logo

Genes within 1Mb (chr12:93260696:AAGGAAAGAGGGTG:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0123 0.0807 0.092 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 7.48e-01 0.0257 0.08 0.092 B L1
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0422 0.121 0.092 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 2.43e-01 -0.105 0.0897 0.092 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 4.42e-01 0.061 0.0793 0.092 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 557853 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0972 0.0894 0.092 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 1.90e-01 -0.162 0.123 0.092 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 794245 sc-eQTL 8.80e-01 0.00923 0.0611 0.092 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 261478 sc-eQTL 1.46e-01 -0.179 0.123 0.092 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 896864 sc-eQTL 1.53e-02 0.292 0.119 0.092 B L1
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 1.36e-01 0.124 0.083 0.092 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -309118 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0151 0.0807 0.092 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 4.30e-03 -0.24 0.0831 0.092 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 4.31e-02 -0.28 0.137 0.092 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 7.44e-02 -0.143 0.0795 0.092 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 2.49e-01 0.0856 0.0741 0.092 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 9.22e-01 0.0127 0.129 0.092 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 8.53e-02 -0.16 0.0925 0.092 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -309118 sc-eQTL 1.55e-01 0.152 0.106 0.092 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 8.28e-04 -0.364 0.107 0.092 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 9.43e-02 -0.216 0.129 0.092 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0439 0.0768 0.092 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 2.76e-01 0.104 0.0954 0.092 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 6.86e-01 0.0552 0.136 0.092 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 3.76e-01 -0.106 0.12 0.095 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 5.31e-03 0.358 0.127 0.095 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 7.89e-01 0.0392 0.146 0.095 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 2.77e-01 0.131 0.12 0.095 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 4.00e-02 0.249 0.12 0.095 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 3.52e-01 -0.13 0.139 0.095 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 794245 sc-eQTL 7.78e-01 0.0349 0.123 0.095 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 896864 sc-eQTL 2.68e-01 0.141 0.127 0.095 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00818 0.0719 0.092 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0397 0.082 0.092 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 2.31e-01 0.181 0.151 0.092 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 1.83e-01 0.139 0.104 0.092 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 8.64e-02 -0.134 0.0776 0.092 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 8.70e-01 0.0173 0.105 0.092 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 3.88e-01 0.0888 0.103 0.092 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -309118 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0191 0.096 0.092 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0859 0.1 0.092 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 1.35e-01 -0.215 0.143 0.092 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 5.59e-01 0.0545 0.0931 0.092 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 8.11e-01 0.0221 0.0922 0.092 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 7.05e-01 0.0499 0.132 0.092 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -311072 sc-eQTL 8.28e-01 0.0326 0.15 0.092 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 1.35e-01 0.196 0.13 0.092 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -309118 sc-eQTL 4.95e-01 0.0829 0.121 0.092 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 2.24e-01 -0.138 0.114 0.092 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0276 0.138 0.092 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 2.35e-02 0.222 0.0973 0.092 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 3.51e-01 0.0852 0.0911 0.092 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 1.41e-02 -0.264 0.106 0.092 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 3.31e-01 0.163 0.167 0.077 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 9.71e-01 -0.0051 0.141 0.077 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 1.21e-01 -0.257 0.165 0.077 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 5.72e-01 0.0836 0.148 0.077 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 6.02e-01 0.0956 0.183 0.077 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 557853 sc-eQTL 3.15e-01 0.156 0.154 0.077 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 7.03e-01 -0.068 0.178 0.077 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 794245 sc-eQTL 8.07e-01 0.0394 0.161 0.077 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 261478 sc-eQTL 7.41e-01 -0.057 0.172 0.077 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 896864 sc-eQTL 6.93e-01 0.0566 0.143 0.077 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 1.34e-01 0.183 0.121 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0595 0.121 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 6.11e-01 0.073 0.143 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 3.08e-01 0.122 0.119 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 6.76e-04 0.409 0.119 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 557853 sc-eQTL 3.50e-01 -0.126 0.135 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0539 0.148 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 794245 sc-eQTL 5.88e-01 0.0542 0.0998 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 261478 sc-eQTL 5.53e-01 0.0869 0.146 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 896864 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0805 0.14 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0236 0.127 0.093 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 3.59e-01 -0.11 0.12 0.093 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000814 0.157 0.093 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 