Genes within 1Mb (chr12:93362499:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0233 0.0644 0.203 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 6.92e-01 0.0253 0.0638 0.203 B L1
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 8.40e-01 0.0195 0.0966 0.203 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 3.17e-02 -0.154 0.0711 0.203 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 2.16e-02 0.145 0.0626 0.203 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 659656 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0476 0.0715 0.203 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0382 0.0989 0.203 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 896048 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00608 0.0488 0.203 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 363281 sc-eQTL 2.71e-01 0.108 0.0982 0.203 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 998667 sc-eQTL 8.48e-02 0.166 0.0959 0.203 B L1
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 8.77e-01 0.0105 0.0674 0.203 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -207315 sc-eQTL 3.05e-01 0.0669 0.065 0.203 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 6.52e-01 0.0309 0.0684 0.203 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 4.48e-01 0.0852 0.112 0.203 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0753 0.0645 0.203 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00594 0.0601 0.203 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0737 0.104 0.203 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 4.64e-02 -0.148 0.074 0.203 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -207315 sc-eQTL 4.53e-01 0.0644 0.0856 0.203 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 9.98e-01 0.000258 0.0883 0.203 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 3.18e-02 0.222 0.103 0.203 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0604 0.0615 0.203 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 7.57e-01 0.0238 0.0767 0.203 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0712 0.109 0.203 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0982 0.0972 0.2 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 3.83e-01 0.0918 0.105 0.2 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 4.59e-01 0.088 0.119 0.2 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0416 0.0977 0.2 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0796 0.0985 0.2 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 6.76e-02 -0.207 0.112 0.2 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 896048 sc-eQTL 3.78e-02 -0.207 0.0991 0.2 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 998667 sc-eQTL 1.71e-01 0.141 0.103 0.2 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0167 0.0586 0.203 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 9.35e-01 0.00543 0.0669 0.203 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00625 0.123 0.203 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 6.84e-01 0.0345 0.0849 0.203 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0339 0.0637 0.203 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 5.55e-02 -0.164 0.085 0.203 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0793 0.0822 0.204 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -207315 sc-eQTL 1.48e-01 -0.111 0.0766 0.204 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0511 0.0803 0.204 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 3.35e-01 -0.111 0.115 0.204 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0571 0.0746 0.204 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 2.08e-01 0.0929 0.0736 0.204 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 2.27e-02 0.239 0.104 0.204 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -209269 sc-eQTL 7.41e-02 -0.214 0.119 0.204 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 4.33e-01 -0.082 0.104 0.203 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -207315 sc-eQTL 8.93e-01 0.0131 0.0969 0.203 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 8.70e-01 0.0148 0.0909 0.203 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 9.87e-01 0.00177 0.11 0.203 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0209 0.0785 0.203 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0584 0.0727 0.203 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00775 0.0861 0.203 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 5.79e-02 0.227 0.119 0.209 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0454 0.101 0.209 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 2.43e-01 0.139 0.118 0.209 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 4.86e-01 0.0737 0.106 0.209 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 3.26e-01 -0.129 0.131 0.209 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 659656 sc-eQTL 2.23e-01 0.135 0.11 0.209 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 1.74e-01 0.173 0.127 0.209 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 896048 sc-eQTL 9.19e-01 0.0118 0.115 0.209 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 363281 sc-eQTL 3.59e-01 0.113 0.123 0.209 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 998667 sc-eQTL 5.76e-01 0.0573 0.102 0.209 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 4.18e-01 0.0793 0.0976 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 4.60e-01 0.0716 0.0968 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0143 0.115 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0444 0.096 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 1.62e-02 0.234 0.0964 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 659656 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0741 0.108 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0488 0.119 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 896048 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0236 0.0801 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 363281 sc-eQTL 6.58e-01 0.0521 0.117 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 998667 sc-eQTL 4.01e-01 0.0948 0.113 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 9.11e-01 0.0111 0.0995 0.203 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 5.45e-01 0.0567 0.0935 0.203 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 4.69e-02 -0.243 0.121 0.203 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00426 0.0878 0.203 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 1.77e-01 0.106 0.0782 0.203 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 659656 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00887 0.1 0.203 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00982 0.117 0.203 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 896048 sc-eQTL 3.03e-01 0.0999 0.0968 0.203 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 363281 sc-eQTL 1.36e-01 0.173 0.116 0.203 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 998667 sc-eQTL 4.85e-01 0.0765 0.109 0.203 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 9.40e-02 -0.159 0.0944 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 2.71e-01 0.109 0.0984 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 2.07e-01 0.156 0.123 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 2.47e-03 -0.266 0.0868 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 9.55e-02 0.159 0.0947 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 659656 sc-eQTL 5.54e-02 -0.201 0.104 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 8.12e-01 0.0262 0.11 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 896048 sc-eQTL 5.64e-01 0.0371 0.0641 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 363281 sc-eQTL 6.16e-01 0.0585 0.117 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 998667 sc-eQTL 2.40e-01 0.123 0.105 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 3.48e-01 0.107 0.114 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0883 0.106 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 3.67e-01 -0.108 0.119 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 2.91e-01 -0.104 0.0982 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 1.09e-01 0.154 0.0958 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 659656 sc-eQTL 3.04e-01 0.0859 0.0835 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 3.75e-01 -0.111 0.125 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 896048 sc-eQTL 6.73e-01 0.0253 0.06 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 363281 sc-eQTL 7.93e-01 0.0315 0.12 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 998667 sc-eQTL 3.17e-01 0.112 0.112 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 8.07e-01 0.0276 0.113 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -207315 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0222 0.113 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 4.24e-02 0.219 0.107 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 6.92e-03 0.294 0.108 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 4.20e-02 -0.218 0.106 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 3.31e-01 0.107 0.109 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 9.56e-01 0.00684 0.123 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0231 0.0705 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -207315 sc-eQTL 1.95e-01 0.0864 0.0664 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0208 0.0753 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0142 0.115 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 7.92e-01 0.0179 0.0676 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 5.61e-01 0.0378 0.0648 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0755 0.109 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 6.61e-02 -0.179 0.0969 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -207315 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00795 0.0761 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 3.37e-01 0.0868 0.0901 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 7.79e-01 0.0342 0.122 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 4.67e-02 -0.152 0.0757 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 3.01e-01 -0.076 0.0733 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 1.99e-01 -0.144 0.112 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 5.43e-01 0.0675 0.111 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -207315 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0448 0.0819 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 5.87e-01 0.0533 0.0981 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0121 0.121 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 1.76e-01 -0.129 0.0949 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 4.27e-01 0.0779 0.0978 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 5.94e-01 0.0574 0.108 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0699 0.0993 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -207315 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0292 0.0965 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 4.88e-01 0.0679 0.0978 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 1.85e-01 0.158 0.118 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0564 0.0881 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 6.45e-01 0.0471 0.102 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 3.56e-01 0.108 0.117 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 1.95e-02 -0.213 0.0905 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -207315 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0271 0.0903 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0239 0.101 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 1.62e-01 0.164 0.116 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 9.09e-01 0.00922 0.0809 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 4.54e-01 0.0661 0.0882 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0681 0.113 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 4.55e-01 0.0904 0.121 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -207315 sc-eQTL 4.16e-02 -0.211 0.103 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0805 0.117 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 1.77e-01 0.166 0.123 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 4.88e-01 -0.068 0.0979 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 6.27e-01 0.0567 0.117 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0943 0.119 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 6.55e-01 0.0539 0.12 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -207315 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0196 0.112 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00309 0.118 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 4.79e-01 0.0883 0.125 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 2.80e-01 -0.124 0.115 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0267 0.11 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 2.96e-01 -0.119 0.113 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 2.51e-01 -0.135 0.117 0.201 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -207315 