logo

Genes within 1Mb (chr12:93349438:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 7.88e-01 0.0171 0.0635 0.203 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 5.31e-01 0.0395 0.0629 0.203 B L1
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0247 0.0954 0.203 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0612 0.0708 0.203 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 6.41e-02 0.115 0.062 0.203 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 646595 sc-eQTL 8.79e-01 0.0108 0.0706 0.203 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0677 0.0975 0.203 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 882987 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0293 0.0481 0.203 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 350220 sc-eQTL 5.52e-01 0.0578 0.0971 0.203 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 985606 sc-eQTL 5.07e-01 0.0632 0.0952 0.203 B L1
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 9.48e-01 0.00435 0.0667 0.203 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -220376 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0332 0.0645 0.203 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0686 0.0676 0.203 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 4.02e-01 0.0931 0.111 0.203 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 1.59e-01 -0.0901 0.0638 0.203 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0402 0.0594 0.203 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 5.93e-02 -0.194 0.103 0.203 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 9.62e-02 -0.125 0.0748 0.203 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -220376 sc-eQTL 6.74e-01 0.0364 0.0864 0.203 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0591 0.0889 0.203 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 5.21e-02 0.203 0.104 0.203 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0344 0.0621 0.203 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 5.97e-01 0.0409 0.0773 0.203 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 2.81e-01 -0.119 0.11 0.203 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 1.23e-01 -0.151 0.0971 0.2 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 4.14e-02 0.214 0.104 0.2 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 6.21e-01 0.0588 0.119 0.2 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0137 0.0979 0.2 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 9.29e-01 0.00882 0.0989 0.2 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 1.82e-01 -0.152 0.113 0.2 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 882987 sc-eQTL 8.34e-02 -0.173 0.0996 0.2 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 985606 sc-eQTL 7.32e-01 0.0355 0.103 0.2 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 9.41e-01 0.00424 0.0575 0.203 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00882 0.0657 0.203 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 4.23e-01 -0.097 0.121 0.203 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 9.85e-02 0.137 0.0828 0.203 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0612 0.0624 0.203 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 1.45e-01 -0.123 0.0838 0.203 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 9.81e-01 0.00188 0.0809 0.204 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -220376 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0835 0.0754 0.204 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 1.78e-01 -0.106 0.0786 0.204 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0163 0.113 0.204 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0476 0.0733 0.204 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 1.35e-02 0.178 0.0715 0.204 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 2.76e-01 0.113 0.103 0.204 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -222330 sc-eQTL 1.27e-01 -0.18 0.118 0.204 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 5.55e-01 -0.061 0.103 0.203 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -220376 sc-eQTL 1.60e-01 -0.134 0.0953 0.203 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 4.83e-01 -0.063 0.0897 0.203 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 7.58e-01 0.0335 0.109 0.203 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0371 0.0775 0.203 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 1.85e-01 -0.0952 0.0716 0.203 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0654 0.0849 0.203 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 2.41e-01 0.139 0.118 0.207 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0942 0.0998 0.207 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 3.25e-01 0.116 0.117 0.207 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 8.69e-01 0.0173 0.104 0.207 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 3.01e-01 -0.134 0.129 0.207 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 646595 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00374 0.11 0.207 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 8.74e-01 0.02 0.126 0.207 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 882987 sc-eQTL 9.38e-01 0.00891 0.114 0.207 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 350220 sc-eQTL 6.15e-01 0.0614 0.122 0.207 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 985606 sc-eQTL 6.87e-01 0.0409 0.101 0.207 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 5.00e-01 0.0646 0.0955 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 2.28e-01 0.114 0.0944 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0663 0.113 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0265 0.0939 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 5.62e-02 0.182 0.0947 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 646595 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0198 0.106 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 4.57e-02 -0.232 0.115 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 882987 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00221 0.0783 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 350220 sc-eQTL 4.68e-01 0.0835 0.115 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 985606 sc-eQTL 9.78e-01 0.00306 0.11 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0246 0.0975 0.203 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 9.92e-01 0.000864 0.0917 0.203 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 6.89e-02 -0.218 0.119 0.203 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 5.04e-01 0.0575 0.0859 0.203 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 7.00e-01 0.0297 0.0769 0.203 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 646595 sc-eQTL 5.18e-01 0.0634 0.0979 0.203 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0731 0.114 0.203 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 882987 sc-eQTL 3.44e-01 0.0899 0.0949 0.203 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 350220 sc-eQTL 2.53e-01 0.13 0.114 0.203 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 985606 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0375 0.107 0.203 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 7.67e-01 -0.028 0.0943 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 3.08e-01 0.0998 0.0978 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 2.83e-01 0.132 0.123 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 1.44e-01 -0.128 0.0876 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 1.04e-01 0.154 0.0941 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 646595 sc-eQTL 4.04e-02 -0.214 0.104 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0279 0.109 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 882987 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00459 0.0637 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 350220 sc-eQTL 6.10e-01 0.0592 0.116 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 985606 sc-eQTL 6.26e-01 0.0509 0.104 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 8.55e-02 0.19 0.11 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0828 0.102 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0712 0.115 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 9.19e-01 0.00972 0.0952 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 2.31e-01 0.112 0.0929 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 646595 sc-eQTL 3.11e-01 0.0819 0.0807 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0885 0.121 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 882987 sc-eQTL 9.82e-01 0.00132 0.0581 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 350220 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0264 0.116 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 985606 sc-eQTL 6.38e-01 0.0511 0.108 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0496 0.112 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -220376 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0182 0.113 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 1.98e-01 0.139 0.108 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 3.79e-02 0.226 0.108 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 4.19e-02 -0.218 0.106 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 3.50e-01 0.102 0.109 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0091 0.122 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 9.24e-01 0.00674 0.0703 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -220376 sc-eQTL 9.85e-01 0.00122 0.0664 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 1.47e-01 -0.109 0.0747 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0409 0.115 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0281 0.0674 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0123 0.0647 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 7.17e-02 -0.195 0.108 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 1.15e-01 -0.15 0.095 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -220376 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0789 0.0742 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0294 0.0883 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 6.22e-01 0.0588 0.119 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 1.87e-01 -0.0986 0.0745 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0189 0.0719 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 3.60e-02 -0.229 0.109 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 9.50e-01 0.00685 0.109 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -220376 sc-eQTL 1.60e-01 -0.113 0.0801 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 8.27e-01 0.0211 0.0964 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 3.60e-01 -0.109 0.118 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 2.22e-01 -0.114 0.0933 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 2.94e-01 -0.101 0.0959 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0262 0.106 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0396 0.0991 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -220376 sc-eQTL 2.83e-01 0.103 0.096 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 6.20e-01 0.0485 0.0976 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 1.02e-01 0.194 0.118 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 8.42e-01 0.0176 0.0879 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 5.88e-01 0.0553 0.102 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 7.57e-01 0.0363 0.117 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 1.11e-01 -0.145 0.0907 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -220376 sc-eQTL 1.42e-01 -0.132 0.0894 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 9.63e-02 -0.167 0.0999 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 3.06e-01 0.119 0.116 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 9.09e-01 0.0092 0.0805 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 3.12e-01 0.0888 0.0876 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 2.52e-01 -0.128 0.112 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 1.11e-01 0.192 0.12 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -220376 sc-eQTL 1.01e-01 -0.17 0.103 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 3.70e-01 -0.105 0.116 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 3.90e-01 0.106 0.123 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 6.03e-01 -0.051 0.0979 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 8.20e-01 0.0266 0.117 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0879 0.119 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 7.06e-01 0.0462 0.122 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -220376 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0411 0.114 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0965 0.119 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0155 0.127 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 2.91e-01 -0.123 0.116 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0245 0.111 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0995 0.115 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 2.26e-01 -0.143 0.118 0.199 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -220376 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0228 0.108 0.199 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0196 0.0991 0.199 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 2.36e-01 0.149 0.126 0.199 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 5.26e-01 -0.058 0.0914 0.199 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 9.19e-01 0.0114 0.112 0.199 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 8.27e-01 0.025 0.115 0.199 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 6.54e-01 0.0492 0.11 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -220376 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0518 0.102 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 1.13e-01 -0.158 0.099 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0263 0.121 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 8.02e-01 0.0271 0.108 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 2.71e-02 0.252 0.113 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 3.75e-01 -0.101 0.114 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -222330 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0124 0.106 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 8.66e-01 0.0161 0.0959 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -220376 sc-eQTL 2.43e-01 -0.099 0.0846 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0752 0.0921 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0456 0.12 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00178 0.0852 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 9.41e-01 0.00607 0.0818 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 8.19e-03 0.298 0.111 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -222330 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0965 0.116 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0395 0.107 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -220376 sc-eQTL 2.09e-01 0.133 0.105 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0544 0.0966 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0548 0.118 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00324 0.099 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 6.69e-02 0.203 0.11 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0183 0.124 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -222330 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0457 0.1 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 5.97e-01 0.0523 0.0987 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -220376 sc-eQTL 2.88e-01 -0.1 0.094 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 3.20e-01 -0.095 0.0954 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00339 0.107 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 5.76e-01 -0.047 0.0839 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 3.38e-01 0.0926 0.0963 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 5.59e-01 0.0654 0.112 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -222330 sc-eQTL 1.21e-01 -0.173 0.111 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 5.20e-01 0.0974 0.151 0.17 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 6.90e-01 0.0565 0.141 0.17 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 1.78e-01 -0.175 0.129 0.17 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0705 0.122 0.17 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 5.19e-02 0.207 0.105 0.17 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 646595 sc-eQTL 8.93e-01 0.0205 0.151 0.17 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 7.94e-01 0.0386 0.147 0.17 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 882987 sc-eQTL 4.84e-01 0.0819 0.116 0.17 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 350220 sc-eQTL 2.98e-01 -0.149 0.142 0.17 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 985606 sc-eQTL 4.26e-01 0.114 0.142 0.17 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 8.70e-01 0.0189 0.115 0.202 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -220376 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0838 0.106 0.202 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0542 0.112 0.202 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0971 0.11 0.202 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 1.85e-01 0.118 0.0887 0.202 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0574 0.082 0.202 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0121 0.0986 0.202 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 2.03e-01 0.129 0.101 0.203 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -220376 sc-eQTL 7.00e-02 -0.18 0.0991 0.203 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 2.16e-01 -0.13 0.105 0.203 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 1.90e-01 0.159 0.121 0.203 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 8.13e-02 -0.15 0.0855 0.203 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 7.68e-01 0.0275 0.0929 0.203 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 1.03e-01 -0.19 0.116 0.203 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 6.08e-02 -0.194 0.103 0.205 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 3.64e-02 0.222 0.105 0.205 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 3.56e-01 0.109 0.118 0.205 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 3.85e-01 -0.104 0.12 0.205 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0538 0.104 0.205 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0801 0.119 0.205 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 882987 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0519 0.0727 0.205 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 985606 sc-eQTL 9.29e-01 0.00952 0.107 0.205 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 8.35e-01 0.0141 0.0676 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 9.07e-01 0.00932 0.0796 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 2.82e-01 -0.127 0.118 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 5.45e-01 0.0524 0.0865 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 2.17e-01 0.0837 0.0676 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0841 0.0939 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0248 0.0877 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 1.22e-01 -0.129 0.0833 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 7.85e-01 -0.035 0.128 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 1.97e-02 0.234 0.0995 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 1.00e-02 -0.224 0.0864 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 1.96e-02 -0.234 0.0994 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 8.37e-01 0.0278 0.135 0.221 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -220376 sc-eQTL 6.45e-01 0.0578 0.125 0.221 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 1.18e-01 -0.204 0.13 0.221 