Genes within 1Mb (chr12:93289331:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 7.09e-01 0.0255 0.0684 0.15 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 8.31e-01 0.0145 0.0678 0.15 B L1
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0458 0.103 0.15 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 7.43e-01 0.0251 0.0764 0.15 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 2.44e-01 0.0784 0.0672 0.15 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 586488 sc-eQTL 9.04e-01 0.00923 0.076 0.15 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 9.55e-02 -0.175 0.104 0.15 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 822880 sc-eQTL 8.04e-02 0.0905 0.0515 0.15 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 290113 sc-eQTL 2.83e-01 0.112 0.104 0.15 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 925499 sc-eQTL 7.59e-01 0.0316 0.103 0.15 B L1
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 9.51e-01 0.00439 0.0711 0.15 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -280483 sc-eQTL 8.01e-01 0.0174 0.0687 0.15 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0416 0.0721 0.15 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 2.59e-01 -0.134 0.118 0.15 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0774 0.068 0.15 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 6.03e-01 -0.033 0.0633 0.15 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 8.04e-01 0.0274 0.11 0.15 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0809 0.0773 0.15 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -280483 sc-eQTL 4.99e-01 0.0602 0.0889 0.15 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 5.68e-01 0.0524 0.0916 0.15 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 2.85e-01 0.115 0.108 0.15 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0403 0.0639 0.15 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 9.16e-01 0.00837 0.0796 0.15 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 1.83e-01 0.151 0.113 0.15 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 6.93e-01 0.0409 0.103 0.151 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 3.02e-01 -0.115 0.111 0.151 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0242 0.126 0.151 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0974 0.103 0.151 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 6.29e-01 0.0507 0.105 0.151 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0472 0.12 0.151 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 822880 sc-eQTL 2.42e-01 0.124 0.106 0.151 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 925499 sc-eQTL 8.87e-01 0.0155 0.109 0.151 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 6.65e-01 0.0268 0.0619 0.15 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 5.86e-01 0.0385 0.0706 0.15 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 9.92e-02 -0.214 0.129 0.15 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0403 0.0897 0.15 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 7.73e-01 0.0195 0.0673 0.15 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00543 0.0906 0.15 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0254 0.0871 0.15 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -280483 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0565 0.0813 0.15 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0237 0.085 0.15 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 2.77e-01 0.133 0.122 0.15 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 2.88e-01 0.0839 0.0788 0.15 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00469 0.0782 0.15 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 5.96e-01 0.0593 0.112 0.15 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -282437 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0573 0.127 0.15 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0321 0.111 0.15 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -280483 sc-eQTL 4.94e-01 0.0705 0.103 0.15 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 2.63e-02 -0.213 0.0954 0.15 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 3.35e-01 0.113 0.116 0.15 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 6.85e-02 -0.151 0.0827 0.15 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 3.15e-01 0.0776 0.0771 0.15 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00854 0.0914 0.15 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 3.66e-01 0.119 0.131 0.145 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0806 0.111 0.145 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 8.69e-01 0.0214 0.13 0.145 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 2.72e-01 0.127 0.115 0.145 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 4.92e-01 0.0986 0.143 0.145 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 586488 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0283 0.121 0.145 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0343 0.139 0.145 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 822880 sc-eQTL 7.52e-01 0.0399 0.126 0.145 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 290113 sc-eQTL 1.12e-01 0.214 0.134 0.145 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 925499 sc-eQTL 5.42e-01 0.0683 0.112 0.145 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0626 0.103 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 4.01e-01 0.0854 0.102 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0648 0.121 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0182 0.101 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 7.54e-01 0.0321 0.103 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 586488 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0154 0.114 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0802 0.125 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 822880 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0964 0.0838 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 290113 sc-eQTL 6.86e-01 0.0499 0.123 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 925499 sc-eQTL 7.77e-03 0.313 0.116 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0374 0.106 0.149 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 4.86e-01 0.0698 0.1 0.149 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 7.99e-02 0.229 0.13 0.149 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 9.69e-01 0.00363 0.0939 0.149 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 