sc-eQTL 2.41e-01 0.125 0.106 0.201 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 5.99e-01 0.0518 0.0983 0.201 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 4.76e-02 0.247 0.124 0.201 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0359 0.0907 0.201 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0257 0.111 0.201 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 9.21e-01 0.0113 0.114 0.201 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0422 0.112 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -207315 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0101 0.104 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 3.76e-01 -0.09 0.101 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 2.89e-01 -0.131 0.123 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0274 0.11 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 4.25e-02 0.236 0.116 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0698 0.116 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -209269 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0287 0.108 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 3.51e-01 -0.091 0.0973 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -207315 sc-eQTL 8.73e-02 -0.147 0.0857 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0781 0.0937 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0931 0.122 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0306 0.0866 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0135 0.0832 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 7.16e-03 0.308 0.113 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -209269 sc-eQTL 1.72e-01 -0.162 0.118 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 3.28e-01 -0.111 0.113 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -207315 sc-eQTL 1.01e-01 0.184 0.112 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0782 0.102 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 7.51e-01 -0.04 0.126 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0752 0.105 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 3.34e-02 0.249 0.116 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 4.50e-01 0.0992 0.131 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -209269 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00866 0.106 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 6.70e-01 0.043 0.101 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -207315 sc-eQTL 1.41e-01 -0.141 0.0957 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 9.17e-01 0.0102 0.0975 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0747 0.109 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00914 0.0856 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 6.01e-01 0.0515 0.0984 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 4.11e-02 0.232 0.113 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -209269 sc-eQTL 6.32e-02 -0.211 0.113 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 5.06e-01 0.099 0.148 0.174 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 4.23e-01 0.111 0.138 0.174 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 1.39e-01 -0.189 0.127 0.174 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 2.80e-01 -0.129 0.119 0.174 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 2.90e-01 0.112 0.105 0.174 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 659656 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0699 0.148 0.174 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 3.99e-01 0.122 0.144 0.174 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 896048 sc-eQTL 3.86e-01 0.0995 0.114 0.174 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 363281 sc-eQTL 7.81e-01 0.0392 0.14 0.174 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 998667 sc-eQTL 5.56e-01 0.0827 0.14 0.174 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0143 0.117 0.204 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -207315 sc-eQTL 9.70e-01 0.00409 0.108 0.204 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 3.29e-01 -0.112 0.114 0.204 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 4.64e-01 -0.082 0.112 0.204 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 1.09e-01 0.145 0.0902 0.204 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 8.27e-01 0.0183 0.0836 0.204 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 8.61e-01 0.0176 0.1 0.204 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 1.85e-01 0.136 0.103 0.203 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -207315 sc-eQTL 3.22e-01 -0.1 0.101 0.203 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 1.18e-01 -0.167 0.106 0.203 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 5.14e-01 0.0806 0.123 0.203 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 8.82e-02 -0.149 0.087 0.203 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0493 0.0944 0.203 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 1.19e-01 -0.185 0.118 0.203 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 1.53e-01 -0.147 0.102 0.202 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 1.99e-01 0.136 0.105 0.202 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 2.41e-01 0.137 0.117 0.202 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 1.45e-01 -0.173 0.118 0.202 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 3.21e-01 -0.103 0.103 0.202 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 1.78e-01 -0.16 0.118 0.202 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 896048 sc-eQTL 2.42e-01 -0.0846 0.072 0.202 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 998667 sc-eQTL 1.18e-01 0.166 0.106 0.202 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00669 0.0693 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 5.97e-01 0.0431 0.0815 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 3.24e-01 -0.12 0.121 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0556 0.0887 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 3.31e-01 0.0677 0.0694 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 1.05e-01 -0.156 0.0959 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0425 0.089 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0974 0.0849 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 4.25e-01 0.104 0.13 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 1.38e-01 0.152 0.102 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 9.21e-02 -0.15 0.0885 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 2.39e-02 -0.23 0.101 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00819 0.136 0.224 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -207315 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0132 0.126 0.224 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 2.20e-01 -0.162 0.131 0.224 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 1.10e-01 -0.207 0.128 0.224 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0726 0.123 0.224 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0568 0.135 0.224 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 6.34e-01 0.0627 0.131 0.224 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 2.96e-01 0.113 0.108 0.2 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 4.72e-02 -0.208 0.104 0.2 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 1.26e-01 -0.185 0.12 0.2 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0922 0.11 0.2 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0116 0.105 0.2 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0455 0.113 0.2 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 5.71e-01 0.0509 0.0896 0.206 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0229 0.0748 0.206 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 3.54e-01 -0.108 0.116 0.206 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 3.68e-01 0.0922 0.102 0.206 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 1.28e-02 0.247 0.0982 0.206 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 8.48e-01 0.0198 0.103 0.206 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 7.62e-01 -0.039 0.129 0.201 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0424 0.124 0.201 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 8.16e-01 0.0294 0.126 0.201 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 6.15e-01 0.0546 0.108 0.201 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 3.11e-01 0.13 0.128 0.201 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0503 0.133 0.201 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 896048 sc-eQTL 9.45e-02 -0.194 0.115 0.201 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 998667 sc-eQTL 7.67e-01 0.028 0.0943 0.201 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 3.71e-01 0.0731 0.0816 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0156 0.0731 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0813 0.124 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0201 0.0735 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 2.06e-02 0.154 0.0662 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 659656 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0136 0.0864 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 9.29e-01 0.0097 0.109 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 896048 sc-eQTL 7.49e-01 0.0243 0.0759 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 363281 sc-eQTL 1.44e-01 0.166 0.113 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 998667 sc-eQTL 7.11e-01 0.0427 0.115 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 1.94e-01 -0.118 0.0904 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 3.98e-01 0.075 0.0885 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 4.88e-01 0.0815 0.117 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 8.90e-03 -0.223 0.0844 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 2.45e-02 0.197 0.087 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 659656 sc-eQTL 9.54e-02 -0.179 0.107 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0466 0.108 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 896048 sc-eQTL 6.49e-01 0.0233 0.0512 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 363281 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0204 0.111 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 998667 sc-eQTL 7.05e-02 0.186 0.102 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0405 0.0639 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 9.91e-01 0.00081 0.0757 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00981 0.122 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 9.92e-01 0.000897 0.0874 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0751 0.0657 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 4.63e-02 -0.181 0.0904 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 4.27e-01 0.0657 0.0826 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0749 0.0691 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 2.87e-01 -0.133 0.125 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00929 0.0936 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 2.23e-01 0.114 0.0934 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 5.85e-01 -0.054 0.0988 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 433168 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0586 0.0846 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -207315 sc-eQTL 1.91e-01 -0.102 0.0778 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -786078 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0264 0.0854 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -314876 sc-eQTL 4.02e-01 -0.101 0.121 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0815 0.0764 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -79448 sc-eQTL 8.87e-01 0.0105 0.0741 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 sc-eQTL 1.13e-02 0.279 0.109 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -209269 sc-eQTL 5.68e-02 -0.231 0.12 0.205 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 eQTL 0.0001 -0.0885 0.0226 0.0 0.0 0.204
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 eQTL 5.53e-07 0.12 0.0238 0.0 0.0 0.204


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000173598 NUDT4 -15384 3.75e-05 3.42e-05 6.4e-06 1.6e-05 5.94e-06 1.52e-05 4.59e-05 4.99e-06 3.31e-05 1.64e-05 4.22e-05 1.79e-05 5.21e-05 1.48e-05 7.47e-06 2.04e-05 1.77e-05 2.59e-05 8.04e-06 7.1e-06 1.64e-05 3.5e-05 3.29e-05 9.45e-06 4.61e-05 8.26e-06 1.53e-05 1.36e-05 3.36e-05 2.59e-05 2.2e-05 1.65e-06 2.83e-06 7.37e-06 1.21e-05 5.78e-06 3.22e-06 3.26e-06 5e-06 3.57e-06 1.74e-06 4e-05 3.55e-06 3.78e-07 2.63e-06 4.43e-06 4.3e-06 1.68e-06 1.54e-06
ENSG00000198015 MRPL42 -104989 1e-05 1.26e-05 1.68e-06 6.84e-06 2.54e-06 5.07e-06 1.19e-05 2.14e-06 1.12e-05 5.41e-06 1.5e-05 6.05e-06 1.85e-05 4.19e-06 3.54e-06 7.36e-06 5.73e-06 8.09e-06 2.93e-06 3.12e-06 6.26e-06 1.09e-05 9.7e-06 3.24e-06 1.6e-05 4.28e-06 6.78e-06 5.22e-06 1.13e-05 7.87e-06 6.63e-06 9.92e-07 1.28e-06 3.06e-06 4.89e-06 2.59e-06 1.83e-06 1.95e-06 2.02e-06 1.21e-06 1.02e-06 1.59e-05 1.6e-06 1.9e-07 7.78e-07 1.67e-06 1.79e-06 7.53e-07 4.9e-07