Genes within 1Mb (chr12:93148382:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0498 0.0669 0.145 B L1
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 1.62e-01 0.14 0.1 0.145 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 3.91e-02 0.154 0.074 0.145 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 3.12e-01 0.0667 0.0658 0.145 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 445539 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0343 0.0744 0.145 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0869 0.103 0.145 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 681931 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0659 0.0506 0.145 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 149164 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0465 0.102 0.145 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 784550 sc-eQTL 5.20e-02 -0.195 0.0996 0.145 B L1
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 1.74e-01 -0.0948 0.0695 0.145 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -421432 sc-eQTL 6.35e-01 -0.032 0.0674 0.145 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 7.20e-01 0.0417 0.116 0.145 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 4.55e-01 0.0501 0.0669 0.145 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0273 0.0622 0.145 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 3.25e-02 -0.23 0.107 0.145 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 9.58e-01 0.00404 0.0771 0.145 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -421432 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0515 0.0885 0.145 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 3.45e-02 -0.226 0.106 0.145 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 2.50e-01 0.0731 0.0634 0.145 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00411 0.0792 0.145 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 2.30e-01 -0.135 0.112 0.145 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 7.69e-01 0.0314 0.107 0.142 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 5.68e-02 -0.247 0.129 0.142 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 3.40e-01 0.102 0.107 0.142 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0481 0.108 0.142 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 2.51e-01 -0.142 0.124 0.142 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 681931 sc-eQTL 1.78e-01 -0.148 0.109 0.142 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 784550 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0443 0.113 0.142 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0458 0.0611 0.145 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 2.55e-02 -0.286 0.127 0.145 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0403 0.0886 0.145 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0427 0.0665 0.145 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0965 0.0893 0.145 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 8.46e-01 0.0167 0.0861 0.146 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -421432 sc-eQTL 6.68e-01 0.0346 0.0805 0.146 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 5.04e-02 0.235 0.12 0.146 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 5.31e-01 0.049 0.078 0.146 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 1.24e-01 0.119 0.0769 0.146 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 3.39e-02 -0.233 0.109 0.146 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -423386 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0197 0.126 0.146 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 2.97e-01 -0.115 0.11 0.145 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -421432 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0134 0.102 0.145 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 1.03e-02 -0.295 0.114 0.145 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 3.63e-01 0.0753 0.0825 0.145 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0303 0.0766 0.145 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0157 0.0906 0.145 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0528 0.13 0.148 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 1.45e-01 -0.187 0.128 0.148 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 5.39e-01 0.0706 0.115 0.148 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0422 0.142 0.148 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 445539 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0517 0.12 0.148 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 1.61e-01 -0.194 0.137 0.148 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 681931 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0513 0.125 0.148 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 149164 sc-eQTL 3.80e-01 0.118 0.134 0.148 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 784550 sc-eQTL 1.92e-01 0.145 0.111 0.148 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 9.21e-01 0.0103 0.104 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 1.79e-01 0.165 0.122 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 2.79e-01 0.111 0.102 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 6.81e-02 0.189 0.103 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 445539 sc-eQTL 9.59e-01 0.00598 0.115 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 3.20e-01 0.126 0.126 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 681931 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0239 0.0851 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 149164 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0983 0.125 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 784550 sc-eQTL 6.49e-04 -0.404 0.117 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 2.58e-01 -0.119 0.105 0.147 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 9.28e-02 -0.217 0.128 0.147 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 8.90e-01 0.0129 0.0925 0.147 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 9.18e-01 0.00858 0.0828 0.147 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 445539 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0336 0.105 0.147 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0185 0.123 0.147 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 681931 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0347 0.102 0.147 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 149164 sc-eQTL 6.76e-01 0.0514 0.123 0.147 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 784550 sc-eQTL 6.21e-01 0.0571 0.115 0.147 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 3.45e-01 -0.092 0.0971 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 1.99e-01 0.163 0.126 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 2.38e-03 0.273 0.0889 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 8.74e-01 0.0155 0.0977 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 445539 sc-eQTL 7.30e-01 0.0373 0.108 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 3.40e-01 -0.108 0.113 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 681931 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0727 0.0655 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 149164 sc-eQTL 2.90e-01 -0.126 0.119 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 784550 sc-eQTL 1.24e-01 -0.166 0.107 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 6.39e-01 0.0561 0.119 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 1.77e-01 0.167 0.124 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 1.92e-01 0.134 0.102 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 9.69e-01 0.00392 0.1 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 445539 sc-eQTL 8.07e-01 0.0214 0.0872 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 7.99e-02 -0.228 0.129 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 681931 sc-eQTL 1.16e-01 -0.0982 0.0622 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 149164 sc-eQTL 8.51e-01 0.0234 0.125 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 784550 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0958 0.117 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0742 0.121 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -421432 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0357 0.122 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0595 0.118 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0235 0.116 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 6.86e-01 0.0479 0.118 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0641 0.132 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0659 0.0729 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -421432 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0557 0.0688 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 8.74e-01 0.0188 0.119 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 1.77e-01 0.0944 0.0697 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 8.63e-01 0.0116 0.0671 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 2.09e-02 -0.259 0.111 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0867 0.1 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -421432 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0584 0.078 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 2.86e-01 0.134 0.125 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0451 0.0785 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 6.19e-01 0.0376 0.0755 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0891 0.115 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00809 0.115 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -421432 sc-eQTL 1.12e-01 0.134 0.0841 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0248 0.125 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0698 0.0983 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0474 0.101 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 1.71e-01 -0.152 0.111 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 3.71e-01 0.0927 0.103 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -421432 sc-eQTL 1.34e-02 0.247 0.0992 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 2.85e-01 -0.133 0.124 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 1.18e-01 0.144 0.0914 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 6.70e-01 0.0455 0.107 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 3.28e-01 -0.12 0.122 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 1.45e-01 -0.14 0.0953 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -421432 sc-eQTL 8.31e-02 -0.163 0.0936 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 2.70e-01 -0.135 0.122 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 9.72e-01 0.003 0.0845 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 4.23e-01 0.0738 0.092 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 9.97e-02 -0.193 0.117 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 2.53e-01 -0.151 0.132 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -421432 sc-eQTL 6.86e-01 0.046 0.114 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0918 0.135 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 5.51e-01 0.064 0.107 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0367 0.128 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 9.79e-01 0.00352 0.131 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 7.77e-01 0.0356 0.125 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -421432 sc-eQTL 3.76e-01 -0.103 0.116 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 7.40e-01 0.0432 0.13 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 1.25e-01 0.183 0.119 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0478 0.114 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0985 0.118 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0131 0.123 0.147 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -421432 sc-eQTL 4.81e-01 0.0789 0.112 0.147 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 3.82e-01 -0.115 0.131 0.147 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 2.70e-01 0.105 0.0948 0.147 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 3.80e-01 -0.103 0.116 0.147 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 8.19e-01 0.0273 0.119 0.147 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0165 0.12 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -421432 sc-eQTL 2.37e-01 -0.133 0.112 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 5.61e-02 0.253 0.132 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 7.47e-01 0.0382 0.118 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 5.22e-02 -0.243 0.124 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00735 0.125 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -423386 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0769 0.116 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 5.76e-01 0.0579 0.103 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -421432 sc-eQTL 7.32e-01 0.0314 0.0915 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 5.73e-01 -0.073 0.13 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0524 0.0918 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 3.85e-04 0.309 0.0856 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 2.04e-01 -0.155 0.122 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -423386 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0192 0.126 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 1.87e-01 0.156 0.118 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -421432 sc-eQTL 6.82e-01 0.048 0.117 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0915 0.131 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 8.49e-01 0.0209 0.109 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 3.36e-01 -0.118 0.122 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 5.97e-02 -0.257 0.136 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -423386 sc-eQTL 2.41e-01 0.13 0.11 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 6.48e-01 -0.049 0.107 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -421432 sc-eQTL 1.74e-01 0.139 0.102 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 9.17e-03 0.3 0.114 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 4.43e-01 0.0699 0.0911 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 9.90e-01 0.00137 0.105 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 1.24e-01 -0.187 0.121 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -423386 sc-eQTL 4.86e-01 0.0847 0.121 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 7.07e-01 0.0594 0.158 0.152 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 2.27e-01 0.164 0.135 0.152 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0857 0.127 0.152 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 3.25e-01 0.11 0.111 0.152 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 445539 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0526 0.158 0.152 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 3.47e-01 -0.145 0.153 0.152 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 681931 sc-eQTL 5.92e-01 0.0653 0.122 0.152 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 149164 sc-eQTL 1.23e-02 -0.369 0.145 0.152 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 784550 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0203 0.149 0.152 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0161 0.124 0.146 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -421432 sc-eQTL 9.27e-01 0.0104 0.113 0.146 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 2.91e-01 -0.124 0.117 0.146 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0324 0.0955 0.146 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0911 0.0878 0.146 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 9.58e-01 0.00557 0.106 0.146 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0152 0.108 0.145 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -421432 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00513 0.106 0.145 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000293 0.129 0.145 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 6.33e-01 0.0437 0.0915 0.145 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 3.11e-01 -0.1 0.0986 0.145 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 8.35e-01 -0.026 0.124 0.145 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0481 0.119 0.137 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 4.56e-01 -0.101 0.135 0.137 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0861 0.137 0.137 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0807 0.119 0.137 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 6.33e-02 -0.254 0.136 0.137 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 681931 sc-eQTL 4.24e-01 0.0668 0.0833 0.137 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 784550 sc-eQTL 3.10e-01 -0.125 0.122 0.137 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 8.64e-01 0.0121 0.0704 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 1.63e-01 -0.172 0.123 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0127 0.0902 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0838 0.0704 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0146 0.098 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 1.45e-01 -0.131 0.0898 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 2.71e-02 -0.29 0.13 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 8.83e-01 0.0153 0.104 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 1.72e-01 0.123 0.0899 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 1.21e-01 -0.16 0.103 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 6.01e-01 0.0841 0.16 0.136 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -421432 sc-eQTL 7.22e-01 0.053 0.149 0.136 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0474 0.153 0.136 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 9.91e-01 0.0017 0.145 0.136 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0583 0.159 0.136 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 8.20e-01 0.0354 0.155 0.136 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 6.45e-01 0.0509 0.11 0.144 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0651 0.124 0.144 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 1.16e-01 -0.177 0.112 0.144 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 6.40e-02 -0.198 0.106 0.144 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 9.19e-01 0.0118 0.116 0.144 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 8.14e-01 0.0237 0.101 0.138 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 2.96e-01 -0.137 0.13 0.138 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 2.56e-01 -0.13 0.114 0.138 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 9.75e-02 -0.185 0.111 0.138 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0954 0.116 0.138 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 6.87e-02 0.245 0.134 0.147 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 7.76e-02 -0.232 0.131 0.147 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 1.57e-01 0.16 0.113 0.147 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0457 0.134 0.147 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 2.47e-01 -0.161 0.139 0.147 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 681931 sc-eQTL 1.78e-01 -0.164 0.121 0.147 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 784550 sc-eQTL 2.99e-01 0.103 0.0985 0.147 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 1.47e-01 -0.127 0.087 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0216 0.133 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 4.89e-01 0.0544 0.0786 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 4.34e-01 0.0561 0.0716 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 445539 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0681 0.0923 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 4.51e-01 0.0881 0.117 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 681931 sc-eQTL 1.77e-01 -0.11 0.0809 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 149164 sc-eQTL 9.34e-01 0.0102 0.122 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 784550 sc-eQTL 3.01e-02 -0.266 0.122 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0376 0.0945 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 7.54e-02 0.217 0.122 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 5.90e-03 0.244 0.0878 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0181 0.0917 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 445539 sc-eQTL 5.49e-01 0.0672 0.112 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 1.18e-01 -0.176 0.112 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 681931 sc-eQTL 1.27e-01 -0.0814 0.053 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 149164 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0647 0.116 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 784550 sc-eQTL 1.50e-01 -0.154 0.107 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0584 0.0649 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 1.99e-02 -0.288 0.123 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 9.43e-01 0.00632 0.089 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 8.99e-01 0.00854 0.067 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0938 0.0927 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 1.69e-01 0.121 0.0874 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 3.75e-01 -0.118 0.132 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 1.53e-01 -0.142 0.0988 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 1.47e-01 -0.144 0.0989 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 8.10e-01 0.0252 0.105 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 219051 sc-eQTL 6.96e-01 0.035 0.0893 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -421432 sc-eQTL 4.76e-01 0.0587 0.0823 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -528993 sc-eQTL 3.45e-01 0.12 0.127 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -229501 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00689 0.0808 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -293565 sc-eQTL 4.46e-02 0.156 0.0774 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 sc-eQTL 2.15e-02 -0.267 0.115 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -423386 sc-eQTL 9.77e-01 0.00366 0.128 0.147 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000198015 MRPL42 -319106 eQTL 4.27e-02 0.0553 0.0272 0.0 0.0 0.156
ENSG00000257322 AC138123.1 -67297 eQTL 0.000951 0.116 0.0349 0.0 0.0 0.156


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000257322 AC138123.1 -67297 6.69e-06 7.75e-06 7.72e-07 3.83e-06 1.83e-06 2.51e-06 9.07e-06 1.3e-06 4.96e-06 3.42e-06 8.76e-06 3.55e-06 1.07e-05 2.82e-06 1.4e-06 4.58e-06 3.62e-06 3.85e-06 1.94e-06 2.23e-06 3.12e-06 7.2e-06 5.54e-06 2.3e-06 9.55e-06 2.35e-06 3.35e-06 1.9e-06 6.89e-06 7.79e-06 3.67e-06 4.84e-07 6.66e-07 2.74e-06 2.36e-06 1.83e-06 1.27e-06 8.19e-07 1.36e-06 7.31e-07 8.54e-07 8.42e-06 9.07e-07 1.51e-07 6.83e-07 8.79e-07 1.07e-06 7.08e-07 6.22e-07