3.05e-01 0.0861 0.0838 0.149 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 586488 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00134 0.107 0.149 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0341 0.125 0.149 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 822880 sc-eQTL 4.65e-02 0.206 0.103 0.149 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 290113 sc-eQTL 8.10e-01 0.03 0.125 0.149 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 925499 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0862 0.117 0.149 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 3.13e-01 0.101 0.0999 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0842 0.104 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 8.00e-01 0.033 0.13 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 6.63e-01 0.0407 0.0934 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 1.28e-02 0.249 0.099 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 586488 sc-eQTL 7.44e-01 0.0363 0.111 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 3.52e-01 -0.108 0.116 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 822880 sc-eQTL 8.51e-02 0.116 0.0671 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 290113 sc-eQTL 6.73e-01 -0.052 0.123 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 925499 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0112 0.111 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 2.79e-01 0.131 0.121 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 9.50e-01 0.00701 0.112 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 2.17e-01 -0.155 0.125 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 1.19e-01 0.162 0.103 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 9.08e-01 0.0118 0.102 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 586488 sc-eQTL 4.46e-01 0.0674 0.0883 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 1.84e-01 -0.175 0.132 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 822880 sc-eQTL 4.70e-01 0.0459 0.0634 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 290113 sc-eQTL 2.08e-01 0.16 0.126 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 925499 sc-eQTL 3.12e-01 -0.12 0.118 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0214 0.125 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -280483 sc-eQTL 6.65e-01 0.0543 0.125 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 5.54e-02 0.228 0.118 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00103 0.121 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0531 0.119 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 1.47e-03 -0.381 0.118 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 6.80e-01 0.056 0.135 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 6.34e-01 0.0355 0.0745 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -280483 sc-eQTL 3.19e-01 0.0702 0.0702 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0696 0.0794 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 3.82e-01 -0.106 0.121 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 1.40e-01 -0.105 0.071 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 8.52e-01 0.0128 0.0685 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 7.75e-01 0.0329 0.115 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 7.49e-01 -0.033 0.103 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -280483 sc-eQTL 5.89e-01 0.0435 0.0803 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 7.96e-01 0.0247 0.0954 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 7.73e-01 0.0372 0.129 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0597 0.0807 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 7.45e-01 0.0252 0.0776 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0438 0.118 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 3.55e-01 -0.107 0.115 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -280483 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0208 0.0853 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 2.05e-01 -0.13 0.102 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0918 0.126 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0129 0.0993 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 2.71e-01 0.112 0.102 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00837 0.112 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0117 0.105 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -280483 sc-eQTL 9.86e-01 0.00175 0.102 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 8.82e-01 0.0154 0.103 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 6.00e-01 0.0659 0.125 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 7.04e-01 0.0354 0.0929 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 7.04e-01 -0.041 0.108 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 6.22e-01 0.0611 0.124 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 5.97e-01 0.0511 0.0964 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -280483 sc-eQTL 1.49e-01 0.137 0.0945 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00178 0.106 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 7.80e-01 0.0344 0.123 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 3.35e-01 -0.082 0.0849 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 4.33e-01 0.0728 0.0927 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 6.45e-02 0.219 0.118 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 3.47e-01 -0.119 0.126 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -280483 sc-eQTL 4.55e-02 -0.216 0.107 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 5.64e-01 0.0703 0.122 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 5.83e-01 0.0707 0.129 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 8.91e-01 -0.014 0.102 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 5.42e-01 0.0743 0.122 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0518 0.125 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 7.82e-01 0.035 0.126 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -280483 sc-eQTL 4.25e-01 0.0936 0.117 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 1.56e-01 0.175 0.123 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0584 0.131 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 9.50e-01 0.00756 0.121 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 8.16e-01 0.0269 0.115 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 6.27e-01 0.0581 0.119 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 5.59e-01 0.0717 0.123 0.149 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -280483 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00422 0.112 0.149 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 6.41e-02 -0.19 0.102 0.149 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 5.53e-01 0.0776 0.131 0.149 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 9.01e-01 0.0118 0.0948 0.149 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 2.51e-01 0.134 0.116 0.149 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0549 0.119 0.149 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0881 0.122 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -280483 sc-eQTL 6.23e-01 0.0563 0.114 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 5.90e-01 -0.06 0.111 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 9.23e-01 0.0132 0.135 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0444 0.121 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0908 0.128 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0734 0.127 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -282437 sc-eQTL 1.31e-01 -0.179 0.118 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 4.22e-01 0.0832 0.103 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -280483 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0319 0.0916 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 2.92e-01 0.105 0.0994 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 2.71e-02 0.286 0.128 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 3.50e-02 0.193 0.0911 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00514 0.0884 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 6.29e-01 0.0592 0.122 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -282437 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0814 0.126 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 2.70e-01 -0.133 0.12 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -280483 sc-eQTL 1.81e-01 0.159 0.118 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0471 0.109 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0493 0.133 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0921 0.111 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0673 0.125 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0381 0.139 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -282437 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00796 0.112 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0914 0.107 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -280483 sc-eQTL 1.39e-01 -0.151 0.101 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 9.60e-02 -0.172 0.103 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 1.81e-01 0.154 0.115 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0377 0.0907 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 1.79e-01 0.14 0.104 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 2.20e-01 0.148 0.121 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -282437 sc-eQTL 3.73e-01 0.108 0.121 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00167 0.15 0.13 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 9.69e-01 0.0054 0.14 0.13 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0629 0.129 0.13 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 8.13e-01 0.0286 0.121 0.13 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0168 0.106 0.13 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 586488 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0536 0.15 0.13 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 9.99e-01 0.000127 0.146 0.13 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 822880 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0192 0.116 0.13 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 290113 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0723 0.142 0.13 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 925499 sc-eQTL 5.86e-01 0.0772 0.141 0.13 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 5.34e-01 0.0797 0.128 0.148 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -280483 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0135 0.117 0.148 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 1.22e-01 -0.193 0.124 0.148 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 9.56e-02 0.203 0.121 0.148 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 3.32e-02 -0.21 0.0978 0.148 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0106 0.0911 0.148 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 4.27e-01 0.087 0.109 0.148 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 9.62e-01 0.00531 0.112 0.15 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -280483 sc-eQTL 5.72e-01 0.0625 0.111 0.15 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0275 0.117 0.15 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 2.31e-01 0.161 0.134 0.15 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 3.35e-01 -0.092 0.0952 0.15 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0601 0.103 0.15 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 3.84e-01 0.113 0.129 0.15 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 5.64e-01 0.0647 0.112 0.151 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 1.64e-01 -0.16 0.115 0.151 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0826 0.127 0.151 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 1.88e-01 -0.17 0.129 0.151 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00189 0.113 0.151 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 9.79e-01 0.00333 0.129 0.151 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 822880 sc-eQTL 7.70e-01 0.0231 0.0787 0.151 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 925499 sc-eQTL 8.25e-01 0.0256 0.116 0.151 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 4.62e-01 0.0527 0.0715 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 7.01e-01 0.0323 0.0842 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 1.80e-01 -0.168 0.125 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0195 0.0917 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 3.79e-01 0.0633 0.0718 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 7.13e-01 0.0367 0.0996 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 2.63e-01 0.103 0.0918 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 8.03e-01 -0.022 0.088 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 1.91e-01 -0.176 0.134 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 8.18e-01 0.0244 0.106 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0408 0.0921 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 1.96e-01 -0.137 0.105 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 7.70e-01 0.0444 0.151 0.161 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -280483 sc-eQTL 4.05e-01 0.117 0.14 0.161 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 2.35e-01 0.174 0.146 0.161 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 8.84e-01 0.021 0.144 0.161 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 2.60e-01 -0.154 0.136 0.161 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 9.14e-01 0.0161 0.15 0.161 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 4.63e-01 0.107 0.146 0.161 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0718 0.111 0.151 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 3.17e-01 0.109 0.108 0.151 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 8.99e-01 0.0158 0.125 0.151 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0148 0.114 0.151 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 1.01e-01 0.177 0.108 0.151 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 5.10e-01 0.0768 0.116 0.151 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 1.03e-01 -0.155 0.0944 0.152 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 9.54e-01 0.00453 0.0793 0.152 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 2.27e-01 0.149 0.123 0.152 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 9.97e-01 0.000435 0.108 0.152 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 4.37e-01 0.0823 0.106 0.152 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 9.50e-01 0.00693 0.11 0.152 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 2.05e-01 -0.163 0.128 0.161 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0867 0.124 0.161 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0964 0.125 0.161 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 9.22e-01 0.0106 0.108 0.161 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 6.80e-01 0.0529 0.128 0.161 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 6.99e-01 0.0513 0.133 0.161 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 822880 sc-eQTL 1.64e-01 0.161 0.116 0.161 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 925499 sc-eQTL 1.96e-01 0.122 0.0937 0.161 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 9.91e-01 0.00102 0.0867 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 5.85e-01 0.0423 0.0774 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 4.76e-01 0.0941 0.132 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 7.05e-01 0.0296 0.0779 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 3.34e-01 0.0687 0.0709 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 586488 sc-eQTL 5.89e-01 0.0495 0.0915 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 7.14e-02 -0.208 0.115 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 822880 sc-eQTL 7.67e-01 0.0239 0.0805 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 290113 sc-eQTL 1.62e-01 0.169 0.12 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 925499 sc-eQTL 2.78e-02 0.267 0.12 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 4.03e-01 0.0818 0.0976 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0182 0.0955 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0363 0.127 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 5.20e-01 0.0596 0.0924 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 4.07e-02 0.193 0.0939 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 586488 sc-eQTL 5.85e-01 0.0634 0.116 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 1.74e-01 -0.159 0.116 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 822880 sc-eQTL 6.40e-02 0.102 0.0547 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 290113 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00496 0.12 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 925499 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0324 0.111 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 3.47e-01 0.0624 0.0662 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 8.31e-01 0.0168 0.0785 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 4.34e-02 -0.255 0.125 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0296 0.0907 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0043 0.0683 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 9.16e-01 -0.01 0.0947 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 2.15e-01 -0.109 0.0879 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 2.76e-01 0.0805 0.0736 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 2.48e-01 0.154 0.133 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0649 0.0997 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 2.80e-01 0.108 0.0997 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 4.41e-01 0.0812 0.105 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 360000 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0269 0.0895 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -280483 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0598 0.0825 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -859246 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0303 0.0902 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -388044 sc-eQTL 2.46e-01 0.148 0.127 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -88552 sc-eQTL 3.64e-01 0.0734 0.0808 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -152616 sc-eQTL 7.90e-01 0.0209 0.0783 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 sc-eQTL 4.57e-01 0.087 0.117 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -282437 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00933 0.128 0.151 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000198015 MRPL42 -178157 eQTL 3.23e-03 -0.0781 0.0265 0.0 0.0 0.16


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000102189 \N 360000 1.26e-06 9.25e-07 2.7e-07 4.88e-07 1.56e-07 4.12e-07 9.74e-07 2.68e-07 1.09e-06 3.13e-07 1.32e-06 5.77e-07 1.53e-06 2.54e-07 4.3e-07 4.96e-07 7.78e-07 5.27e-07 3.79e-07 4.19e-07 2.86e-07 7.73e-07 6.63e-07 3.93e-07 1.86e-06 2.44e-07 6.16e-07 5.44e-07 8.4e-07 9.11e-07 5.3e-07 3.86e-08 9.36e-08 3.51e-07 4.22e-07 2.94e-07 2.9e-07 1.5e-07 1.6e-07 9.74e-09 1.2e-07 1.22e-06 6.87e-08 2.67e-08 1.82e-07 7.77e-08 1.8e-07 8.74e-08 6.12e-08