Genes within 1Mb (chr12:93297916:A:AT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 8.48e-01 0.0149 0.0778 0.111 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0245 0.0771 0.111 B L1
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 5.98e-01 0.0616 0.117 0.111 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 3.34e-01 0.0838 0.0866 0.111 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 1.67e-01 0.106 0.0762 0.111 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 595073 sc-eQTL 4.11e-01 0.071 0.0863 0.111 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 3.48e-02 -0.251 0.118 0.111 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 831465 sc-eQTL 5.30e-02 0.114 0.0584 0.111 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 298698 sc-eQTL 9.25e-01 0.0112 0.119 0.111 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 934084 sc-eQTL 8.03e-01 0.0291 0.117 0.111 B L1
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0059 0.0809 0.111 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -271898 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0178 0.0783 0.111 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0368 0.0821 0.111 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0498 0.135 0.111 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0361 0.0777 0.111 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0416 0.0721 0.111 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0858 0.125 0.111 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0519 0.0896 0.111 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -271898 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0471 0.103 0.111 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 5.56e-01 0.0624 0.106 0.111 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 2.44e-01 0.145 0.124 0.111 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0318 0.0739 0.111 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0587 0.092 0.111 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 4.11e-01 0.108 0.131 0.111 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 3.73e-01 0.106 0.119 0.113 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 1.43e-01 -0.188 0.128 0.113 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 9.90e-01 -0.0019 0.145 0.113 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0755 0.119 0.113 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 7.04e-01 0.0458 0.12 0.113 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 2.48e-01 -0.16 0.138 0.113 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 831465 sc-eQTL 3.00e-01 0.127 0.122 0.113 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 934084 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0234 0.126 0.113 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 9.04e-01 0.00852 0.0707 0.111 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 4.50e-01 0.061 0.0806 0.111 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 4.04e-01 -0.124 0.148 0.111 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0373 0.102 0.111 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00301 0.0769 0.111 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 8.71e-01 0.0169 0.103 0.111 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 7.63e-01 0.0302 0.1 0.112 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -271898 sc-eQTL 2.82e-01 -0.101 0.0932 0.112 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0429 0.0975 0.112 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 8.52e-02 0.241 0.139 0.112 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 1.42e-01 0.133 0.0902 0.112 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0265 0.0897 0.112 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0389 0.128 0.112 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -273852 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0383 0.146 0.112 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 9.27e-01 0.0116 0.126 0.111 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -271898 sc-eQTL 7.76e-01 0.0333 0.117 0.111 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 2.12e-02 -0.251 0.108 0.111 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 5.06e-01 0.0882 0.132 0.111 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0667 0.0946 0.111 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 5.61e-02 0.167 0.087 0.111 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0558 0.104 0.111 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 3.40e-01 0.142 0.149 0.105 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0544 0.126 0.105 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0992 0.147 0.105 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 4.84e-02 0.258 0.13 0.105 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 7.06e-01 0.0616 0.163 0.105 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 595073 sc-eQTL 3.08e-01 -0.14 0.137 0.105 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0308 0.158 0.105 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 831465 sc-eQTL 4.76e-01 -0.102 0.143 0.105 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 298698 sc-eQTL 1.00e-01 0.251 0.152 0.105 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 934084 sc-eQTL 8.53e-01 0.0236 0.127 0.105 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0583 0.118 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 8.03e-01 0.0293 0.117 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 6.87e-01 0.0563 0.139 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 7.46e-01 0.0377 0.116 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 4.41e-01 0.0914 0.118 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 595073 sc-eQTL 2.99e-01 0.136 0.131 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 1.08e-01 -0.231 0.143 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 831465 sc-eQTL 5.10e-01 -0.064 0.0969 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 298698 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0331 0.142 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 934084 sc-eQTL 5.75e-02 0.259 0.135 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 6.46e-01 0.0562 0.122 0.11 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 2.85e-01 0.123 0.115 0.11 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 2.15e-02 0.344 0.149 0.11 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 5.99e-01 0.0567 0.108 0.11 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 2.60e-01 0.108 0.0961 0.11 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 595073 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0755 0.123 0.11 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0855 0.143 0.11 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 831465 sc-eQTL 9.41e-02 0.199 0.118 0.11 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 298698 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0146 0.143 0.11 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 934084 sc-eQTL 8.90e-01 0.0186 0.135 0.11 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 2.95e-01 0.119 0.113 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0882 0.117 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0501 0.148 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 3.51e-01 0.0985 0.105 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 2.10e-02 0.261 0.112 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 595073 sc-eQTL 2.94e-01 0.132 0.125 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 2.34e-01 -0.156 0.131 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 831465 sc-eQTL 3.21e-02 0.163 0.0756 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 298698 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0716 0.139 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 934084 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0304 0.125 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 4.83e-01 0.0968 0.138 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0393 0.127 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0336 0.144 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 2.85e-01 0.127 0.118 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0203 0.116 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 595073 sc-eQTL 6.80e-01 0.0417 0.101 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 9.36e-02 -0.252 0.15 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 831465 sc-eQTL 4.73e-01 0.0519 0.0723 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 298698 sc-eQTL 5.69e-01 0.0823 0.144 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 934084 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0466 0.135 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 3.58e-02 0.295 0.14 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -271898 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0399 0.142 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 9.75e-01 0.00425 0.136 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0712 0.137 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 6.31e-01 0.0648 0.135 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 3.60e-03 -0.397 0.135 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 8.20e-01 0.0349 0.154 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 8.96e-01 0.0111 0.085 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -271898 sc-eQTL 4.36e-01 0.0625 0.0801 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0693 0.0906 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0531 0.138 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0816 0.0812 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 8.83e-01 0.0115 0.0782 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0856 0.131 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0293 0.118 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -271898 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0722 0.0917 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 7.66e-01 0.0325 0.109 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 3.20e-01 0.146 0.147 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0448 0.0923 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00824 0.0888 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0753 0.135 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0561 0.134 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -271898 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0349 0.0987 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 2.28e-01 -0.143 0.118 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0484 0.146 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 6.62e-01 0.0503 0.115 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 2.34e-01 0.14 0.118 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 4.20e-01 -0.105 0.129 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 6.86e-01 0.0485 0.12 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -271898 sc-eQTL 1.00e+00 1.5e-05 0.117 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0457 0.118 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 7.06e-01 0.0543 0.144 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 3.85e-01 0.0924 0.106 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0632 0.123 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0706 0.142 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 4.78e-01 0.0786 0.111 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -271898 sc-eQTL 5.09e-01 0.0722 0.109 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 6.41e-01 0.057 0.122 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 5.80e-01 0.0782 0.141 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 5.00e-01 -0.066 0.0977 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 7.78e-01 0.0301 0.107 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 3.45e-01 0.129 0.136 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0718 0.145 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -271898 sc-eQTL 1.76e-01 -0.169 0.124 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 6.11e-01 0.0715 0.14 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00945 0.148 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 9.13e-01 0.0128 0.118 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 8.10e-01 0.0338 0.14 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0293 0.144 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 3.65e-01 0.129 0.142 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -271898 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0677 0.132 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 8.45e-02 0.239 0.138 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0728 0.147 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 1.81e-01 0.181 0.135 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00202 0.129 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 4.43e-01 0.103 0.134 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 5.16e-01 0.0915 0.141 0.113 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -271898 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0885 0.128 0.113 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 4.77e-02 -0.233 0.117 0.113 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 9.38e-01 0.0117 0.15 0.113 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 4.05e-01 0.0907 0.109 0.113 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 1.58e-01 0.188 0.133 0.113 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 4.21e-01 -0.11 0.136 0.113 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0104 0.142 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -271898 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0461 0.132 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0214 0.129 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 3.95e-01 0.133 0.156 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 7.96e-01 0.0361 0.139 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 2.18e-01 -0.182 0.147 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0658 0.147 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -273852 sc-eQTL 1.27e-01 -0.209 0.137 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 2.16e-01 0.147 0.118 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -271898 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0264 0.105 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 3.46e-01 0.108 0.114 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 1.92e-02 0.346 0.147 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 3.57e-02 0.22 0.104 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0532 0.101 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0523 0.14 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -273852 sc-eQTL 6.68e-01 -0.062 0.144 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 2.58e-01 -0.159 0.141 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -271898 sc-eQTL 5.29e-01 0.0877 0.139 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0921 0.127 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0279 0.156 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0283 0.13 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 2.62e-01 -0.164 0.145 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 4.94e-01 -0.111 0.163 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -273852 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0224 0.132 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 5.18e-01 -0.079 0.122 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -271898 sc-eQTL 1.11e-01 -0.185 0.116 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 1.24e-01 -0.181 0.117 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 3.56e-01 0.122 0.132 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 7.95e-01 -0.027 0.104 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 1.27e-01 0.182 0.119 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 6.17e-01 0.0692 0.138 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -273852 sc-eQTL 7.38e-01 0.0462 0.138 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 5.75e-01 0.0949 0.169 0.1 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 5.24e-01 -0.101 0.158 0.1 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0342 0.146 0.1 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 7.31e-01 0.0469 0.136 0.1 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 3.22e-01 -0.119 0.119 0.1 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 595073 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00498 0.169 0.1 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 9.88e-01 0.00241 0.165 0.1 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 831465 sc-eQTL 9.58e-01 0.00682 0.13 0.1 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 298698 sc-eQTL 3.61e-01 -0.146 0.159 0.1 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 934084 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0484 0.159 0.1 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 5.90e-01 0.0775 0.144 0.111 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -271898 sc-eQTL 8.37e-01 0.0271 0.132 0.111 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 1.64e-01 -0.195 0.14 0.111 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 5.43e-02 0.263 0.136 0.111 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 1.45e-01 -0.161 0.11 0.111 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 6.83e-01 0.0419 0.102 0.111 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 1.66e-01 0.17 0.122 0.111 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 7.07e-01 0.0488 0.129 0.111 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -271898 sc-eQTL 8.13e-01 0.0302 0.128 0.111 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0826 0.134 0.111 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 2.81e-01 0.168 0.155 0.111 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0164 0.11 0.111 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 3.79e-01 -0.105 0.119 0.111 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 4.60e-01 0.11 0.149 0.111 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 1.95e-01 0.168 0.129 0.11 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 2.75e-01 -0.145 0.133 0.11 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 3.13e-01 -0.149 0.147 0.11 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 5.48e-01 -0.09 0.15 0.11 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 5.95e-01 0.0693 0.13 0.11 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 9.39e-01 0.0114 0.149 0.11 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 831465 sc-eQTL 9.55e-01 0.00518 0.0909 0.11 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 934084 sc-eQTL 6.98e-01 0.052 0.134 0.11 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 6.59e-01 0.0363 0.082 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 4.69e-01 0.07 0.0964 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0643 0.143 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0788 0.105 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 8.49e-01 0.0157 0.0824 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 8.96e-01 0.015 0.114 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 4.51e-01 0.0794 0.105 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000235 0.101 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 2.79e-01 -0.167 0.154 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 6.86e-01 0.049 0.121 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0536 0.105 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 3.29e-01 -0.118 0.121 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 6.04e-01 0.0895 0.172 0.118 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -271898 sc-eQTL 5.47e-01 0.0961 0.159 0.118 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 1.32e-01 0.251 0.166 0.118 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 6.00e-01 0.086 0.164 0.118 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 8.19e-01 0.0356 0.156 0.118 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0484 0.17 0.118 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00938 0.166 0.118 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0215 0.128 0.111 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 3.76e-01 0.11 0.124 0.111 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 3.27e-01 0.141 0.143 0.111 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 9.33e-01 -0.011 0.131 0.111 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 1.68e-02 0.296 0.123 0.111 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 1.95e-01 0.173 0.133 0.111 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 1.22e-01 -0.171 0.11 0.111 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0319 0.0924 0.111 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 3.56e-01 0.133 0.144 0.111 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 5.57e-01 0.0744 0.126 0.111 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00656 0.123 0.111 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 6.75e-01 0.0537 0.128 0.111 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 2.24e-01 -0.182 0.149 0.119 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 9.40e-02 -0.242 0.144 0.119 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0934 0.147 0.119 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 7.46e-01 0.041 0.126 0.119 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0676 0.15 0.119 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 3.51e-01 -0.144 0.154 0.119 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 831465 sc-eQTL 1.23e-01 0.209 0.135 0.119 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 934084 sc-eQTL 9.44e-01 0.00772 0.11 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 9.83e-01 0.00207 0.0996 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 8.49e-01 0.017 0.0891 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 6.68e-02 0.277 0.15 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 3.84e-01 0.0781 0.0895 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 2.97e-01 0.0851 0.0815 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 595073 sc-eQTL 4.72e-01 0.0758 0.105 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 9.05e-03 -0.345 0.131 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 831465 sc-eQTL 5.35e-01 0.0574 0.0925 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 298698 sc-eQTL 4.52e-01 0.104 0.138 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 934084 sc-eQTL 5.98e-02 0.263 0.139 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 4.66e-01 0.0806 0.11 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0781 0.108 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0572 0.143 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 4.70e-01 0.0755 0.104 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 7.13e-02 0.193 0.106 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 595073 sc-eQTL 2.37e-01 0.155 0.13 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 1.30e-01 -0.199 0.131 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 831465 sc-eQTL 2.86e-02 0.136 0.0617 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 298698 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0775 0.136 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 934084 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00876 0.126 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 5.64e-01 0.0438 0.0757 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 5.36e-01 0.0556 0.0897 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 2.61e-01 -0.163 0.144 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0539 0.104 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0343 0.078 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00843 0.108 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 2.70e-01 -0.112 0.102 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 6.34e-01 0.0406 0.0851 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 2.77e-01 0.167 0.154 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0294 0.115 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 4.78e-01 0.0818 0.115 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 1.58e-01 0.171 0.121 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 368585 sc-eQTL 7.45e-01 0.0334 0.103 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -271898 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0953 0.0945 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -850661 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0399 0.103 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -379459 sc-eQTL 1.15e-01 0.23 0.145 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -79967 sc-eQTL 2.52e-01 0.106 0.0926 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -144031 sc-eQTL 8.69e-01 0.0148 0.0898 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0399 0.134 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -273852 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000791 0.147 0.112 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 eQTL 2.49e-05 -0.131 0.0309 0.0 0.0 0.11


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000102189 \N 368585 7.23e-07 8.33e-07 6.57e-08 4.04e-07 9.94e-08 2.16e-07 6.18e-07 5.43e-08 3.32e-07 1.78e-07 5.29e-07 3.84e-07 9.97e-07 1.34e-07 7.79e-08 2e-07 2.77e-07 3.56e-07 1.56e-07 5.87e-08 2.49e-07 3.71e-07 5.87e-07 1.04e-07 6.39e-07 1.94e-07 1.74e-07 1.67e-07 3e-07 8.43e-07 2.11e-07 4.61e-08 6.08e-08 1.54e-07 9.25e-08 2.68e-08 7.97e-08 7.75e-08 6.41e-08 4.17e-07 5.05e-08 4.35e-07 1.94e-07 1.99e-08 3.32e-08 1.35e-08 8.61e-08 1.98e-09 4.8e-08
ENSG00000198015 MRPL42 -169572 1.6e-06 3.37e-06 2.54e-07 2.04e-06 4.22e-07 7.53e-07 1.92e-06 3.26e-07 1.68e-06 7.58e-07 2.43e-06 1.74e-06 4.26e-06 1.16e-06 3.35e-07 1.52e-06 1.36e-06 2.16e-06 5.57e-07 5.11e-07 1.5e-06 2.87e-06 3.25e-06 9.54e-07 2.52e-06 1.26e-06 1.04e-06 1.3e-06 1.99e-06 2.56e-06 1.08e-06 3.1e-07 5.04e-07 1.73e-06 9.25e-07 6.24e-07 8.21e-07 5.28e-07 1.34e-06 3.6e-06 3.03e-07 3.28e-06 1.26e-06 1.61e-07 3.3e-07 3.31e-07 2.94e-07 2.54e-07 1.98e-07