logo

Genes within 1Mb (chr12:93364007:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0694 0.0834 0.096 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 7.53e-01 0.0261 0.0828 0.096 B L1
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 4.49e-02 -0.251 0.124 0.096 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 8.05e-01 0.023 0.0932 0.096 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 5.66e-02 -0.156 0.0815 0.096 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 661164 sc-eQTL 3.90e-01 0.0798 0.0926 0.096 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 3.09e-07 0.638 0.121 0.096 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 897556 sc-eQTL 1.11e-01 -0.101 0.0629 0.096 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 364789 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00645 0.128 0.096 B L1
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 1.62e-01 -0.121 0.0862 0.096 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -205807 sc-eQTL 8.47e-02 0.144 0.0831 0.096 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 4.39e-01 0.068 0.0878 0.096 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00837 0.144 0.096 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0395 0.0831 0.096 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000798 0.0772 0.096 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 6.74e-08 0.701 0.125 0.096 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 3.06e-01 -0.101 0.0979 0.096 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -205807 sc-eQTL 7.87e-01 0.0305 0.113 0.096 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00412 0.116 0.096 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 2.62e-01 0.153 0.136 0.096 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 6.88e-01 0.0326 0.0809 0.096 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 8.05e-01 0.0249 0.101 0.096 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 1.87e-04 0.528 0.139 0.096 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 2.91e-01 0.138 0.13 0.097 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 2.28e-01 -0.17 0.14 0.097 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 4.30e-01 0.125 0.159 0.097 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 1.08e-01 0.209 0.13 0.097 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0543 0.132 0.097 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 5.78e-02 0.287 0.15 0.097 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 897556 sc-eQTL 1.68e-01 -0.184 0.133 0.097 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0198 0.0771 0.096 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 8.81e-01 0.0132 0.0881 0.096 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0695 0.162 0.096 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 3.58e-01 0.103 0.112 0.096 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 7.12e-01 -0.031 0.0838 0.096 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 1.35e-05 0.481 0.108 0.096 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 4.57e-01 -0.082 0.11 0.097 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -205807 sc-eQTL 5.44e-01 0.0625 0.103 0.097 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 9.74e-01 0.00346 0.108 0.097 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 4.92e-01 -0.106 0.154 0.097 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0904 0.0997 0.097 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 6.48e-02 -0.182 0.098 0.097 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 8.47e-03 0.369 0.139 0.097 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -207761 sc-eQTL 4.92e-01 -0.111 0.161 0.097 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0314 0.139 0.096 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -205807 sc-eQTL 5.66e-01 0.0739 0.129 0.096 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 3.54e-01 0.112 0.12 0.096 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 2.04e-02 0.337 0.144 0.096 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0587 0.104 0.096 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0117 0.0966 0.096 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 1.05e-02 0.291 0.113 0.096 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 2.53e-01 0.184 0.16 0.094 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 3.44e-01 0.128 0.135 0.094 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 1.49e-01 -0.229 0.158 0.094 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 9.21e-01 0.014 0.141 0.094 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 1.33e-01 0.263 0.174 0.094 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 661164 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0786 0.148 0.094 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 4.58e-02 0.338 0.168 0.094 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 897556 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0849 0.154 0.094 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 364789 sc-eQTL 4.49e-01 -0.125 0.165 0.094 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 1.20e-01 -0.199 0.127 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 3.14e-01 -0.128 0.127 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0918 0.151 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0277 0.126 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 2.57e-01 -0.145 0.128 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 661164 sc-eQTL 8.33e-01 0.0299 0.142 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 6.92e-04 0.523 0.152 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 897556 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0871 0.105 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 364789 sc-eQTL 5.18e-01 0.0995 0.154 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 9.78e-01 0.00358 0.13 0.097 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0271 0.122 0.097 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0361 0.16 0.097 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 9.30e-01 0.01 0.114 0.097 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 2.66e-02 -0.226 0.101 0.097 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 661164 sc-eQTL 2.21e-01 0.16 0.13 0.097 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 7.23e-01 0.0541 0.152 0.097 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 897556 sc-eQTL 2.66e-02 -0.279 0.125 0.097 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 364789 sc-eQTL 3.42e-01 0.145 0.152 0.097 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0635 0.123 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0293 0.128 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 6.13e-02 -0.299 0.159 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 1.16e-01 0.18 0.114 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 8.39e-02 -0.213 0.123 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 661164 sc-eQTL 4.23e-02 0.276 0.135 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 1.22e-04 0.539 0.138 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 897556 sc-eQTL 1.14e-01 -0.131 0.0826 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 364789 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0481 0.151 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 2.30e-01 -0.178 0.148 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 7.58e-03 0.364 0.135 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0116 0.155 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 2.10e-01 -0.16 0.127 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 1.58e-01 -0.176 0.124 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 661164 sc-eQTL 9.15e-01 0.0116 0.109 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 5.28e-04 0.555 0.158 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 897556 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0151 0.0779 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 364789 sc-eQTL 2.12e-01 -0.194 0.155 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0667 0.153 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -205807 sc-eQTL 5.55e-01 0.0907 0.154 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 7.58e-01 0.0452 0.146 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 1.86e-01 -0.196 0.148 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0109 0.146 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 5.06e-01 0.0989 0.148 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0384 0.166 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0583 0.0909 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -205807 sc-eQTL 9.19e-02 0.144 0.0853 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 8.19e-01 0.0222 0.0971 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 7.86e-01 0.0403 0.148 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0394 0.0871 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 8.19e-01 0.0191 0.0836 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 1.57e-06 0.657 0.133 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 2.84e-01 -0.135 0.126 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -205807 sc-eQTL 1.07e-01 0.158 0.0976 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 1.50e-01 0.168 0.116 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0295 0.157 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0483 0.0986 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 7.13e-01 0.0349 0.0948 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 6.09e-07 0.702 0.136 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00232 0.145 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -205807 sc-eQTL 2.30e-01 0.129 0.107 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 4.86e-01 0.0898 0.129 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 5.44e-01 0.0962 0.158 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 5.49e-01 -0.075 0.125 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 7.04e-02 -0.232 0.127 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 1.52e-01 0.202 0.14 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0649 0.131 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -205807 sc-eQTL 6.42e-01 0.0594 0.127 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 7.03e-01 0.0493 0.129 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 8.09e-01 0.0381 0.157 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 1.39e-01 0.172 0.116 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0179 0.135 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 8.04e-02 0.27 0.154 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0524 0.121 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -205807 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0603 0.12 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 9.08e-01 0.0156 0.134 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 7.15e-01 0.0566 0.155 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0408 0.107 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 2.14e-01 0.145 0.117 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 2.92e-04 0.533 0.145 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 1.96e-01 -0.205 0.158 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -205807 sc-eQTL 4.31e-01 0.107 0.136 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 1.52e-01 0.219 0.152 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 2.68e-01 0.179 0.161 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0316 0.129 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 2.34e-01 0.182 0.153 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 4.14e-01 0.128 0.157 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0677 0.153 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -205807 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0136 0.142 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0863 0.15 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0609 0.159 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00602 0.146 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 9.47e-01 0.00931 0.14 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 7.00e-03 0.387 0.142 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 5.07e-01 -0.102 0.154 0.097 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -205807 sc-eQTL 8.48e-01 0.027 0.141 0.097 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0667 0.129 0.097 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 6.00e-01 0.0862 0.164 0.097 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0513 0.119 0.097 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0694 0.146 0.097 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 2.66e-02 0.33 0.148 0.097 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 8.51e-01 -0.028 0.149 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -205807 sc-eQTL 7.89e-02 0.243 0.138 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 9.08e-02 0.228 0.134 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 3.19e-02 0.351 0.162 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00124 0.146 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 8.20e-01 0.0353 0.155 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 2.32e-01 0.185 0.154 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -207761 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0678 0.144 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0144 0.13 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -205807 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00995 0.115 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 5.99e-01 -0.066 0.125 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 8.27e-01 0.0358 0.163 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 4.71e-02 -0.229 0.115 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0412 0.111 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 1.12e-01 0.245 0.153 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -207761 sc-eQTL 5.20e-01 -0.102 0.158 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 4.63e-01 -0.11 0.149 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -205807 sc-eQTL 5.28e-01 0.0928 0.147 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 5.44e-01 0.0817 0.134 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 2.91e-01 -0.174 0.164 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 6.11e-01 0.0702 0.138 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 7.05e-01 0.0584 0.154 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 1.12e-03 0.554 0.168 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -207761 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0657 0.139 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 2.58e-01 -0.152 0.134 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -205807 sc-eQTL 3.35e-01 0.123 0.128 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 6.33e-01 0.0621 0.13 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0775 0.145 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0138 0.114 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 3.57e-02 -0.274 0.13 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 1.27e-01 0.231 0.151 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -207761 sc-eQTL 8.72e-01 0.0245 0.152 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 2.90e-01 -0.196 0.185 0.096 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 4.27e-01 0.138 0.173 0.096 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 3.69e-01 0.144 0.159 0.096 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 8.67e-01 0.0251 0.149 0.096 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 6.47e-01 0.0604 0.131 0.096 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 661164 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0827 0.185 0.096 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 3.25e-01 0.178 0.18 0.096 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 897556 sc-eQTL 4.06e-01 -0.119 0.143 0.096 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 364789 sc-eQTL 9.08e-01 0.0203 0.175 0.096 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 2.74e-01 -0.173 0.158 0.096 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -205807 sc-eQTL 9.11e-01 0.0163 0.145 0.096 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 9.88e-01 0.00233 0.155 0.096 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 7.91e-01 0.04 0.151 0.096 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 4.59e-01 0.0906 0.122 0.096 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0375 0.113 0.096 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 5.71e-01 0.0768 0.135 0.096 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 4.43e-01 -0.104 0.135 0.096 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -205807 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0726 0.133 0.096 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 9.15e-01 0.0149 0.141 0.096 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0799 0.162 0.096 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 1.62e-01 -0.161 0.114 0.096 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 1.92e-01 0.162 0.124 0.096 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 8.42e-06 0.68 0.149 0.096 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 4.49e-01 0.105 0.138 0.1 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 1.89e-01 -0.186 0.141 0.1 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 8.96e-01 0.0205 0.157 0.1 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 1.73e-01 0.217 0.159 0.1 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0793 0.139 0.1 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 4.19e-01 0.129 0.159 0.1 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 897556 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0852 0.0967 0.1 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 9.37e-01 0.00709 0.0889 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 9.04e-01 0.0126 0.105 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 4.30e-01 0.123 0.155 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 3.08e-01 0.116 0.114 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0933 0.0891 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 1.04e-05 0.534 0.118 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0464 0.116 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 2.90e-01 0.117 0.111 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 2.92e-01 -0.179 0.169 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 3.87e-01 0.115 0.133 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 5.75e-01 0.0651 0.116 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 1.17e-03 0.427 0.13 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 2.30e-01 0.231 0.192 0.1 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -205807 sc-eQTL 6.70e-01 0.0762 0.178 0.1 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 6.16e-01 0.0937 0.187 0.1 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 9.26e-02 0.307 0.181 0.1 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 8.40e-01 0.0352 0.174 0.1 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 5.24e-01 0.122 0.19 0.1 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 4.07e-01 0.154 0.185 0.1 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 2.71e-01 -0.157 0.142 0.096 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 2.17e-01 -0.171 0.138 0.096 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 9.28e-01 0.0145 0.16 0.096 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 6.20e-01 0.0722 0.145 0.096 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 8.62e-01 0.0241 0.138 0.096 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 2.85e-01 0.159 0.149 0.096 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 7.76e-01 -0.035 0.123 0.095 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 7.04e-01 -0.039 0.102 0.095 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00392 0.159 0.095 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 3.60e-01 -0.128 0.14 0.095 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0478 0.137 0.095 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 6.04e-01 0.0735 0.141 0.095 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0357 0.172 0.099 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 7.35e-02 -0.296 0.164 0.099 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 4.80e-01 0.119 0.168 0.099 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 5.82e-01 0.0798 0.145 0.099 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 9.16e-01 0.0182 0.172 0.099 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 3.56e-02 0.371 0.175 0.099 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 897556 sc-eQTL 6.39e-01 -0.073 0.155 0.099 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 3.69e-01 -0.097 0.108 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0855 0.0963 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 6.60e-02 -0.301 0.163 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0442 0.097 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 5.22e-02 -0.171 0.0877 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 661164 sc-eQTL 8.29e-01 0.0246 0.114 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 3.93e-03 0.412 0.141 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 897556 sc-eQTL 1.10e-01 -0.16 0.0996 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 364789 sc-eQTL 2.76e-01 0.164 0.15 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0657 0.119 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 2.37e-01 0.138 0.116 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 1.34e-01 -0.231 0.154 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 4.05e-01 0.094 0.112 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 4.55e-02 -0.23 0.114 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 661164 sc-eQTL 1.92e-01 0.184 0.141 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 1.72e-06 0.663 0.135 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 897556 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0794 0.067 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 364789 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0878 0.146 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 9.63e-01 0.00386 0.0822 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 6.23e-01 0.048 0.0973 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 9.43e-01 0.0113 0.157 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 1.61e-01 0.157 0.112 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00714 0.0847 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 1.84e-06 0.546 0.111 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00259 0.113 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 1.77e-01 -0.127 0.0939 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0582 0.17 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0672 0.127 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0462 0.128 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 2.14e-01 0.167 0.134 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 434676 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0854 0.113 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -205807 sc-eQTL 6.86e-01 0.0423 0.104 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -784570 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0114 0.114 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -313368 sc-eQTL 2.69e-01 -0.178 0.161 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -13876 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0964 0.102 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -77940 sc-eQTL 7.61e-02 -0.175 0.0982 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 sc-eQTL 4.75e-03 0.414 0.145 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -207761 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0805 0.162 0.097 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000120833 SOCS2 -205807 eQTL 0.00648 0.118 0.0433 0.00249 0.00126 0.0888
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 eQTL 1.53e-12 0.242 0.0337 0.0 0.0 0.0888
ENSG00000257345 LINC02413 364789 eQTL 0.0142 -0.163 0.0664 0.00235 0.0 0.0888

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000198015 MRPL42 -103481 4.04e-05 1.28e-05 1.89e-06 8.12e-06 2.4e-06 7.76e-06 1.61e-05 2.04e-06 1.14e-05 5.43e-06 1.23e-05 5.78e-06 1.74e-05 4.76e-06 3.41e-06 8.62e-06 4.98e-06 9.78e-06 3.55e-06 2.76e-06 6.18e-06 1.14e-05 1.12e-05 3.27e-06 2.14e-05 3.36e-06 7.46e-06 4.41e-06 1.22e-05 8.96e-06 5.42e-06 7.97e-07 1.17e-06 3.64e-06 5.32e-06 2.07e-06 1.27e-06 1.09e-06 1.61e-06 9.95e-07 8.99e-07 1.7e-05 2.8e-06 1.5e-07 8.89e-07 1.64e-06 1.74e-06 8.28e-07 5.05e-07