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 2.83e-01 -0.138 0.128 0.221 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 1.44e-01 -0.178 0.121 0.221 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 9.66e-01 0.00574 0.134 0.221 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 4.24e-01 0.104 0.13 0.221 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 2.38e-01 0.125 0.105 0.2 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 6.52e-02 -0.189 0.102 0.2 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 1.93e-01 -0.154 0.118 0.2 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0465 0.108 0.2 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 2.64e-01 -0.115 0.102 0.2 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0919 0.11 0.2 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 6.83e-01 0.0364 0.089 0.21 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 8.57e-01 0.0134 0.0742 0.21 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0925 0.115 0.21 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 4.30e-01 0.0801 0.101 0.21 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 2.74e-02 0.217 0.0978 0.21 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0237 0.103 0.21 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0362 0.13 0.203 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 1.29e-01 0.191 0.125 0.203 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 4.15e-01 0.104 0.127 0.203 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 4.96e-01 0.0745 0.109 0.203 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 8.99e-01 0.0165 0.13 0.203 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 9.74e-01 0.00434 0.134 0.203 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 882987 sc-eQTL 1.15e-01 -0.185 0.117 0.203 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 985606 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0418 0.0953 0.203 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 6.58e-01 0.0358 0.0808 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0327 0.0722 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 4.14e-01 -0.1 0.123 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 6.90e-01 0.029 0.0727 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 1.12e-01 0.105 0.0659 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 646595 sc-eQTL 6.40e-01 0.04 0.0853 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 3.36e-01 -0.104 0.108 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 882987 sc-eQTL 8.74e-01 0.0119 0.0751 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 350220 sc-eQTL 1.77e-01 0.152 0.112 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 985606 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0807 0.113 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 8.81e-01 0.0134 0.0894 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 4.23e-01 0.07 0.0872 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 5.51e-01 0.0691 0.116 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0824 0.0843 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 4.16e-02 0.176 0.0858 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 646595 sc-eQTL 3.11e-02 -0.227 0.105 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0884 0.107 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 882987 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0154 0.0504 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 350220 sc-eQTL 6.68e-01 -0.047 0.11 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 985606 sc-eQTL 3.63e-01 0.0925 0.101 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0231 0.0626 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0337 0.0741 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 3.87e-01 -0.103 0.119 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 1.61e-01 0.12 0.0852 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 1.55e-01 -0.0916 0.0642 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 1.36e-01 -0.133 0.0889 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 4.25e-01 0.0652 0.0815 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0376 0.0683 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 1.84e-01 -0.164 0.123 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 7.58e-01 0.0285 0.0923 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 6.16e-01 0.0464 0.0924 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0562 0.0974 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 420107 sc-eQTL 8.90e-01 0.0115 0.0833 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -220376 sc-eQTL 4.43e-01 -0.059 0.0767 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -799139 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0886 0.0838 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -327937 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0125 0.119 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -28445 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0684 0.0752 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -92509 sc-eQTL 1.84e-01 0.0968 0.0726 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -118050 sc-eQTL 1.30e-01 0.165 0.108 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -222330 sc-eQTL 9.57e-02 -0.199 0.119 0.205 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000120833 \N -220376 1.29e-06 1.33e-06 2.59e-07 1.3e-06 3.36e-07 6.25e-07 1.49e-06 4.04e-07 1.47e-06 6.18e-07 2.04e-06 8.48e-07 2.45e-06 3.07e-07 5.37e-07 9.42e-07 9.31e-07 9.1e-07 8.15e-07 5.75e-07 8.18e-07 1.75e-06 1.03e-06 5.17e-07 2.47e-06 6.73e-07 9.62e-07 8.92e-07 1.61e-06 1.21e-06 8.22e-07 2.07e-07 3e-07 6.11e-07 5.82e-07 4.91e-07 6.1e-07 3.18e-07 4.78e-07 3.34e-07 2.81e-07 1.61e-06 1.53e-07 9.66e-08 2.47e-07 1.71e-07 2.29e-07 9.26e-08 1.55e-07
ENSG00000173598 \N -28445 1.09e-05 1.27e-05 2.44e-06 7.53e-06 2.4e-06 5.65e-06 1.48e-05 2.18e-06 1.12e-05 6.06e-06 1.6e-05 6.65e-06 2.13e-05 4.48e-06 3.66e-06 7.21e-06 6.94e-06 1e-05 3.52e-06 3.16e-06 6.54e-06 1.12e-05 1.16e-05 3.88e-06 2.11e-05 4.26e-06 6.35e-06 5e-06 1.37e-05 1.25e-05 8.2e-06 9.92e-07 1.27e-06 3.7e-06 5.59e-06 2.88e-06 1.78e-06 2.16e-06 2.22e-06 1.34e-06 9.75e-07 1.6e-05 1.61e-06 2.03e-07 9.22e-07 1.85e-06 1.99e-06 6.86e-07 4.58e-07
ENSG00000198015 \N -118050 3.99e-06 4.3e-06 5.55e-07 1.8e-06 7.24e-07 9.66e-07 2.48e-06 9.75e-07 2.79e-06 1.46e-06 4e-06 2.48e-06 5.72e-06 1.49e-06 9.36e-07 2.03e-06 1.8e-06 2.22e-06 1.52e-06 1.26e-06 1.8e-06 3.44e-06 3.24e-06 1.8e-06 4.78e-06 1.22e-06 1.58e-06 1.74e-06 3.78e-06 3.32e-06 2.05e-06 4.14e-07 6.65e-07 1.68e-06 1.96e-06 9.19e-07 8.57e-07 4.88e-07 1.32e-06 3.27e-07 2.54e-07 4.34e-06 4.77e-07 1.87e-07 3.5e-07 3.62e-07 8.3e-07 2.22e-07 1.58e-07