2.42e-01 -0.131 0.112 0.093 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 1.87e-01 0.133 0.1 0.093 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 557853 sc-eQTL 3.33e-01 -0.124 0.128 0.093 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 3.10e-01 -0.152 0.149 0.093 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 794245 sc-eQTL 5.60e-01 0.0725 0.124 0.093 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 261478 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000432 0.149 0.093 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 896864 sc-eQTL 6.98e-01 0.0544 0.14 0.093 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 5.72e-01 0.0655 0.116 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 5.73e-01 0.0677 0.12 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 9.17e-01 0.0158 0.151 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 2.79e-01 -0.117 0.108 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 9.61e-01 0.00568 0.116 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 557853 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0403 0.128 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 1.71e-01 -0.183 0.133 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 794245 sc-eQTL 2.81e-01 0.0841 0.0779 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 261478 sc-eQTL 4.48e-01 -0.108 0.142 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 896864 sc-eQTL 6.84e-04 0.429 0.125 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0505 0.142 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0742 0.131 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 8.67e-01 0.0248 0.148 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 3.05e-01 -0.125 0.122 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 5.11e-01 0.0785 0.119 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 557853 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0118 0.104 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 4.89e-01 -0.107 0.155 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 794245 sc-eQTL 5.03e-02 -0.145 0.0737 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 261478 sc-eQTL 1.48e-01 -0.215 0.148 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 896864 sc-eQTL 1.08e-01 0.223 0.138 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 2.21e-01 0.176 0.143 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309118 sc-eQTL 7.31e-01 -0.05 0.145 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 2.53e-01 -0.158 0.138 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 4.54e-01 -0.105 0.14 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0807 0.137 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 5.22e-02 0.271 0.139 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 8.12e-01 0.0373 0.157 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 4.37e-01 0.0687 0.0881 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309118 sc-eQTL 7.38e-01 -0.028 0.0833 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 1.88e-03 -0.29 0.0921 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 2.83e-01 -0.154 0.143 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 2.03e-01 -0.107 0.0842 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 4.05e-01 0.0676 0.081 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 5.84e-01 0.0746 0.136 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 3.09e-01 0.126 0.123 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309118 sc-eQTL 8.52e-01 0.018 0.0963 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0779 0.114 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 4.08e-01 -0.128 0.154 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0472 0.0967 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 5.31e-02 0.179 0.0922 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 3.98e-01 -0.12 0.142 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 7.08e-01 0.0526 0.14 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309118 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0649 0.103 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 1.87e-01 -0.163 0.123 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 7.07e-01 0.0573 0.153 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 5.77e-01 0.0672 0.12 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 7.00e-01 0.0478 0.124 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00788 0.136 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00812 0.122 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309118 sc-eQTL 5.14e-02 0.23 0.117 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 2.61e-02 -0.266 0.119 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 4.65e-01 -0.107 0.146 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000409 0.108 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0577 0.125 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 7.76e-01 0.041 0.144 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 1.59e-01 -0.16 0.113 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309118 sc-eQTL 3.33e-01 0.108 0.112 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 4.18e-03 -0.356 0.123 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 1.28e-01 -0.22 0.144 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0784 0.1 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 9.75e-01 0.00347 0.109 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 7.04e-01 0.0531 0.14 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 2.83e-01 -0.162 0.151 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309118 sc-eQTL 2.06e-02 -0.299 0.128 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0541 0.146 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 3.88e-01 -0.133 0.154 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 4.78e-01 -0.087 0.122 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 6.26e-01 0.0711 0.146 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 2.60e-01 -0.168 0.149 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 1.13e-01 0.234 0.147 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309118 sc-eQTL 6.70e-02 0.251 0.136 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 3.48e-01 -0.136 0.144 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 8.08e-02 -0.267 0.152 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0107 0.141 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 6.67e-01 0.058 0.135 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 4.22e-01 -0.112 0.139 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 6.12e-01 0.0754 0.148 0.091 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309118 sc-eQTL 4.62e-01 0.0995 0.135 0.091 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 4.60e-02 -0.247 0.123 0.091 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 2.13e-01 -0.197 0.158 0.091 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 7.74e-02 0.202 0.114 0.091 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0355 0.141 0.091 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 5.77e-02 -0.272 0.143 0.091 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 9.81e-01 0.00342 0.141 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309118 sc-eQTL 3.96e-01 -0.111 0.131 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0853 0.128 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 2.29e-02 0.352 0.153 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 3.78e-01 0.122 0.138 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0378 0.147 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 5.65e-01 0.0842 0.146 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -311072 sc-eQTL 1.80e-01 -0.183 0.136 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 7.57e-01 0.0376 0.121 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309118 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0783 0.107 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0844 0.117 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 9.90e-02 -0.251 0.151 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 6.46e-01 0.0496 0.108 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0305 0.104 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 9.02e-01 0.0177 0.144 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -311072 sc-eQTL 9.09e-01 0.0169 0.148 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 6.88e-01 0.0585 0.145 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309118 sc-eQTL 4.38e-01 -0.111 0.143 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 8.55e-01 -0.024 0.131 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 9.84e-01 0.00326 0.161 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 4.17e-01 -0.109 0.134 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 4.94e-01 -0.103 0.15 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0562 0.168 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -311072 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0561 0.136 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 8.00e-01 0.0316 0.125 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309118 sc-eQTL 5.78e-01 0.0664 0.119 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 1.54e-01 -0.172 0.12 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 3.14e-01 -0.136 0.135 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 6.90e-01 0.0424 0.106 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 4.06e-01 0.102 0.122 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 1.18e-01 0.221 0.141 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -311072 sc-eQTL 2.91e-01 0.15 0.141 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 5.97e-01 0.106 0.2 0.081 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 7.06e-01 0.0707 0.187 0.081 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 8.71e-02 -0.293 0.17 0.081 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 4.00e-02 0.328 0.158 0.081 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 8.91e-01 0.0194 0.142 0.081 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 557853 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0149 0.2 0.081 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 4.44e-01 0.149 0.194 0.081 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 794245 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0178 0.154 0.081 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 261478 sc-eQTL 7.38e-01 0.0633 0.189 0.081 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 896864 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0359 0.188 0.081 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 1.72e-01 0.198 0.144 0.093 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309118 sc-eQTL 1.34e-01 0.199 0.132 0.093 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 3.08e-01 0.144 0.141 0.093 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 3.57e-01 0.127 0.138 0.093 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 7.21e-01 0.0401 0.112 0.093 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 1.86e-01 0.136 0.103 0.093 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 1.68e-01 -0.171 0.123 0.093 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 3.56e-01 0.118 0.128 0.092 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309118 sc-eQTL 3.42e-01 0.12 0.126 0.092 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 3.27e-02 -0.283 0.132 0.092 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 1.29e-01 -0.233 0.153 0.092 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 3.26e-01 -0.107 0.109 0.092 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 8.00e-01 0.0298 0.117 0.092 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0675 0.148 0.092 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 7.54e-01 0.0403 0.129 0.098 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 4.49e-03 0.372 0.129 0.098 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 1.85e-01 -0.194 0.146 0.098 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 7.86e-01 0.0405 0.149 0.098 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 9.56e-01 0.00719 0.129 0.098 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 8.47e-01 0.0286 0.148 0.098 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 794245 sc-eQTL 8.34e-01 0.0189 0.0903 0.098 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 896864 sc-eQTL 3.44e-01 0.126 0.132 0.098 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 7.06e-01 0.0312 0.0826 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 7.08e-01 0.0365 0.0973 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 4.12e-01 0.119 0.144 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 5.29e-01 0.0667 0.106 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 3.35e-01 -0.08 0.0828 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 2.38e-01 0.136 0.115 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0881 0.108 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0869 0.103 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 6.72e-01 0.0668 0.157 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 2.35e-01 0.147 0.123 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 3.69e-02 -0.224 0.107 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00857 0.124 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 7.50e-02 0.32 0.179 0.085 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309118 sc-eQTL 1.67e-03 -0.518 0.162 0.085 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 3.59e-01 0.161 0.175 0.085 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 6.59e-01 0.0759 0.172 0.085 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 1.13e-01 0.258 0.162 0.085 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 6.75e-01 0.075 0.179 0.085 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 2.52e-01 -0.2 0.173 0.085 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 9.97e-01 0.00045 0.127 0.096 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0444 0.124 0.096 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0226 0.142 0.096 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 5.04e-01 0.0868 0.13 0.096 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0844 0.123 0.096 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0945 0.133 0.096 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 2.65e-01 0.125 0.112 0.093 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 9.62e-01 0.00446 0.0937 0.093 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 6.18e-01 0.0729 0.146 0.093 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 6.52e-01 0.0578 0.128 0.093 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0987 0.125 0.093 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 7.37e-01 0.0436 0.13 0.093 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 2.20e-01 -0.194 0.158 0.099 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 1.64e-01 0.213 0.152 0.099 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 7.70e-02 0.273 0.153 0.099 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0247 0.133 0.099 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 6.92e-02 0.286 0.156 0.099 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0918 0.163 0.099 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 794245 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0177 0.143 0.099 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 896864 sc-eQTL 4.19e-01 0.0938 0.116 0.099 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 1.38e-01 0.154 0.103 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0794 0.0927 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 3.73e-01 0.141 0.158 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 4.10e-01 0.077 0.0932 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 2.66e-03 0.253 0.0833 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 557853 sc-eQTL 2.61e-01 -0.123 0.109 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 3.13e-01 -0.14 0.138 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 794245 sc-eQTL 4.82e-01 0.0679 0.0963 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 261478 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00321 0.144 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 896864 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0487 0.146 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 7.55e-01 0.0354 0.113 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 4.25e-01 0.0883 0.111 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 9.09e-01 0.0167 0.147 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 2.34e-01 -0.128 0.107 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 9.36e-01 0.00881 0.11 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 557853 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0586 0.134 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 7.69e-02 -0.239 0.134 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 794245 sc-eQTL 8.38e-01 0.0131 0.0639 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 261478 sc-eQTL 1.33e-01 -0.209 0.138 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 896864 sc-eQTL 6.88e-04 0.432 0.125 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0212 0.0767 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0202 0.0908 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 2.40e-01 0.172 0.146 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 1.78e-01 0.141 0.104 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 1.17e-01 -0.124 0.0785 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 4.52e-01 0.0824 0.109 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 4.81e-01 0.0728 0.103 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0434 0.0863 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 7.05e-01 0.0592 0.156 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 3.87e-01 0.101 0.117 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 3.47e-01 -0.11 0.117 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 3.78e-01 -0.109 0.123 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 331365 sc-eQTL 3.72e-01 0.0943 0.106 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -309118 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00943 0.0975 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -887881 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0793 0.106 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -416679 sc-eQTL 6.61e-02 -0.276 0.149 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -117187 sc-eQTL 5.24e-01 0.0609 0.0955 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -181251 sc-eQTL 7.63e-01 0.0279 0.0925 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -206792 sc-eQTL 7.27e-01 0.0482 0.138 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -311072 sc-eQTL 5.45e-01 0.0918 0.152 0.093 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000102189 EEA1 331365 eQTL 0.0135 -0.0699 0.0282 0.0 0.0 0.0873

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000257322 \N 45017 4.3e-06 3.01e-05 8.13e-07 4.25e-06 1.51e-06 1.35e-06 1.24e-05 1.35e-05 8.69e-05 1.77e-05 0.000342 2.94e-05 5.36e-05 1.4e-05 3.54e-06 8.95e-06 4.01e-06 6.85e-06 7.29e-07 1.05e-06 3.41e-06 2.15e-05 5.36e-06 1.22e-06 2.84e-05 9.19e-07 3.68e-06 1.57e-05 8.51e-06 6.2e-06 0.00022 3.04e-07 3.9e-07 1.59e-06 2.5e-06 6.79e-07 3.4e-07 1.58e-07 7.31e-07 2.22e-07 2.84e-07 1.65e-05 4.63e-07 7.18e-09 6.22e-07 1.74e-06 3.64e-07 2.2e-07 6.14e-08