Genes within 1Mb (chr12:93178649:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 4.10e-01 0.0855 0.104 0.064 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 3.32e-01 0.0998 0.103 0.064 B L1
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 3.15e-02 0.333 0.154 0.064 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 5.76e-01 0.0648 0.116 0.064 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0406 0.102 0.064 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 475806 sc-eQTL 8.63e-01 0.02 0.115 0.064 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00189 0.159 0.064 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 712198 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0387 0.0786 0.064 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 179431 sc-eQTL 9.25e-01 0.015 0.159 0.064 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 814817 sc-eQTL 1.63e-01 -0.217 0.155 0.064 B L1
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 2.17e-01 0.131 0.106 0.064 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -391165 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0255 0.102 0.064 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0482 0.108 0.064 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 7.54e-01 0.0554 0.176 0.064 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0534 0.102 0.064 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0438 0.0944 0.064 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 9.11e-02 0.277 0.163 0.064 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 8.64e-01 0.0207 0.12 0.064 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -391165 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0568 0.138 0.064 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 2.64e-01 -0.159 0.142 0.064 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0804 0.167 0.064 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 9.59e-02 -0.165 0.0986 0.064 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 3.92e-01 -0.106 0.123 0.064 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 9.60e-01 0.00877 0.176 0.064 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 1.32e-01 0.239 0.158 0.063 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 3.21e-01 0.171 0.171 0.063 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 5.23e-01 -0.124 0.194 0.063 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 2.04e-01 -0.202 0.159 0.063 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 2.09e-01 0.202 0.16 0.063 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 3.59e-01 0.17 0.185 0.063 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 712198 sc-eQTL 9.55e-01 0.00918 0.163 0.063 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 814817 sc-eQTL 7.08e-01 0.0631 0.168 0.063 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0134 0.093 0.064 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 7.41e-02 0.189 0.105 0.064 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00942 0.195 0.064 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 2.55e-01 0.153 0.134 0.064 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 3.99e-02 -0.207 0.1 0.064 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 5.27e-01 0.0861 0.136 0.064 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 2.16e-01 0.164 0.132 0.064 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -391165 sc-eQTL 1.16e-01 -0.195 0.123 0.064 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 6.74e-01 0.0545 0.129 0.064 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 5.62e-01 -0.108 0.186 0.064 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 8.24e-01 0.0268 0.12 0.064 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0439 0.119 0.064 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 4.91e-01 0.117 0.17 0.064 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -393119 sc-eQTL 3.05e-01 -0.199 0.193 0.064 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 8.19e-02 0.288 0.165 0.064 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -391165 sc-eQTL 6.91e-02 -0.279 0.153 0.064 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 4.92e-01 0.0995 0.144 0.064 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 8.69e-01 0.0289 0.175 0.064 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 8.01e-01 0.0315 0.125 0.064 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0572 0.116 0.064 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0784 0.137 0.064 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 4.16e-01 -0.161 0.198 0.066 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 2.96e-01 0.175 0.166 0.066 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 5.08e-01 -0.13 0.196 0.066 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 2.67e-01 0.193 0.174 0.066 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 5.20e-01 0.139 0.216 0.066 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 475806 sc-eQTL 6.98e-01 0.0711 0.183 0.066 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 4.82e-01 0.148 0.21 0.066 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 712198 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00503 0.19 0.066 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 179431 sc-eQTL 6.75e-01 0.0854 0.203 0.066 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 814817 sc-eQTL 3.10e-01 0.171 0.168 0.066 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 7.25e-01 0.056 0.159 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 4.24e-01 0.126 0.157 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 1.61e-02 0.448 0.185 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 3.98e-01 -0.132 0.156 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 9.70e-01 0.00595 0.159 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 475806 sc-eQTL 9.65e-01 0.00777 0.176 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0356 0.194 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 712198 sc-eQTL 3.09e-01 0.133 0.13 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 179431 sc-eQTL 8.87e-02 -0.325 0.19 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 814817 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0777 0.183 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 5.23e-01 -0.102 0.159 0.065 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 4.15e-01 0.122 0.149 0.065 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 1.33e-01 0.293 0.195 0.065 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 8.40e-01 0.0283 0.14 0.065 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 2.64e-01 -0.14 0.125 0.065 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 475806 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0417 0.16 0.065 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 1.57e-01 -0.264 0.185 0.065 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 712198 sc-eQTL 2.54e-01 0.177 0.155 0.065 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 179431 sc-eQTL 6.10e-01 0.095 0.186 0.065 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 814817 sc-eQTL 3.52e-02 -0.367 0.173 0.065 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 8.76e-02 0.256 0.149 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 6.51e-01 0.0707 0.156 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 3.69e-01 0.176 0.196 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 5.77e-01 0.0783 0.14 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 6.40e-01 0.0707 0.151 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 475806 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0514 0.167 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 6.36e-01 0.0825 0.174 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 712198 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0462 0.101 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 179431 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0101 0.185 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 814817 sc-eQTL 3.97e-01 -0.141 0.166 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 5.29e-01 0.114 0.18 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 6.52e-01 0.0751 0.166 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 8.25e-01 0.0414 0.187 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0315 0.155 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0819 0.151 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 475806 sc-eQTL 6.22e-01 -0.065 0.132 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 4.74e-01 0.141 0.196 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 712198 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0325 0.0944 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 179431 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0918 0.189 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 814817 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0391 0.176 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 8.58e-01 0.0333 0.186 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -391165 sc-eQTL 3.65e-01 -0.169 0.186 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 6.46e-01 0.082 0.178 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 7.07e-01 0.0681 0.181 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0437 0.177 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 4.97e-01 0.123 0.18 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 2.60e-01 -0.227 0.201 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 5.33e-01 0.0694 0.111 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -391165 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0124 0.105 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0112 0.119 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 4.49e-01 0.137 0.181 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0306 0.106 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 5.08e-01 0.0678 0.102 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 3.62e-02 0.358 0.17 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 1.94e-01 0.202 0.155 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -391165 sc-eQTL 3.32e-01 -0.118 0.121 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0483 0.144 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 7.16e-01 0.0706 0.194 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 3.97e-01 -0.103 0.121 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 1.01e-01 -0.192 0.116 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 8.65e-01 0.0305 0.178 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 4.34e-01 0.138 0.176 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -391165 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00262 0.13 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0205 0.156 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 7.31e-01 0.0661 0.192 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0796 0.152 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 1.89e-01 -0.204 0.155 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0296 0.171 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 8.67e-02 0.272 0.158 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -391165 sc-eQTL 8.32e-02 -0.267 0.153 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 5.83e-02 -0.296 0.155 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0559 0.19 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 1.77e-02 -0.333 0.139 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 1.97e-01 -0.211 0.163 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 7.69e-01 0.0552 0.188 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0112 0.15 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -391165 sc-eQTL 2.69e-01 0.163 0.147 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 9.34e-01 0.0137 0.165 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0813 0.191 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0873 0.132 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 4.58e-01 -0.107 0.144 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 7.37e-01 0.062 0.184 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 3.10e-01 -0.192 0.188 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -391165 sc-eQTL 8.97e-01 0.021 0.162 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 4.99e-01 0.123 0.182 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 7.75e-01 0.0552 0.193 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 2.47e-01 0.177 0.153 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 3.84e-01 -0.159 0.182 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 1.47e-01 0.27 0.186 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0505 0.196 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -391165 sc-eQTL 5.17e-01 -0.118 0.182 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 1.05e-01 0.31 0.19 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 4.83e-01 0.142 0.202 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 7.90e-02 -0.327 0.185 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 5.04e-01 0.119 0.178 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0267 0.185 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 4.57e-01 0.138 0.185 0.063 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -391165 sc-eQTL 4.91e-02 -0.331 0.167 0.063 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 3.80e-01 0.137 0.155 0.063 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0104 0.198 0.063 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 3.59e-01 -0.132 0.143 0.063 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0382 0.176 0.063 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 3.83e-01 -0.157 0.18 0.063 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 5.64e-01 0.103 0.179 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -391165 sc-eQTL 1.92e-01 -0.218 0.167 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 3.21e-01 0.162 0.162 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 1.56e-03 -0.619 0.193 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 5.48e-01 -0.106 0.176 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 2.93e-01 -0.197 0.187 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 1.06e-01 0.301 0.185 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -393119 sc-eQTL 5.27e-01 -0.11 0.174 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 1.46e-01 0.229 0.157 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -391165 sc-eQTL 1.15e-01 -0.219 0.138 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 9.54e-01 0.00875 0.152 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 9.99e-01 0.000212 0.197 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 9.70e-01 0.00534 0.14 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0895 0.134 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 8.10e-01 0.0448 0.186 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -393119 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0194 0.191 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 5.90e-01 0.1 0.186 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -391165 sc-eQTL 6.04e-01 0.0955 0.184 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 9.72e-01 0.00592 0.168 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00246 0.206 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 9.72e-01 0.00606 0.172 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 7.89e-01 0.0518 0.193 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 3.74e-01 0.191 0.215 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -393119 sc-eQTL 4.67e-01 -0.127 0.174 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 5.29e-01 0.102 0.162 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -391165 sc-eQTL 2.90e-01 -0.163 0.154 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 1.99e-01 -0.201 0.156 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0991 0.175 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 2.84e-01 0.147 0.137 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 3.04e-01 0.163 0.158 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 5.53e-01 0.109 0.183 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -393119 sc-eQTL 3.84e-01 -0.16 0.183 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 4.23e-01 -0.189 0.236 0.056 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 2.74e-01 0.241 0.219 0.056 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 1.85e-01 0.269 0.202 0.056 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 3.39e-01 -0.182 0.189 0.056 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 3.29e-02 0.354 0.164 0.056 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 475806 sc-eQTL 2.03e-01 0.3 0.234 0.056 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 2.14e-01 -0.286 0.228 0.056 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 712198 sc-eQTL 4.96e-01 0.124 0.182 0.056 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 179431 sc-eQTL 2.91e-01 0.235 0.222 0.056 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 814817 sc-eQTL 5.24e-01 0.142 0.222 0.056 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0289 0.191 0.063 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -391165 sc-eQTL 7.92e-01 0.0461 0.175 0.063 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 2.47e-02 0.416 0.184 0.063 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 2.52e-01 0.208 0.181 0.063 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 2.72e-01 0.162 0.147 0.063 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 2.90e-01 0.144 0.136 0.063 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 8.32e-01 0.0346 0.163 0.063 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 4.02e-02 0.344 0.167 0.064 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -391165 sc-eQTL 7.06e-01 0.0626 0.166 0.064 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 9.27e-01 0.016 0.175 0.064 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 7.88e-01 0.0544 0.202 0.064 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 8.88e-01 0.0202 0.143 0.064 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0906 0.154 0.064 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 9.44e-01 0.0135 0.194 0.064 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 1.73e-02 0.404 0.168 0.061 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 6.75e-01 0.0737 0.175 0.061 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0836 0.194 0.061 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 1.07e-01 -0.317 0.196 0.061 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 9.07e-01 0.0201 0.172 0.061 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 4.06e-01 0.163 0.196 0.061 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 712198 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0632 0.12 0.061 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 814817 sc-eQTL 6.48e-01 0.0805 0.176 0.061 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0349 0.108 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 2.28e-01 0.153 0.126 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 8.61e-01 0.033 0.188 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0824 0.138 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 8.55e-02 -0.186 0.107 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0494 0.15 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 2.95e-01 0.146 0.139 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 9.97e-02 0.219 0.132 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0454 0.204 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 2.57e-01 0.182 0.16 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0884 0.139 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 2.62e-01 0.179 0.16 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 1.38e-01 0.333 0.223 0.064 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -391165 sc-eQTL 8.73e-01 0.0335 0.209 0.064 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 6.40e-01 0.102 0.218 0.064 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 3.02e-01 -0.221 0.213 0.064 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 4.51e-01 -0.154 0.203 0.064 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 1.68e-02 -0.528 0.218 0.064 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 1.03e-01 0.353 0.215 0.064 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 4.78e-01 -0.121 0.17 0.064 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0515 0.166 0.064 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 8.68e-02 0.326 0.189 0.064 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 7.74e-02 0.306 0.172 0.064 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 1.68e-01 -0.228 0.165 0.064 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 3.16e-01 0.179 0.178 0.064 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0509 0.144 0.066 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 3.47e-01 0.113 0.12 0.066 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 1.58e-01 -0.265 0.186 0.066 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 2.59e-03 0.491 0.161 0.066 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 4.90e-01 0.111 0.16 0.066 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0353 0.166 0.066 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 4.60e-02 -0.409 0.203 0.068 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 6.57e-01 0.0883 0.199 0.068 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0506 0.201 0.068 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 4.76e-01 -0.124 0.173 0.068 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 7.73e-03 0.541 0.201 0.068 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0863 0.212 0.068 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 712198 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0947 0.186 0.068 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 814817 sc-eQTL 2.20e-01 0.185 0.15 0.068 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0447 0.133 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 1.12e-01 0.189 0.119 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 1.27e-02 0.503 0.2 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0228 0.12 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 2.83e-01 -0.117 0.109 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 475806 sc-eQTL 7.13e-01 -0.052 0.141 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0791 0.178 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 712198 sc-eQTL 3.03e-01 0.128 0.124 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 179431 sc-eQTL 5.67e-01 -0.106 0.186 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 814817 sc-eQTL 2.62e-01 -0.21 0.187 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 2.07e-01 0.184 0.145 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 4.12e-01 0.117 0.142 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 3.93e-01 0.162 0.189 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 7.19e-01 0.0497 0.138 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 8.51e-01 0.0266 0.141 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 475806 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0425 0.173 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 5.24e-01 0.111 0.174 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 712198 sc-eQTL 1.66e-01 -0.114 0.0819 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 179431 sc-eQTL 7.54e-01 -0.056 0.179 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 814817 sc-eQTL 2.35e-01 -0.197 0.165 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 7.84e-01 0.0275 0.1 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 6.43e-02 0.219 0.118 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0161 0.191 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 8.10e-01 0.0329 0.137 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 6.26e-02 -0.191 0.102 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 4.22e-01 0.115 0.143 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0148 0.133 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 3.68e-01 0.1 0.111 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 8.07e-01 0.0491 0.201 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 1.51e-02 0.363 0.148 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0726 0.15 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 7.96e-01 0.0411 0.159 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 249318 sc-eQTL 1.85e-01 0.18 0.135 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -391165 sc-eQTL 1.55e-01 -0.178 0.125 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -969928 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0311 0.137 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -498726 sc-eQTL 9.57e-01 -0.0106 0.194 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 sc-eQTL 5.66e-01 0.0707 0.123 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -263298 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0679 0.119 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -288839 sc-eQTL 6.88e-01 0.0712 0.177 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -393119 sc-eQTL 3.56e-01 -0.18 0.195 0.065 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000173598 NUDT4 -199234 eQTL 0.223 -0.0392 0.0322 0.0011 0.0 0.0844


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina