Genes within 1Mb (chr12:92537693:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 6.40e-01 0.0344 0.0735 0.122 B L1
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0279 0.0589 0.122 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 2.38e-01 0.0966 0.0817 0.122 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 1.22e-01 0.112 0.0719 0.122 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 -165150 sc-eQTL 2.15e-01 -0.101 0.0813 0.122 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 5.81e-01 0.0624 0.113 0.122 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 71242 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0466 0.0556 0.122 B L1
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0647 0.0799 0.122 B L1
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0272 0.0756 0.122 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 -461525 sc-eQTL 3.09e-01 -0.114 0.112 0.122 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 173861 sc-eQTL 2.45e-01 0.128 0.11 0.122 B L1
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0267 0.0744 0.122 CD4T L1
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 3.85e-01 0.0629 0.0723 0.122 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0367 0.0714 0.122 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0865 0.0661 0.122 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0746 0.115 0.122 CD4T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 4.12e-01 0.0813 0.0989 0.122 CD4T L1
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0324 0.0924 0.122 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0111 0.0839 0.122 CD8T L1
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 1.29e-01 0.107 0.0701 0.122 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0276 0.0692 0.122 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 1.98e-01 -0.111 0.0858 0.122 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0564 0.123 0.122 CD8T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 4.97e-01 0.0624 0.0917 0.122 CD8T L1
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0472 0.0947 0.122 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 1.24e-02 -0.277 0.11 0.122 DC L1
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 2.16e-01 0.148 0.12 0.122 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 6.26e-01 0.0545 0.112 0.122 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00528 0.113 0.122 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 8.02e-01 0.0325 0.13 0.122 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 71242 sc-eQTL 3.08e-01 -0.117 0.114 0.122 DC L1
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 9.81e-01 0.00307 0.13 0.122 DC L1
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0454 0.125 0.122 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 173861 sc-eQTL 1.19e-01 -0.184 0.117 0.122 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 1.82e-01 0.0882 0.0659 0.122 Mono L1
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 8.34e-02 -0.0967 0.0556 0.122 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 2.36e-01 0.114 0.0955 0.122 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0807 0.0717 0.122 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0377 0.0968 0.122 Mono L1
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0336 0.0911 0.122 Mono L1
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 1.67e-01 0.154 0.112 0.122 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 9.28e-02 -0.157 0.0927 0.122 NK L1
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 8.50e-01 0.0125 0.066 0.122 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0711 0.0845 0.122 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0364 0.0837 0.122 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 2.45e-01 -0.139 0.119 0.122 NK L1
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 5.15e-01 0.0596 0.0915 0.122 NK L1
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 3.13e-01 0.092 0.0909 0.122 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 9.88e-01 0.00183 0.12 0.122 Other_T L1
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 7.07e-01 0.0208 0.0554 0.122 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 4.92e-01 0.0622 0.0903 0.122 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 2.55e-01 0.0954 0.0836 0.122 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 8.57e-01 0.0179 0.0992 0.122 Other_T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00442 0.117 0.122 Other_T L1
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 3.04e-01 0.113 0.11 0.122 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 1.52e-01 0.199 0.138 0.128 B_Activated L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0683 0.0725 0.128 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 3.65e-02 0.254 0.121 0.128 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 9.26e-01 0.0141 0.152 0.128 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 -165150 sc-eQTL 1.19e-01 0.199 0.127 0.128 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 5.32e-01 0.092 0.147 0.128 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 71242 sc-eQTL 9.64e-01 0.0061 0.133 0.128 B_Activated L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 4.30e-02 -0.285 0.14 0.128 B_Activated L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0265 0.11 0.128 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 -461525 sc-eQTL 9.14e-01 0.0155 0.143 0.128 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 173861 sc-eQTL 2.46e-01 -0.137 0.118 0.128 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 5.77e-02 -0.216 0.113 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 9.07e-01 0.00858 0.0732 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0193 0.112 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 1.60e-01 0.16 0.114 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 -165150 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0356 0.127 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 2.44e-01 0.162 0.139 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 71242 sc-eQTL 2.06e-01 -0.118 0.0933 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0689 0.103 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 2.22e-01 -0.123 0.1 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 -461525 sc-eQTL 5.27e-01 -0.087 0.137 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 173861 sc-eQTL 2.67e-01 -0.146 0.132 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0986 0.117 0.116 B_Memory L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 5.77e-01 0.0378 0.0678 0.116 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0521 0.104 0.116 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 1.04e-01 0.151 0.0921 0.116 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 -165150 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0377 0.118 0.116 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 4.82e-01 0.0969 0.138 0.116 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 71242 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0778 0.114 0.116 B_Memory L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 9.84e-01 0.00247 0.12 0.116 B_Memory L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0689 0.108 0.116 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 -461525 sc-eQTL 3.21e-01 -0.137 0.137 0.116 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 173861 sc-eQTL 4.38e-01 -0.1 0.129 0.116 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000579 0.108 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0279 0.068 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 1.70e-01 0.139 0.101 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 5.20e-01 0.0701 0.109 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -165150 sc-eQTL 2.50e-03 -0.36 0.118 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 6.11e-01 0.064 0.126 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 71242 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0996 0.0729 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 4.83e-01 -0.069 0.0983 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 7.21e-01 0.0349 0.0976 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -461525 sc-eQTL 1.18e-01 -0.208 0.132 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 173861 sc-eQTL 2.54e-01 0.137 0.12 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 1.82e-01 0.178 0.133 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0106 0.0671 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 3.46e-02 0.242 0.114 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 6.66e-01 0.0485 0.112 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -165150 sc-eQTL 4.91e-01 0.0672 0.0974 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 2.70e-01 0.161 0.145 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 71242 sc-eQTL 9.13e-02 -0.118 0.0695 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 9.44e-01 0.00772 0.11 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0146 0.106 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -461525 sc-eQTL 9.76e-01 0.00416 0.14 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 173861 sc-eQTL 4.12e-01 0.107 0.131 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0395 0.131 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00739 0.0862 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0679 0.125 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 8.40e-01 0.0258 0.128 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 1.01e-01 -0.234 0.142 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 3.99e-01 0.114 0.135 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 5.44e-01 0.0742 0.122 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 9.38e-01 0.00616 0.0788 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 6.42e-01 0.0343 0.0737 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0492 0.0754 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 1.62e-01 -0.101 0.0721 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0151 0.122 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 7.78e-01 0.0282 0.0998 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 1.58e-01 -0.135 0.0955 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 6.21e-01 -0.054 0.109 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 6.93e-01 0.0277 0.0699 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00321 0.0853 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0732 0.0819 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 2.82e-01 -0.135 0.125 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 4.63e-01 0.077 0.105 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 5.15e-01 0.0589 0.0903 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0291 0.127 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000382 0.0875 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 9.07e-01 0.0127 0.109 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0205 0.112 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 2.07e-01 -0.155 0.122 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 8.27e-01 0.0282 0.128 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0217 0.123 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0159 0.113 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 1.13e-01 0.114 0.0716 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 4.90e-01 0.0695 0.1 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0126 0.117 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 2.24e-01 -0.163 0.133 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 8.15e-01 0.0277 0.118 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 3.57e-01 0.0985 0.107 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 8.79e-01 -0.016 0.105 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 1.22e-01 0.14 0.0904 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 8.26e-01 0.0205 0.0927 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 6.75e-01 0.0425 0.101 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 2.95e-01 0.135 0.129 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 3.42e-02 0.238 0.112 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0125 0.115 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 2.68e-01 -0.153 0.137 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 1.72e-01 -0.132 0.0965 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00918 0.112 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 5.60e-01 0.0775 0.133 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0243 0.136 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 4.26e-01 -0.107 0.133 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 7.19e-01 0.0481 0.133 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0726 0.14 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 4.61e-02 0.191 0.0954 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 7.73e-01 0.0384 0.133 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 2.27e-01 -0.154 0.127 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 5.30e-01 0.083 0.132 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0486 0.143 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 6.90e-01 0.0527 0.132 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0918 0.13 0.123 MAIT L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 8.16e-01 0.0189 0.0814 0.123 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 2.25e-01 0.122 0.1 0.123 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 6.26e-01 0.0602 0.123 0.123 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 1.06e-01 0.204 0.125 0.123 MAIT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 4.44e-01 0.094 0.123 0.123 MAIT L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 4.49e-01 0.0898 0.118 0.123 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 3.88e-02 -0.26 0.125 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 6.25e-01 0.0424 0.0865 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0554 0.124 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 7.32e-01 0.0453 0.132 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 6.20e-01 0.0652 0.131 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0867 0.122 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 6.88e-01 0.0506 0.126 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0555 0.111 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 9.90e-01 -0.000827 0.0671 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 3.80e-01 0.0864 0.0982 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 3.17e-01 0.0945 0.0943 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 8.79e-02 -0.223 0.13 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 2.21e-01 0.138 0.112 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 1.09e-01 0.168 0.104 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0302 0.131 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00274 0.0898 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 2.53e-01 -0.139 0.121 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0358 0.136 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0383 0.151 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 2.46e-01 -0.16 0.138 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 4.82e-01 0.0859 0.122 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0913 0.116 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 2.63e-01 0.0794 0.0707 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 1.02e-01 -0.161 0.0981 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0757 0.113 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0305 0.132 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 1.71e-02 0.25 0.104 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 7.93e-01 0.0281 0.107 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 5.71e-01 0.0952 0.167 0.115 PB L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 3.53e-01 0.077 0.0825 0.115 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 4.22e-01 -0.108 0.134 0.115 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0388 0.119 0.115 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 -165150 sc-eQTL 5.12e-01 0.11 0.167 0.115 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0547 0.163 0.115 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 71242 sc-eQTL 3.54e-01 0.12 0.129 0.115 PB L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 2.01e-01 0.183 0.142 0.115 PB L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 1.76e-02 -0.367 0.152 0.115 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 -461525 sc-eQTL 2.57e-02 -0.35 0.155 0.115 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 173861 sc-eQTL 3.93e-01 -0.135 0.157 0.115 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 6.72e-01 0.0586 0.138 0.124 Pro_T L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00548 0.0566 0.124 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 5.79e-01 0.0593 0.107 0.124 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 8.82e-01 0.0146 0.0985 0.124 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 9.74e-01 0.00383 0.118 0.124 Pro_T L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 3.91e-01 -0.109 0.126 0.124 Pro_T L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0355 0.118 0.124 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0242 0.119 0.122 Treg L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 1.48e-01 0.141 0.097 0.122 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 7.51e-01 0.0319 0.101 0.122 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 1.52e-01 0.155 0.108 0.122 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 2.94e-01 0.143 0.136 0.122 Treg L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 9.44e-01 0.00851 0.122 0.122 Treg L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 7.38e-01 0.045 0.134 0.122 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 1.11e-01 -0.193 0.12 0.124 cDC L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 3.13e-01 0.108 0.107 0.124 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0848 0.14 0.124 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0797 0.122 0.124 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 7.77e-01 0.0395 0.14 0.124 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 71242 sc-eQTL 1.46e-01 -0.123 0.0845 0.124 cDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 6.57e-01 0.0615 0.138 0.124 cDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0561 0.129 0.124 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 173861 sc-eQTL 1.28e-01 -0.19 0.124 0.124 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 6.46e-01 0.0352 0.0764 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 9.18e-02 -0.107 0.0631 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0339 0.0979 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 9.85e-01 0.00143 0.0768 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 3.27e-01 -0.104 0.106 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0564 0.0997 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 3.13e-01 0.123 0.122 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 9.27e-01 0.00915 0.099 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0521 0.0737 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 9.46e-02 0.19 0.113 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 1.78e-01 -0.133 0.0987 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0815 0.114 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0769 0.106 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 2.19e-01 0.158 0.128 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 2.33e-01 0.204 0.17 0.124 gdT L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 7.02e-01 0.0349 0.0911 0.124 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 8.97e-01 0.02 0.155 0.124 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 4.38e-01 0.131 0.169 0.124 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0129 0.165 0.124 gdT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 4.90e-01 0.102 0.147 0.124 gdT L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 1.58e-01 0.218 0.154 0.124 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 7.99e-01 0.0306 0.12 0.124 intMono L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 2.12e-02 -0.174 0.0748 0.124 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 2.01e-01 0.157 0.122 0.124 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 5.51e-02 -0.223 0.116 0.124 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 3.54e-01 -0.117 0.126 0.124 intMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 2.32e-01 -0.144 0.12 0.124 intMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00543 0.125 0.124 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 1.33e-02 0.254 0.102 0.124 ncMono L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0403 0.0714 0.124 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 3.73e-01 0.105 0.117 0.124 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00853 0.115 0.124 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 2.04e-01 0.151 0.119 0.124 ncMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 3.60e-01 0.104 0.113 0.124 ncMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 2.18e-01 0.147 0.119 0.124 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 6.07e-02 -0.276 0.146 0.121 pDC L2
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 2.27e-01 -0.175 0.144 0.121 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 2.03e-01 0.158 0.124 0.121 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 6.05e-01 0.0761 0.147 0.121 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0766 0.152 0.121 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 71242 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0888 0.133 0.121 pDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0125 0.136 0.121 pDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 1.73e-01 0.172 0.126 0.121 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 173861 sc-eQTL 2.75e-01 -0.118 0.108 0.121 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0802 0.0942 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0187 0.0625 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 6.51e-01 0.0384 0.0848 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 1.42e-01 0.114 0.077 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -165150 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0351 0.0997 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 2.97e-01 0.131 0.126 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 71242 sc-eQTL 2.30e-01 -0.105 0.0874 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0214 0.091 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0676 0.0871 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -461525 sc-eQTL 1.23e-01 -0.202 0.131 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 173861 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0853 0.133 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 3.50e-01 0.0986 0.105 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0303 0.0602 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 3.44e-02 0.21 0.0987 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 5.90e-01 0.0552 0.102 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -165150 sc-eQTL 1.71e-02 -0.296 0.123 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 3.82e-01 0.11 0.126 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 71242 sc-eQTL 7.12e-02 -0.107 0.0591 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 8.52e-01 -0.017 0.0909 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0324 0.0884 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -461525 sc-eQTL 2.89e-01 -0.137 0.129 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 173861 sc-eQTL 2.57e-01 0.136 0.12 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 7.43e-01 0.0232 0.0709 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 2.34e-01 -0.072 0.0603 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 5.95e-01 0.0516 0.0969 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 6.62e-01 -0.032 0.073 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 2.54e-01 -0.115 0.101 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0346 0.0956 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 1.46e-01 0.173 0.118 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 1.71e-01 0.13 0.0947 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 5.50e-02 -0.117 0.0605 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 7.70e-02 0.19 0.107 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 2.74e-01 -0.118 0.107 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 1.87e-01 0.15 0.113 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0535 0.106 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 7.11e-01 0.0465 0.125 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -391638 sc-eQTL 3.25e-01 -0.094 0.0953 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 391847 sc-eQTL 9.89e-01 0.000888 0.0627 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -840190 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0664 0.0863 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -904254 sc-eQTL 7.47e-01 -0.027 0.0836 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -929795 sc-eQTL 1.61e-01 -0.175 0.124 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 392120 sc-eQTL 2.39e-01 0.11 0.093 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 394779 sc-eQTL 5.17e-01 0.0595 0.0917 0.123 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000205056 LINC02397 71242 eQTL 0.000883 0.0833 0.025 0.0 0.0 0.123


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000102189 \N -391638 2.96e-06 9.1e-07 2.88e-07 1.3e-06 1.19e-07 6.17e-07 1.52e-06 3.24e-07 1.14e-06 4.03e-07 1.25e-06 5.95e-07 1.82e-06 3.03e-07 4.89e-07 7.54e-07 6.15e-07 7.78e-07 7.98e-07 5.97e-07 4.39e-07 1.04e-06 9.26e-07 6.02e-07 2.28e-06 2.99e-07 8.68e-07 7.22e-07 1.01e-06 1.24e-06 5.39e-07 7.4e-08 1.48e-07 6.68e-07 5.64e-07 3.94e-07 1.31e-07 1.27e-07 2.21e-07 4.25e-08 1.16e-07 1.62e-06 4.02e-07 1.55e-08 1.7e-07 1.24e-07 1.77e-07 3.09e-09 5.81e-08