logo

Genes within 1Mb (chr12:93208178:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 4.26e-01 0.0737 0.0923 0.079 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 5.04e-01 0.0613 0.0915 0.079 B L1
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 1.55e-01 0.197 0.138 0.079 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0513 0.103 0.079 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0125 0.091 0.079 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 505335 sc-eQTL 7.63e-01 0.031 0.103 0.079 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0366 0.142 0.079 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 741727 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0855 0.0698 0.079 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 208960 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0514 0.141 0.079 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 844346 sc-eQTL 1.71e-01 -0.19 0.138 0.079 B L1
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 8.37e-01 0.0195 0.0946 0.079 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -361636 sc-eQTL 3.54e-01 0.0848 0.0913 0.079 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 1.54e-01 -0.137 0.0956 0.079 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0361 0.157 0.079 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0821 0.0907 0.079 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 7.76e-01 0.024 0.0843 0.079 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 9.93e-03 0.376 0.144 0.079 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0468 0.107 0.079 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -361636 sc-eQTL 5.63e-01 0.071 0.123 0.079 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 6.36e-02 -0.234 0.125 0.079 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 7.31e-01 0.0511 0.149 0.079 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 1.01e-01 -0.144 0.0876 0.079 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 1.25e-01 -0.168 0.109 0.079 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 2.10e-01 0.196 0.156 0.079 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 9.79e-02 0.23 0.138 0.079 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 7.04e-02 0.271 0.149 0.079 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 7.84e-01 0.0465 0.17 0.079 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 3.25e-01 -0.137 0.139 0.079 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 2.66e-01 0.157 0.141 0.079 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 5.45e-01 0.0982 0.162 0.079 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 741727 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00244 0.143 0.079 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 844346 sc-eQTL 8.67e-01 0.0247 0.147 0.079 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0247 0.0818 0.079 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 3.15e-01 0.094 0.0933 0.079 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 8.18e-01 0.0397 0.172 0.079 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0116 0.119 0.079 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 1.69e-01 -0.122 0.0886 0.079 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 8.64e-01 0.0205 0.12 0.079 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 4.77e-01 0.0834 0.117 0.079 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -361636 sc-eQTL 2.47e-01 -0.127 0.109 0.079 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 8.06e-02 0.199 0.114 0.079 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 7.88e-02 -0.288 0.163 0.079 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 9.49e-01 0.00686 0.106 0.079 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 5.00e-01 -0.071 0.105 0.079 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 4.83e-01 0.105 0.15 0.079 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -363590 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0889 0.171 0.079 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 3.79e-02 0.307 0.147 0.079 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -361636 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0838 0.138 0.079 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 7.68e-01 0.0381 0.129 0.079 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 6.42e-01 0.0727 0.156 0.079 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 5.78e-01 0.0622 0.112 0.079 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 7.79e-01 0.0291 0.104 0.079 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 2.56e-01 -0.139 0.122 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 3.22e-01 0.184 0.185 0.074 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0809 0.157 0.074 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 1.95e-01 -0.238 0.183 0.074 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 8.38e-01 0.0335 0.164 0.074 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 7.26e-01 0.0712 0.203 0.074 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 505335 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0114 0.172 0.074 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 8.98e-01 0.0252 0.197 0.074 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 741727 sc-eQTL 1.12e-01 0.283 0.177 0.074 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 208960 sc-eQTL 9.15e-01 0.0205 0.191 0.074 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 844346 sc-eQTL 2.10e-01 0.199 0.158 0.074 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 5.32e-01 0.0888 0.142 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 7.04e-01 0.0535 0.141 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 9.94e-02 0.275 0.166 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0842 0.139 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 5.80e-01 0.0786 0.142 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 505335 sc-eQTL 3.41e-01 0.15 0.157 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 3.66e-01 -0.156 0.173 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 741727 sc-eQTL 3.86e-01 0.101 0.116 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 208960 sc-eQTL 1.50e-01 -0.245 0.17 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 844346 sc-eQTL 3.68e-01 -0.147 0.163 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0741 0.146 0.08 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 4.58e-01 0.102 0.137 0.08 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 4.01e-01 0.151 0.18 0.08 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0769 0.129 0.08 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 3.35e-01 -0.111 0.115 0.08 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 505335 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0795 0.147 0.08 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0127 0.171 0.08 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 741727 sc-eQTL 7.18e-01 0.0516 0.143 0.08 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 208960 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0313 0.171 0.08 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 844346 sc-eQTL 8.34e-02 -0.278 0.16 0.08 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 5.21e-02 0.257 0.131 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00753 0.138 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 5.60e-01 0.101 0.173 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0574 0.124 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00935 0.133 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 505335 sc-eQTL 2.05e-01 -0.186 0.146 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 5.99e-01 0.0809 0.154 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 741727 sc-eQTL 2.37e-01 -0.106 0.0892 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 208960 sc-eQTL 8.52e-01 0.0304 0.163 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 844346 sc-eQTL 8.17e-01 -0.034 0.147 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 6.88e-01 0.0642 0.16 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0375 0.148 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 8.99e-01 0.0212 0.167 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0703 0.138 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 6.11e-01 0.0685 0.135 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 505335 sc-eQTL 1.67e-01 -0.161 0.116 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0598 0.175 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 741727 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0646 0.0838 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 208960 sc-eQTL 3.04e-01 -0.172 0.167 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 844346 sc-eQTL 2.53e-01 -0.179 0.156 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0424 0.172 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361636 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0231 0.173 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 7.91e-01 0.0437 0.165 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 7.88e-01 0.045 0.167 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0349 0.164 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 3.35e-01 0.161 0.167 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 2.44e-01 -0.218 0.186 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0707 0.0997 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361636 sc-eQTL 4.06e-01 0.0783 0.0941 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 1.43e-01 -0.156 0.106 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 3.83e-01 0.142 0.162 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0614 0.0956 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 1.48e-01 0.133 0.0914 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 8.82e-03 0.401 0.152 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 4.67e-01 0.105 0.143 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361636 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0201 0.112 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0202 0.133 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 4.66e-01 -0.131 0.179 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 3.09e-01 -0.114 0.112 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0868 0.108 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 3.14e-01 0.166 0.164 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 3.88e-01 0.141 0.163 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361636 sc-eQTL 5.23e-01 0.0771 0.121 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 2.99e-01 -0.15 0.144 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 5.64e-01 0.103 0.178 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 6.00e-01 0.0737 0.14 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 3.74e-01 -0.128 0.144 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 8.66e-01 0.0268 0.158 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 1.59e-01 0.198 0.14 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361636 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0909 0.136 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 1.33e-02 -0.341 0.136 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 6.46e-01 0.0774 0.168 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 2.19e-02 -0.284 0.123 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 1.81e-02 -0.34 0.143 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 2.33e-01 0.198 0.165 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0326 0.135 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361636 sc-eQTL 1.78e-02 0.313 0.131 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 7.29e-01 0.0515 0.149 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 5.78e-01 0.0956 0.172 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0794 0.119 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0578 0.13 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 1.07e-01 0.267 0.165 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 1.46e-01 -0.244 0.168 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361636 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0888 0.144 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 3.42e-01 0.154 0.162 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 9.13e-01 0.0188 0.172 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 3.56e-01 0.126 0.136 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 1.38e-01 -0.24 0.161 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 1.17e-01 0.26 0.165 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 7.73e-01 0.0511 0.177 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361636 sc-eQTL 6.45e-01 0.0759 0.165 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 2.88e-01 0.184 0.173 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0581 0.184 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 3.29e-02 -0.359 0.167 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0038 0.162 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 4.34e-01 -0.131 0.167 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 3.03e-01 0.178 0.172 0.076 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361636 sc-eQTL 2.00e-01 -0.201 0.156 0.076 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 8.30e-01 0.031 0.145 0.076 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 4.63e-01 -0.135 0.184 0.076 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0257 0.133 0.076 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 6.27e-01 0.0796 0.164 0.076 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 3.52e-01 -0.156 0.167 0.076 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 2.50e-01 0.182 0.158 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361636 sc-eQTL 4.35e-01 -0.116 0.148 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 2.75e-01 0.157 0.144 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 2.23e-02 -0.398 0.173 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 9.70e-01 0.0058 0.156 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 3.03e-01 -0.171 0.165 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 6.48e-02 0.304 0.164 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -363590 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0864 0.154 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 9.36e-01 0.0111 0.138 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361636 sc-eQTL 3.13e-01 -0.123 0.122 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 4.32e-01 0.105 0.133 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 1.65e-01 -0.241 0.173 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 1.50e-01 -0.177 0.122 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 2.07e-01 -0.149 0.118 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 4.31e-01 0.129 0.163 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -363590 sc-eQTL 6.85e-01 0.0683 0.168 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 6.01e-01 0.0848 0.162 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361636 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0746 0.16 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 9.91e-01 -0.0017 0.146 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0949 0.179 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0329 0.15 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 9.20e-01 0.0169 0.168 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 2.30e-01 0.225 0.187 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -363590 sc-eQTL 8.54e-01 0.0279 0.151 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 1.51e-01 0.204 0.142 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361636 sc-eQTL 6.01e-01 -0.071 0.136 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0548 0.138 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 5.85e-01 -0.084 0.154 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 5.86e-02 0.228 0.12 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 4.63e-01 0.102 0.139 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 7.69e-01 0.0474 0.161 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -363590 sc-eQTL 3.64e-01 -0.146 0.161 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 3.30e-01 -0.208 0.213 0.063 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 5.78e-02 0.376 0.196 0.063 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 3.74e-01 0.164 0.183 0.063 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0427 0.172 0.063 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 7.37e-01 0.0509 0.151 0.063 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 505335 sc-eQTL 9.05e-01 0.0255 0.213 0.063 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 3.38e-01 -0.199 0.207 0.063 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 741727 sc-eQTL 9.24e-01 0.0158 0.165 0.063 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 208960 sc-eQTL 2.22e-01 0.246 0.2 0.063 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 844346 sc-eQTL 4.53e-01 -0.151 0.201 0.063 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 2.22e-01 0.206 0.168 0.08 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361636 sc-eQTL 9.52e-01 0.0093 0.154 0.08 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 3.85e-03 0.471 0.161 0.08 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 9.05e-02 0.271 0.159 0.08 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 6.65e-01 0.0563 0.13 0.08 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 4.24e-01 0.0959 0.12 0.08 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 1.92e-01 -0.188 0.143 0.08 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 5.89e-01 0.0817 0.151 0.079 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361636 sc-eQTL 5.55e-01 0.088 0.149 0.079 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0193 0.157 0.079 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 4.14e-01 -0.148 0.181 0.079 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 9.07e-01 0.015 0.128 0.079 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 3.34e-01 -0.134 0.138 0.079 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 6.40e-01 0.0816 0.174 0.079 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 3.05e-03 0.435 0.145 0.078 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 6.57e-01 0.0678 0.152 0.078 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0711 0.168 0.078 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 1.08e-01 -0.274 0.17 0.078 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 7.97e-01 0.0384 0.149 0.078 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 3.85e-01 0.148 0.17 0.078 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 741727 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0878 0.104 0.078 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 844346 sc-eQTL 8.80e-01 0.0232 0.153 0.078 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0263 0.0947 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 3.72e-01 0.0996 0.111 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 7.28e-01 0.0576 0.166 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 3.70e-01 -0.109 0.121 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 1.10e-01 -0.152 0.0945 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0994 0.132 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 5.06e-01 0.0818 0.123 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 4.87e-01 0.0817 0.117 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 5.60e-01 -0.105 0.18 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 9.13e-01 0.0155 0.141 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 8.04e-01 0.0306 0.123 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 7.15e-02 0.254 0.14 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 2.37e-01 0.242 0.204 0.082 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361636 sc-eQTL 5.09e-01 -0.125 0.189 0.082 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0485 0.198 0.082 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 7.14e-01 0.0714 0.195 0.082 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 3.52e-01 -0.172 0.184 0.082 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 2.78e-01 -0.219 0.202 0.082 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 4.51e-01 0.149 0.197 0.082 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 4.11e-01 -0.124 0.15 0.08 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 4.89e-01 -0.101 0.146 0.08 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 5.63e-01 0.0977 0.168 0.08 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 2.43e-01 0.179 0.153 0.08 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0686 0.146 0.08 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0302 0.157 0.08 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 9.51e-01 0.0079 0.129 0.081 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 2.58e-01 0.121 0.107 0.081 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0433 0.167 0.081 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 1.81e-01 0.196 0.146 0.081 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 5.57e-01 0.084 0.143 0.081 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0172 0.148 0.081 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 7.63e-03 -0.466 0.173 0.085 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 5.68e-02 0.323 0.169 0.085 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 7.18e-01 0.0623 0.172 0.085 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0997 0.148 0.085 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 7.00e-02 0.318 0.174 0.085 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0527 0.182 0.085 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 741727 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0614 0.16 0.085 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 844346 sc-eQTL 7.62e-01 0.0393 0.129 0.085 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 2.52e-01 0.139 0.121 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 4.03e-01 0.0905 0.108 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 1.15e-01 0.289 0.183 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0507 0.109 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0308 0.0992 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 505335 sc-eQTL 9.72e-01 0.00443 0.128 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 8.63e-01 -0.028 0.162 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 741727 sc-eQTL 4.07e-01 0.0932 0.112 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 208960 sc-eQTL 3.51e-01 -0.157 0.168 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 844346 sc-eQTL 2.51e-01 -0.195 0.17 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 2.18e-01 0.16 0.129 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 8.23e-01 0.0284 0.127 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 4.41e-01 0.129 0.168 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0661 0.122 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 8.78e-01 0.0194 0.126 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 505335 sc-eQTL 1.20e-01 -0.238 0.153 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 9.16e-01 0.0163 0.155 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 741727 sc-eQTL 6.50e-02 -0.135 0.0725 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 208960 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0569 0.159 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 844346 sc-eQTL 3.45e-01 -0.139 0.147 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 9.41e-01 0.00648 0.0876 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 2.81e-01 0.112 0.103 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00303 0.167 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0707 0.12 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 1.99e-01 -0.116 0.0899 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 5.43e-01 0.0761 0.125 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 8.72e-01 0.019 0.118 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 4.92e-01 0.068 0.0988 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 5.16e-01 0.116 0.179 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 3.29e-01 0.131 0.133 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0219 0.134 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0512 0.141 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 278847 sc-eQTL 5.14e-01 0.0784 0.12 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -361636 sc-eQTL 2.79e-01 -0.12 0.11 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -940399 sc-eQTL 2.53e-01 0.138 0.121 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -469197 sc-eQTL 1.68e-01 -0.236 0.17 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 sc-eQTL 7.19e-01 0.039 0.109 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -233769 sc-eQTL 3.40e-01 -0.1 0.105 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -259310 sc-eQTL 5.89e-01 0.0849 0.157 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -363590 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0765 0.172 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 eQTL 0.039 -0.0727 0.0352 0.00437 0.0 0.079

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000169372 \N -469197 6.09e-07 3.47e-07 6.57e-08 3.58e-07 1.05e-07 1.44e-07 3.7e-07 6.75e-08 2.26e-07 1.37e-07 3.25e-07 2.22e-07 5.39e-07 1.01e-07 1.45e-07 1.1e-07 1.18e-07 2.66e-07 8e-08 8.52e-08 1.39e-07 2.3e-07 2.04e-07 3.27e-08 3.7e-07 1.71e-07 1.48e-07 1.54e-07 1.48e-07 2.26e-07 1.93e-07 5.3e-08 4.97e-08 9.9e-08 1.83e-07 4.86e-08 6.48e-08 7.25e-08 5.86e-08 5.88e-08 4.9e-08 2.9e-07 3.2e-08 1.43e-08 4e-08 1.05e-08 7.12e-08 0.0 4.67e-08
ENSG00000173598 NUDT4 -169705 3.47e-06 3.7e-06 2.86e-07 1.93e-06 4.65e-07 7.73e-07 1.86e-06 4.41e-07 1.89e-06 8.46e-07 2.45e-06 1.43e-06 4.32e-06 1.43e-06 9.21e-07 1.19e-06 1.32e-06 1.89e-06 6.59e-07 8.01e-07 6.5e-07 2.88e-06 2.16e-06 9.28e-07 3.74e-06 1.1e-06 1.18e-06 1.39e-06 1.8e-06 1.86e-06 1.99e-06 2.45e-07 3.72e-07 8.95e-07 1.31e-06 6.32e-07 7.5e-07 3.43e-07 1.09e-06 3.54e-07 2.59e-07 4.09e-06 4.79e-07 1.14e-07 3.04e-07 2.93e-07 2.66e-07 1.43e-07 1.97e-07