logo

Genes within 1Mb (chr12:93260484:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0651 0.0965 0.071 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 8.44e-01 0.0189 0.0958 0.071 B L1
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 2.31e-01 0.174 0.145 0.071 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0921 0.108 0.071 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 5.96e-01 0.0504 0.0951 0.071 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 557641 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0961 0.107 0.071 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 2.55e-02 -0.33 0.147 0.071 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 794033 sc-eQTL 4.42e-01 0.0564 0.0731 0.071 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 261266 sc-eQTL 2.01e-01 -0.189 0.147 0.071 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 896652 sc-eQTL 7.92e-02 0.254 0.144 0.071 B L1
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 1.67e-01 0.135 0.0975 0.071 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -309330 sc-eQTL 8.35e-01 0.0197 0.0947 0.071 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 4.45e-03 -0.28 0.0975 0.071 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 1.01e-01 -0.267 0.162 0.071 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 1.81e-01 -0.126 0.0936 0.071 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 6.95e-02 0.158 0.0866 0.071 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0336 0.152 0.071 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 9.31e-02 -0.185 0.11 0.071 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -309330 sc-eQTL 2.98e-01 0.132 0.126 0.071 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 1.10e-02 -0.33 0.129 0.071 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 1.41e-01 -0.226 0.153 0.071 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0266 0.0911 0.071 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 4.90e-01 0.0784 0.113 0.071 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0348 0.162 0.071 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 2.64e-01 -0.157 0.14 0.074 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 2.00e-03 0.465 0.149 0.074 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 8.91e-01 0.0236 0.172 0.074 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 4.26e-01 0.113 0.141 0.074 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 2.70e-01 0.157 0.142 0.074 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 1.11e-01 -0.261 0.163 0.074 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 794033 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0755 0.145 0.074 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 896652 sc-eQTL 2.39e-01 0.176 0.149 0.074 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 6.91e-01 0.0342 0.0858 0.071 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 7.92e-01 0.0259 0.098 0.071 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 5.43e-01 0.11 0.18 0.071 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 8.63e-01 0.0215 0.124 0.071 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 4.73e-02 -0.184 0.0924 0.071 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 2.21e-01 -0.154 0.125 0.071 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 8.44e-01 0.0241 0.122 0.071 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -309330 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00219 0.114 0.071 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00798 0.119 0.071 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 7.58e-02 -0.304 0.17 0.071 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0109 0.111 0.071 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00998 0.11 0.071 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 9.15e-01 0.0167 0.157 0.071 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -311284 sc-eQTL 4.17e-01 0.145 0.178 0.071 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 1.91e-01 0.201 0.153 0.071 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -309330 sc-eQTL 1.40e-01 0.21 0.142 0.071 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 1.61e-01 -0.187 0.133 0.071 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 8.03e-01 0.0404 0.162 0.071 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 1.38e-02 0.283 0.114 0.071 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 2.40e-01 0.126 0.107 0.071 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 1.23e-01 -0.195 0.126 0.071 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 9.85e-01 0.00393 0.21 0.054 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 6.55e-01 0.0789 0.177 0.054 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 2.82e-01 -0.223 0.207 0.054 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 7.25e-01 0.0649 0.184 0.054 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0531 0.229 0.054 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 557641 sc-eQTL 5.15e-01 0.126 0.193 0.054 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 2.15e-01 -0.275 0.221 0.054 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 794033 sc-eQTL 6.12e-01 0.102 0.201 0.054 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 261266 sc-eQTL 9.89e-01 0.00302 0.215 0.054 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 896652 sc-eQTL 1.74e-01 0.243 0.178 0.054 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 2.82e-02 0.313 0.142 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0992 0.142 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 7.66e-01 0.0503 0.169 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 5.04e-01 0.0941 0.141 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 1.18e-05 0.614 0.137 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 557641 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0634 0.159 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 1.42e-01 -0.256 0.174 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 794033 sc-eQTL 3.45e-01 0.111 0.117 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 261266 sc-eQTL 6.66e-01 0.0745 0.172 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 896652 sc-eQTL 3.36e-01 -0.159 0.165 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 9.02e-01 0.0192 0.155 0.071 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 4.45e-01 -0.112 0.146 0.071 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 9.41e-01 0.0141 0.191 0.071 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 3.14e-01 -0.138 0.137 0.071 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 4.05e-01 0.102 0.122 0.071 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 557641 sc-eQTL 1.83e-01 -0.208 0.155 0.071 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 3.78e-01 -0.161 0.182 0.071 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 794033 sc-eQTL 7.90e-01 0.0403 0.151 0.071 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 261266 sc-eQTL 4.44e-01 -0.139 0.181 0.071 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 896652 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0274 0.171 0.071 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 3.76e-01 0.121 0.136 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 7.82e-01 0.0392 0.142 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 7.72e-02 0.314 0.177 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 3.96e-01 -0.108 0.127 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 8.33e-01 -0.029 0.137 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 557641 sc-eQTL 3.23e-01 -0.15 0.151 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 1.30e-01 -0.24 0.158 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 794033 sc-eQTL 4.34e-02 0.186 0.0914 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 261266 sc-eQTL 5.24e-01 -0.107 0.168 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 896652 sc-eQTL 4.51e-03 0.426 0.148 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0882 0.169 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 2.09e-01 -0.196 0.155 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 2.46e-01 0.203 0.175 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 4.01e-01 -0.122 0.145 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 6.07e-01 0.0731 0.142 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 557641 sc-eQTL 3.16e-01 -0.124 0.123 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 1.95e-01 -0.238 0.183 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 794033 sc-eQTL 1.06e-01 -0.143 0.0879 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 261266 sc-eQTL 3.31e-01 -0.172 0.176 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 896652 sc-eQTL 4.36e-01 0.129 0.165 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 2.20e-01 0.21 0.17 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309330 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0809 0.172 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0572 0.164 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 4.36e-01 -0.13 0.166 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 2.34e-01 -0.194 0.163 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 2.61e-02 0.368 0.164 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 7.09e-01 0.0696 0.186 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 5.88e-01 0.0564 0.104 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309330 sc-eQTL 9.17e-01 0.0102 0.0982 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 7.62e-04 -0.369 0.108 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0799 0.169 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0581 0.0996 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 3.59e-02 0.2 0.0947 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 8.28e-01 0.035 0.161 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 3.43e-01 0.139 0.146 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309330 sc-eQTL 6.16e-01 0.0573 0.114 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0616 0.135 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 3.68e-01 -0.164 0.182 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 2.80e-01 -0.124 0.114 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 1.33e-01 0.165 0.11 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 3.25e-01 -0.165 0.168 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 4.51e-01 0.128 0.169 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309330 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0129 0.125 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 3.62e-01 -0.136 0.149 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 6.55e-01 0.0823 0.184 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 2.72e-01 0.159 0.145 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 4.56e-01 0.111 0.149 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 8.38e-01 0.0335 0.164 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0303 0.144 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309330 sc-eQTL 1.24e-01 0.215 0.139 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 2.73e-01 -0.156 0.142 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 5.11e-01 -0.113 0.172 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0473 0.128 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0538 0.148 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 5.01e-01 -0.115 0.17 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 4.48e-01 -0.102 0.135 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309330 sc-eQTL 2.25e-01 0.161 0.133 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 3.50e-02 -0.313 0.147 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 2.27e-01 -0.208 0.172 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0805 0.119 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 9.73e-01 0.00433 0.13 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 8.78e-01 0.0256 0.166 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 5.26e-01 -0.117 0.185 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309330 sc-eQTL 4.30e-02 -0.321 0.157 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 4.26e-01 -0.142 0.179 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 5.81e-01 -0.104 0.189 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0302 0.15 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 3.58e-01 0.164 0.178 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 2.73e-01 -0.201 0.182 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 4.06e-01 0.148 0.178 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309330 sc-eQTL 6.79e-01 0.0685 0.166 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 2.33e-01 -0.208 0.174 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 8.89e-02 -0.314 0.184 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 5.11e-01 0.112 0.17 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 9.41e-01 -0.012 0.163 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 2.22e-01 -0.205 0.168 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 2.22e-01 0.214 0.174 0.069 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309330 sc-eQTL 2.07e-01 0.201 0.159 0.069 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 1.18e-01 -0.229 0.146 0.069 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 3.61e-01 -0.171 0.186 0.069 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 9.09e-02 0.228 0.134 0.069 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0557 0.166 0.069 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 2.33e-01 -0.202 0.169 0.069 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00442 0.164 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309330 sc-eQTL 2.85e-01 -0.164 0.153 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 2.77e-01 -0.162 0.149 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 8.56e-02 0.311 0.18 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 5.73e-01 0.0912 0.161 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0652 0.171 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 4.76e-01 0.122 0.171 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -311284 sc-eQTL 2.97e-01 -0.166 0.159 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 8.84e-01 -0.021 0.144 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309330 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0411 0.128 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0179 0.139 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 2.69e-02 -0.398 0.179 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0533 0.128 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 3.51e-01 -0.115 0.123 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0116 0.17 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -311284 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0147 0.175 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 5.77e-01 0.0964 0.172 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309330 sc-eQTL 2.73e-01 -0.186 0.17 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 6.21e-01 0.0769 0.156 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0207 0.191 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 5.29e-01 -0.1 0.159 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0386 0.179 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 2.44e-01 -0.232 0.198 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -311284 sc-eQTL 7.38e-01 0.0538 0.161 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 6.37e-01 0.0694 0.147 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309330 sc-eQTL 3.10e-01 0.142 0.14 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 3.50e-01 -0.133 0.142 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 4.96e-01 -0.108 0.159 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 8.86e-01 -0.018 0.125 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 6.51e-01 0.065 0.144 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 1.10e-01 0.265 0.165 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -311284 sc-eQTL 3.05e-02 0.358 0.165 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 8.65e-01 0.0404 0.237 0.063 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 6.06e-01 0.114 0.221 0.063 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 1.97e-01 -0.263 0.202 0.063 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 1.23e-01 0.293 0.189 0.063 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0379 0.168 0.063 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 557641 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00449 0.236 0.063 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 5.20e-01 0.148 0.23 0.063 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 794033 sc-eQTL 9.79e-01 0.00472 0.183 0.063 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 261266 sc-eQTL 5.11e-01 0.147 0.223 0.063 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 896652 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0535 0.223 0.063 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 6.95e-02 0.312 0.171 0.072 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309330 sc-eQTL 1.47e-01 0.229 0.157 0.072 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 4.82e-01 0.118 0.168 0.072 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 2.45e-01 0.191 0.164 0.072 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 4.50e-01 0.101 0.133 0.072 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 1.85e-01 0.162 0.122 0.072 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 2.45e-01 -0.171 0.147 0.072 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 3.28e-01 0.15 0.153 0.071 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309330 sc-eQTL 4.04e-01 0.126 0.151 0.071 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 2.10e-01 -0.2 0.159 0.071 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 4.37e-02 -0.37 0.183 0.071 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 4.44e-01 -0.1 0.13 0.071 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00379 0.141 0.071 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 4.08e-01 -0.147 0.177 0.071 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 8.10e-01 0.0368 0.153 0.076 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 3.51e-03 0.454 0.153 0.076 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 9.93e-02 -0.286 0.172 0.076 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0806 0.176 0.076 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0635 0.153 0.076 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0442 0.176 0.076 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 794033 sc-eQTL 9.73e-01 0.00358 0.107 0.076 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 896652 sc-eQTL 2.91e-01 0.166 0.157 0.076 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 2.63e-01 0.11 0.098 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 2.72e-01 0.127 0.115 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 9.72e-01 0.006 0.172 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0486 0.126 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 2.23e-01 -0.12 0.0983 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0312 0.137 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0663 0.127 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 3.04e-01 -0.125 0.121 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 9.63e-01 0.00868 0.186 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 6.14e-01 0.074 0.146 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 1.21e-01 -0.197 0.127 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 4.09e-01 -0.121 0.146 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 2.74e-01 0.24 0.219 0.07 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -309330 sc-eQTL 5.66e-03 -0.557 0.198 0.07 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 5.81e-01 0.118 0.213 0.07 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 4.66e-01 0.153 0.209 0.07 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 1.42e-01 0.291 0.197 0.07 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 9.16e-01 0.0229 0.217 0.07 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 3.81e-01 -0.186 0.211 0.07 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 7.77e-01 0.0429 0.151 0.073 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 7.64e-01 0.0443 0.147 0.073 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 4.92e-01 -0.117 0.17 0.073 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0714 0.154 0.073 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 4.72e-01 -0.106 0.147 0.073 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 4.31e-01 -0.125 0.158 0.073 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 5.76e-01 0.0744 0.133 0.072 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 8.04e-01 0.0276 0.111 0.072 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 3.96e-01 0.147 0.172 0.072 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 4.58e-01 0.113 0.151 0.072 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 2.34e-01 -0.176 0.147 0.072 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0828 0.153 0.072 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 2.84e-01 -0.205 0.19 0.079 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 4.38e-02 0.37 0.182 0.079 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 2.70e-02 0.41 0.184 0.079 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 7.50e-01 0.0512 0.16 0.079 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 2.79e-01 0.206 0.19 0.079 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 3.63e-01 -0.179 0.196 0.079 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 794033 sc-eQTL 4.82e-01 -0.121 0.172 0.079 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 896652 sc-eQTL 3.94e-01 0.119 0.139 0.079 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 9.20e-02 0.207 0.122 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0952 0.11 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 3.00e-01 0.194 0.187 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 4.37e-01 0.0861 0.111 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 2.35e-03 0.304 0.0987 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 557641 sc-eQTL 2.84e-01 -0.139 0.13 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 6.94e-02 -0.298 0.163 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 794033 sc-eQTL 4.77e-01 0.0814 0.114 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 261266 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0936 0.171 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 896652 sc-eQTL 4.37e-01 -0.135 0.173 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 8.50e-01 0.0254 0.134 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 6.69e-01 0.0561 0.131 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 4.74e-02 0.344 0.172 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 3.82e-01 -0.111 0.127 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0257 0.13 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 557641 sc-eQTL 2.77e-01 -0.173 0.159 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 2.22e-02 -0.365 0.158 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 794033 sc-eQTL 3.66e-01 0.0685 0.0756 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 261266 sc-eQTL 2.07e-01 -0.208 0.164 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 896652 sc-eQTL 1.02e-02 0.389 0.15 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 7.54e-01 0.0287 0.0914 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 9.17e-01 0.0113 0.108 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 6.58e-01 0.0775 0.175 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 9.40e-01 0.0094 0.125 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 1.27e-01 -0.144 0.0936 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0835 0.13 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 4.29e-01 0.0965 0.122 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 7.31e-01 0.0352 0.102 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 5.76e-01 0.103 0.184 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 8.43e-01 0.0273 0.138 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 1.59e-01 -0.194 0.138 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 2.30e-01 -0.175 0.145 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 331153 sc-eQTL 8.38e-01 0.0257 0.126 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -309330 sc-eQTL 6.79e-01 0.048 0.116 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -888093 sc-eQTL 9.28e-01 0.0115 0.127 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -416891 sc-eQTL 3.22e-02 -0.382 0.177 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -117399 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0115 0.114 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -181463 sc-eQTL 8.28e-01 -0.024 0.11 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -207004 sc-eQTL 9.50e-01 0.0102 0.164 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -311284 sc-eQTL 2.49e-01 0.208 0.18 0.071 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000102189 EEA1 331153 eQTL 0.0212 -0.0696 0.0301 0.0 0.0 0.0716

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina