Genes within 1Mb (chr12:92586780:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 6.54e-02 0.198 0.107 0.051 B L1
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 2.68e-01 0.0955 0.086 0.051 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 8.89e-01 0.0167 0.12 0.051 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 5.35e-02 -0.204 0.105 0.051 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 -116063 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0415 0.119 0.051 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 1.93e-01 0.215 0.165 0.051 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 120329 sc-eQTL 4.38e-01 0.0632 0.0814 0.051 B L1
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 4.35e-02 0.236 0.116 0.051 B L1
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0731 0.111 0.051 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 -412438 sc-eQTL 3.29e-01 0.16 0.164 0.051 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 222948 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00843 0.161 0.051 B L1
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 2.63e-01 -0.126 0.112 0.051 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -983034 sc-eQTL 6.68e-01 0.0466 0.108 0.051 CD4T L1
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 7.34e-01 0.0371 0.109 0.051 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 9.48e-01 0.00702 0.108 0.051 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 8.16e-01 0.0232 0.0999 0.051 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 6.65e-01 0.0754 0.174 0.051 CD4T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00612 0.149 0.051 CD4T L1
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 2.78e-03 -0.413 0.136 0.051 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0404 0.126 0.051 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -983034 sc-eQTL 1.44e-01 0.211 0.144 0.051 CD8T L1
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0309 0.106 0.051 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 5.74e-01 0.0586 0.104 0.051 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 2.31e-01 0.155 0.129 0.051 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 3.79e-01 0.163 0.184 0.051 CD8T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 2.58e-01 0.156 0.138 0.051 CD8T L1
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 2.95e-01 -0.149 0.142 0.051 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0105 0.0987 0.051 Mono L1
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 1.47e-01 0.121 0.0831 0.051 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0143 0.143 0.051 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 9.57e-02 0.178 0.107 0.051 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 6.75e-01 0.0606 0.144 0.051 Mono L1
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 9.49e-01 0.00872 0.136 0.051 Mono L1
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0442 0.167 0.051 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0317 0.139 0.052 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -983034 sc-eQTL 3.24e-02 0.278 0.129 0.052 NK L1
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 7.37e-01 0.0331 0.0986 0.052 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 9.82e-01 0.00293 0.126 0.052 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 4.66e-01 0.0914 0.125 0.052 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 8.76e-01 0.0279 0.179 0.052 NK L1
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 1.02e-01 0.223 0.136 0.052 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -984988 sc-eQTL 6.91e-01 -0.081 0.204 0.052 NK L1
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 3.68e-01 -0.123 0.136 0.052 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 2.69e-01 0.193 0.174 0.051 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -983034 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00313 0.162 0.051 Other_T L1
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 4.89e-01 0.0555 0.0801 0.051 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 5.83e-01 0.0719 0.131 0.051 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0851 0.121 0.051 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 7.97e-01 0.037 0.144 0.051 Other_T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 9.25e-01 0.016 0.17 0.051 Other_T L1
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0963 0.159 0.051 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 7.80e-01 0.0453 0.162 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 2.70e-01 0.114 0.103 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 6.48e-01 0.0726 0.159 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 8.15e-02 -0.281 0.161 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 -116063 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0437 0.179 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 2.32e-01 0.236 0.197 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 120329 sc-eQTL 4.97e-01 0.0902 0.133 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 1.67e-02 0.346 0.144 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 1.57e-02 0.343 0.141 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 -412438 sc-eQTL 2.90e-01 0.206 0.194 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 222948 sc-eQTL 1.05e-01 -0.302 0.186 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0097 0.164 0.052 B_Memory L2
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 2.72e-01 0.104 0.0945 0.052 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 9.94e-01 0.00107 0.145 0.052 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 3.62e-01 -0.118 0.129 0.052 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 -116063 sc-eQTL 4.50e-01 -0.125 0.165 0.052 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00387 0.192 0.052 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 120329 sc-eQTL 8.33e-02 -0.277 0.159 0.052 B_Memory L2
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 5.92e-01 0.0902 0.168 0.052 B_Memory L2
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 9.19e-01 0.0154 0.151 0.052 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 -412438 sc-eQTL 5.20e-02 0.372 0.191 0.052 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 222948 sc-eQTL 1.56e-01 0.256 0.18 0.052 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000755 0.154 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 5.31e-02 0.186 0.0957 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0608 0.144 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 5.23e-02 -0.299 0.153 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -116063 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0517 0.17 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 8.14e-01 0.0419 0.178 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 120329 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0456 0.104 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 7.60e-02 0.247 0.139 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 2.16e-01 -0.171 0.138 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -412438 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0449 0.189 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 222948 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0922 0.17 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 5.31e-01 0.118 0.188 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 6.63e-01 0.0413 0.0948 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 6.37e-02 -0.3 0.161 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 1.15e-01 -0.25 0.158 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -116063 sc-eQTL 4.25e-01 -0.11 0.138 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 1.17e-02 0.515 0.203 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 120329 sc-eQTL 6.14e-01 -0.05 0.0988 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0799 0.156 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 1.13e-01 -0.236 0.148 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -412438 sc-eQTL 1.11e-01 -0.314 0.196 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 222948 sc-eQTL 1.00e+00 -4.5e-05 0.185 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 3.74e-01 -0.105 0.118 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -983034 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00593 0.112 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 4.28e-01 0.088 0.111 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0306 0.114 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0381 0.109 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 8.24e-01 0.0408 0.183 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 7.29e-01 0.0522 0.15 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 2.47e-02 -0.323 0.143 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 3.59e-01 -0.15 0.163 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -983034 sc-eQTL 5.36e-01 0.0788 0.127 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 3.83e-01 0.0914 0.105 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 4.42e-01 0.0984 0.128 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 7.97e-01 0.0317 0.123 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 4.19e-01 0.152 0.187 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 9.54e-01 0.00901 0.157 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 5.07e-02 -0.264 0.134 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 5.29e-01 -0.117 0.185 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -983034 sc-eQTL 4.99e-01 0.0927 0.137 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 9.10e-01 0.0145 0.128 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 7.59e-01 0.0489 0.159 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 5.37e-01 -0.101 0.164 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 6.66e-01 0.0778 0.18 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00454 0.188 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 1.19e-01 -0.281 0.18 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 7.64e-02 -0.295 0.166 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -983034 sc-eQTL 1.74e-01 0.22 0.161 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 8.64e-01 0.0182 0.106 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 4.02e-01 0.124 0.148 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 4.52e-01 0.129 0.172 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 2.71e-01 0.217 0.197 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 3.45e-03 0.505 0.171 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 2.58e-02 -0.349 0.155 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 3.34e-01 -0.15 0.155 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -983034 sc-eQTL 6.96e-01 -0.06 0.153 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0735 0.135 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 6.26e-01 0.0671 0.137 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 8.82e-01 0.0222 0.15 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 3.31e-01 0.186 0.191 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 6.55e-01 0.0748 0.167 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 2.68e-01 -0.188 0.169 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 9.52e-02 0.329 0.196 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -983034 sc-eQTL 4.81e-01 0.12 0.17 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 8.66e-02 0.238 0.138 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 1.02e-01 -0.261 0.159 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 3.87e-01 0.165 0.19 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 7.52e-01 0.0618 0.195 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 5.52e-01 -0.114 0.192 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 3.09e-01 -0.195 0.191 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 4.48e-01 0.155 0.204 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -983034 sc-eQTL 4.93e-01 -0.13 0.189 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0924 0.141 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 6.51e-01 0.0882 0.195 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 1.16e-01 0.291 0.185 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 7.66e-01 0.0574 0.193 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 2.66e-02 -0.46 0.206 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0151 0.193 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 6.05e-01 0.102 0.196 0.052 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -983034 sc-eQTL 1.50e-01 0.257 0.178 0.052 MAIT L2
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 1.12e-01 0.194 0.122 0.052 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 8.24e-01 0.0338 0.152 0.052 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 4.42e-01 0.143 0.186 0.052 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 6.76e-01 0.0794 0.19 0.052 MAIT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 6.14e-01 0.0934 0.185 0.052 MAIT L2
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 8.10e-01 -0.043 0.179 0.052 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 1.49e-01 0.272 0.188 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -983034 sc-eQTL 3.40e-03 0.511 0.172 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0155 0.129 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 3.62e-01 -0.169 0.185 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 5.78e-02 0.373 0.195 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 3.46e-01 -0.185 0.196 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 1.07e-01 0.294 0.182 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -984988 sc-eQTL 9.05e-02 0.309 0.182 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 1.38e-01 0.279 0.187 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0432 0.164 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -983034 sc-eQTL 5.47e-02 0.278 0.144 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000729 0.0994 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 9.12e-01 -0.016 0.146 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 8.11e-01 0.0336 0.14 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 3.80e-01 0.17 0.193 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 9.27e-01 0.0153 0.167 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -984988 sc-eQTL 6.50e-01 0.0906 0.199 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 2.26e-01 -0.188 0.155 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 8.17e-01 0.043 0.185 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -983034 sc-eQTL 9.73e-01 0.00623 0.183 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 9.38e-01 0.0099 0.127 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0868 0.171 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 1.97e-01 -0.247 0.191 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 5.15e-01 0.139 0.214 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 1.05e-01 0.316 0.194 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -984988 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0609 0.173 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 1.05e-01 -0.279 0.171 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0815 0.168 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -983034 sc-eQTL 4.66e-02 0.317 0.159 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 9.19e-01 0.0105 0.102 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 6.89e-01 0.057 0.142 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 4.23e-01 0.131 0.164 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 6.00e-01 0.0996 0.19 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 1.32e-01 0.229 0.152 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -984988 sc-eQTL 1.11e-01 -0.302 0.189 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 5.14e-02 -0.3 0.153 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0224 0.192 0.052 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -983034 sc-eQTL 1.86e-01 -0.233 0.176 0.052 Pro_T L2
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 9.91e-01 0.000856 0.0786 0.052 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0333 0.149 0.052 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 4.63e-01 -0.101 0.137 0.052 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 5.15e-01 -0.107 0.164 0.052 Pro_T L2
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 8.11e-01 0.0421 0.176 0.052 Pro_T L2
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 9.63e-01 0.00757 0.163 0.052 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0656 0.171 0.051 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -983034 sc-eQTL 6.12e-01 0.0855 0.168 0.051 Treg L2
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 2.92e-01 0.148 0.14 0.051 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 1.52e-01 -0.208 0.145 0.051 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 9.51e-02 0.261 0.156 0.051 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 1.71e-02 0.468 0.195 0.051 Treg L2
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 3.23e-01 0.174 0.176 0.051 Treg L2
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 4.26e-03 -0.55 0.19 0.051 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 3.06e-01 0.183 0.179 0.054 cDC L2
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 1.54e-01 0.226 0.158 0.054 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 1.24e-01 0.317 0.206 0.054 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 8.19e-01 0.0413 0.18 0.054 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 6.51e-01 0.0933 0.206 0.054 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 120329 sc-eQTL 5.11e-01 0.0827 0.126 0.054 cDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 4.19e-01 -0.165 0.204 0.054 cDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 9.88e-02 0.314 0.189 0.054 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 222948 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0035 0.185 0.054 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0191 0.112 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 1.15e-01 0.147 0.0925 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0392 0.144 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 5.64e-01 0.0649 0.112 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 2.94e-01 0.164 0.156 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0684 0.146 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 8.76e-01 0.028 0.179 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0395 0.144 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 1.61e-01 0.15 0.107 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 9.32e-01 0.0142 0.166 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 1.30e-01 0.218 0.143 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 4.64e-01 -0.121 0.165 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0675 0.155 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 8.30e-01 0.0402 0.187 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 2.72e-01 0.256 0.232 0.055 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -983034 sc-eQTL 3.60e-01 -0.198 0.215 0.055 gdT L2
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0162 0.124 0.055 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 3.09e-01 0.214 0.21 0.055 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0238 0.231 0.055 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 1.57e-01 0.318 0.223 0.055 gdT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 2.88e-01 -0.213 0.2 0.055 gdT L2
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 9.39e-01 0.0162 0.211 0.055 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 3.61e-02 -0.359 0.17 0.053 intMono L2
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 5.29e-01 0.0683 0.108 0.053 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 3.31e-01 -0.17 0.175 0.053 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 8.74e-01 0.0264 0.167 0.053 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 9.91e-01 0.00205 0.18 0.053 intMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 1.46e-01 0.249 0.171 0.053 intMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 7.22e-01 0.0635 0.178 0.053 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0372 0.208 0.056 pDC L2
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 4.18e-01 0.166 0.204 0.056 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 1.87e-01 0.231 0.174 0.056 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 5.07e-01 0.138 0.207 0.056 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 4.23e-02 0.434 0.212 0.056 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 120329 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0768 0.188 0.056 pDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 8.33e-01 0.0403 0.191 0.056 pDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 5.37e-01 -0.111 0.179 0.056 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 222948 sc-eQTL 8.43e-01 0.0302 0.153 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 6.44e-01 0.0632 0.137 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 1.22e-01 0.14 0.09 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 6.18e-01 0.0614 0.123 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 2.77e-01 -0.122 0.112 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -116063 sc-eQTL 4.41e-01 -0.111 0.144 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 4.06e-01 0.152 0.182 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 120329 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0321 0.127 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 2.10e-02 0.303 0.13 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 4.69e-02 0.25 0.125 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -412438 sc-eQTL 6.89e-03 0.51 0.187 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 222948 sc-eQTL 5.18e-01 -0.124 0.192 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 9.05e-01 0.0181 0.152 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 9.43e-02 0.145 0.086 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 2.01e-01 -0.183 0.143 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 1.22e-02 -0.366 0.145 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -116063 sc-eQTL 5.16e-01 -0.117 0.179 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 1.07e-01 0.291 0.18 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 120329 sc-eQTL 6.27e-01 0.0416 0.0855 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 4.16e-02 0.265 0.129 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 1.40e-01 -0.187 0.126 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -412438 sc-eQTL 4.10e-01 -0.153 0.186 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 222948 sc-eQTL 5.10e-01 -0.114 0.172 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 9.43e-01 0.00748 0.104 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 9.46e-02 0.148 0.0884 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0188 0.143 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 1.57e-01 0.152 0.107 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 6.14e-01 0.0753 0.149 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0515 0.141 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 7.52e-01 0.0553 0.175 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0901 0.146 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 9.93e-01 0.000825 0.0938 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 8.99e-01 0.0211 0.165 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 1.73e-01 0.226 0.165 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 7.06e-01 0.0659 0.175 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 2.75e-01 0.178 0.162 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 4.46e-01 -0.147 0.193 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -342551 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0549 0.143 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -983034 sc-eQTL 5.49e-02 0.252 0.131 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 440934 sc-eQTL 9.12e-01 0.0104 0.0938 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -791103 sc-eQTL 6.04e-01 0.0671 0.129 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -855167 sc-eQTL 7.31e-01 0.0431 0.125 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -880708 sc-eQTL 5.47e-01 0.113 0.187 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 441207 sc-eQTL 1.97e-01 0.18 0.139 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -984988 sc-eQTL 5.34e-01 -0.128 0.205 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 443866 sc-eQTL 8.10e-02 -0.239 0.136 0.052 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000205056 LINC02397 120329 eQTL 0.0198 -0.109 0.0469 0.0 0.0 0.0422
ENSG00000257242 LINC01619 443866 eQTL 0.00229 -0.121 0.0395 0.0021 0.00258 0.0422


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina