logo

Genes within 1Mb (chr12:92543588:G:GTT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 8.48e-01 0.0141 0.0734 0.122 B L1
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0514 0.0588 0.122 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 3.13e-01 0.0827 0.0818 0.122 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 2.15e-01 0.0895 0.072 0.122 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 -159255 sc-eQTL 1.40e-01 -0.12 0.0812 0.122 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 7.10e-01 0.0419 0.113 0.122 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 77137 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0437 0.0556 0.122 B L1
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0768 0.0798 0.122 B L1
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0149 0.0756 0.122 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 -455630 sc-eQTL 2.81e-01 -0.121 0.112 0.122 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 179756 sc-eQTL 3.54e-01 0.102 0.11 0.122 B L1
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0431 0.0742 0.122 CD4T L1
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 5.19e-01 0.0467 0.0722 0.122 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0529 0.0712 0.122 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0845 0.0659 0.122 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0968 0.115 0.122 CD4T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 3.79e-01 0.0869 0.0986 0.122 CD4T L1
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 6.73e-01 -0.039 0.0922 0.122 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00581 0.0838 0.122 CD8T L1
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 1.66e-01 0.0975 0.0701 0.122 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0264 0.0691 0.122 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 2.05e-01 -0.109 0.0857 0.122 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0628 0.123 0.122 CD8T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 3.63e-01 0.0834 0.0915 0.122 CD8T L1
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0398 0.0946 0.122 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 1.43e-02 -0.271 0.11 0.122 DC L1
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 2.11e-01 0.15 0.119 0.122 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 5.63e-01 0.0645 0.111 0.122 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 8.95e-01 0.0149 0.113 0.122 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 6.27e-01 0.0629 0.129 0.122 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 77137 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0834 0.114 0.122 DC L1
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00938 0.13 0.122 DC L1
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0543 0.124 0.122 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 179756 sc-eQTL 1.12e-01 -0.186 0.117 0.122 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 1.77e-01 0.0894 0.0659 0.122 Mono L1
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 4.84e-02 -0.11 0.0555 0.122 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 2.31e-01 0.115 0.0956 0.122 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 2.97e-01 -0.075 0.0718 0.122 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0247 0.0969 0.122 Mono L1
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 7.84e-01 -0.025 0.0912 0.122 Mono L1
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 1.45e-01 0.163 0.112 0.122 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 1.62e-01 -0.13 0.0926 0.122 NK L1
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 8.90e-01 -0.00909 0.0658 0.122 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 3.37e-01 -0.081 0.0842 0.122 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0425 0.0834 0.122 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 3.20e-01 -0.119 0.119 0.122 NK L1
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 6.91e-01 0.0364 0.0913 0.122 NK L1
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 2.64e-01 0.101 0.0906 0.122 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 7.19e-01 0.0432 0.12 0.122 Other_T L1
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 6.30e-01 0.0267 0.0552 0.122 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 6.57e-01 0.0401 0.0901 0.122 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 2.65e-01 0.0931 0.0834 0.122 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 7.61e-01 0.0302 0.0989 0.122 Other_T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 8.94e-01 0.0156 0.117 0.122 Other_T L1
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 5.75e-01 0.0617 0.11 0.122 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 1.66e-01 0.191 0.137 0.128 B_Activated L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 2.03e-01 -0.0918 0.0718 0.128 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 5.32e-02 0.234 0.12 0.128 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0256 0.151 0.128 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 -159255 sc-eQTL 1.00e-01 0.209 0.126 0.128 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 6.69e-01 0.0625 0.146 0.128 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 77137 sc-eQTL 9.77e-01 0.00375 0.133 0.128 B_Activated L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 3.46e-02 -0.296 0.139 0.128 B_Activated L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0451 0.109 0.128 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 -455630 sc-eQTL 7.62e-01 0.043 0.142 0.128 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 179756 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0776 0.117 0.128 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 8.95e-02 -0.194 0.114 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0226 0.0732 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 9.18e-01 0.0116 0.112 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 2.15e-01 0.142 0.114 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 -159255 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0456 0.127 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 2.23e-01 0.17 0.139 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 77137 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0908 0.0935 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0847 0.103 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 2.23e-01 -0.123 0.1 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 -455630 sc-eQTL 2.78e-01 -0.149 0.137 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 179756 sc-eQTL 2.01e-01 -0.169 0.131 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 4.23e-01 -0.094 0.117 0.116 B_Memory L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 9.15e-01 0.00726 0.0676 0.116 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0581 0.103 0.116 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 1.76e-01 0.125 0.0921 0.116 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 -159255 sc-eQTL 6.17e-01 -0.059 0.118 0.116 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 2.60e-01 0.155 0.137 0.116 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 77137 sc-eQTL 3.96e-01 -0.097 0.114 0.116 B_Memory L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0303 0.12 0.116 B_Memory L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0619 0.108 0.116 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 -455630 sc-eQTL 2.28e-01 -0.165 0.137 0.116 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 179756 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0931 0.129 0.116 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0176 0.108 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0609 0.0676 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 2.60e-01 0.113 0.1 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 5.16e-01 0.0703 0.108 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -159255 sc-eQTL 1.67e-03 -0.372 0.117 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 7.09e-01 0.0466 0.125 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 77137 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0835 0.0726 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0712 0.0977 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 6.60e-01 0.0428 0.097 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -455630 sc-eQTL 7.96e-02 -0.232 0.131 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 179756 sc-eQTL 4.73e-01 0.0857 0.119 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 2.03e-01 0.169 0.132 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0324 0.0667 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 3.39e-02 0.241 0.113 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 6.73e-01 0.0471 0.112 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -159255 sc-eQTL 8.54e-01 0.0179 0.097 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 3.87e-01 0.125 0.145 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 77137 sc-eQTL 9.09e-02 -0.117 0.0691 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 9.65e-01 0.00489 0.11 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00194 0.105 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -455630 sc-eQTL 8.90e-01 0.0193 0.139 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 179756 sc-eQTL 5.42e-01 0.0794 0.13 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 5.04e-01 -0.087 0.13 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 8.79e-01 0.013 0.0856 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 6.52e-01 -0.056 0.124 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 6.18e-01 0.0633 0.127 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 1.16e-01 -0.222 0.141 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 5.38e-01 0.0827 0.134 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 4.25e-01 0.0968 0.121 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00902 0.0788 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 9.39e-01 0.00561 0.0738 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0651 0.0754 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0936 0.0722 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0355 0.122 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 6.74e-01 0.042 0.0999 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 1.31e-01 -0.145 0.0955 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0476 0.109 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 6.85e-01 0.0283 0.0698 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0133 0.0852 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0638 0.0818 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 1.51e-01 -0.179 0.124 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 3.54e-01 0.097 0.105 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 4.24e-01 0.0722 0.0901 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0759 0.126 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0104 0.0873 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 9.09e-01 0.0124 0.108 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0607 0.111 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 1.99e-01 -0.157 0.122 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000535 0.128 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0129 0.123 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 7.23e-01 0.0401 0.113 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 1.00e-01 0.118 0.0712 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 5.01e-01 0.0674 0.0999 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0448 0.116 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 2.41e-01 -0.156 0.133 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 9.11e-01 0.0132 0.118 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 4.42e-01 0.0817 0.106 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0561 0.104 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 1.53e-01 0.129 0.0899 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00219 0.0921 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 7.39e-01 0.0335 0.1 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 2.47e-01 0.148 0.128 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 7.04e-03 0.3 0.11 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 8.41e-01 0.0229 0.114 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 3.07e-01 -0.141 0.138 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 1.31e-01 -0.147 0.0967 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00964 0.112 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 4.22e-01 0.107 0.133 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0326 0.137 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 3.89e-01 -0.116 0.134 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 6.98e-01 0.052 0.134 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0611 0.138 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 3.59e-02 0.2 0.0944 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 8.38e-01 0.027 0.132 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 2.22e-01 -0.154 0.126 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 5.11e-01 0.086 0.131 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0711 0.141 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 6.43e-01 0.0607 0.131 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0526 0.13 0.123 MAIT L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 7.82e-01 0.0224 0.081 0.123 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 3.33e-01 0.0971 0.1 0.123 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 6.19e-01 0.0612 0.123 0.123 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 9.96e-02 0.206 0.125 0.123 MAIT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 2.81e-01 0.132 0.122 0.123 MAIT L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 7.54e-01 0.037 0.118 0.123 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 8.45e-02 -0.216 0.125 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 6.19e-01 0.0428 0.0861 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0908 0.124 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 7.40e-01 0.0436 0.131 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00587 0.131 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0989 0.122 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 4.63e-01 0.0922 0.125 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 6.64e-01 -0.048 0.11 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0185 0.0668 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 3.67e-01 0.0884 0.0977 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 3.48e-01 0.0883 0.0939 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 1.37e-01 -0.193 0.13 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 2.73e-01 0.123 0.112 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 9.78e-02 0.173 0.104 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0644 0.13 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0105 0.0888 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 2.03e-01 -0.152 0.119 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0375 0.134 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00444 0.15 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 3.14e-01 -0.138 0.136 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 3.12e-01 0.122 0.12 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0551 0.116 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 3.04e-01 0.0725 0.0704 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 1.05e-01 -0.159 0.0977 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0786 0.113 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00823 0.131 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 2.62e-02 0.233 0.104 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 9.75e-01 0.00333 0.107 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 8.17e-01 0.0385 0.166 0.115 PB L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 2.25e-01 0.0993 0.0814 0.115 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0824 0.133 0.115 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0541 0.117 0.115 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 -159255 sc-eQTL 5.08e-01 0.11 0.165 0.115 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 4.90e-01 -0.111 0.161 0.115 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 77137 sc-eQTL 3.76e-01 0.113 0.127 0.115 PB L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 2.57e-01 0.161 0.141 0.115 PB L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 1.71e-02 -0.365 0.151 0.115 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 -455630 sc-eQTL 2.05e-02 -0.359 0.153 0.115 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 179756 sc-eQTL 3.99e-01 -0.132 0.156 0.115 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 6.45e-01 0.0634 0.137 0.124 Pro_T L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00067 0.0562 0.124 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 5.15e-01 0.0692 0.106 0.124 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 8.59e-01 0.0174 0.0979 0.124 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 9.31e-01 0.0102 0.118 0.124 Pro_T L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 3.21e-01 -0.125 0.126 0.124 Pro_T L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0773 0.117 0.124 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0809 0.118 0.122 Treg L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 1.30e-01 0.147 0.0965 0.122 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 8.83e-01 0.0148 0.1 0.122 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 9.57e-02 0.18 0.108 0.122 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 2.45e-01 0.158 0.136 0.122 Treg L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 8.57e-01 0.0219 0.122 0.122 Treg L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 7.21e-01 0.0479 0.134 0.122 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 9.39e-02 -0.201 0.12 0.124 cDC L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 2.96e-01 0.112 0.107 0.124 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0987 0.139 0.124 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0628 0.121 0.124 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 6.64e-01 0.0604 0.139 0.124 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 77137 sc-eQTL 1.54e-01 -0.12 0.0841 0.124 cDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 7.81e-01 0.0382 0.138 0.124 cDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 5.85e-01 -0.07 0.128 0.124 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 179756 sc-eQTL 1.31e-01 -0.187 0.123 0.124 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 6.07e-01 0.0394 0.0765 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 7.53e-02 -0.113 0.0631 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0187 0.098 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 9.79e-01 0.00201 0.0768 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 3.35e-01 -0.103 0.106 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0396 0.0998 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 2.69e-01 0.135 0.122 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 8.53e-01 0.0184 0.099 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0582 0.0736 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 1.17e-01 0.178 0.113 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 3.02e-01 -0.102 0.0988 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0476 0.114 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0788 0.106 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 1.95e-01 0.166 0.128 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 1.99e-01 0.22 0.17 0.121 gdT L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000966 0.0913 0.121 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 9.27e-01 0.0142 0.155 0.121 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 2.71e-01 0.186 0.169 0.121 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 9.10e-01 0.0188 0.165 0.121 gdT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 4.23e-01 0.118 0.147 0.121 gdT L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 1.63e-01 0.216 0.154 0.121 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0163 0.12 0.124 intMono L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 1.40e-02 -0.185 0.0748 0.124 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 1.26e-01 0.188 0.122 0.124 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 6.94e-02 -0.212 0.116 0.124 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0529 0.126 0.124 intMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 2.37e-01 -0.142 0.12 0.124 intMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 9.68e-01 0.00503 0.125 0.124 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 2.02e-02 0.237 0.101 0.124 ncMono L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0398 0.0711 0.124 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 4.14e-01 0.0958 0.117 0.124 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 9.20e-01 0.0115 0.114 0.124 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 2.11e-01 0.148 0.118 0.124 ncMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 3.37e-01 0.109 0.113 0.124 ncMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 2.13e-01 0.148 0.119 0.124 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 7.69e-02 -0.26 0.146 0.121 pDC L2
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 2.75e-01 -0.158 0.144 0.121 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 1.71e-01 0.17 0.123 0.121 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 4.29e-01 0.116 0.147 0.121 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0286 0.152 0.121 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 77137 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0517 0.133 0.121 pDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 9.95e-01 0.000852 0.136 0.121 pDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 1.32e-01 0.19 0.126 0.121 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 179756 sc-eQTL 2.55e-01 -0.123 0.108 0.121 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0714 0.0944 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 4.15e-01 -0.051 0.0625 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 5.70e-01 0.0484 0.0849 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 2.58e-01 0.0877 0.0772 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -159255 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0454 0.0998 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 1.88e-01 0.166 0.126 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 77137 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0979 0.0875 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0483 0.0911 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0462 0.0873 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -455630 sc-eQTL 6.32e-02 -0.244 0.13 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 179756 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0573 0.133 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 4.62e-01 0.0772 0.105 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0555 0.0598 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 5.26e-02 0.192 0.0983 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 6.30e-01 0.049 0.102 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -159255 sc-eQTL 6.15e-03 -0.338 0.122 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 5.16e-01 0.0814 0.125 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 77137 sc-eQTL 9.43e-02 -0.0988 0.0588 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0235 0.0904 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0189 0.0879 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -455630 sc-eQTL 2.63e-01 -0.144 0.128 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 179756 sc-eQTL 4.87e-01 0.0829 0.119 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 6.53e-01 0.0319 0.0709 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 1.92e-01 -0.079 0.0603 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 5.49e-01 0.0583 0.097 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0215 0.0731 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 3.18e-01 -0.101 0.101 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0192 0.0957 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 1.07e-01 0.192 0.118 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 2.42e-01 0.111 0.0947 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 3.76e-02 -0.126 0.0603 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 6.18e-02 0.2 0.107 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 3.02e-01 -0.111 0.107 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 1.56e-01 0.161 0.113 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0583 0.106 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 6.53e-01 0.0563 0.125 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -385743 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0741 0.0951 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 397742 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0184 0.0624 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -834295 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0704 0.086 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -898359 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0299 0.0833 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -923900 sc-eQTL 2.67e-01 -0.138 0.124 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 398015 sc-eQTL 3.29e-01 0.0907 0.0927 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 400674 sc-eQTL 4.85e-01 0.0639 0.0913 0.123 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000205056 LINC02397 77137 eQTL 0.000345 0.0909 0.0253 0.0 0.0 0.121

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000102189 \N -385743 1.26e-06 8.36e-07 1.24e-07 3.25e-07 9.72e-08 6.02e-07 1.55e-06 7.65e-08 1.13e-06 2.85e-07 1.07e-06 5.73e-07 2.64e-06 2.29e-07 4.36e-07 9.33e-07 4.3e-07 5.45e-07 3.01e-07 1.65e-07 5.66e-07 1.01e-06 7.79e-07 4.25e-08 1.86e-06 2.47e-07 8.29e-07 3.95e-07 1.24e-06 1.06e-06 6.9e-07 4.94e-08 4.86e-08 2.46e-07 3.63e-07 7.86e-08 1.08e-07 1.02e-07 8.72e-08 1.61e-08 8.61e-08 1.52e-06 5.29e-08 1.86e-08 5.49e-08 3.25e-07 7.89e-08 0.0 4.85e-08