Genes within 1Mb (chr12:93375841:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 7.36e-01 0.0252 0.0747 0.115 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0162 0.074 0.115 B L1
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 7.90e-02 -0.196 0.111 0.115 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 2.12e-01 0.104 0.083 0.115 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 3.64e-02 -0.153 0.0728 0.115 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 672998 sc-eQTL 2.53e-01 0.0948 0.0827 0.115 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 9.26e-07 0.548 0.108 0.115 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 909390 sc-eQTL 1.45e-01 -0.0823 0.0563 0.115 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 376623 sc-eQTL 3.90e-01 0.0981 0.114 0.115 B L1
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0123 0.0765 0.115 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -193973 sc-eQTL 1.54e-01 0.105 0.0737 0.115 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 3.17e-01 0.0778 0.0775 0.115 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 6.93e-01 0.0503 0.127 0.115 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 3.47e-01 0.0692 0.0734 0.115 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 7.04e-01 0.0259 0.0682 0.115 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 2.42e-08 0.639 0.11 0.115 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0178 0.0873 0.115 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -193973 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0115 0.1 0.115 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00532 0.103 0.115 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 4.96e-01 0.0827 0.121 0.115 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 4.21e-01 0.058 0.0719 0.115 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 4.88e-01 0.0622 0.0896 0.115 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 3.83e-05 0.516 0.123 0.115 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 3.06e-01 0.119 0.117 0.115 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 2.04e-01 -0.16 0.126 0.115 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 6.25e-01 0.0697 0.142 0.115 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 1.02e-01 0.191 0.116 0.115 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 7.13e-01 0.0436 0.118 0.115 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 9.00e-03 0.352 0.134 0.115 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 909390 sc-eQTL 2.25e-01 -0.145 0.12 0.115 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 9.10e-01 0.00785 0.0693 0.115 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0474 0.0791 0.115 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0272 0.146 0.115 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 4.97e-01 0.0682 0.1 0.115 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00168 0.0754 0.115 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 6.66e-06 0.447 0.0967 0.115 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0693 0.0977 0.114 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -193973 sc-eQTL 3.22e-01 0.0906 0.0912 0.114 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 9.89e-01 0.0013 0.0955 0.114 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0326 0.137 0.114 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0386 0.0886 0.114 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0834 0.0876 0.114 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 9.81e-04 0.408 0.122 0.114 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -195927 sc-eQTL 9.49e-01 0.00906 0.143 0.114 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 5.56e-01 0.0726 0.123 0.115 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -193973 sc-eQTL 2.82e-01 0.123 0.114 0.115 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 5.71e-01 0.0607 0.107 0.115 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 4.26e-02 0.261 0.128 0.115 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 9.76e-01 0.00279 0.0924 0.115 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0131 0.0857 0.115 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 3.04e-02 0.219 0.1 0.115 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 2.61e-01 0.165 0.146 0.11 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 3.36e-01 0.119 0.123 0.11 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 1.24e-01 -0.222 0.144 0.11 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 8.16e-01 -0.03 0.129 0.11 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 2.30e-01 0.192 0.159 0.11 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 672998 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0216 0.135 0.11 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 2.00e-02 0.359 0.153 0.11 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 909390 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0766 0.141 0.11 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 376623 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0984 0.15 0.11 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 3.22e-01 -0.113 0.113 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 7.61e-02 -0.199 0.112 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 4.39e-01 -0.104 0.133 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 4.23e-01 0.0894 0.111 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 1.01e-01 -0.186 0.113 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 672998 sc-eQTL 9.32e-01 0.0107 0.126 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 5.55e-04 0.471 0.134 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 909390 sc-eQTL 8.67e-01 0.0156 0.093 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 376623 sc-eQTL 2.44e-01 0.159 0.136 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000483 0.116 0.116 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 8.89e-01 0.0153 0.109 0.116 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0373 0.143 0.116 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 3.87e-01 0.0886 0.102 0.116 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 2.07e-02 -0.211 0.0905 0.116 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 672998 sc-eQTL 4.03e-01 0.0977 0.117 0.116 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 7.14e-01 0.0499 0.136 0.116 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 909390 sc-eQTL 2.21e-02 -0.258 0.112 0.116 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 376623 sc-eQTL 2.16e-01 0.168 0.136 0.116 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 6.13e-01 0.0552 0.109 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0443 0.113 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 3.03e-01 -0.147 0.142 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 3.39e-02 0.215 0.101 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 1.89e-01 -0.144 0.109 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 672998 sc-eQTL 3.37e-02 0.256 0.12 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 2.68e-05 0.52 0.121 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 909390 sc-eQTL 6.11e-02 -0.137 0.073 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 376623 sc-eQTL 6.17e-01 -0.067 0.134 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0728 0.132 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 8.23e-02 0.211 0.121 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0739 0.137 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 3.30e-01 -0.11 0.113 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 7.52e-03 -0.294 0.109 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 672998 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0139 0.0962 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 9.72e-04 0.468 0.14 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 909390 sc-eQTL 6.75e-01 -0.029 0.069 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 376623 sc-eQTL 4.26e-01 -0.11 0.138 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0286 0.135 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -193973 sc-eQTL 4.01e-01 0.114 0.136 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0382 0.13 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 3.20e-02 -0.281 0.13 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00887 0.129 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 6.04e-01 0.0684 0.132 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0242 0.147 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 7.00e-01 0.031 0.0804 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -193973 sc-eQTL 2.41e-01 0.089 0.0757 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 5.68e-01 0.0491 0.0858 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 4.11e-01 0.108 0.131 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 2.05e-01 0.0976 0.0767 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 3.53e-01 0.0686 0.0738 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 5.27e-07 0.605 0.117 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 8.64e-01 0.0191 0.112 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -193973 sc-eQTL 2.95e-01 0.091 0.0867 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 1.03e-01 0.168 0.103 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 9.94e-01 0.00105 0.139 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 4.03e-01 0.0731 0.0872 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0136 0.084 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 2.29e-07 0.644 0.12 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 3.23e-01 0.128 0.129 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -193973 sc-eQTL 8.80e-02 0.163 0.0951 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 7.14e-01 0.0421 0.115 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 4.71e-02 0.279 0.14 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 7.74e-01 -0.032 0.111 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 2.27e-01 -0.138 0.114 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 1.10e-01 0.2 0.125 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0601 0.117 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -193973 sc-eQTL 6.29e-01 0.0547 0.113 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 9.36e-01 0.00923 0.115 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0113 0.14 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 8.27e-02 0.179 0.103 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 6.49e-01 0.0546 0.12 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 6.18e-02 0.256 0.137 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 2.66e-01 0.12 0.108 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -193973 sc-eQTL 6.64e-01 0.0463 0.106 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 6.94e-01 0.0469 0.119 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 4.54e-01 0.103 0.138 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 8.72e-01 0.0153 0.0954 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 1.61e-01 0.146 0.104 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 2.40e-04 0.481 0.129 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 9.89e-02 -0.233 0.14 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -193973 sc-eQTL 2.58e-01 0.137 0.121 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 1.88e-01 0.179 0.136 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 5.26e-01 0.0914 0.144 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 7.60e-01 -0.035 0.114 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 8.68e-02 0.233 0.135 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 1.26e-01 0.213 0.139 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 4.18e-01 -0.11 0.136 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -193973 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0967 0.126 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0361 0.133 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0309 0.141 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 3.90e-01 0.112 0.13 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0647 0.124 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 6.15e-03 0.349 0.126 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 8.29e-01 0.0298 0.138 0.117 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -193973 sc-eQTL 3.90e-01 0.108 0.125 0.117 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0684 0.115 0.117 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 3.78e-01 0.129 0.147 0.117 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0482 0.107 0.117 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 7.42e-01 0.0431 0.131 0.117 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 1.72e-02 0.317 0.132 0.117 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 8.29e-01 0.0283 0.131 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -193973 sc-eQTL 9.73e-02 0.203 0.122 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 1.97e-01 0.154 0.119 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 7.48e-02 0.258 0.144 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 7.72e-01 0.0375 0.129 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 5.74e-01 0.0773 0.137 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 1.33e-01 0.205 0.136 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -195927 sc-eQTL 9.97e-01 0.000549 0.127 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00271 0.116 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -193973 sc-eQTL 5.23e-01 0.0658 0.103 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00818 0.112 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 7.37e-01 0.049 0.146 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 1.17e-01 -0.161 0.103 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 8.24e-01 0.0221 0.0992 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 2.02e-02 0.318 0.136 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -195927 sc-eQTL 7.82e-01 0.0392 0.141 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0306 0.132 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -193973 sc-eQTL 9.88e-02 0.214 0.129 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 2.03e-01 0.151 0.118 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 4.04e-01 -0.122 0.145 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 9.13e-01 0.0133 0.122 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 4.25e-01 0.109 0.136 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 2.83e-04 0.544 0.147 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -195927 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00967 0.123 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 2.38e-01 -0.14 0.119 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -193973 sc-eQTL 3.82e-01 0.0993 0.113 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 7.33e-01 0.0393 0.115 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 9.54e-01 0.00748 0.129 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 5.76e-01 0.0566 0.101 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 7.82e-02 -0.204 0.115 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 4.32e-02 0.271 0.133 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -195927 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00613 0.135 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0376 0.169 0.115 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 6.11e-01 0.0806 0.158 0.115 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 1.62e-01 0.203 0.145 0.115 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0692 0.136 0.115 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 7.18e-01 0.0435 0.12 0.115 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 672998 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0452 0.169 0.115 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 1.36e-01 0.245 0.163 0.115 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 909390 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0476 0.131 0.115 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 376623 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0905 0.16 0.115 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 2.86e-01 -0.147 0.137 0.115 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -193973 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0707 0.126 0.115 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0173 0.134 0.115 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 6.43e-01 0.0607 0.131 0.115 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 6.44e-01 0.0491 0.106 0.115 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 2.72e-01 -0.107 0.0976 0.115 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0197 0.118 0.115 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0584 0.121 0.115 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -193973 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0474 0.119 0.115 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 5.10e-01 0.083 0.126 0.115 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 2.98e-01 -0.151 0.145 0.115 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 2.60e-01 -0.116 0.103 0.115 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 3.35e-01 0.107 0.111 0.115 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 4.19e-06 0.628 0.133 0.115 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 2.50e-01 0.142 0.123 0.115 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 4.61e-02 -0.252 0.126 0.115 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 8.87e-01 0.02 0.14 0.115 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 1.02e-01 0.233 0.142 0.115 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 5.75e-01 0.0697 0.124 0.115 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 7.89e-02 0.249 0.141 0.115 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 909390 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0723 0.0865 0.115 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 7.02e-01 -0.031 0.0808 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0474 0.095 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 3.38e-01 0.135 0.141 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 3.97e-01 0.0877 0.103 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0543 0.0811 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 1.17e-04 0.426 0.109 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 9.45e-01 0.00728 0.105 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 7.35e-01 0.034 0.1 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 8.71e-01 -0.025 0.154 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 3.69e-01 0.109 0.12 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 4.23e-01 0.0843 0.105 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 2.99e-04 0.429 0.117 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 1.58e-01 0.234 0.165 0.118 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -193973 sc-eQTL 9.48e-01 0.01 0.154 0.118 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 8.09e-01 0.0389 0.161 0.118 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 7.33e-01 0.0539 0.158 0.118 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 1.23e-01 0.231 0.149 0.118 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00361 0.164 0.118 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 1.54e-01 0.227 0.159 0.118 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0387 0.127 0.111 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0695 0.124 0.111 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 9.40e-01 0.0108 0.142 0.111 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 8.33e-01 0.0274 0.13 0.111 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0427 0.123 0.111 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 4.19e-01 0.107 0.133 0.111 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0568 0.108 0.113 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0258 0.0904 0.113 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0461 0.141 0.113 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 2.85e-01 -0.132 0.123 0.113 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 7.77e-01 0.0342 0.121 0.113 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 4.83e-01 0.0877 0.125 0.113 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 9.95e-01 0.000971 0.152 0.119 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 1.72e-01 -0.2 0.146 0.119 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 5.83e-01 0.0815 0.148 0.119 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 5.85e-01 0.0698 0.127 0.119 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 9.92e-01 0.00158 0.151 0.119 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 3.16e-02 0.334 0.154 0.119 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 909390 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0749 0.137 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0171 0.0967 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0922 0.0862 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 4.76e-02 -0.291 0.146 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 4.42e-01 0.0669 0.0868 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 1.13e-02 -0.2 0.0781 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 672998 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00778 0.102 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 5.81e-03 0.354 0.127 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 909390 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0877 0.0896 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 376623 sc-eQTL 7.62e-02 0.238 0.134 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 6.03e-01 0.055 0.106 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 6.31e-01 0.0497 0.103 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 2.95e-01 -0.143 0.137 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 1.89e-01 0.131 0.0995 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 1.87e-02 -0.24 0.101 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 672998 sc-eQTL 2.00e-01 0.16 0.125 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 1.19e-06 0.597 0.119 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 909390 sc-eQTL 1.52e-01 -0.0852 0.0593 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 376623 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0659 0.13 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00328 0.0747 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0137 0.0885 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 5.52e-01 0.0851 0.143 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 2.42e-01 0.12 0.102 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 8.21e-01 0.0174 0.077 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 4.60e-06 0.478 0.102 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 8.92e-01 0.0136 0.1 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0858 0.0835 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0979 0.151 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0433 0.113 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 9.43e-01 0.00816 0.113 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 1.84e-01 0.159 0.119 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 446510 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0757 0.1 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -193973 sc-eQTL 3.61e-01 0.0847 0.0925 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -772736 sc-eQTL 9.33e-01 0.00849 0.101 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -301534 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0916 0.143 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -2042 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0367 0.0908 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -66106 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0885 0.0877 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 sc-eQTL 4.53e-04 0.454 0.127 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -195927 sc-eQTL 9.13e-01 0.0158 0.144 0.112 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000120833 SOCS2 -193973 eQTL 0.0452 0.0792 0.0395 0.00104 0.0 0.109
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 eQTL 1.42e-13 0.23 0.0306 0.0 0.0 0.109
ENSG00000257345 LINC02413 376623 eQTL 0.0312 -0.13 0.0605 0.0015 0.0 0.109


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136040 \N -772736 1.01e-06 9e-07 3.27e-07 1.27e-06 9.33e-08 2.95e-07 6.18e-07 1.37e-07 1.14e-06 3.64e-07 1.19e-06 5.97e-07 2.46e-06 3e-07 4.35e-07 3.79e-07 7.96e-07 5.27e-07 5.07e-07 6.55e-07 3.6e-07 9.57e-07 5.67e-07 3.59e-07 1.66e-06 2.6e-07 4.16e-07 7.22e-07 4.15e-07 8.47e-07 6.76e-07 2.55e-07 1.76e-07 8.18e-07 5.17e-07 4.45e-07 8.96e-07 3.16e-07 5.08e-07 3.15e-07 2.89e-07 9.58e-07 3.44e-07 1.74e-07 1.99e-07 2.47e-07 1.24e-07 2.25e-07 2.46e-07
ENSG00000198015 MRPL42 -91647 1.12e-05 1.51e-05 3.64e-06 1.21e-05 2.96e-06 5.69e-06 1.65e-05 2.48e-06 2.01e-05 8.5e-06 1.99e-05 8.28e-06 3.56e-05 7.27e-06 4.49e-06 9.51e-06 1.05e-05 1.22e-05 4.18e-06 4.26e-06 8.43e-06 1.73e-05 1.33e-05 4.8e-06 2.35e-05 5e-06 7.54e-06 8.03e-06 1.45e-05 1.19e-05 1.28e-05 1.59e-06 1.43e-06 5.15e-06 7.21e-06 4.55e-06 2.77e-06 2.49e-06 3.25e-06 2.3e-06 1.67e-06 1.93e-05 2.14e-06 3.05e-07 1.85e-06 2.58e-06 2.32e-06 1.24e-06 1.01e-06