logo

Genes within 1Mb (chr12:93161766:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0149 0.0668 0.141 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 1.86e-01 -0.0875 0.0659 0.141 B L1
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 3.84e-01 0.0872 0.1 0.141 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 3.30e-01 0.0726 0.0743 0.141 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 5.13e-01 0.043 0.0656 0.141 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 458923 sc-eQTL 9.54e-01 0.00432 0.0742 0.141 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0457 0.103 0.141 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 695315 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0744 0.0503 0.141 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 162548 sc-eQTL 5.57e-01 -0.06 0.102 0.141 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 797934 sc-eQTL 7.37e-02 -0.179 0.0994 0.141 B L1
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0917 0.0702 0.141 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -408048 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0102 0.0681 0.141 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 1.39e-01 -0.106 0.0712 0.141 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 8.65e-01 0.02 0.117 0.141 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 5.44e-01 0.041 0.0676 0.141 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00441 0.0628 0.141 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 7.71e-02 -0.193 0.108 0.141 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 4.70e-01 0.0559 0.0772 0.141 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -408048 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00606 0.0887 0.141 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0392 0.0913 0.141 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 1.25e-01 -0.164 0.107 0.141 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 4.89e-01 0.0441 0.0637 0.141 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0161 0.0794 0.141 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0528 0.113 0.141 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 9.69e-01 0.00409 0.104 0.14 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 7.21e-01 0.0401 0.112 0.14 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 8.96e-02 -0.214 0.125 0.14 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 1.43e-01 0.152 0.103 0.14 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0163 0.105 0.14 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0906 0.12 0.14 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 695315 sc-eQTL 1.14e-01 -0.168 0.106 0.14 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 797934 sc-eQTL 1.95e-01 -0.142 0.109 0.14 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0437 0.0608 0.141 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0146 0.0696 0.141 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 3.45e-02 -0.27 0.127 0.141 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0343 0.0883 0.141 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 9.41e-01 0.00487 0.0662 0.141 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0344 0.0891 0.141 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 5.31e-01 0.0546 0.0871 0.142 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -408048 sc-eQTL 7.53e-01 0.0257 0.0815 0.142 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 2.30e-01 -0.102 0.0848 0.142 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 2.77e-02 0.268 0.121 0.142 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 7.96e-01 0.0204 0.079 0.142 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 3.36e-01 0.0752 0.0781 0.142 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 7.05e-02 -0.202 0.111 0.142 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -410002 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0702 0.127 0.142 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0301 0.109 0.141 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -408048 sc-eQTL 9.55e-01 0.00572 0.101 0.141 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 5.22e-01 -0.061 0.0951 0.141 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 8.60e-03 -0.3 0.113 0.141 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 7.32e-01 0.0282 0.0822 0.141 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0256 0.0762 0.141 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00996 0.0902 0.141 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0623 0.126 0.145 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 1.52e-02 -0.256 0.104 0.145 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 7.37e-02 -0.222 0.123 0.145 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 5.29e-01 0.0698 0.111 0.145 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 9.60e-01 0.00693 0.138 0.145 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 458923 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0827 0.116 0.145 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 2.36e-01 -0.158 0.133 0.145 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 695315 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00176 0.121 0.145 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 162548 sc-eQTL 3.51e-01 0.121 0.129 0.145 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 797934 sc-eQTL 1.72e-01 0.147 0.107 0.145 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 4.74e-01 0.0731 0.102 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00916 0.101 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 1.86e-01 0.159 0.12 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 5.62e-01 0.0582 0.1 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 1.19e-01 0.159 0.101 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 458923 sc-eQTL 8.15e-01 0.0264 0.113 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 5.75e-01 0.0698 0.124 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 695315 sc-eQTL 6.16e-01 -0.042 0.0836 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 162548 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0792 0.123 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 797934 sc-eQTL 4.96e-04 -0.405 0.114 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0802 0.104 0.142 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 9.78e-01 0.00267 0.0977 0.142 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 9.02e-02 -0.216 0.127 0.142 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 9.32e-01 0.00781 0.0915 0.142 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 7.34e-01 0.0279 0.0819 0.142 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 458923 sc-eQTL 8.36e-01 0.0216 0.104 0.142 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0433 0.122 0.142 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 695315 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0354 0.101 0.142 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 162548 sc-eQTL 6.78e-01 0.0505 0.122 0.142 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 797934 sc-eQTL 5.39e-01 0.0703 0.114 0.142 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0982 0.0967 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 9.20e-02 -0.169 0.1 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 4.17e-01 0.102 0.126 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 7.75e-02 0.159 0.0898 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0206 0.0972 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 458923 sc-eQTL 5.27e-01 0.068 0.107 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0853 0.112 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 695315 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0643 0.0653 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 162548 sc-eQTL 1.46e-01 -0.173 0.118 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 797934 sc-eQTL 1.23e-01 -0.165 0.107 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 7.05e-01 0.0449 0.119 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 4.22e-01 -0.088 0.109 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 3.91e-01 0.106 0.123 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 5.91e-01 0.0549 0.102 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0256 0.0999 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 458923 sc-eQTL 6.52e-01 0.0391 0.0867 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 3.42e-01 -0.123 0.129 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 695315 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0763 0.062 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 162548 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0273 0.124 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 797934 sc-eQTL 2.84e-01 -0.124 0.116 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0824 0.12 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -408048 sc-eQTL 8.87e-01 0.0173 0.121 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 6.10e-01 -0.059 0.115 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0331 0.117 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 6.28e-01 0.0557 0.115 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 7.89e-01 0.0314 0.117 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 6.98e-01 0.0508 0.131 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0503 0.0737 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -408048 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00111 0.0697 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 2.18e-01 -0.0971 0.0785 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 8.27e-01 0.0263 0.12 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 2.31e-01 0.0846 0.0705 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 7.04e-01 0.0258 0.0679 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 2.48e-02 -0.254 0.113 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0746 0.101 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -408048 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0507 0.0785 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 7.64e-01 -0.028 0.0933 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 8.67e-01 0.0211 0.126 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0949 0.0787 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 1.67e-01 0.105 0.0756 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 9.16e-01 0.0122 0.116 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 6.94e-01 0.045 0.114 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -408048 sc-eQTL 5.71e-02 0.16 0.0837 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 6.24e-02 -0.188 0.1 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 8.94e-01 0.0166 0.125 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0774 0.0981 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0564 0.101 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 3.90e-02 -0.228 0.11 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 2.24e-01 0.125 0.103 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -408048 sc-eQTL 1.33e-02 0.246 0.0987 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 8.43e-01 0.0201 0.102 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 3.39e-01 -0.118 0.123 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 2.98e-01 0.0952 0.0912 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 6.73e-01 0.0448 0.106 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0545 0.122 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0947 0.0962 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -408048 sc-eQTL 2.53e-01 -0.109 0.0947 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0881 0.106 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0748 0.123 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 7.35e-01 0.0289 0.0851 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 8.17e-01 0.0215 0.0928 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0715 0.118 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0672 0.127 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -408048 sc-eQTL 6.32e-01 0.0525 0.109 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 5.53e-01 0.0731 0.123 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 3.58e-01 -0.119 0.13 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 7.28e-01 -0.036 0.103 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0627 0.123 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 4.95e-01 0.086 0.126 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 8.54e-01 0.0232 0.126 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -408048 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0893 0.116 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 6.78e-02 -0.224 0.122 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 8.65e-01 0.0221 0.13 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 1.52e-01 0.171 0.119 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 9.66e-01 0.00482 0.114 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 3.88e-01 -0.102 0.118 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00251 0.123 0.143 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -408048 sc-eQTL 7.94e-01 0.0293 0.112 0.143 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0404 0.103 0.143 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 2.45e-01 -0.153 0.131 0.143 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 7.61e-01 0.029 0.0954 0.143 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0577 0.117 0.143 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 6.18e-01 0.0596 0.119 0.143 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0187 0.119 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -408048 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0961 0.111 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 6.92e-02 -0.196 0.107 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 4.72e-02 0.26 0.13 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 6.73e-01 0.0494 0.117 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 1.30e-01 -0.188 0.124 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 7.44e-01 0.0405 0.124 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -410002 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0245 0.115 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 7.77e-01 0.0296 0.104 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -408048 sc-eQTL 8.92e-01 0.0126 0.0921 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 2.63e-01 -0.112 0.0998 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 8.22e-01 0.0294 0.13 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0424 0.0924 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 1.43e-02 0.216 0.0875 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 1.91e-01 -0.161 0.122 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -410002 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0272 0.126 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 1.19e-01 0.186 0.119 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -408048 sc-eQTL 7.62e-01 0.0358 0.118 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 2.35e-01 0.128 0.107 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 3.18e-01 -0.132 0.132 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 9.03e-01 0.0135 0.11 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0441 0.124 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 3.91e-01 -0.118 0.138 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -410002 sc-eQTL 5.00e-01 0.0753 0.112 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 7.33e-01 0.0367 0.107 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -408048 sc-eQTL 4.76e-01 0.0732 0.102 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 9.08e-01 -0.012 0.104 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 6.58e-02 0.213 0.115 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 8.08e-01 0.0222 0.0913 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0614 0.105 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 2.83e-01 -0.131 0.121 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -410002 sc-eQTL 9.02e-01 0.015 0.122 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 6.91e-01 0.0672 0.168 0.144 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 1.86e-01 -0.208 0.156 0.144 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 4.77e-02 0.286 0.143 0.144 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 8.58e-01 0.0243 0.136 0.144 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 6.15e-01 0.0603 0.119 0.144 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 458923 sc-eQTL 1.49e-01 -0.243 0.167 0.144 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0692 0.164 0.144 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 695315 sc-eQTL 7.45e-01 0.0423 0.13 0.144 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 162548 sc-eQTL 6.55e-03 -0.427 0.154 0.144 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 797934 sc-eQTL 4.71e-01 -0.115 0.159 0.144 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000904 0.123 0.141 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -408048 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00997 0.113 0.141 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 9.39e-01 0.00917 0.12 0.141 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 1.98e-01 -0.151 0.117 0.141 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00119 0.095 0.141 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0661 0.0874 0.141 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0165 0.105 0.141 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0564 0.108 0.141 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -408048 sc-eQTL 4.17e-01 0.0864 0.106 0.141 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0572 0.112 0.141 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0129 0.129 0.141 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 4.05e-01 0.0763 0.0916 0.141 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 2.50e-01 -0.114 0.0986 0.141 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00498 0.124 0.141 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0431 0.114 0.137 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0198 0.117 0.137 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0822 0.129 0.137 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 7.93e-01 0.0346 0.132 0.137 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0771 0.114 0.137 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 1.53e-01 -0.188 0.131 0.137 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 695315 sc-eQTL 3.90e-01 0.0688 0.0798 0.137 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 797934 sc-eQTL 3.82e-02 -0.243 0.116 0.137 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0151 0.0702 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 9.36e-01 0.00663 0.0826 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 1.30e-01 -0.186 0.122 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 8.63e-01 0.0156 0.0899 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0518 0.0704 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 7.48e-01 0.0314 0.0977 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 2.43e-01 -0.105 0.0896 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0333 0.0858 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 3.20e-02 -0.281 0.13 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 7.83e-01 0.0285 0.103 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 6.81e-02 0.164 0.0892 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0405 0.103 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 5.46e-01 0.0911 0.151 0.139 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -408048 sc-eQTL 3.75e-01 0.124 0.139 0.139 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 5.69e-01 0.0833 0.146 0.139 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 8.82e-01 0.0214 0.143 0.139 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 5.18e-01 0.0882 0.136 0.139 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0918 0.149 0.139 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 7.55e-01 0.0454 0.145 0.139 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 1.75e-01 0.15 0.11 0.14 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0775 0.108 0.14 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00596 0.124 0.14 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 2.84e-01 -0.121 0.113 0.14 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 2.10e-01 -0.135 0.107 0.14 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 4.46e-01 0.0883 0.116 0.14 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 5.22e-01 0.0622 0.097 0.138 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 2.93e-01 0.0851 0.0807 0.138 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 9.67e-01 -0.0053 0.126 0.138 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 9.62e-02 -0.184 0.11 0.138 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0414 0.108 0.138 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0731 0.112 0.138 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 5.32e-02 0.255 0.131 0.144 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0804 0.128 0.144 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 5.54e-02 -0.246 0.128 0.144 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 8.97e-02 0.188 0.11 0.144 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0544 0.132 0.144 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0645 0.136 0.144 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 695315 sc-eQTL 8.75e-02 -0.204 0.118 0.144 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 797934 sc-eQTL 7.55e-01 0.0303 0.0968 0.144 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0717 0.0857 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0601 0.0766 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0485 0.131 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 9.90e-01 -0.000934 0.0772 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 4.36e-01 0.0548 0.0703 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 458923 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0395 0.0907 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 6.46e-01 0.0528 0.115 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 695315 sc-eQTL 1.06e-01 -0.129 0.0793 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 162548 sc-eQTL 9.51e-01 0.00736 0.119 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 797934 sc-eQTL 2.43e-02 -0.271 0.119 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0385 0.0943 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 9.83e-02 -0.152 0.0915 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 2.99e-01 0.127 0.122 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 1.38e-01 0.132 0.0887 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0579 0.0914 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 458923 sc-eQTL 5.74e-01 0.0628 0.112 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0993 0.112 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 695315 sc-eQTL 2.18e-01 -0.0654 0.053 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 162548 sc-eQTL 2.77e-01 -0.126 0.115 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 797934 sc-eQTL 1.46e-01 -0.156 0.107 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0665 0.0647 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 9.34e-01 0.00641 0.0768 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 1.84e-02 -0.29 0.122 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 8.19e-01 0.0203 0.0887 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 5.80e-01 0.037 0.0668 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0153 0.0926 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 1.05e-01 0.142 0.087 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 9.14e-01 0.0079 0.0733 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 8.59e-01 0.0236 0.132 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 1.98e-01 -0.127 0.0986 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0463 0.0991 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 6.51e-01 0.0474 0.105 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 232435 sc-eQTL 3.91e-01 0.0773 0.0899 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -408048 sc-eQTL 8.02e-01 0.0209 0.083 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -986811 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0457 0.0907 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -515609 sc-eQTL 1.85e-01 0.17 0.128 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0135 0.0814 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -280181 sc-eQTL 1.33e-01 0.118 0.0783 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -305722 sc-eQTL 6.79e-02 -0.214 0.117 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -410002 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0637 0.129 0.142 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000173598 NUDT4 -216117 eQTL 0.0103 0.0674 0.0262 0.00451 0.0 0.153
ENSG00000257322 AC138123.1 -53913 eQTL 1.25e-05 0.155 0.0354 0.101 0.0707 0.153
ENSG00000277851 LINC02391 797934 eQTL 0.0136 -0.129 0.0522 0.0 0.0 0.153

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000257322 AC138123.1 -53913 1.29e-05 1.23e-05 6.36e-07 6.18e-06 1.8e-06 4.23e-06 1e-05 1.5e-06 7.68e-06 4.19e-06 1.05e-05 4.99e-06 1.27e-05 3.7e-06 1.81e-06 5.65e-06 4.36e-06 6.88e-06 2.19e-06 2e-06 3.43e-06 7.94e-06 6.93e-06 1.96e-06 1.6e-05 2.55e-06 4.47e-06 2.09e-06 7.09e-06 7.83e-06 4.51e-06 4.17e-07 5.47e-07 2.2e-06 4.59e-06 9.89e-07 9.63e-07 4.58e-07 9.82e-07 8.85e-07 3.05e-07 1.43e-05 1.47e-06 1.6e-07 7.81e-07 1.08e-06 1.13e-06 2.26e-07 3.41e-07
ENSG00000258303 \N -674401 2.95e-07 1.56e-07 4.91e-08 2.41e-07 9.25e-08 8.33e-08 1.73e-07 5.43e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.52e-07 8.68e-08 1.69e-07 7.37e-08 5.69e-08 7.36e-08 4.01e-08 1.27e-07 6.75e-08 4.3e-08 1.13e-07 1.24e-07 1.45e-07 3.03e-08 1.72e-07 1.14e-07 1.17e-07 9.61e-08 1.2e-07 1.07e-07 1.06e-07 3.06e-08 3.26e-08 8.44e-08 3.07e-08 3.94e-08 4.95e-08 9.61e-08 6.86e-08 6.19e-08 4.37e-08 1.59e-07 5.22e-08 1.43e-08 3.83e-08 1.84e-08 1.22e-07 3.99e-09 4.88e-08
ENSG00000277851 LINC02391 797934 2.74e-07 1.35e-07 3.71e-08 2.09e-07 9.01e-08 9.76e-08 1.53e-07 5.19e-08 1.41e-07 4.57e-08 1.62e-07 7.78e-08 1.45e-07 6.56e-08 6.12e-08 7.17e-08 3.98e-08 1.18e-07 5.82e-08 4e-08 1.05e-07 1.27e-07 1.34e-07 4.05e-08 1.46e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.32e-08 1.05e-07 1.1e-07 9.64e-08 3.89e-08 2.91e-08 8.65e-08 6.67e-08 3.97e-08 5.03e-08 9.49e-08 6.56e-08 3.75e-08 4.46e-08 1.46e-07 4.19e-08 1.27e-08 5.43e-08 1.83e-08 1.23e-07 4.2e-09 4.85e-08