logo

Genes within 1Mb (chr12:93215012:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 1.77e-01 -0.14 0.103 0.068 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0514 0.102 0.068 B L1
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 5.05e-01 0.103 0.155 0.068 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0904 0.115 0.068 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 3.24e-01 0.1 0.102 0.068 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 512169 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0183 0.115 0.068 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 2.42e-01 -0.186 0.158 0.068 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 748561 sc-eQTL 2.09e-02 0.18 0.0774 0.068 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 215794 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0952 0.158 0.068 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 851180 sc-eQTL 2.09e-01 0.195 0.155 0.068 B L1
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 1.73e-01 0.141 0.103 0.068 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -354802 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0463 0.1 0.068 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 2.78e-04 -0.377 0.102 0.068 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 8.97e-02 -0.292 0.171 0.068 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 6.56e-02 -0.183 0.0987 0.068 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 3.61e-01 0.0844 0.0922 0.068 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 3.79e-01 0.141 0.16 0.068 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 1.34e-01 -0.176 0.117 0.068 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -354802 sc-eQTL 3.11e-01 0.137 0.135 0.068 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 8.36e-03 -0.364 0.137 0.068 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 1.51e-01 -0.235 0.163 0.068 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00926 0.097 0.068 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 2.48e-01 0.14 0.12 0.068 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 4.19e-01 0.139 0.172 0.068 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 1.41e-01 -0.22 0.149 0.072 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 8.51e-02 0.278 0.161 0.072 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 2.96e-01 -0.191 0.182 0.072 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 9.26e-01 0.014 0.15 0.072 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 3.78e-01 0.134 0.151 0.072 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0552 0.174 0.072 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 748561 sc-eQTL 9.26e-01 0.0142 0.154 0.072 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 851180 sc-eQTL 7.34e-01 0.0539 0.158 0.072 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 2.87e-01 0.0985 0.0924 0.068 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 5.35e-01 0.0656 0.106 0.068 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 2.40e-01 0.229 0.194 0.068 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 5.40e-01 0.0824 0.134 0.068 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 4.83e-03 -0.282 0.0988 0.068 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0177 0.136 0.068 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 5.82e-01 0.0721 0.131 0.069 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -354802 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0296 0.122 0.069 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0262 0.128 0.069 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0526 0.183 0.069 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0233 0.119 0.069 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 4.44e-01 -0.09 0.117 0.069 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 1.64e-01 0.233 0.167 0.069 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -356756 sc-eQTL 4.50e-01 0.144 0.191 0.069 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 6.45e-01 0.0755 0.164 0.068 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -354802 sc-eQTL 2.64e-01 0.17 0.151 0.068 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 5.95e-02 -0.268 0.141 0.068 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 8.97e-01 0.0223 0.172 0.068 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 3.46e-02 0.259 0.122 0.068 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 2.79e-01 0.123 0.114 0.068 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0206 0.135 0.068 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 9.71e-01 0.00793 0.218 0.051 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 8.51e-01 0.0347 0.184 0.051 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 1.99e-01 -0.277 0.215 0.051 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 6.85e-01 0.0781 0.192 0.051 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 3.88e-01 0.206 0.238 0.051 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 512169 sc-eQTL 5.16e-01 0.131 0.201 0.051 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0859 0.231 0.051 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 748561 sc-eQTL 5.34e-01 0.131 0.21 0.051 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 215794 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0453 0.224 0.051 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 851180 sc-eQTL 4.21e-01 0.15 0.186 0.051 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 6.44e-01 0.0706 0.153 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 1.32e-01 -0.227 0.15 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 8.99e-01 0.0228 0.18 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 6.63e-01 0.0653 0.15 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 4.04e-04 0.532 0.148 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 512169 sc-eQTL 5.93e-01 0.0903 0.169 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 3.46e-01 -0.175 0.185 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 748561 sc-eQTL 2.07e-01 0.158 0.124 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 215794 sc-eQTL 4.27e-01 0.146 0.183 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 851180 sc-eQTL 5.50e-01 -0.105 0.176 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 3.18e-01 -0.16 0.16 0.069 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 4.26e-01 -0.12 0.15 0.069 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 9.41e-01 0.0145 0.197 0.069 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0794 0.141 0.069 