Genes within 1Mb (chr12:93175368:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 4.10e-01 0.0855 0.104 0.064 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 3.32e-01 0.0998 0.103 0.064 B L1
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 3.15e-02 0.333 0.154 0.064 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 5.76e-01 0.0648 0.116 0.064 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0406 0.102 0.064 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 472525 sc-eQTL 8.63e-01 0.02 0.115 0.064 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00189 0.159 0.064 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 708917 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0387 0.0786 0.064 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 176150 sc-eQTL 9.25e-01 0.015 0.159 0.064 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 811536 sc-eQTL 1.63e-01 -0.217 0.155 0.064 B L1
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 2.17e-01 0.131 0.106 0.064 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -394446 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0255 0.102 0.064 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0482 0.108 0.064 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 7.54e-01 0.0554 0.176 0.064 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0534 0.102 0.064 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0438 0.0944 0.064 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 9.11e-02 0.277 0.163 0.064 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 8.64e-01 0.0207 0.12 0.064 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -394446 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0568 0.138 0.064 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 2.64e-01 -0.159 0.142 0.064 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0804 0.167 0.064 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 9.59e-02 -0.165 0.0986 0.064 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 3.92e-01 -0.106 0.123 0.064 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 9.60e-01 0.00877 0.176 0.064 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 1.32e-01 0.239 0.158 0.063 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 3.21e-01 0.171 0.171 0.063 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 5.23e-01 -0.124 0.194 0.063 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 2.04e-01 -0.202 0.159 0.063 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 2.09e-01 0.202 0.16 0.063 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 3.59e-01 0.17 0.185 0.063 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 708917 sc-eQTL 9.55e-01 0.00918 0.163 0.063 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 811536 sc-eQTL 7.08e-01 0.0631 0.168 0.063 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0134 0.093 0.064 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 7.41e-02 0.189 0.105 0.064 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00942 0.195 0.064 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 2.55e-01 0.153 0.134 0.064 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 3.99e-02 -0.207 0.1 0.064 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 5.27e-01 0.0861 0.136 0.064 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 2.16e-01 0.164 0.132 0.064 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -394446 sc-eQTL 1.16e-01 -0.195 0.123 0.064 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 6.74e-01 0.0545 0.129 0.064 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 5.62e-01 -0.108 0.186 0.064 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 8.24e-01 0.0268 0.12 0.064 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0439 0.119 0.064 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 4.91e-01 0.117 0.17 0.064 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -396400 sc-eQTL 3.05e-01 -0.199 0.193 0.064 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 8.19e-02 0.288 0.165 0.064 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -394446 sc-eQTL 6.91e-02 -0.279 0.153 0.064 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 4.92e-01 0.0995 0.144 0.064 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 8.69e-01 0.0289 0.175 0.064 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 8.01e-01 0.0315 0.125 0.064 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0572 0.116 0.064 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0784 0.137 0.064 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 4.16e-01 -0.161 0.198 0.066 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 2.96e-01 0.175 0.166 0.066 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 5.08e-01 -0.13 0.196 0.066 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 2.67e-01 0.193 0.174 0.066 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 5.20e-01 0.139 0.216 0.066 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 472525 sc-eQTL 6.98e-01 0.0711 0.183 0.066 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 4.82e-01 0.148 0.21 0.066 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 708917 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00503 0.19 0.066 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 176150 sc-eQTL 6.75e-01 0.0854 0.203 0.066 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 811536 sc-eQTL 3.10e-01 0.171 0.168 0.066 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 7.25e-01 0.056 0.159 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 4.24e-01 0.126 0.157 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 1.61e-02 0.448 0.185 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 3.98e-01 -0.132 0.156 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 9.70e-01 0.00595 0.159 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 472525 sc-eQTL 9.65e-01 0.00777 0.176 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0356 0.194 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 708917 sc-eQTL 3.09e-01 0.133 0.13 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 176150 sc-eQTL 8.87e-02 -0.325 0.19 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 811536 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0777 0.183 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 5.23e-01 -0.102 0.159 0.065 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 4.15e-01 0.122 0.149 0.065 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 1.33e-01 0.293 0.195 0.065 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 8.40e-01 0.0283 0.14 0.065 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 2.64e-01 -0.14 0.125 0.065 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 472525 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0417 0.16 0.065 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 1.57e-01 -0.264 0.185 0.065 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 708917 sc-eQTL 2.54e-01 0.177 0.155 0.065 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 176150 sc-eQTL 6.10e-01 0.095 0.186 0.065 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 811536 sc-eQTL 3.52e-02 -0.367 0.173 0.065 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 8.76e-02 0.256 0.149 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 6.51e-01 0.0707 0.156 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 3.69e-01 0.176 0.196 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 5.77e-01 0.0783 0.14 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 6.40e-01 0.0707 0.151 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 472525 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0514 0.167 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 6.36e-01 0.0825 0.174 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 708917 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0462 0.101 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 176150 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0101 0.185 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 811536 sc-eQTL 3.97e-01 -0.141 0.166 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 5.29e-01 0.114 0.18 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 6.52e-01 0.0751 0.166 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 8.25e-01 0.0414 0.187 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0315 0.155 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0819 0.151 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 472525 sc-eQTL 6.22e-01 -0.065 0.132 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 4.74e-01 0.141 0.196 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 708917 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0325 0.0944 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 176150 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0918 0.189 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 811536 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0391 0.176 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 8.58e-01 0.0333 0.186 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -394446 sc-eQTL 3.65e-01 -0.169 0.186 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 6.46e-01 0.082 0.178 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 7.07e-01 0.0681 0.181 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0437 0.177 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 4.97e-01 0.123 0.18 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 2.60e-01 -0.227 0.201 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 5.33e-01 0.0694 0.111 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -394446 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0124 0.105 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0112 0.119 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 4.49e-01 0.137 0.181 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0306 0.106 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 5.08e-01 0.0678 0.102 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 3.62e-02 0.358 0.17 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 1.94e-01 0.202 0.155 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -394446 sc-eQTL 3.32e-01 -0.118 0.121 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0483 0.144 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 7.16e-01 0.0706 0.194 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 3.97e-01 -0.103 0.121 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 1.01e-01 -0.192 0.116 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 8.65e-01 0.0305 0.178 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 4.34e-01 0.138 0.176 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -394446 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00262 0.13 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0205 0.156 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 7.31e-01 0.0661 0.192 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0796 0.152 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 1.89e-01 -0.204 0.155 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0296 0.171 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 8.67e-02 0.272 0.158 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -394446 sc-eQTL 8.32e-02 -0.267 0.153 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 5.83e-02 -0.296 0.155 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0559 0.19 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 1.77e-02 -0.333 0.139 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 1.97e-01 -0.211 0.163 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 7.69e-01 0.0552 0.188 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0112 0.15 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -394446 sc-eQTL 2.69e-01 0.163 0.147 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 9.34e-01 0.0137 0.165 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0813 0.191 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0873 0.132 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 4.58e-01 -0.107 0.144 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 7.37e-01 0.062 0.184 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 3.10e-01 -0.192 0.188 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -394446 sc-eQTL 8.97e-01 0.021 0.162 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 4.99e-01 0.123 0.182 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 7.75e-01 0.0552 0.193 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 2.47e-01 0.177 0.153 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 3.84e-01 -0.159 0.182 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 1.47e-01 0.27 0.186 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0505 0.196 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -394446 sc-eQTL 5.17e-01 -0.118 0.182 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 1.05e-01 0.31 0.19 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 4.83e-01 0.142 0.202 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 7.90e-02 -0.327 0.185 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 5.04e-01 0.119 0.178 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0267 0.185 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 4.57e-01 0.138 0.185 0.063 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -394446 sc-eQTL 4.91e-02 -0.331 0.167 0.063 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 3.80e-01 0.137 0.155 0.063 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0104 0.198 0.063 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 3.59e-01 -0.132 0.143 0.063 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0382 0.176 0.063 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 3.83e-01 -0.157 0.18 0.063 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 5.64e-01 0.103 0.179 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -394446 sc-eQTL 1.92e-01 -0.218 0.167 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 3.21e-01 0.162 0.162 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 1.56e-03 -0.619 0.193 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 5.48e-01 -0.106 0.176 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 2.93e-01 -0.197 0.187 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 1.06e-01 0.301 0.185 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -396400 sc-eQTL 5.27e-01 -0.11 0.174 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 1.46e-01 0.229 0.157 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -394446 sc-eQTL 1.15e-01 -0.219 0.138 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 9.54e-01 0.00875 0.152 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 9.99e-01 0.000212 0.197 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 9.70e-01 0.00534 0.14 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0895 0.134 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 8.10e-01 0.0448 0.186 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -396400 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0194 0.191 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 5.90e-01 0.1 0.186 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -394446 sc-eQTL 6.04e-01 0.0955 0.184 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 9.72e-01 0.00592 0.168 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00246 0.206 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 9.72e-01 0.00606 0.172 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 7.89e-01 0.0518 0.193 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 3.74e-01 0.191 0.215 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -396400 sc-eQTL 4.67e-01 -0.127 0.174 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 5.29e-01 0.102 0.162 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -394446 sc-eQTL 2.90e-01 -0.163 0.154 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 1.99e-01 -0.201 0.156 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0991 0.175 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 2.84e-01 0.147 0.137 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 3.04e-01 0.163 0.158 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 5.53e-01 0.109 0.183 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -396400 sc-eQTL 3.84e-01 -0.16 0.183 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 4.23e-01 -0.189 0.236 0.056 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 2.74e-01 0.241 0.219 0.056 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 1.85e-01 0.269 0.202 0.056 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 3.39e-01 -0.182 0.189 0.056 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 3.29e-02 0.354 0.164 0.056 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 472525 sc-eQTL 2.03e-01 0.3 0.234 0.056 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 2.14e-01 -0.286 0.228 0.056 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 708917 sc-eQTL 4.96e-01 0.124 0.182 0.056 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 176150 sc-eQTL 2.91e-01 0.235 0.222 0.056 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 811536 sc-eQTL 5.24e-01 0.142 0.222 0.056 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0289 0.191 0.063 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -394446 sc-eQTL 7.92e-01 0.0461 0.175 0.063 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 2.47e-02 0.416 0.184 0.063 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 2.52e-01 0.208 0.181 0.063 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 2.72e-01 0.162 0.147 0.063 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 2.90e-01 0.144 0.136 0.063 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 8.32e-01 0.0346 0.163 0.063 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 4.02e-02 0.344 0.167 0.064 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -394446 sc-eQTL 7.06e-01 0.0626 0.166 0.064 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 9.27e-01 0.016 0.175 0.064 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 7.88e-01 0.0544 0.202 0.064 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 8.88e-01 0.0202 0.143 0.064 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0906 0.154 0.064 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 9.44e-01 0.0135 0.194 0.064 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 1.73e-02 0.404 0.168 0.061 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 6.75e-01 0.0737 0.175 0.061 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0836 0.194 0.061 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 1.07e-01 -0.317 0.196 0.061 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 9.07e-01 0.0201 0.172 0.061 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 4.06e-01 0.163 0.196 0.061 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 708917 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0632 0.12 0.061 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 811536 sc-eQTL 6.48e-01 0.0805 0.176 0.061 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0349 0.108 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 2.28e-01 0.153 0.126 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 8.61e-01 0.033 0.188 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0824 0.138 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 8.55e-02 -0.186 0.107 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0494 0.15 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 2.95e-01 0.146 0.139 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 9.97e-02 0.219 0.132 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0454 0.204 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 2.57e-01 0.182 0.16 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0884 0.139 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 2.62e-01 0.179 0.16 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 1.38e-01 0.333 0.223 0.064 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -394446 sc-eQTL 8.73e-01 0.0335 0.209 0.064 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 6.40e-01 0.102 0.218 0.064 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 3.02e-01 -0.221 0.213 0.064 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 4.51e-01 -0.154 0.203 0.064 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 1.68e-02 -0.528 0.218 0.064 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 1.03e-01 0.353 0.215 0.064 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 4.78e-01 -0.121 0.17 0.064 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0515 0.166 0.064 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 8.68e-02 0.326 0.189 0.064 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 7.74e-02 0.306 0.172 0.064 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 1.68e-01 -0.228 0.165 0.064 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 3.16e-01 0.179 0.178 0.064 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0509 0.144 0.066 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 3.47e-01 0.113 0.12 0.066 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 1.58e-01 -0.265 0.186 0.066 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 2.59e-03 0.491 0.161 0.066 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 4.90e-01 0.111 0.16 0.066 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0353 0.166 0.066 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 4.60e-02 -0.409 0.203 0.068 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 6.57e-01 0.0883 0.199 0.068 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0506 0.201 0.068 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 4.76e-01 -0.124 0.173 0.068 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 7.73e-03 0.541 0.201 0.068 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0863 0.212 0.068 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 708917 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0947 0.186 0.068 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 811536 sc-eQTL 2.20e-01 0.185 0.15 0.068 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0447 0.133 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 1.12e-01 0.189 0.119 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 1.27e-02 0.503 0.2 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0228 0.12 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 2.83e-01 -0.117 0.109 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 472525 sc-eQTL 7.13e-01 -0.052 0.141 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0791 0.178 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 708917 sc-eQTL 3.03e-01 0.128 0.124 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 176150 sc-eQTL 5.67e-01 -0.106 0.186 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 811536 sc-eQTL 2.62e-01 -0.21 0.187 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 2.07e-01 0.184 0.145 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 4.12e-01 0.117 0.142 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 3.93e-01 0.162 0.189 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 7.19e-01 0.0497 0.138 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 8.51e-01 0.0266 0.141 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 472525 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0425 0.173 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 5.24e-01 0.111 0.174 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 708917 sc-eQTL 1.66e-01 -0.114 0.0819 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 176150 sc-eQTL 7.54e-01 -0.056 0.179 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 811536 sc-eQTL 2.35e-01 -0.197 0.165 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 7.84e-01 0.0275 0.1 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 6.43e-02 0.219 0.118 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0161 0.191 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 8.10e-01 0.0329 0.137 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 6.26e-02 -0.191 0.102 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 4.22e-01 0.115 0.143 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0148 0.133 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 3.68e-01 0.1 0.111 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 8.07e-01 0.0491 0.201 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 1.51e-02 0.363 0.148 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0726 0.15 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 7.96e-01 0.0411 0.159 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 246037 sc-eQTL 1.85e-01 0.18 0.135 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -394446 sc-eQTL 1.55e-01 -0.178 0.125 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -973209 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0311 0.137 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -502007 sc-eQTL 9.57e-01 -0.0106 0.194 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 sc-eQTL 5.66e-01 0.0707 0.123 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -266579 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0679 0.119 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -292120 sc-eQTL 6.88e-01 0.0712 0.177 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -396400 sc-eQTL 3.56e-01 -0.18 0.195 0.065 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000173598 NUDT4 -202515 eQTL 0.227 -0.0388 0.0321 0.00108 0.0 0.0844


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina