logo

Genes within 1Mb (chr12:93208018:G:GTAGA):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 6.45e-01 0.0467 0.101 0.066 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 5.93e-01 0.0537 0.1 0.066 B L1
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 3.73e-01 0.135 0.152 0.066 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0399 0.113 0.066 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0492 0.0996 0.066 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 505175 sc-eQTL 5.57e-01 0.0661 0.112 0.066 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 7.20e-01 0.0559 0.155 0.066 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 741567 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0815 0.0765 0.066 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 208800 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0439 0.155 0.066 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 844186 sc-eQTL 1.26e-01 -0.232 0.151 0.066 B L1
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 8.61e-01 0.0182 0.104 0.066 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -361796 sc-eQTL 3.20e-01 0.0998 0.1 0.066 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0815 0.105 0.066 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0215 0.172 0.066 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0722 0.0994 0.066 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00739 0.0924 0.066 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 5.52e-03 0.442 0.158 0.066 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 6.44e-01 0.0543 0.117 0.066 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -361796 sc-eQTL 3.30e-01 0.131 0.134 0.066 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 1.79e-01 -0.186 0.138 0.066 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0434 0.163 0.066 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 5.38e-02 -0.186 0.0959 0.066 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 7.23e-02 -0.216 0.12 0.066 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 1.34e-01 0.257 0.171 0.066 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 1.91e-01 0.204 0.156 0.065 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 5.42e-01 0.103 0.169 0.065 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 8.64e-01 0.0328 0.191 0.065 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 5.02e-01 -0.105 0.157 0.065 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 4.37e-01 0.123 0.158 0.065 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 1.85e-01 0.241 0.181 0.065 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 741567 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00529 0.161 0.065 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 844186 sc-eQTL 9.52e-01 0.0101 0.166 0.065 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0202 0.0911 0.066 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 3.75e-01 0.0923 0.104 0.066 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 7.16e-01 0.0698 0.191 0.066 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 6.49e-01 0.0601 0.132 0.066 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 8.87e-02 -0.168 0.0984 0.066 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 5.74e-01 0.075 0.133 0.066 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 4.92e-01 0.089 0.129 0.067 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -361796 sc-eQTL 3.84e-01 -0.105 0.121 0.067 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 1.53e-01 0.18 0.126 0.067 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 7.69e-02 -0.32 0.18 0.067 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 6.64e-01 0.051 0.117 0.067 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0947 0.116 0.067 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 3.03e-01 0.171 0.166 0.067 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -363750 sc-eQTL 4.38e-01 -0.147 0.189 0.067 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 2.70e-02 0.361 0.162 0.066 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -361796 sc-eQTL 1.59e-01 -0.214 0.151 0.066 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 7.32e-01 0.0489 0.143 0.066 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 7.49e-01 0.0552 0.172 0.066 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 6.02e-01 0.0643 0.123 0.066 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 8.24e-01 0.0255 0.114 0.066 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 3.68e-01 -0.122 0.135 0.066 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 8.15e-01 0.0462 0.197 0.066 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 6.79e-01 0.0688 0.166 0.066 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 2.36e-01 -0.231 0.194 0.066 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 6.21e-01 0.0859 0.173 0.066 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 7.11e-01 0.0799 0.215 0.066 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 505175 sc-eQTL 7.44e-01 0.0596 0.182 0.066 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 9.17e-01 0.0219 0.209 0.066 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 741567 sc-eQTL 4.93e-01 0.13 0.189 0.066 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 208800 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0702 0.203 0.066 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 844186 sc-eQTL 1.95e-01 0.218 0.167 0.066 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 7.78e-01 -0.044 0.156 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0138 0.154 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 2.75e-02 0.402 0.181 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 9.40e-02 -0.256 0.152 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0536 0.156 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 505175 sc-eQTL 2.59e-01 0.195 0.172 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 7.46e-01 0.0616 0.19 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 741567 sc-eQTL 9.02e-01 0.0157 0.128 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 208800 sc-eQTL 2.61e-01 -0.21 0.187 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 844186 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0964 0.179 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 8.88e-01 -0.022 0.156 0.067 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 2.02e-01 0.188 0.147 0.067 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 5.13e-01 0.126 0.192 0.067 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 4.51e-01 -0.104 0.138 0.067 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 3.19e-01 -0.123 0.123 0.067 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 505175 sc-eQTL 5.09e-01 -0.104 0.157 0.067 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 8.40e-01 -0.037 0.183 0.067 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 741567 sc-eQTL 9.76e-01 -0.0046 0.153 0.067 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 208800 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0435 0.183 0.067 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 844186 sc-eQTL 2.02e-02 -0.398 0.17 0.067 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 1.44e-01 0.213 0.146 0.066 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0438 0.152 0.066 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0115 0.191 0.066 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 9.00e-01 0.0173 0.137 0.066 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0461 0.147 0.066 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 505175 sc-eQTL 1.13e-01 -0.257 0.161 0.066 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 5.60e-01 0.0991 0.17 0.066 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 741567 sc-eQTL 1.72e-01 -0.135 0.0984 0.066 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 208800 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00487 0.18 0.066 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 844186 sc-eQTL 5.37e-01 -0.1 0.162 0.066 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 5.83e-01 0.0971 0.177 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 4.87e-01 -0.114 0.163 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 7.51e-01 0.0584 0.184 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 3.86e-01 -0.132 0.152 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0121 0.149 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 505175 sc-eQTL 1.31e-01 -0.195 0.129 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 8.17e-01 0.0448 0.193 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 741567 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0601 0.0927 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 208800 sc-eQTL 4.83e-01 -0.13 0.185 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 844186 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0633 0.173 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0876 0.185 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361796 sc-eQTL 4.42e-01 -0.143 0.186 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 9.45e-01 0.0123 0.177 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 7.96e-01 0.0466 0.18 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0664 0.176 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 5.39e-01 0.111 0.18 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 5.44e-01 -0.122 0.201 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0551 0.109 0.066 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361796 sc-eQTL 4.37e-01 0.0801 0.103 0.066 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 3.45e-01 -0.11 0.116 0.066 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 3.44e-01 0.169 0.178 0.066 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0316 0.105 0.066 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 3.13e-01 0.101 0.1 0.066 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 5.91e-03 0.461 0.166 0.066 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 4.76e-01 0.109 0.153 0.066 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361796 sc-eQTL 8.15e-01 0.0281 0.12 0.066 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 9.41e-01 0.0105 0.142 0.066 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 3.75e-01 -0.17 0.191 0.066 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 2.74e-01 -0.132 0.12 0.066 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 1.57e-01 -0.164 0.115 0.066 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 2.67e-01 0.196 0.176 0.066 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 1.10e-01 0.277 0.172 0.066 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361796 sc-eQTL 9.33e-01 0.0108 0.128 0.066 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0456 0.153 0.066 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 6.81e-01 0.0776 0.189 0.066 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 6.82e-01 0.0611 0.149 0.066 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 3.10e-01 -0.155 0.153 0.066 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 3.98e-01 0.142 0.168 0.066 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 1.06e-01 0.251 0.155 0.066 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361796 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0478 0.151 0.066 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 2.13e-02 -0.351 0.151 0.066 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0638 0.186 0.066 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 5.99e-02 -0.259 0.137 0.066 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 4.42e-02 -0.321 0.159 0.066 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 2.38e-01 0.217 0.183 0.066 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 8.92e-01 0.0199 0.147 0.066 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361796 sc-eQTL 3.18e-02 0.309 0.143 0.066 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 4.88e-01 0.112 0.162 0.066 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0876 0.187 0.066 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 3.39e-01 -0.124 0.129 0.066 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 2.38e-01 -0.167 0.141 0.066 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 7.64e-02 0.319 0.179 0.066 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0346 0.186 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361796 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0656 0.16 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 3.84e-01 0.156 0.179 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 3.43e-01 0.18 0.189 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 3.44e-01 0.143 0.15 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 1.44e-01 -0.261 0.178 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 2.83e-02 0.401 0.181 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 6.61e-01 0.0841 0.192 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361796 sc-eQTL 8.73e-01 0.0285 0.178 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 4.56e-01 0.14 0.187 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0816 0.199 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 2.65e-01 -0.204 0.182 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 3.52e-01 0.163 0.174 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 5.70e-01 -0.103 0.181 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 4.26e-01 0.146 0.184 0.065 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361796 sc-eQTL 7.85e-02 -0.294 0.166 0.065 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 9.70e-01 0.00571 0.154 0.065 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0398 0.196 0.065 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 3.07e-01 -0.145 0.142 0.065 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 1.00e+00 -1.11e-05 0.174 0.065 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 4.64e-01 -0.131 0.178 0.065 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 4.37e-01 0.137 0.176 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361796 sc-eQTL 2.21e-01 -0.201 0.164 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 2.31e-01 0.191 0.159 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 8.49e-04 -0.641 0.189 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0836 0.173 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 1.40e-01 -0.271 0.183 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 1.06e-01 0.296 0.182 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -363750 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0195 0.171 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 8.17e-01 0.0354 0.153 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361796 sc-eQTL 6.16e-01 -0.068 0.135 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 9.19e-01 0.015 0.147 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 1.33e-01 -0.288 0.191 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0707 0.136 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 3.58e-01 -0.12 0.13 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 3.21e-01 0.18 0.181 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -363750 sc-eQTL 8.08e-01 0.0454 0.186 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 4.73e-01 0.131 0.182 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361796 sc-eQTL 8.21e-01 0.0409 0.18 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 7.62e-01 0.05 0.165 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0659 0.202 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 3.71e-01 0.151 0.168 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0244 0.189 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 2.21e-01 0.258 0.21 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -363750 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0264 0.17 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 7.15e-02 0.283 0.156 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361796 sc-eQTL 4.66e-01 -0.11 0.15 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0224 0.152 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0481 0.17 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 9.49e-02 0.223 0.133 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 7.02e-01 0.059 0.154 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 9.55e-01 0.01 0.178 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -363750 sc-eQTL 1.89e-01 -0.234 0.178 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 5.07e-01 -0.16 0.24 0.052 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 1.37e-01 0.333 0.222 0.052 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 2.81e-01 0.223 0.206 0.052 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0792 0.193 0.052 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 9.26e-01 0.0158 0.17 0.052 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 505175 sc-eQTL 6.41e-01 0.112 0.24 0.052 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 1.14e-01 -0.369 0.231 0.052 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 741567 sc-eQTL 6.82e-01 0.076 0.185 0.052 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 208800 sc-eQTL 4.22e-01 0.182 0.226 0.052 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 844186 sc-eQTL 9.60e-01 -0.0113 0.227 0.052 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 2.65e-01 0.207 0.185 0.067 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361796 sc-eQTL 8.97e-01 0.0221 0.17 0.067 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 2.88e-03 0.535 0.177 0.067 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 4.10e-01 0.146 0.177 0.067 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 6.41e-01 0.0669 0.143 0.067 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 5.39e-01 0.0812 0.132 0.067 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0609 0.159 0.067 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 8.39e-01 0.0335 0.165 0.066 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361796 sc-eQTL 3.42e-01 0.155 0.162 0.066 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0845 0.171 0.066 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 4.64e-01 -0.145 0.198 0.066 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0667 0.14 0.066 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0672 0.151 0.066 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 3.24e-01 0.188 0.19 0.066 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 4.49e-03 0.473 0.164 0.063 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 9.70e-01 -0.0064 0.173 0.063 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 7.90e-01 -0.051 0.191 0.063 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 3.58e-01 -0.178 0.193 0.063 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 5.91e-01 0.0906 0.169 0.063 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 8.72e-02 0.33 0.192 0.063 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 741567 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0714 0.118 0.063 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 844186 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00994 0.173 0.063 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0431 0.106 0.066 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 8.91e-01 0.017 0.124 0.066 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 5.55e-01 0.109 0.185 0.066 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0762 0.135 0.066 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 7.82e-02 -0.187 0.105 0.066 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0547 0.147 0.066 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 2.68e-01 0.151 0.136 0.066 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 2.56e-01 0.148 0.13 0.066 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0491 0.2 0.066 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 7.10e-01 0.0585 0.157 0.066 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0424 0.137 0.066 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 1.24e-01 0.241 0.156 0.066 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 2.72e-01 0.242 0.22 0.07 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -361796 sc-eQTL 3.71e-01 -0.183 0.204 0.07 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 7.12e-01 -0.079 0.214 0.07 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0287 0.21 0.07 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 3.97e-01 -0.169 0.199 0.07 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 2.80e-01 -0.236 0.217 0.07 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 4.67e-01 0.155 0.212 0.07 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 2.47e-01 -0.194 0.167 0.067 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0433 0.163 0.067 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 6.33e-01 0.0898 0.188 0.067 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 1.68e-01 0.236 0.17 0.067 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 4.06e-01 -0.135 0.163 0.067 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 6.77e-01 0.0731 0.175 0.067 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 8.73e-01 0.0229 0.143 0.068 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 2.99e-01 0.124 0.119 0.068 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 2.21e-01 -0.228 0.185 0.068 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 9.95e-02 0.269 0.162 0.068 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 7.48e-01 0.0512 0.159 0.068 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0706 0.165 0.068 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 4.10e-03 -0.553 0.19 0.073 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 1.76e-01 0.254 0.187 0.073 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 6.56e-01 0.0849 0.19 0.073 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0777 0.164 0.073 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 1.09e-01 0.31 0.193 0.073 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0642 0.201 0.073 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 741567 sc-eQTL 5.48e-01 -0.106 0.176 0.073 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 844186 sc-eQTL 5.63e-01 0.0826 0.143 0.073 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0109 0.131 0.066 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 2.21e-01 0.143 0.116 0.066 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 1.14e-01 0.313 0.198 0.066 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 1.99e-01 -0.151 0.117 0.066 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 3.03e-01 -0.11 0.107 0.066 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 505175 sc-eQTL 9.26e-01 0.0128 0.138 0.066 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 6.16e-01 0.0876 0.174 0.066 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 741567 sc-eQTL 9.71e-01 0.00443 0.121 0.066 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 208800 sc-eQTL 4.38e-01 -0.141 0.181 0.066 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 844186 sc-eQTL 2.27e-01 -0.222 0.183 0.066 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 3.69e-01 0.128 0.142 0.066 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0601 0.139 0.066 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 8.94e-01 0.0247 0.184 0.066 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0378 0.135 0.066 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0245 0.138 0.066 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 505175 sc-eQTL 4.66e-02 -0.334 0.167 0.066 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 5.36e-01 0.105 0.17 0.066 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 741567 sc-eQTL 8.02e-02 -0.14 0.0798 0.066 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 208800 sc-eQTL 6.39e-01 -0.082 0.175 0.066 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 844186 sc-eQTL 2.58e-01 -0.183 0.161 0.066 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 7.18e-01 0.0353 0.0977 0.066 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 4.06e-01 0.0963 0.116 0.066 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 7.64e-01 0.0561 0.187 0.066 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00744 0.134 0.066 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 1.02e-01 -0.164 0.1 0.066 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 3.25e-01 0.137 0.139 0.066 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 9.12e-01 0.0144 0.131 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 3.72e-01 0.0981 0.11 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0146 0.198 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 2.02e-01 0.189 0.148 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0683 0.148 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0266 0.157 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 278687 sc-eQTL 4.04e-01 0.111 0.132 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -361796 sc-eQTL 4.82e-01 -0.086 0.122 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -940559 sc-eQTL 5.06e-01 0.0891 0.134 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -469357 sc-eQTL 2.31e-01 -0.226 0.188 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 sc-eQTL 3.13e-01 0.121 0.12 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -233929 sc-eQTL 3.37e-01 -0.111 0.116 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -259470 sc-eQTL 4.14e-01 0.141 0.173 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -363750 sc-eQTL 4.36e-01 -0.148 0.19 0.067 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000173598 NUDT4 -169865 eQTL 0.0504 -0.0709 0.0362 0.00457 0.0 0.0726

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina