logo

Genes within 1Mb (chr12:93290384:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 6.53e-01 0.0281 0.0624 0.177 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 5.20e-01 0.0398 0.0618 0.177 B L1
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 1.27e-01 -0.143 0.0932 0.177 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00559 0.0697 0.177 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 1.56e-01 0.087 0.0612 0.177 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 587541 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0247 0.0693 0.177 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0973 0.0957 0.177 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 823933 sc-eQTL 3.94e-01 0.0404 0.0472 0.177 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 291166 sc-eQTL 3.27e-01 0.0936 0.0952 0.177 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 926552 sc-eQTL 1.93e-01 0.122 0.0933 0.177 B L1
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 7.00e-01 0.0254 0.066 0.177 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -279430 sc-eQTL 8.29e-01 0.0138 0.0638 0.177 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 4.04e-01 -0.056 0.0669 0.177 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 5.30e-02 -0.212 0.109 0.177 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 1.22e-01 -0.0978 0.063 0.177 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 6.58e-01 -0.026 0.0588 0.177 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 5.75e-01 0.0574 0.102 0.177 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 1.07e-01 -0.115 0.071 0.177 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -279430 sc-eQTL 2.86e-01 0.0875 0.0818 0.177 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0241 0.0845 0.177 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 4.25e-01 0.0793 0.0992 0.177 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0574 0.0588 0.177 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 5.02e-01 0.0494 0.0733 0.177 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 5.56e-02 0.2 0.104 0.177 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 6.08e-01 0.0485 0.0946 0.178 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0718 0.102 0.178 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 6.74e-01 0.0486 0.115 0.178 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0731 0.0947 0.178 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 2.89e-01 0.102 0.0956 0.178 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000126 0.11 0.178 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 823933 sc-eQTL 7.87e-02 0.171 0.0965 0.178 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 926552 sc-eQTL 7.19e-01 0.0361 0.1 0.178 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 6.59e-01 0.0251 0.0567 0.177 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0113 0.0647 0.177 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 2.69e-01 -0.132 0.119 0.177 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 7.28e-01 0.0286 0.0822 0.177 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 9.34e-01 0.00507 0.0616 0.177 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 4.07e-01 0.0688 0.0829 0.177 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 7.23e-01 0.0284 0.0802 0.178 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -279430 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0567 0.0749 0.178 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0522 0.0782 0.178 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 2.75e-01 0.123 0.112 0.178 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 3.87e-01 0.0629 0.0726 0.178 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 8.06e-01 0.0177 0.072 0.178 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 4.56e-01 0.0767 0.103 0.178 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -281384 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0531 0.117 0.178 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 6.07e-01 0.0529 0.103 0.177 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -279430 sc-eQTL 6.45e-01 0.0438 0.0951 0.177 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 3.79e-02 -0.185 0.0884 0.177 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 5.63e-01 0.0625 0.108 0.177 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0956 0.0768 0.177 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 2.56e-01 0.0811 0.0713 0.177 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0596 0.0844 0.177 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 1.19e-01 0.186 0.119 0.176 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 2.07e-01 -0.127 0.1 0.176 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 9.54e-01 0.00681 0.118 0.176 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 2.24e-01 0.128 0.105 0.176 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 2.54e-01 0.149 0.13 0.176 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 587541 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0186 0.11 0.176 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 8.44e-01 0.0249 0.126 0.176 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 823933 sc-eQTL 7.52e-01 0.0363 0.115 0.176 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 291166 sc-eQTL 1.58e-01 0.173 0.122 0.176 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 926552 sc-eQTL 8.96e-01 0.0133 0.102 0.176 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 2.68e-01 -0.105 0.0943 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 1.76e-01 0.127 0.0933 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0357 0.111 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 8.24e-01 0.0207 0.0928 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 9.35e-01 0.00767 0.0945 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 587541 sc-eQTL 3.29e-01 -0.102 0.104 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 9.17e-01 -0.012 0.115 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 823933 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0927 0.0772 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 291166 sc-eQTL 4.81e-01 0.0801 0.113 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 926552 sc-eQTL 2.48e-03 0.327 0.107 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0611 0.0971 0.177 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 6.33e-01 0.0437 0.0914 0.177 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 1.78e-01 0.161 0.119 0.177 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0126 0.0857 0.177 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 2.27e-01 0.0925 0.0764 0.177 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 587541 sc-eQTL 7.84e-01 0.0268 0.0976 0.177 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0387 0.114 0.177 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 823933 sc-eQTL 3.59e-02 0.198 0.0938 0.177 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 291166 sc-eQTL 3.68e-01 0.102 0.114 0.177 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 926552 sc-eQTL 6.92e-01 0.0424 0.107 0.177 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 4.51e-01 0.0692 0.0916 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0291 0.0953 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 3.44e-01 -0.113 0.119 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000796 0.0856 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 7.23e-03 0.245 0.0905 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 587541 sc-eQTL 4.37e-01 0.079 0.102 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0835 0.106 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 823933 sc-eQTL 4.94e-01 0.0424 0.0619 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 291166 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0393 0.113 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 926552 sc-eQTL 5.92e-01 0.0544 0.101 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 2.60e-01 0.125 0.111 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 5.96e-01 0.0545 0.102 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 7.44e-02 -0.206 0.115 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 2.05e-01 0.121 0.0951 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 6.74e-01 0.0393 0.0934 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 587541 sc-eQTL 2.62e-01 0.0909 0.0809 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 3.22e-01 -0.12 0.121 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 823933 sc-eQTL 6.69e-01 0.0249 0.0582 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 291166 sc-eQTL 4.77e-01 0.0828 0.116 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 926552 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0273 0.109 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0119 0.113 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -279430 sc-eQTL 5.40e-01 0.0697 0.113 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 2.24e-01 0.131 0.108 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00533 0.11 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0103 0.107 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 9.86e-03 -0.281 0.108 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00468 0.123 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 5.18e-01 0.0446 0.0688 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -279430 sc-eQTL 4.41e-01 0.0501 0.065 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0708 0.0734 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 1.20e-01 -0.175 0.112 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 4.79e-02 -0.13 0.0654 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0187 0.0634 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 5.22e-01 0.0682 0.106 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 8.72e-01 0.0153 0.0953 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -279430 sc-eQTL 5.15e-01 0.0483 0.0742 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 9.36e-01 0.00712 0.0882 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0115 0.119 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0209 0.0746 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 2.43e-01 0.0837 0.0715 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0272 0.109 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 3.48e-01 -0.1 0.106 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -279430 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0339 0.0786 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 1.65e-01 -0.131 0.0938 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0894 0.116 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0514 0.0914 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 4.88e-01 0.0652 0.0939 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 9.89e-01 0.00139 0.103 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0246 0.0961 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -279430 sc-eQTL 7.87e-01 0.0253 0.0933 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0588 0.0946 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 7.16e-01 0.0419 0.115 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 7.97e-01 0.022 0.0852 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0799 0.0988 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 1.76e-01 0.153 0.113 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0456 0.0889 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -279430 sc-eQTL 1.47e-01 0.127 0.0871 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0893 0.0978 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 8.25e-01 0.0252 0.113 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0854 0.0782 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 2.53e-01 0.0979 0.0853 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 3.45e-02 0.23 0.108 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 2.55e-01 -0.134 0.117 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -279430 sc-eQTL 2.18e-02 -0.231 0.0998 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 4.65e-01 0.0831 0.114 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 7.42e-01 0.0396 0.12 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 6.30e-01 -0.046 0.0954 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 6.51e-01 0.0515 0.114 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0531 0.116 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 2.03e-01 0.147 0.115 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -279430 sc-eQTL 1.85e-02 0.251 0.106 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 1.79e-01 0.152 0.113 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0444 0.12 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0993 0.11 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 7.85e-01 0.0287 0.105 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 5.48e-01 0.0656 0.109 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 6.23e-01 0.056 0.114 0.177 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -279430 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0227 0.104 0.177 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 2.05e-02 -0.22 0.0942 0.177 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 8.78e-01 0.0187 0.121 0.177 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 6.64e-01 0.0383 0.088 0.177 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 2.73e-01 0.118 0.108 0.177 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 3.69e-01 -0.099 0.11 0.177 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0571 0.112 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -279430 sc-eQTL 6.15e-01 0.0526 0.104 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0138 0.102 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 5.84e-01 0.0679 0.124 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0372 0.11 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0888 0.117 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0651 0.117 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -281384 sc-eQTL 6.53e-02 -0.2 0.108 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 2.11e-01 0.119 0.0949 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -279430 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0381 0.0843 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 4.80e-01 0.0647 0.0916 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 2.05e-02 0.275 0.118 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 4.52e-02 0.169 0.0838 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 5.07e-01 0.054 0.0812 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 5.41e-01 0.0689 0.113 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -281384 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0627 0.116 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 3.31e-01 -0.107 0.11 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -279430 sc-eQTL 3.20e-01 0.108 0.109 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0924 0.0993 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0121 0.122 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 1.75e-01 -0.138 0.101 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 2.32e-01 -0.136 0.114 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 5.20e-01 0.082 0.127 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -281384 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0231 0.103 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 2.59e-01 -0.111 0.0979 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -279430 sc-eQTL 1.35e-01 -0.14 0.0932 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 4.13e-02 -0.193 0.0941 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 5.26e-01 0.0673 0.106 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0099 0.0835 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 1.35e-01 0.143 0.0955 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 2.43e-01 0.13 0.111 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -281384 sc-eQTL 4.61e-01 0.082 0.111 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 9.26e-01 0.0134 0.145 0.152 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 7.58e-01 0.0417 0.135 0.152 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 2.70e-01 -0.137 0.124 0.152 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 3.49e-01 0.109 0.116 0.152 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 9.00e-01 -0.013 0.102 0.152 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 587541 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0537 0.144 0.152 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 8.96e-01 0.0184 0.141 0.152 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 823933 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0185 0.111 0.152 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 291166 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0894 0.136 0.152 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 926552 sc-eQTL 6.66e-01 0.0589 0.136 0.152 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 4.05e-01 0.0997 0.119 0.176 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -279430 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0212 0.11 0.176 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0966 0.116 0.176 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 9.00e-02 0.193 0.113 0.176 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 3.57e-02 -0.193 0.0914 0.176 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00143 0.0851 0.176 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 4.55e-01 0.0765 0.102 0.176 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 8.20e-01 0.0235 0.103 0.177 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -279430 sc-eQTL 5.43e-01 0.0617 0.101 0.177 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 2.21e-01 -0.131 0.106 0.177 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 2.13e-01 0.153 0.123 0.177 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0977 0.0871 0.177 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0401 0.0942 0.177 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 3.53e-01 0.11 0.118 0.177 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 6.02e-01 0.0533 0.102 0.18 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0747 0.105 0.18 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0623 0.116 0.18 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 3.53e-01 -0.11 0.118 0.18 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 8.15e-01 -0.024 0.103 0.18 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 9.97e-01 0.000514 0.118 0.18 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 823933 sc-eQTL 7.11e-01 0.0266 0.0716 0.18 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 926552 sc-eQTL 9.46e-01 0.0071 0.105 0.18 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 3.91e-01 0.0563 0.0655 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 8.77e-01 -0.012 0.0772 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 3.38e-01 -0.11 0.115 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 6.91e-01 0.0335 0.0841 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 6.02e-01 0.0344 0.0659 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 1.43e-01 0.134 0.0909 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 4.06e-01 0.0702 0.0844 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0265 0.0807 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 3.09e-01 -0.126 0.123 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 4.46e-01 0.074 0.097 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0983 0.0843 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0667 0.0969 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 3.27e-01 0.135 0.138 0.182 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -279430 sc-eQTL 9.10e-01 0.0144 0.128 0.182 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 2.07e-01 0.169 0.133 0.182 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 9.94e-01 0.000943 0.131 0.182 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0758 0.125 0.182 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 7.00e-01 0.0527 0.136 0.182 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 7.32e-01 0.0457 0.133 0.182 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0798 0.102 0.178 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 6.85e-01 0.0405 0.0997 0.178 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 4.71e-01 0.0829 0.115 0.178 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 4.09e-01 0.0864 0.104 0.178 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 1.25e-01 0.152 0.099 0.178 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 5.73e-01 0.0605 0.107 0.178 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0815 0.0873 0.176 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00661 0.073 0.176 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 3.34e-01 0.11 0.113 0.176 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0154 0.0998 0.176 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 3.77e-01 0.086 0.0971 0.176 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 4.53e-01 0.0758 0.101 0.176 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 1.65e-01 -0.167 0.119 0.186 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 2.42e-01 -0.136 0.116 0.186 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0284 0.117 0.186 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0226 0.101 0.186 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 2.90e-01 0.127 0.119 0.186 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 4.16e-01 0.101 0.124 0.186 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 823933 sc-eQTL 5.16e-02 0.211 0.107 0.186 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 926552 sc-eQTL 8.97e-02 0.149 0.0872 0.186 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00629 0.0798 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 5.32e-01 0.0446 0.0712 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 4.88e-01 0.0842 0.121 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 5.17e-01 0.0466 0.0717 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 2.41e-01 0.0766 0.0652 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 587541 sc-eQTL 8.86e-01 0.0121 0.0843 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 2.42e-01 -0.125 0.106 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 823933 sc-eQTL 7.45e-01 0.0241 0.0741 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 291166 sc-eQTL 5.88e-02 0.209 0.11 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 926552 sc-eQTL 4.37e-03 0.317 0.11 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 3.11e-01 0.0907 0.0892 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 6.31e-01 0.042 0.0873 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 1.71e-01 -0.158 0.115 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 8.50e-01 0.016 0.0846 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 2.36e-02 0.195 0.0857 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 587541 sc-eQTL 4.03e-01 0.0886 0.106 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 3.12e-01 -0.108 0.106 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 823933 sc-eQTL 3.49e-01 0.0473 0.0504 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 291166 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0196 0.11 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 926552 sc-eQTL 5.36e-01 0.063 0.102 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 4.03e-01 0.0507 0.0606 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0107 0.0719 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 1.32e-01 -0.174 0.115 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 5.71e-01 0.0471 0.0829 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0373 0.0624 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 3.56e-01 0.08 0.0864 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0835 0.081 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 7.72e-01 0.0197 0.068 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 2.22e-01 0.15 0.122 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0111 0.0919 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 1.76e-01 0.124 0.0916 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 4.11e-01 0.0798 0.0969 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 361053 sc-eQTL 7.54e-01 0.0259 0.0825 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -279430 sc-eQTL 3.52e-01 -0.071 0.076 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -858193 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0589 0.0832 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -386991 sc-eQTL 2.41e-01 0.138 0.117 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 sc-eQTL 3.87e-01 0.0646 0.0746 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -151563 sc-eQTL 4.59e-01 0.0535 0.0722 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 sc-eQTL 3.57e-01 0.0995 0.108 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -281384 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00295 0.118 0.179 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000173598 NUDT4 -87499 eQTL 0.845 0.00463 0.0236 0.00162 0.0 0.182
ENSG00000186076 AC012085.1 -351202 eQTL 4.91e-02 0.0874 0.0444 0.0 0.0 0.182
ENSG00000198015 MRPL42 -177104 eQTL 2.42e-02 -0.0562 0.0249 0.0 0.0 0.182

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000102189 \N 361053 1.32e-06 9.47e-07 3.03e-07 1.02e-06 1.07e-07 4.7e-07 1.64e-06 2.73e-07 1.13e-06 3.99e-07 1.4e-06 5.82e-07 1.91e-06 2.89e-07 4.58e-07 4.12e-07 7.43e-07 5.5e-07 6.68e-07 4.19e-07 3.87e-07 1.05e-06 8.52e-07 5.4e-07 1.97e-06 2.55e-07 5.49e-07 4.98e-07 1.17e-06 1.21e-06 5.45e-07 1.55e-07 1.27e-07 4.57e-07 4.4e-07 3.02e-07 2.34e-07 1.21e-07 1.41e-07 8.15e-09 5.38e-08 1.49e-06 5.89e-08 1.24e-08 1.95e-07 1.29e-07 1.88e-07 3.79e-08 9.32e-08