logo

Genes within 1Mb (chr12:93202263:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 4.61e-01 0.078 0.106 0.06 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 1.80e-01 0.14 0.104 0.06 B L1
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 2.34e-02 0.358 0.157 0.06 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0309 0.118 0.06 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0592 0.104 0.06 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 499420 sc-eQTL 8.23e-01 0.0263 0.117 0.06 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 6.65e-01 0.0704 0.162 0.06 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 735812 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0794 0.0799 0.06 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 203045 sc-eQTL 8.83e-01 0.0239 0.162 0.06 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 838431 sc-eQTL 2.94e-01 -0.167 0.158 0.06 B L1
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 3.79e-01 0.0956 0.108 0.06 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -367551 sc-eQTL 7.30e-01 0.0362 0.105 0.06 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0818 0.11 0.06 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 6.55e-01 0.0808 0.181 0.06 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 3.26e-01 -0.102 0.104 0.06 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0169 0.0967 0.06 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 6.69e-03 0.453 0.165 0.06 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 9.77e-01 0.00353 0.123 0.06 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -367551 sc-eQTL 7.30e-01 0.0487 0.141 0.06 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 1.61e-01 -0.203 0.144 0.06 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0345 0.171 0.06 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 1.23e-01 -0.156 0.101 0.06 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 2.18e-01 -0.155 0.126 0.06 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 2.30e-01 0.215 0.179 0.06 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 5.95e-01 0.087 0.163 0.059 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 2.48e-01 0.204 0.176 0.059 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 9.11e-01 0.0222 0.199 0.059 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 2.28e-01 -0.197 0.163 0.059 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 4.80e-01 0.117 0.165 0.059 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 1.18e-01 0.296 0.189 0.059 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 735812 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0593 0.168 0.059 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 838431 sc-eQTL 8.21e-01 0.0392 0.173 0.059 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0344 0.0949 0.06 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 3.96e-01 0.0922 0.108 0.06 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0889 0.2 0.06 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 2.28e-01 0.166 0.137 0.06 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 1.00e-01 -0.169 0.103 0.06 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 3.96e-01 0.118 0.139 0.06 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 2.78e-01 0.147 0.135 0.06 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -367551 sc-eQTL 1.93e-01 -0.164 0.126 0.06 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 5.21e-01 0.0848 0.132 0.06 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 1.48e-01 -0.274 0.189 0.06 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 9.08e-01 0.0141 0.123 0.06 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0605 0.121 0.06 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 2.57e-01 0.196 0.173 0.06 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -369505 sc-eQTL 4.63e-01 -0.145 0.197 0.06 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 6.77e-02 0.312 0.17 0.06 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -367551 sc-eQTL 1.11e-01 -0.253 0.158 0.06 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 5.91e-01 0.0802 0.149 0.06 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 8.45e-01 0.0353 0.18 0.06 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0388 0.129 0.06 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00485 0.119 0.06 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0574 0.141 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0891 0.203 0.061 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 1.21e-01 0.264 0.17 0.061 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 1.20e-01 -0.311 0.199 0.061 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 2.23e-01 0.218 0.178 0.061 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 5.69e-01 0.126 0.222 0.061 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 499420 sc-eQTL 7.88e-01 0.0504 0.187 0.061 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 7.78e-01 0.0608 0.215 0.061 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 735812 sc-eQTL 8.54e-01 0.036 0.195 0.061 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 203045 sc-eQTL 7.76e-01 0.0594 0.209 0.061 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 838431 sc-eQTL 4.71e-01 0.125 0.173 0.061 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 9.87e-01 0.00265 0.162 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 3.60e-01 0.147 0.161 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 1.16e-02 0.48 0.188 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 1.73e-01 -0.217 0.159 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0568 0.162 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 499420 sc-eQTL 6.64e-01 0.0783 0.18 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 4.88e-01 0.137 0.198 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 735812 sc-eQTL 6.53e-01 0.0599 0.133 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 203045 sc-eQTL 2.89e-01 -0.207 0.195 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 838431 sc-eQTL 9.82e-01 0.00429 0.187 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 8.30e-01 -0.035 0.163 0.06 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 1.72e-01 0.209 0.153 0.06 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 2.39e-01 0.236 0.2 0.06 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0819 0.144 0.06 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 1.59e-01 -0.181 0.128 0.06 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 499420 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0373 0.164 0.06 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 5.15e-01 -0.125 0.191 0.06 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 735812 sc-eQTL 5.50e-01 0.0954 0.159 0.06 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 203045 sc-eQTL 6.90e-01 0.0763 0.191 0.06 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 838431 sc-eQTL 4.36e-03 -0.508 0.176 0.06 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 9.64e-02 0.254 0.152 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 8.48e-01 0.0306 0.159 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 3.37e-01 0.192 0.199 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0186 0.143 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 9.66e-01 0.00658 0.154 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 499420 sc-eQTL 1.21e-01 -0.263 0.169 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 3.21e-01 0.176 0.177 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 735812 sc-eQTL 2.40e-01 -0.122 0.103 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 203045 sc-eQTL 9.68e-01 0.00746 0.188 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 838431 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0548 0.17 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 7.44e-01 0.0602 0.184 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 7.22e-01 0.0607 0.17 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 5.56e-01 0.113 0.192 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0936 0.158 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0562 0.155 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 499420 sc-eQTL 2.94e-01 -0.141 0.134 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 6.59e-01 0.0889 0.201 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 735812 sc-eQTL 1.25e-01 -0.148 0.0961 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 203045 sc-eQTL 5.25e-01 -0.123 0.193 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 838431 sc-eQTL 7.09e-01 0.0675 0.18 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0331 0.192 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -367551 sc-eQTL 3.54e-01 -0.179 0.192 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 7.54e-01 0.0576 0.184 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 4.26e-01 0.148 0.186 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 4.50e-01 -0.138 0.182 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 2.84e-01 0.2 0.186 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 6.10e-01 -0.106 0.208 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 9.26e-01 0.0106 0.114 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -367551 sc-eQTL 8.72e-01 0.0173 0.107 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0711 0.121 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 1.62e-01 0.259 0.185 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 5.33e-01 -0.068 0.109 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 4.24e-01 0.0837 0.105 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 2.97e-03 0.517 0.172 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 3.52e-01 0.149 0.16 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -367551 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0501 0.125 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 9.77e-01 0.00437 0.148 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0767 0.2 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 1.16e-01 -0.197 0.125 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 1.06e-01 -0.195 0.12 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 3.47e-01 0.173 0.184 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 5.43e-01 0.11 0.18 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -367551 sc-eQTL 9.77e-01 0.00377 0.133 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0147 0.16 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 5.53e-01 0.117 0.196 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0154 0.155 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 4.44e-01 -0.122 0.159 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 7.06e-01 0.0661 0.175 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 1.93e-01 0.211 0.162 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -367551 sc-eQTL 3.16e-01 -0.158 0.157 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 4.31e-02 -0.323 0.159 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0102 0.195 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 4.75e-02 -0.285 0.143 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 1.86e-01 -0.221 0.167 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 2.90e-01 0.203 0.191 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0143 0.154 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -367551 sc-eQTL 8.11e-02 0.264 0.151 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 7.76e-01 0.0484 0.17 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0696 0.196 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0981 0.136 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0666 0.148 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 1.07e-01 0.304 0.188 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 1.59e-01 -0.275 0.194 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -367551 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0952 0.168 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 4.87e-01 0.131 0.188 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 2.26e-01 0.241 0.199 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 2.21e-01 0.194 0.158 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 2.08e-01 -0.237 0.188 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 5.29e-02 0.373 0.191 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 8.14e-01 0.0467 0.199 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -367551 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0602 0.185 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 3.59e-01 0.178 0.194 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 7.78e-01 0.0581 0.206 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 5.75e-02 -0.359 0.188 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 6.92e-01 0.0719 0.181 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 6.66e-01 -0.081 0.188 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 5.45e-01 0.116 0.191 0.058 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -367551 sc-eQTL 8.86e-02 -0.296 0.173 0.058 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 5.43e-01 0.0976 0.16 0.058 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0469 0.204 0.058 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 1.59e-01 -0.208 0.147 0.058 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0903 0.181 0.058 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 3.98e-01 -0.157 0.185 0.058 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 5.79e-01 0.102 0.184 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -367551 sc-eQTL 2.91e-01 -0.181 0.171 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 4.02e-01 0.14 0.167 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 1.58e-03 -0.635 0.198 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 3.40e-01 -0.173 0.181 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0948 0.192 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 8.55e-02 0.328 0.19 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -369505 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00247 0.178 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 2.77e-01 0.174 0.16 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -367551 sc-eQTL 2.42e-01 -0.166 0.141 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 9.70e-01 0.00576 0.154 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 4.95e-01 -0.137 0.201 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0753 0.142 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 5.69e-01 -0.078 0.137 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 3.64e-01 0.172 0.189 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -369505 sc-eQTL 8.78e-01 0.0298 0.195 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 9.43e-01 0.0136 0.191 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -367551 sc-eQTL 9.04e-01 0.0228 0.188 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 9.91e-01 0.00194 0.172 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0317 0.211 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 5.22e-01 0.113 0.176 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 6.77e-01 0.0822 0.197 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 2.31e-01 0.264 0.219 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -369505 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0742 0.178 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 2.69e-01 0.182 0.164 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -367551 sc-eQTL 5.93e-01 -0.084 0.157 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 4.95e-01 -0.109 0.159 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 3.51e-01 -0.166 0.177 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 1.48e-01 0.202 0.139 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 3.19e-01 0.16 0.16 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 5.83e-01 0.102 0.186 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -369505 sc-eQTL 2.71e-01 -0.205 0.186 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 2.66e-01 -0.264 0.237 0.052 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 3.07e-01 0.227 0.221 0.052 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 3.57e-01 0.189 0.204 0.052 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 3.53e-01 -0.178 0.191 0.052 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 2.32e-01 0.201 0.168 0.052 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 499420 sc-eQTL 5.65e-01 0.137 0.237 0.052 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 2.47e-01 -0.268 0.23 0.052 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 735812 sc-eQTL 6.91e-01 0.0731 0.183 0.052 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 203045 sc-eQTL 4.14e-01 0.184 0.224 0.052 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 838431 sc-eQTL 5.76e-01 0.126 0.224 0.052 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 8.01e-01 0.0498 0.197 0.059 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -367551 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0123 0.181 0.059 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 1.18e-02 0.481 0.189 0.059 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 2.59e-01 0.212 0.187 0.059 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 5.58e-01 0.0894 0.152 0.059 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 2.62e-01 0.158 0.14 0.059 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 6.93e-01 0.0668 0.169 0.059 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 1.52e-01 0.246 0.171 0.06 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -367551 sc-eQTL 4.16e-01 0.138 0.17 0.06 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0184 0.179 0.06 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 5.48e-01 -0.124 0.207 0.06 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0264 0.146 0.06 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0167 0.158 0.06 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 5.27e-01 0.126 0.199 0.06 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 9.47e-02 0.293 0.175 0.056 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 5.52e-01 0.108 0.181 0.056 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 9.17e-01 0.0208 0.2 0.056 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 1.45e-01 -0.296 0.202 0.056 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 7.33e-01 0.0604 0.177 0.056 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 4.78e-02 0.399 0.2 0.056 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 735812 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0526 0.123 0.056 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 838431 sc-eQTL 8.07e-01 0.0443 0.181 0.056 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0797 0.11 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 8.01e-01 0.0328 0.13 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 8.50e-01 0.0364 0.193 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0687 0.141 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 1.62e-01 -0.155 0.11 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0328 0.153 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 3.41e-01 0.136 0.143 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 3.80e-01 0.12 0.136 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 4.67e-01 -0.152 0.209 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 1.86e-01 0.217 0.164 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 3.97e-01 -0.121 0.143 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 1.27e-01 0.25 0.163 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 1.69e-01 0.318 0.23 0.061 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -367551 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0324 0.214 0.061 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 5.95e-01 0.119 0.224 0.061 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 2.31e-01 -0.263 0.219 0.061 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 1.56e-01 -0.297 0.208 0.061 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 6.87e-02 -0.415 0.226 0.061 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 2.29e-01 0.268 0.222 0.061 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 4.30e-01 -0.139 0.175 0.06 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 2.00e-01 -0.219 0.17 0.06 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 2.52e-01 0.225 0.196 0.06 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 2.76e-01 0.195 0.179 0.06 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 4.05e-01 -0.142 0.17 0.06 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 4.60e-01 0.136 0.183 0.06 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0322 0.149 0.061 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 1.60e-01 0.174 0.124 0.061 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 6.83e-02 -0.351 0.192 0.061 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 6.89e-03 0.455 0.167 0.061 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 3.24e-01 0.163 0.165 0.061 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 8.75e-01 0.027 0.172 0.061 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 7.58e-03 -0.551 0.204 0.065 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 9.18e-01 0.0208 0.201 0.065 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 9.02e-01 0.0251 0.204 0.065 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 3.95e-01 -0.149 0.175 0.065 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 7.43e-02 0.369 0.206 0.065 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 4.89e-01 -0.149 0.214 0.065 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 735812 sc-eQTL 3.20e-01 -0.187 0.188 0.065 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 838431 sc-eQTL 4.70e-01 0.11 0.152 0.065 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0271 0.136 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 3.39e-02 0.258 0.121 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 3.60e-02 0.434 0.206 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 3.02e-01 -0.127 0.122 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 1.48e-01 -0.162 0.111 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 499420 sc-eQTL 9.28e-01 -0.013 0.144 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 6.50e-01 0.0829 0.182 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 735812 sc-eQTL 6.45e-01 0.0584 0.127 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 203045 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0658 0.19 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 838431 sc-eQTL 2.52e-01 -0.22 0.191 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 3.00e-01 0.154 0.148 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 6.24e-01 0.0714 0.145 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 2.51e-01 0.221 0.192 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 8.09e-01 -0.034 0.141 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0137 0.144 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 499420 sc-eQTL 8.44e-02 -0.304 0.175 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 3.64e-01 0.161 0.177 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 735812 sc-eQTL 2.49e-02 -0.188 0.083 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 203045 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0718 0.183 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 838431 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0855 0.169 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 9.47e-01 0.00676 0.102 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 4.24e-01 0.0968 0.121 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0705 0.195 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 6.07e-01 0.0719 0.14 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 1.01e-01 -0.172 0.104 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 2.82e-01 0.157 0.145 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0133 0.137 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 4.66e-01 0.0835 0.114 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0604 0.207 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 6.21e-02 0.288 0.153 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00604 0.155 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 6.60e-01 0.0719 0.163 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 272932 sc-eQTL 2.00e-01 0.178 0.138 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -367551 sc-eQTL 2.79e-01 -0.139 0.128 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -946314 sc-eQTL 9.60e-01 0.00698 0.14 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -475112 sc-eQTL 3.33e-01 -0.191 0.197 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 sc-eQTL 5.61e-01 0.073 0.125 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -239684 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0857 0.121 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -265225 sc-eQTL 3.29e-01 0.177 0.181 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -369505 sc-eQTL 4.35e-01 -0.155 0.199 0.06 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000173598 NUDT4 -175620 eQTL 0.124 -0.0559 0.0363 0.00176 0.0 0.0721

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina