Genes within 1Mb (chr12:92469996:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 7.62e-01 0.0175 0.0576 0.244 B L1
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 5.16e-01 -0.03 0.0462 0.244 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 3.53e-02 -0.135 0.0636 0.244 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 9.41e-01 0.00418 0.0567 0.244 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 -232847 sc-eQTL 3.77e-01 0.0566 0.0639 0.244 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 7.73e-01 0.0256 0.0885 0.244 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 3545 sc-eQTL 1.82e-04 0.161 0.0422 0.244 B L1
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 5.59e-01 0.0367 0.0627 0.244 B L1
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0209 0.0593 0.244 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 -529222 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0505 0.088 0.244 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 106164 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0452 0.0864 0.244 B L1
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0349 0.0589 0.244 CD4T L1
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0249 0.0574 0.244 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 6.29e-01 0.0273 0.0566 0.244 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 4.00e-01 0.0443 0.0525 0.244 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 1.69e-01 0.126 0.091 0.244 CD4T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 6.34e-01 0.0374 0.0784 0.244 CD4T L1
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 7.20e-02 -0.131 0.0727 0.244 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0214 0.0667 0.244 CD8T L1
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0449 0.0561 0.244 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 6.77e-01 -0.023 0.0551 0.244 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 3.79e-01 0.0604 0.0685 0.244 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 7.18e-01 0.0353 0.0977 0.244 CD8T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00285 0.0731 0.244 CD8T L1
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0817 0.0752 0.244 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 4.32e-01 0.0694 0.0881 0.248 DC L1
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 2.66e-01 0.106 0.0948 0.248 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 7.86e-01 -0.024 0.0885 0.248 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0544 0.0893 0.248 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 5.78e-01 0.0572 0.103 0.248 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 3545 sc-eQTL 7.77e-01 0.0258 0.0907 0.248 DC L1
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 2.33e-01 0.123 0.103 0.248 DC L1
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 8.87e-01 0.014 0.0988 0.248 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 106164 sc-eQTL 8.62e-01 0.0163 0.0934 0.248 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 6.87e-02 0.0966 0.0528 0.244 Mono L1
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0157 0.045 0.244 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0258 0.0771 0.244 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 2.04e-01 0.0734 0.0576 0.244 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0464 0.0778 0.244 Mono L1
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 6.91e-01 0.0292 0.0733 0.244 Mono L1
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0236 0.0901 0.244 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0356 0.0739 0.245 NK L1
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0327 0.0523 0.245 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0656 0.0669 0.245 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00472 0.0664 0.245 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 4.87e-01 0.066 0.0947 0.245 NK L1
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00616 0.0726 0.245 NK L1
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 1.08e-01 -0.116 0.0718 0.245 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 2.18e-01 0.117 0.0944 0.244 Other_T L1
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0212 0.0436 0.244 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 3.86e-01 0.0616 0.071 0.244 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 7.96e-01 0.0171 0.066 0.244 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0545 0.0779 0.244 Other_T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0689 0.0921 0.244 Other_T L1
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0243 0.0867 0.244 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 7.46e-01 0.0362 0.111 0.235 B_Activated L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 8.49e-01 0.0111 0.0582 0.235 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 3.84e-01 0.0853 0.0978 0.235 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 7.60e-01 0.0372 0.122 0.235 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 -232847 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0463 0.103 0.235 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 6.52e-01 0.0532 0.118 0.235 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 3545 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0153 0.107 0.235 B_Activated L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 3.98e-01 0.0958 0.113 0.235 B_Activated L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 5.45e-01 0.0535 0.0882 0.235 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 -529222 sc-eQTL 3.20e-01 -0.114 0.114 0.235 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 106164 sc-eQTL 3.67e-01 0.0857 0.0947 0.235 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 8.01e-01 0.0222 0.088 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0676 0.0561 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 1.02e-01 -0.141 0.0859 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0699 0.0879 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 -232847 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0274 0.0975 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0695 0.107 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 3545 sc-eQTL 6.77e-01 0.0301 0.0721 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 1.06e-01 -0.127 0.0786 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 6.44e-01 0.0359 0.0775 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 -529222 sc-eQTL 8.70e-02 -0.181 0.105 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 106164 sc-eQTL 8.70e-01 0.0166 0.102 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 1.27e-01 0.138 0.0903 0.244 B_Memory L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0265 0.0524 0.244 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0633 0.08 0.244 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0761 0.0714 0.244 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 -232847 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0446 0.0912 0.244 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 8.75e-01 0.0168 0.106 0.244 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 3545 sc-eQTL 4.10e-01 0.073 0.0884 0.244 B_Memory L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 5.77e-01 0.0519 0.093 0.244 B_Memory L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 9.14e-01 0.00905 0.0833 0.244 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 -529222 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0803 0.106 0.244 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 106164 sc-eQTL 1.59e-01 -0.141 0.0994 0.244 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 6.41e-01 0.0391 0.0837 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0553 0.0524 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 2.55e-01 -0.089 0.0779 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 2.76e-02 0.184 0.083 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -232847 sc-eQTL 8.20e-01 0.0211 0.0928 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 2.36e-01 0.115 0.0967 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 3545 sc-eQTL 6.21e-04 0.191 0.055 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0206 0.076 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0504 0.0753 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -529222 sc-eQTL 9.91e-01 0.00113 0.103 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 106164 sc-eQTL 7.54e-01 0.0291 0.0926 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0319 0.102 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 9.12e-01 0.00563 0.0512 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 2.05e-01 -0.111 0.0872 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 6.58e-01 0.038 0.0856 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -232847 sc-eQTL 1.63e-01 -0.104 0.074 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 7.06e-01 0.0419 0.111 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 3545 sc-eQTL 5.91e-02 0.1 0.0529 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 1.72e-01 0.115 0.0838 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00131 0.0806 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -529222 sc-eQTL 8.37e-01 -0.022 0.107 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 106164 sc-eQTL 4.17e-01 0.081 0.0995 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 4.30e-01 0.0844 0.107 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 4.30e-01 0.0555 0.0702 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 1.43e-01 0.149 0.101 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 6.83e-01 0.0426 0.104 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 4.33e-01 0.0912 0.116 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 3.14e-01 0.111 0.11 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0948 0.0995 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0373 0.0621 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00126 0.0581 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 5.99e-01 0.0313 0.0595 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 2.52e-01 0.0654 0.0569 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 5.97e-02 0.18 0.0951 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 4.85e-01 0.055 0.0786 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 1.41e-01 -0.111 0.0752 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0628 0.0861 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 2.18e-01 -0.0681 0.0551 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 9.95e-01 0.000383 0.0675 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 5.06e-01 0.0432 0.0648 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 1.73e-01 0.135 0.0986 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00267 0.0829 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0962 0.0712 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 8.59e-01 0.018 0.101 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000605 0.0698 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 5.01e-01 0.0584 0.0866 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 9.84e-02 -0.147 0.0885 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 4.32e-01 -0.077 0.0978 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0693 0.102 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 9.16e-01 0.0104 0.0984 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0112 0.0898 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0267 0.057 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 6.28e-01 0.0386 0.0796 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 6.07e-01 0.0476 0.0924 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 1.49e-01 0.153 0.106 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 7.01e-01 -0.036 0.0937 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0769 0.0845 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0225 0.083 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 7.83e-01 0.0198 0.0719 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0493 0.0732 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 5.71e-01 0.0453 0.0799 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 4.51e-01 0.0769 0.102 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 1.89e-01 0.117 0.0888 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0368 0.0906 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 1.24e-01 0.17 0.11 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 8.07e-01 0.019 0.0777 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0736 0.0894 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 2.23e-01 0.13 0.106 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 4.91e-01 0.0752 0.109 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0505 0.107 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 3.17e-01 -0.107 0.107 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 2.27e-01 0.131 0.108 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 1.42e-01 0.11 0.0744 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 3.24e-01 0.102 0.103 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 2.21e-01 0.121 0.0985 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 2.05e-01 -0.13 0.102 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0594 0.111 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 2.92e-01 -0.108 0.102 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 6.61e-01 0.046 0.105 0.242 MAIT L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0382 0.0654 0.242 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 1.97e-01 0.104 0.0807 0.242 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 6.68e-01 0.0426 0.0993 0.242 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0498 0.101 0.242 MAIT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 2.99e-01 -0.103 0.0984 0.242 MAIT L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 4.93e-01 0.0654 0.0953 0.242 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 3.37e-02 0.212 0.099 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0284 0.0686 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 8.00e-02 -0.172 0.0978 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 3.90e-01 0.0899 0.104 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 9.69e-01 0.00409 0.104 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0164 0.097 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0147 0.1 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0049 0.0875 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 8.75e-01 0.00833 0.0531 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0318 0.0777 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0885 0.0744 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 4.89e-01 0.0716 0.103 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0162 0.0891 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 2.06e-01 -0.105 0.0827 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0573 0.102 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0682 0.0698 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 8.05e-01 0.0233 0.0944 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 2.30e-01 0.127 0.105 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 2.64e-01 -0.132 0.118 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 3.17e-01 -0.108 0.107 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 4.38e-01 0.0738 0.0949 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 7.79e-01 0.0255 0.0907 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0425 0.0553 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 7.07e-01 0.029 0.077 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00352 0.0886 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 2.52e-01 0.117 0.102 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0245 0.0824 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0464 0.0836 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 3.47e-01 -0.123 0.13 0.252 PB L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 8.73e-01 0.0104 0.0647 0.252 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 9.76e-01 -0.0032 0.105 0.252 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0515 0.0927 0.252 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 -232847 sc-eQTL 5.88e-01 0.071 0.131 0.252 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 3.48e-01 0.12 0.127 0.252 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 3545 sc-eQTL 6.36e-01 0.0479 0.101 0.252 PB L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 3.61e-01 0.102 0.112 0.252 PB L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 4.32e-01 0.0962 0.122 0.252 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 -529222 sc-eQTL 7.03e-01 0.0472 0.124 0.252 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 106164 sc-eQTL 4.93e-01 0.0848 0.123 0.252 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 4.74e-01 0.0753 0.105 0.246 Pro_T L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 5.00e-01 -0.029 0.0429 0.246 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0297 0.0812 0.246 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0374 0.0748 0.246 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0793 0.0898 0.246 Pro_T L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 8.27e-01 -0.021 0.0962 0.246 Pro_T L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0419 0.0893 0.246 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 7.25e-02 0.166 0.0918 0.244 Treg L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0301 0.076 0.244 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 8.10e-01 0.0189 0.0786 0.244 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 3.29e-01 0.0827 0.0846 0.244 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 4.24e-01 0.0854 0.107 0.244 Treg L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0274 0.0952 0.244 Treg L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 1.13e-01 -0.166 0.104 0.244 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 1.45e-01 0.137 0.0932 0.259 cDC L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 1.89e-01 0.109 0.0828 0.259 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 9.92e-01 0.0011 0.108 0.259 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0701 0.094 0.259 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 4.29e-01 0.0854 0.108 0.259 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 3545 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0503 0.0657 0.259 cDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 3.40e-01 0.102 0.107 0.259 cDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0553 0.0996 0.259 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 106164 sc-eQTL 4.95e-01 -0.066 0.0966 0.259 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 9.29e-02 0.102 0.0603 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 7.17e-01 0.0183 0.0504 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 9.58e-01 0.00415 0.0778 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 2.57e-01 0.0692 0.0608 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 6.19e-01 0.0421 0.0845 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 5.21e-01 0.0509 0.0792 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 8.84e-01 0.0142 0.0971 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 4.20e-01 0.0633 0.0785 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 7.04e-01 0.0223 0.0585 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0209 0.0904 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 3.12e-01 0.0795 0.0784 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 1.12e-01 -0.143 0.0897 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 4.59e-01 0.0627 0.0845 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 8.85e-01 0.0148 0.102 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 8.62e-01 0.0233 0.134 0.23 gdT L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 3.78e-01 0.0631 0.0714 0.23 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 9.57e-01 0.00661 0.121 0.23 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 8.25e-01 0.0295 0.133 0.23 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 6.30e-01 0.0625 0.129 0.23 gdT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 2.50e-01 0.133 0.115 0.23 gdT L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 8.95e-01 0.0161 0.121 0.23 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0136 0.0946 0.244 intMono L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 6.59e-01 0.0263 0.0597 0.244 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 8.68e-01 -0.016 0.0965 0.244 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 4.91e-01 0.0633 0.0918 0.244 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 3.42e-01 0.094 0.0988 0.244 intMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 2.82e-01 -0.102 0.0943 0.244 intMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 7.75e-01 0.0281 0.0981 0.244 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 9.27e-02 0.137 0.0809 0.251 ncMono L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 4.89e-02 0.111 0.0559 0.251 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 5.69e-01 -0.053 0.0928 0.251 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0768 0.0904 0.251 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 5.58e-01 0.055 0.0939 0.251 ncMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 1.17e-01 0.14 0.0891 0.251 ncMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0781 0.0944 0.251 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 4.04e-01 0.0948 0.113 0.254 pDC L2
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 9.81e-02 0.184 0.11 0.254 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 8.65e-01 0.0163 0.0955 0.254 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 1.31e-01 0.17 0.112 0.254 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00594 0.117 0.254 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 3545 sc-eQTL 8.99e-01 0.013 0.103 0.254 pDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 2.42e-01 0.122 0.104 0.254 pDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 9.94e-02 0.16 0.0966 0.254 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 106164 sc-eQTL 7.88e-01 0.0224 0.0831 0.254 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 1.23e-01 0.113 0.0731 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 8.29e-01 0.0105 0.0486 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0563 0.066 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0577 0.0601 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -232847 sc-eQTL 9.35e-01 0.00632 0.0776 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0783 0.098 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 3545 sc-eQTL 7.84e-02 0.12 0.0678 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 9.64e-01 0.00318 0.0709 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 9.83e-01 0.00142 0.0679 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -529222 sc-eQTL 7.56e-02 -0.181 0.101 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 106164 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0761 0.103 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00536 0.0814 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 4.64e-01 -0.034 0.0464 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 1.08e-01 -0.123 0.0765 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 8.10e-02 0.137 0.0783 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -232847 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0215 0.0964 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 2.61e-01 0.109 0.0968 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 3545 sc-eQTL 1.76e-04 0.17 0.0444 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 5.86e-01 0.0382 0.07 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0458 0.0681 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -529222 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0591 0.0998 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 106164 sc-eQTL 7.73e-01 0.0267 0.0925 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 4.83e-02 0.111 0.0558 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 8.99e-01 0.00608 0.0481 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00144 0.0771 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 9.95e-02 0.0954 0.0577 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0171 0.0804 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 6.01e-01 0.0398 0.0759 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 7.94e-01 0.0247 0.0945 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 4.67e-01 0.055 0.0755 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 3.67e-01 0.0437 0.0484 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0297 0.0855 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 9.01e-01 0.0107 0.0856 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 6.10e-01 0.0462 0.0902 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 5.36e-01 0.0521 0.084 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0271 0.0996 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -459335 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0407 0.0759 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 324150 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0395 0.0497 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -907887 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0426 0.0686 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -971951 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0528 0.0664 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -997492 sc-eQTL 3.95e-01 0.0845 0.0991 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 324423 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0321 0.0741 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 327082 sc-eQTL 1.29e-01 -0.111 0.0725 0.244 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000205056 LINC02397 3545 eQTL 0.00821 0.054 0.0204 0.0 0.0 0.219


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000205056 LINC02397 3545 6.23e-05 4.26e-05 7.01e-06 1.6e-05 6.41e-06 1.82e-05 5.58e-05 4.46e-06 3.69e-05 1.55e-05 4.8e-05 2.01e-05 5.93e-05 1.73e-05 7.62e-06 2.29e-05 2.17e-05 3e-05 9e-06 7.1e-06 1.86e-05 3.99e-05 4.04e-05 9.6e-06 5.14e-05 8.74e-06 1.62e-05 1.39e-05 4.14e-05 3.06e-05 2.44e-05 1.64e-06 2.53e-06 7.08e-06 1.27e-05 5.85e-06 3.03e-06 3.18e-06 4.58e-06 3.22e-06 1.72e-06 5.2e-05 4.93e-06 2.8e-07 2.78e-06 4.28e-06 4.23e-06 1.53e-06 1.53e-06