Genes within 1Mb (chr12:93218049:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0204 0.0605 0.182 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 8.89e-01 -0.00839 0.06 0.182 B L1
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0804 0.0907 0.182 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 4.29e-01 0.0534 0.0675 0.182 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 3.57e-01 0.0549 0.0595 0.182 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 515206 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0416 0.0672 0.182 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 1.26e-01 -0.142 0.0925 0.182 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 751598 sc-eQTL 4.39e-02 -0.0921 0.0454 0.182 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 218831 sc-eQTL 5.70e-01 0.0527 0.0925 0.182 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 854217 sc-eQTL 7.29e-01 0.0315 0.0908 0.182 B L1
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 7.64e-02 0.112 0.0631 0.182 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -351765 sc-eQTL 5.29e-01 0.0388 0.0614 0.182 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 5.08e-01 0.0428 0.0645 0.182 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 3.40e-01 0.101 0.106 0.182 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 2.18e-01 0.0752 0.0608 0.182 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 9.77e-01 0.00167 0.0567 0.182 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 6.85e-02 -0.179 0.0978 0.182 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 2.48e-01 0.0824 0.0711 0.182 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -351765 sc-eQTL 6.69e-02 0.15 0.0813 0.182 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 1.59e-01 -0.119 0.0839 0.182 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0513 0.0991 0.182 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 3.70e-01 0.0528 0.0587 0.182 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 1.09e-01 0.117 0.0728 0.182 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0852 0.104 0.182 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 3.67e-01 0.088 0.0973 0.182 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 2.12e-01 0.131 0.105 0.182 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 6.76e-01 0.0497 0.119 0.182 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 4.95e-01 0.0667 0.0977 0.182 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 6.18e-01 0.0493 0.0987 0.182 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 1.78e-02 -0.267 0.112 0.182 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 751598 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0184 0.1 0.182 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 854217 sc-eQTL 5.50e-01 0.0617 0.103 0.182 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 7.84e-01 0.0154 0.0559 0.182 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 5.84e-02 0.12 0.0633 0.182 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0275 0.117 0.182 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 8.55e-01 0.0148 0.081 0.182 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00585 0.0608 0.182 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 7.33e-02 -0.146 0.0812 0.182 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 6.32e-01 0.0375 0.0781 0.18 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -351765 sc-eQTL 6.18e-03 0.198 0.0717 0.18 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 1.41e-01 0.112 0.0759 0.18 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0485 0.109 0.18 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0209 0.0708 0.18 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0554 0.07 0.18 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 8.21e-02 -0.174 0.0995 0.18 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -353719 sc-eQTL 2.82e-01 0.123 0.114 0.18 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0851 0.101 0.182 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -351765 sc-eQTL 2.18e-01 0.115 0.0934 0.182 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 3.01e-01 0.091 0.0877 0.182 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 6.30e-02 -0.197 0.105 0.182 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 7.20e-02 0.136 0.0754 0.182 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00398 0.0704 0.182 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 2.15e-01 -0.103 0.083 0.182 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 3.95e-01 0.101 0.118 0.189 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 8.77e-01 0.0155 0.0996 0.189 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 8.52e-02 0.201 0.116 0.189 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 2.36e-01 -0.123 0.104 0.189 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 5.51e-02 -0.247 0.128 0.189 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 515206 sc-eQTL 4.46e-01 0.0832 0.109 0.189 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0258 0.125 0.189 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 751598 sc-eQTL 1.27e-01 -0.173 0.113 0.189 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 218831 sc-eQTL 2.74e-01 0.133 0.121 0.189 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 854217 sc-eQTL 4.80e-01 0.0713 0.101 0.189 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0369 0.0925 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 6.51e-01 0.0415 0.0917 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 6.16e-02 0.203 0.108 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 2.12e-01 0.113 0.0905 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 3.25e-01 0.0911 0.0923 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 515206 sc-eQTL 7.55e-01 0.032 0.102 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 1.51e-01 0.162 0.112 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 751598 sc-eQTL 6.08e-01 0.0389 0.0758 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 218831 sc-eQTL 6.91e-01 0.0443 0.111 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 854217 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0763 0.107 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0977 0.0939 0.183 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 4.44e-01 0.0678 0.0885 0.183 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 8.36e-02 -0.2 0.115 0.183 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 5.08e-02 0.162 0.0823 0.183 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 6.08e-01 0.0381 0.0742 0.183 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 515206 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0197 0.0946 0.183 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 9.65e-01 0.00479 0.11 0.183 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 751598 sc-eQTL 4.88e-02 -0.18 0.091 0.183 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 218831 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0389 0.11 0.183 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 854217 sc-eQTL 4.35e-02 0.208 0.103 0.183 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 8.38e-02 -0.153 0.0881 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 6.71e-01 0.0391 0.0921 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 3.04e-01 -0.119 0.115 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0555 0.0827 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 5.03e-01 0.0596 0.089 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 515206 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0867 0.0982 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 1.56e-01 -0.146 0.102 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 751598 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0778 0.0597 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 218831 sc-eQTL 8.47e-01 0.0211 0.109 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 854217 sc-eQTL 7.58e-01 0.0303 0.0982 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 1.37e-01 0.158 0.106 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 9.71e-01 0.00355 0.0984 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 9.28e-03 -0.286 0.109 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 2.38e-01 0.108 0.0913 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 6.64e-01 0.039 0.0896 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 515206 sc-eQTL 3.21e-02 0.166 0.077 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 2.74e-02 -0.255 0.115 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 751598 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0218 0.0558 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 218831 sc-eQTL 4.17e-01 0.0906 0.111 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 854217 sc-eQTL 8.61e-01 0.0183 0.104 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 8.63e-01 0.0192 0.111 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -351765 sc-eQTL 4.95e-01 0.0765 0.112 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0465 0.107 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 3.96e-01 0.092 0.108 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0232 0.106 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 8.59e-01 0.0193 0.108 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0967 0.121 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 3.18e-01 0.0662 0.0662 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -351765 sc-eQTL 3.81e-01 0.055 0.0626 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00599 0.0709 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 5.24e-01 0.0689 0.108 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 2.78e-01 0.069 0.0634 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 4.68e-01 0.0443 0.061 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 2.82e-02 -0.224 0.101 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 3.20e-01 0.0908 0.091 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -351765 sc-eQTL 4.32e-01 0.0559 0.071 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 2.53e-02 0.188 0.0834 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 2.28e-01 0.137 0.113 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 1.86e-01 0.0944 0.0711 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0388 0.0686 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 1.35e-01 -0.156 0.104 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 3.00e-02 0.224 0.103 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -351765 sc-eQTL 3.83e-01 0.0669 0.0765 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 1.21e-01 0.142 0.0913 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 8.46e-01 -0.022 0.113 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 7.30e-01 0.0307 0.0891 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 3.18e-02 -0.196 0.0906 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 3.90e-01 0.0865 0.1 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00665 0.0969 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -351765 sc-eQTL 5.31e-01 -0.059 0.094 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 3.57e-01 -0.088 0.0952 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 6.00e-01 0.0609 0.116 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0261 0.0859 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 3.84e-01 0.0868 0.0996 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 2.05e-01 -0.145 0.114 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0408 0.0869 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -351765 sc-eQTL 8.83e-02 0.146 0.085 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0583 0.0957 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 9.32e-01 0.00952 0.111 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 9.78e-01 0.00213 0.0767 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 8.39e-01 -0.017 0.0837 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 4.70e-01 0.0771 0.107 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 4.13e-01 0.0954 0.116 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -351765 sc-eQTL 4.78e-02 0.197 0.0989 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 8.78e-01 0.0172 0.112 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 3.94e-01 -0.101 0.118 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 3.96e-01 0.0801 0.0941 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0195 0.112 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 8.79e-01 0.0175 0.115 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 1.28e-01 -0.18 0.118 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -351765 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0733 0.11 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0919 0.116 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0938 0.123 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 2.56e-01 0.129 0.113 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 4.05e-02 0.221 0.107 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 3.62e-01 0.102 0.112 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 2.70e-01 -0.125 0.113 0.177 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -351765 sc-eQTL 2.58e-01 0.117 0.103 0.177 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 1.16e-01 0.149 0.0945 0.177 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 7.42e-01 0.0399 0.121 0.177 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 2.52e-01 0.1 0.0874 0.177 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0999 0.107 0.177 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0118 0.11 0.177 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 1.54e-01 0.153 0.107 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -351765 sc-eQTL 2.20e-01 0.122 0.0995 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 3.37e-01 0.0933 0.0971 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0546 0.118 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0587 0.105 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 6.66e-02 -0.205 0.111 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 5.58e-01 0.0653 0.111 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -353719 sc-eQTL 3.06e-01 -0.106 0.104 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 7.60e-01 0.0283 0.0927 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -351765 sc-eQTL 5.32e-02 0.158 0.0814 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 2.88e-01 0.0949 0.089 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0996 0.116 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0426 0.0824 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0498 0.0791 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0756 0.11 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -353719 sc-eQTL 5.28e-01 0.0712 0.113 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 3.12e-01 0.112 0.11 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -351765 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0228 0.109 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 5.00e-02 0.195 0.0988 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 6.93e-01 0.0483 0.122 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 6.79e-01 0.0423 0.102 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 7.82e-01 0.0317 0.114 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0195 0.128 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -353719 sc-eQTL 1.36e-02 0.253 0.102 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0288 0.0959 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -351765 sc-eQTL 2.31e-02 0.207 0.0904 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 8.43e-01 0.0184 0.0928 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 6.36e-01 0.0491 0.104 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 9.97e-01 0.00028 0.0815 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0123 0.0937 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 7.46e-03 -0.288 0.107 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -353719 sc-eQTL 9.07e-01 0.0128 0.109 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 3.03e-01 -0.135 0.13 0.211 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0805 0.122 0.211 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 2.53e-01 0.129 0.112 0.211 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 7.27e-01 0.0368 0.105 0.211 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00461 0.0929 0.211 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 515206 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0272 0.131 0.211 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 2.55e-01 -0.145 0.127 0.211 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 751598 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0428 0.101 0.211 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 218831 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0408 0.124 0.211 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 854217 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0663 0.123 0.211 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0265 0.113 0.176 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -351765 sc-eQTL 3.01e-01 -0.107 0.103 0.176 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 9.30e-01 0.00966 0.11 0.176 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 4.15e-03 -0.306 0.106 0.176 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0518 0.0873 0.176 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 1.00e-01 0.132 0.08 0.176 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0798 0.0965 0.176 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 3.60e-01 0.0898 0.0979 0.182 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -351765 sc-eQTL 7.53e-01 0.0305 0.0966 0.182 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00288 0.102 0.182 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 3.83e-01 -0.103 0.117 0.182 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 7.70e-01 0.0244 0.0833 0.182 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 6.23e-01 0.0442 0.0899 0.182 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 3.09e-01 -0.115 0.113 0.182 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0987 0.0997 0.188 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 3.69e-01 0.0923 0.103 0.188 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 3.46e-01 0.107 0.113 0.188 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 7.70e-01 0.0338 0.115 0.188 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 8.37e-01 0.0207 0.1 0.188 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 1.69e-01 -0.158 0.115 0.188 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 751598 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00289 0.0701 0.188 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 854217 sc-eQTL 6.77e-01 0.043 0.103 0.188 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 8.58e-01 0.0115 0.0642 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 4.14e-01 0.0618 0.0755 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 2.05e-01 -0.142 0.112 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 7.07e-01 0.031 0.0822 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0634 0.0643 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 1.34e-01 -0.134 0.0889 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 9.67e-01 0.00344 0.0834 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 1.20e-01 0.124 0.0793 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 2.83e-01 0.131 0.122 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 5.29e-01 0.0604 0.0958 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 5.99e-01 0.0439 0.0834 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0938 0.0955 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0123 0.136 0.182 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -351765 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0435 0.126 0.182 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 5.52e-01 0.0783 0.131 0.182 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 4.12e-01 -0.106 0.129 0.182 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 7.63e-01 -0.037 0.123 0.182 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 4.08e-01 -0.111 0.134 0.182 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 2.59e-01 -0.148 0.13 0.182 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00296 0.101 0.18 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 2.51e-01 0.112 0.0977 0.18 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0361 0.113 0.18 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 4.31e-01 -0.081 0.103 0.18 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0567 0.0978 0.18 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0545 0.105 0.18 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 2.31e-01 0.107 0.0893 0.181 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 6.62e-01 0.0327 0.0747 0.181 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0247 0.116 0.181 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 5.96e-01 0.0543 0.102 0.181 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 3.10e-01 0.101 0.0994 0.181 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 4.11e-01 -0.085 0.103 0.181 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 3.08e-02 0.27 0.124 0.192 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 9.45e-01 0.00831 0.121 0.192 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 3.48e-01 0.115 0.122 0.192 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 1.09e-01 0.169 0.105 0.192 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0504 0.125 0.192 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 1.09e-01 -0.207 0.128 0.192 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 751598 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0784 0.113 0.192 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 854217 sc-eQTL 2.50e-01 0.106 0.0915 0.192 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0553 0.078 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 2.24e-01 0.0849 0.0696 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 8.53e-01 0.022 0.119 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 3.39e-02 0.148 0.0695 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 2.79e-01 0.0693 0.0638 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 515206 sc-eQTL 9.11e-01 0.0092 0.0825 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 1.54e-01 0.149 0.104 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 751598 sc-eQTL 3.35e-02 -0.154 0.0718 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 218831 sc-eQTL 7.90e-01 -0.029 0.109 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 854217 sc-eQTL 5.40e-01 0.0674 0.11 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0467 0.0858 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 5.21e-01 0.0539 0.0838 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 2.13e-02 -0.255 0.11 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 8.22e-01 0.0182 0.0812 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 3.71e-01 0.0746 0.0831 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 515206 sc-eQTL 6.26e-01 0.0497 0.102 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 1.92e-02 -0.239 0.101 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 751598 sc-eQTL 1.17e-01 -0.0757 0.0482 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 218831 sc-eQTL 2.97e-01 0.11 0.105 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 854217 sc-eQTL 7.84e-01 0.0268 0.0976 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0217 0.0595 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 1.33e-01 0.106 0.0701 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0136 0.114 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 8.11e-01 0.0195 0.0814 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0403 0.0612 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 1.67e-01 -0.117 0.0846 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 2.51e-01 0.0924 0.0802 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 1.17e-01 0.105 0.0669 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0844 0.122 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00382 0.091 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 2.55e-01 0.104 0.0908 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 2.00e-01 -0.123 0.0957 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 288718 sc-eQTL 9.59e-01 0.00415 0.0802 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -351765 sc-eQTL 3.24e-03 0.216 0.0725 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -930528 sc-eQTL 2.29e-01 0.0974 0.0806 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -459326 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0667 0.114 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -159834 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000184 0.0726 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -223898 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0373 0.0701 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -249439 sc-eQTL 2.91e-02 -0.228 0.104 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -353719 sc-eQTL 1.90e-01 0.151 0.115 0.181 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000169372 CRADD -459326 eQTL 0.0128 -0.045 0.018 0.00233 0.0 0.149


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina