 0.223 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 7.17e-02 -0.15 0.0827 0.223 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 6.41e-01 0.0495 0.106 0.223 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0828 0.0767 0.223 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 7.38e-01 0.0316 0.0943 0.223 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 1.49e-02 0.233 0.095 0.223 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0913 0.0973 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -183296 sc-eQTL 6.71e-01 0.0387 0.091 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 3.84e-01 0.0772 0.0885 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 2.07e-01 0.136 0.107 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 2.92e-01 0.101 0.0957 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0264 0.102 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 5.69e-03 0.278 0.0996 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -185250 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0142 0.0946 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0103 0.0827 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -183296 sc-eQTL 5.38e-01 0.0451 0.0732 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 5.38e-01 0.0491 0.0796 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 2.92e-01 0.109 0.103 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 8.52e-02 -0.126 0.073 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0415 0.0706 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 8.63e-03 0.255 0.0962 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -185250 sc-eQTL 7.43e-01 0.033 0.101 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 4.55e-01 0.0713 0.0953 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -183296 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0643 0.0941 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 2.88e-01 0.0914 0.0858 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 8.45e-01 0.0206 0.105 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0481 0.0881 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0296 0.0987 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 2.41e-04 0.398 0.106 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -185250 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0177 0.0891 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 1.91e-01 -0.112 0.0851 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -183296 sc-eQTL 8.63e-01 0.0141 0.0815 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0191 0.0827 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 4.63e-01 0.0678 0.0922 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 8.96e-01 0.00951 0.0726 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 1.71e-01 -0.114 0.0831 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 1.32e-02 0.238 0.0954 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -185250 sc-eQTL 9.86e-01 0.00173 0.0968 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 1.00e+00 -5.86e-05 0.119 0.241 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 9.02e-01 0.0137 0.111 0.241 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 3.44e-02 0.215 0.1 0.241 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 5.76e-01 0.0537 0.0955 0.241 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 7.50e-01 0.0269 0.0842 0.241 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 683675 sc-eQTL 6.71e-01 0.0506 0.119 0.241 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 3.51e-01 0.108 0.115 0.241 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 920067 sc-eQTL 2.83e-01 0.0984 0.0912 0.241 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 387300 sc-eQTL 2.87e-01 -0.12 0.112 0.241 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 6.73e-01 -0.042 0.0996 0.22 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -183296 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0856 0.0912 0.22 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 4.70e-01 0.0702 0.0971 0.22 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0888 0.0947 0.22 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 9.21e-01 0.0076 0.077 0.22 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0467 0.0709 0.22 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 6.08e-01 0.0437 0.0852 0.22 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0562 0.0886 0.22 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -183296 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0728 0.0873 0.22 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 2.67e-01 0.102 0.0919 0.22 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 6.73e-01 -0.045 0.106 0.22 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 9.44e-01 0.00534 0.0754 0.22 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 6.19e-01 0.0405 0.0813 0.22 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 7.40e-07 0.493 0.0966 0.22 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 3.13e-02 0.19 0.0875 0.22 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 2.26e-02 -0.207 0.0899 0.22 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0814 0.101 0.22 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 3.01e-01 0.106 0.102 0.22 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 4.45e-01 0.068 0.0889 0.22 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 8.55e-03 0.266 0.1 0.22 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 920067 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0066 0.0622 0.22 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0184 0.057 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0241 0.0671 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 6.36e-01 0.0472 0.0997 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00173 0.073 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 1.19e-01 -0.0891 0.0569 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 7.70e-05 0.308 0.0765 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 9.69e-01 0.00284 0.0735 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000774 0.0703 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 7.61e-01 0.0327 0.108 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 2.99e-01 0.0879 0.0844 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 2.29e-01 0.0884 0.0733 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 1.45e-07 0.43 0.079 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 3.70e-01 0.107 0.119 0.206 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -183296 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0591 0.11 0.206 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 9.59e-01 0.00601 0.115 0.206 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 4.47e-01 0.0863 0.113 0.206 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 2.20e-01 0.132 0.107 0.206 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 3.01e-01 -0.122 0.117 0.206 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 3.60e-01 0.105 0.115 0.206 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00785 0.0893 0.22 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 9.36e-01 0.00699 0.0868 0.22 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00309 0.1 0.22 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 2.67e-01 0.101 0.0908 0.22 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 4.03e-01 0.0726 0.0866 0.22 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 5.63e-02 0.178 0.0925 0.22 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 5.57e-01 0.0458 0.078 0.219 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 9.98e-01 0.000187 0.0651 0.219 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0799 0.101 0.219 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0844 0.0889 0.219 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0298 0.0868 0.219 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 3.31e-03 0.262 0.0881 0.219 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0737 0.112 0.223 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0866 0.108 0.223 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 9.40e-01 0.00828 0.11 0.223 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0432 0.0942 0.223 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 3.04e-01 -0.115 0.111 0.223 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 5.99e-03 0.314 0.113 0.223 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 920067 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0401 0.101 0.223 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0859 0.0692 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0375 0.0621 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 3.43e-01 -0.1 0.106 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0245 0.0625 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 3.09e-02 -0.122 0.0563 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 683675 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0264 0.0734 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 3.08e-06 0.423 0.0882 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 920067 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0629 0.0644 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 387300 sc-eQTL 4.10e-01 0.0797 0.0966 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0249 0.0761 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 5.93e-01 0.0398 0.0743 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 9.93e-02 -0.162 0.098 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 8.38e-01 0.0147 0.072 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 3.08e-02 -0.159 0.073 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 683675 sc-eQTL 9.71e-01 0.00328 0.0902 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 1.81e-14 0.651 0.079 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 920067 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0218 0.0429 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 387300 sc-eQTL 2.65e-01 -0.104 0.0931 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 9.40e-01 0.00396 0.0528 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0155 0.0625 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 5.62e-01 0.0584 0.101 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 5.43e-01 0.0439 0.0721 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00733 0.0544 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 2.99e-08 0.403 0.07 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 8.11e-01 0.017 0.0709 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00509 0.0593 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 2.43e-01 -0.125 0.107 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 7.72e-01 0.0233 0.0801 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 7.57e-01 0.0249 0.0802 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 2.03e-03 0.259 0.0827 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 457187 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0507 0.0714 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -183296 sc-eQTL 8.82e-01 0.00981 0.0659 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -762059 sc-eQTL 2.43e-01 0.0841 0.0718 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -290857 sc-eQTL 3.97e-01 0.0864 0.102 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 8635 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0497 0.0645 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -55429 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0546 0.0624 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 sc-eQTL 1.48e-05 0.396 0.0893 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -185250 sc-eQTL 9.43e-01 0.00734 0.103 0.218 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 eQTL 5.17e-27 0.247 0.0222 0.0 0.0 0.22


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000177889 \N -55429 9.14e-06 9.4e-06 1.54e-06 5.14e-06 2.52e-06 4.42e-06 1.16e-05 2.04e-06 9.65e-06 5.11e-06 1.24e-05 5.56e-06 1.46e-05 3.63e-06 2.21e-06 6.34e-06 4.62e-06 7.74e-06 2.61e-06 2.78e-06 5.45e-06 9.62e-06 8.25e-06 3.24e-06 1.58e-05 3.51e-06 4.93e-06 3.91e-06 1.09e-05 8.46e-06 5.65e-06 1.09e-06 1.25e-06 3.07e-06 4.59e-06 2.51e-06 1.72e-06 1.87e-06 1.6e-06 1.03e-06 9.45e-07 1.28e-05 1.38e-06 1.9e-07 7.94e-07 1.63e-06 1.78e-06 7.15e-07 4.71e-07
ENSG00000187510 \N 683675 5.59e-07 2.5e-07 8.67e-08 2.53e-07 1.03e-07 1.32e-07 4.14e-07 7.12e-08 2.35e-07 1.39e-07 3.66e-07 2.11e-07 4.27e-07 8.55e-08 7.35e-08 1.33e-07 8.74e-08 2.87e-07 9.19e-08 8.25e-08 1.48e-07 2.45e-07 2.56e-07 4.91e-08 5.15e-07 1.86e-07 1.74e-07 1.67e-07 2.13e-07 2e-07 1.86e-07 5.38e-08 5.55e-08 1.02e-07 1.97e-07 5.14e-08 6.39e-08 5.8e-08 4.74e-08 7.65e-08 1.01e-07 2.9e-07 3.59e-08 2.09e-08 8.01e-08 1.01e-08 9.52e-08 3.25e-09 4.59e-08
ENSG00000198015 MRPL42 -80970 6.57e-06 7.52e-06 9.83e-07 3.5e-06 1.85e-06 2.96e-06 9.71e-06 1.28e-06 5.22e-06 3.55e-06 8.89e-06 3.84e-06 1.07e-05 3.42e-06 9.51e-07 4.62e-06 3.63e-06 3.86e-06 1.72e-06 1.92e-06 3.42e-06 7.51e-06 5.57e-06 2.06e-06 1.12e-05 2.12e-06 3.58e-06 2.09e-06 7.04e-06 7.15e-06 3.88e-06 5.67e-07 8.21e-07 2.5e-06 2.59e-06 1.56e-06 1.11e-06 9.57e-07 9.96e-07 8.57e-07 9.74e-07 8.17e-06 9.28e-07 1.59e-07 7.34e-07 1.1e-06 9.07e-07 6.09e-07 6e-07