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 1.50e-01 0.182 0.126 0.069 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 512169 sc-eQTL 1.49e-01 -0.232 0.16 0.069 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 2.66e-01 -0.209 0.187 0.069 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 748561 sc-eQTL 1.65e-01 0.217 0.155 0.069 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 215794 sc-eQTL 7.17e-01 0.0681 0.188 0.069 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 851180 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00913 0.176 0.069 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 3.57e-01 0.134 0.145 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0304 0.151 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 3.92e-02 0.389 0.187 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 3.71e-01 -0.121 0.135 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 5.52e-01 0.0866 0.146 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 512169 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0612 0.161 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0129 0.168 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 748561 sc-eQTL 1.29e-02 0.242 0.0966 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 215794 sc-eQTL 5.05e-01 -0.119 0.178 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 851180 sc-eQTL 1.99e-02 0.372 0.159 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 5.38e-01 -0.109 0.177 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 9.46e-02 -0.274 0.163 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 7.07e-01 0.0695 0.185 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 3.61e-01 -0.14 0.152 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 6.62e-01 0.0654 0.149 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 512169 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0815 0.13 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 2.13e-01 -0.241 0.193 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 748561 sc-eQTL 9.09e-01 0.0106 0.0931 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 215794 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0739 0.186 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 851180 sc-eQTL 6.51e-01 0.0788 0.174 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 2.21e-01 0.221 0.18 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -354802 sc-eQTL 5.37e-01 -0.112 0.182 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 8.45e-01 -0.034 0.173 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0544 0.176 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 1.29e-01 -0.261 0.171 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 3.96e-02 0.36 0.174 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 3.03e-01 0.202 0.196 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 8.01e-01 0.0277 0.11 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -354802 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0777 0.103 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 7.85e-06 -0.512 0.112 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 2.26e-01 -0.216 0.178 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 1.86e-01 -0.139 0.105 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 3.08e-01 0.103 0.101 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 2.65e-01 0.189 0.169 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 1.70e-01 0.212 0.154 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -354802 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0551 0.121 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 2.06e-01 -0.181 0.143 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0427 0.193 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 2.14e-01 -0.151 0.121 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 7.54e-02 0.207 0.116 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 9.14e-01 0.0192 0.178 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 8.86e-01 0.0251 0.174 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -354802 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0284 0.129 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 2.00e-01 -0.198 0.154 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 9.05e-01 0.0227 0.19 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 5.51e-01 0.0894 0.15 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 8.97e-01 0.02 0.154 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0364 0.169 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 6.19e-01 0.0762 0.153 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -354802 sc-eQTL 1.19e-01 0.232 0.148 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0838 0.151 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0666 0.183 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 8.66e-01 -0.023 0.136 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00849 0.158 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 8.16e-01 0.0422 0.181 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0412 0.143 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -354802 sc-eQTL 5.08e-01 0.0932 0.141 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 3.01e-02 -0.34 0.156 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 5.59e-02 -0.347 0.181 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0603 0.126 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 6.66e-01 0.0595 0.137 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 2.42e-01 0.205 0.175 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0859 0.201 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -354802 sc-eQTL 9.52e-02 -0.288 0.171 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0326 0.194 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0579 0.205 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 9.60e-01 0.00809 0.163 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 5.80e-01 0.107 0.194 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 4.32e-01 -0.156 0.198 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 4.40e-01 0.144 0.186 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -354802 sc-eQTL 5.16e-01 0.112 0.173 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 8.29e-02 -0.315 0.181 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 3.17e-01 -0.193 0.192 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 6.38e-01 0.0836 0.178 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 6.09e-01 0.087 0.17 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0905 0.176 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 6.75e-01 0.0777 0.185 0.067 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -354802 sc-eQTL 1.71e-01 0.23 0.167 0.067 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 3.31e-02 -0.329 0.153 0.067 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 3.64e-01 -0.179 0.197 0.067 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 1.83e-01 0.19 0.142 0.067 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0395 0.175 0.067 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 5.63e-01 -0.104 0.179 0.067 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0867 0.176 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -354802 sc-eQTL 5.10e-01 -0.109 0.165 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 3.22e-01 -0.159 0.16 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 1.77e-02 0.46 0.192 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 7.64e-01 0.0523 0.174 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 4.73e-01 -0.133 0.184 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 3.07e-01 0.188 0.183 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -356756 sc-eQTL 3.71e-01 -0.153 0.171 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0335 0.154 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -354802 sc-eQTL 9.40e-01 0.0102 0.136 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 9.65e-01 0.00645 0.148 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 2.94e-01 -0.203 0.193 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0651 0.137 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 1.77e-01 -0.177 0.131 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 4.87e-01 0.126 0.182 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -356756 sc-eQTL 9.93e-01 0.00172 0.187 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 3.64e-01 0.166 0.182 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -354802 sc-eQTL 2.12e-01 -0.225 0.18 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 7.91e-01 0.0437 0.165 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 1.42e-01 0.296 0.201 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 5.50e-01 -0.101 0.169 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0539 0.189 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 5.47e-01 -0.127 0.211 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -356756 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0194 0.171 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 6.99e-01 0.0604 0.156 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -354802 sc-eQTL 9.18e-01 0.0153 0.149 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 1.41e-01 -0.222 0.15 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 4.32e-01 -0.132 0.168 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 8.20e-01 0.0302 0.132 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0473 0.152 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 6.97e-03 0.473 0.173 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -356756 sc-eQTL 5.78e-02 0.334 0.175 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 5.91e-01 0.128 0.238 0.063 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0174 0.223 0.063 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 4.62e-01 -0.151 0.205 0.063 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 6.42e-02 0.353 0.189 0.063 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 7.85e-01 0.0463 0.169 0.063 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 512169 sc-eQTL 5.26e-01 0.151 0.238 0.063 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 4.31e-01 0.183 0.232 0.063 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 748561 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00434 0.184 0.063 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 215794 sc-eQTL 6.04e-01 0.117 0.225 0.063 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 851180 sc-eQTL 9.63e-01 -0.0104 0.225 0.063 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 1.97e-01 0.237 0.183 0.07 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -354802 sc-eQTL 7.94e-01 -0.044 0.168 0.07 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 2.88e-01 0.19 0.179 0.07 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 1.98e-01 0.225 0.174 0.07 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 2.05e-01 0.18 0.141 0.07 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 8.37e-02 0.226 0.13 0.07 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0115 0.157 0.07 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 2.69e-01 0.18 0.162 0.068 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -354802 sc-eQTL 6.78e-01 0.0666 0.16 0.068 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 1.95e-01 -0.219 0.168 0.068 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 1.07e-01 -0.314 0.194 0.068 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 4.67e-01 -0.101 0.138 0.068 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0812 0.149 0.068 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 8.67e-01 0.0316 0.188 0.068 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00853 0.161 0.073 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 9.33e-02 0.277 0.164 0.073 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 6.23e-02 -0.34 0.182 0.073 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0979 0.186 0.073 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 9.70e-01 0.0061 0.162 0.073 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 5.15e-01 0.121 0.185 0.073 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 748561 sc-eQTL 3.31e-01 -0.11 0.113 0.073 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 851180 sc-eQTL 7.66e-01 0.0496 0.166 0.073 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 1.30e-01 0.158 0.104 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 1.34e-01 0.184 0.122 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 1.94e-01 0.237 0.182 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0526 0.134 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 2.83e-01 -0.113 0.105 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 6.14e-01 0.0735 0.146 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 7.75e-01 0.0391 0.137 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0638 0.13 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 9.28e-01 0.0181 0.2 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 3.79e-01 0.138 0.157 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 2.80e-02 -0.299 0.135 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 2.14e-01 0.195 0.156 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 3.06e-01 0.243 0.237 0.061 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -354802 sc-eQTL 4.10e-02 -0.448 0.217 0.061 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0218 0.231 0.061 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 2.65e-01 0.252 0.225 0.061 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 1.82e-01 0.287 0.214 0.061 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 5.37e-01 -0.146 0.235 0.061 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 6.06e-01 0.119 0.229 0.061 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 2.69e-01 0.179 0.162 0.071 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 4.63e-01 0.116 0.157 0.071 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 4.87e-01 -0.126 0.181 0.071 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 5.08e-01 -0.109 0.165 0.071 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0702 0.157 0.071 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 9.79e-01 -0.0045 0.17 0.071 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 4.20e-01 0.113 0.14 0.07 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0189 0.117 0.07 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 6.41e-01 0.0852 0.183 0.07 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 3.20e-01 0.159 0.16 0.07 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 4.23e-02 -0.316 0.155 0.07 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0564 0.162 0.07 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 2.43e-01 -0.234 0.2 0.079 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 1.18e-01 0.302 0.193 0.079 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 4.29e-01 0.155 0.196 0.079 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 4.32e-01 -0.133 0.169 0.079 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 6.30e-01 0.0966 0.2 0.079 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 6.58e-01 0.0919 0.207 0.079 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 748561 sc-eQTL 8.43e-01 0.036 0.182 0.079 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 851180 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0198 0.147 0.079 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0285 0.13 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 2.39e-01 -0.137 0.116 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 4.16e-01 0.161 0.197 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 3.26e-01 0.115 0.117 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 2.12e-03 0.324 0.104 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 512169 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0547 0.137 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 2.31e-01 -0.208 0.173 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 748561 sc-eQTL 8.81e-02 0.205 0.12 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 215794 sc-eQTL 6.47e-01 0.0828 0.181 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 851180 sc-eQTL 4.90e-01 -0.126 0.182 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 9.12e-01 0.0158 0.142 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 8.12e-01 -0.033 0.139 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 7.85e-02 0.323 0.183 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 2.76e-01 -0.146 0.134 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 6.45e-01 0.0635 0.138 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 512169 sc-eQTL 5.56e-01 -0.099 0.168 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 3.12e-01 -0.171 0.169 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 748561 sc-eQTL 1.99e-02 0.186 0.0791 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 215794 sc-eQTL 1.98e-01 -0.224 0.174 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 851180 sc-eQTL 5.81e-02 0.305 0.16 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 2.91e-01 0.103 0.0976 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 5.78e-01 0.0646 0.116 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 1.78e-01 0.251 0.186 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 8.62e-01 0.0233 0.134 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 3.69e-02 -0.21 0.0998 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 5.39e-01 0.0858 0.14 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 2.11e-01 0.162 0.129 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 7.78e-01 0.0307 0.109 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 9.65e-01 0.00868 0.196 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 6.75e-01 0.0617 0.147 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 5.23e-02 -0.285 0.146 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0525 0.155 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 285681 sc-eQTL 6.30e-01 0.0649 0.134 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -354802 sc-eQTL 8.94e-01 0.0165 0.124 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -933565 sc-eQTL 9.18e-01 -0.014 0.136 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -462363 sc-eQTL 4.43e-01 -0.147 0.191 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00379 0.122 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -226935 sc-eQTL 3.82e-01 -0.103 0.118 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -252476 sc-eQTL 2.17e-01 0.217 0.175 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -356756 sc-eQTL 2.81e-01 0.208 0.193 0.069 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000173598 NUDT4 -162871 eQTL 0.0413 0.083 0.0406 0.0 0.0 0.0618

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000257322 \N -667 5.89e-05 5.68e-05 1.11e-05 2.34e-05 1.1e-05 2.46e-05 7.82e-05 9.91e-06 6.56e-05 3.49e-05 8.56e-05 3.44e-05 9.58e-05 2.91e-05 1.3e-05 4.35e-05 3.45e-05 4.71e-05 1.43e-05 1.52e-05 3.15e-05 6.69e-05 5.52e-05 1.79e-05 8.54e-05 1.88e-05 3.07e-05 2.68e-05 5.97e-05 4.87e-05 4.25e-05 3.87e-06 6.03e-06 1.26e-05 1.91e-05 1.08e-05 6.11e-06 6.22e-06 9.99e-06 5.03e-06 2.59e-06 6.43e-05 6.23e-06 8.65e-07 6.11e-06 8.66e-06 8.77e-06 3.75e-06 2.68e-06
ENSG00000277851 \N 851180 2.64e-07 1.3e-07 3.59e-08 1.78e-07 9.02e-08 9.57e-08 1.99e-07 5.19e-08 1.4e-07 4.38e-08 1.6e-07 7.75e-08 1.41e-07 6.21e-08 6e-08 7.26e-08 4.01e-08 1.18e-07 5.19e-08 4.03e-08 1.08e-07 1.23e-07 1.44e-07 4.53e-08 1.37e-07 1.14e-07 1.08e-07 8.71e-08 1.09e-07 1.1e-07 9.73e-08 3.95e-08 2.92e-08 8.68e-08 8.99e-08 3.99e-08 4.75e-08 9.26e-08 8e-08 3.01e-08 4.19e-08 1.35e-07 4.19e-08 2.33e-08 5.75e-08 1.68e-08 1.23e-07 4.14e-09 4.74e-08