Genes within 1Mb (chr12:92466093:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 5.24e-01 0.0362 0.0568 0.263 B L1
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0374 0.0455 0.263 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 2.39e-02 -0.143 0.0626 0.263 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 9.29e-01 0.00497 0.0559 0.263 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 -236750 sc-eQTL 8.44e-01 0.0124 0.0631 0.263 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 -358 sc-eQTL 7.06e-04 0.144 0.0419 0.263 B L1
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 7.82e-01 0.0172 0.0619 0.263 B L1
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0242 0.0585 0.263 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 -533125 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0605 0.0868 0.263 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 102261 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0872 0.085 0.263 B L1
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 9.81e-01 0.00141 0.0579 0.263 CD4T L1
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0305 0.0563 0.263 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0179 0.0556 0.263 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 3.22e-01 0.0512 0.0515 0.263 CD4T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 6.71e-01 0.0328 0.0771 0.263 CD4T L1
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0734 0.0718 0.263 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 6.81e-01 0.0271 0.0657 0.263 CD8T L1
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0574 0.0551 0.263 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0289 0.0542 0.263 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 4.64e-01 0.0494 0.0674 0.263 CD8T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 7.18e-01 -0.026 0.0719 0.263 CD8T L1
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0502 0.0742 0.263 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 6.78e-01 0.0362 0.087 0.264 DC L1
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 3.43e-01 0.0889 0.0936 0.264 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 5.21e-01 -0.056 0.0871 0.264 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0369 0.0881 0.264 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 -358 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0145 0.0894 0.264 DC L1
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 1.58e-01 0.143 0.101 0.264 DC L1
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00235 0.0974 0.264 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 102261 sc-eQTL 6.35e-01 0.0438 0.092 0.264 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 1.23e-02 0.129 0.0513 0.263 Mono L1
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0174 0.044 0.263 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0455 0.0754 0.263 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 3.27e-01 0.0554 0.0565 0.263 Mono L1
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 5.20e-01 0.0461 0.0717 0.263 Mono L1
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00566 0.0881 0.263 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0221 0.0728 0.264 NK L1
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0589 0.0513 0.264 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 2.62e-01 -0.074 0.0658 0.264 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0216 0.0653 0.264 NK L1
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0391 0.0714 0.264 NK L1
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 1.01e-01 -0.116 0.0706 0.264 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 1.92e-01 0.121 0.0926 0.263 Other_T L1
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0258 0.0427 0.263 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 4.96e-01 0.0476 0.0698 0.263 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 4.31e-01 0.0511 0.0647 0.263 Other_T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0507 0.0905 0.263 Other_T L1
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 9.05e-01 0.0102 0.0851 0.263 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 9.05e-01 -0.013 0.109 0.255 B_Activated L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0102 0.0568 0.255 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 2.45e-01 0.111 0.0952 0.255 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 5.98e-01 0.0626 0.119 0.255 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 -236750 sc-eQTL 1.99e-01 -0.129 0.0998 0.255 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 -358 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0628 0.104 0.255 B_Activated L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 4.45e-01 0.0846 0.11 0.255 B_Activated L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 4.37e-01 0.0669 0.086 0.255 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 -533125 sc-eQTL 2.98e-01 -0.116 0.111 0.255 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 102261 sc-eQTL 2.19e-01 0.114 0.0922 0.255 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 2.75e-01 0.0948 0.0866 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0542 0.0555 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 6.88e-02 -0.155 0.0846 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0619 0.0867 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 -236750 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0336 0.0962 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 -358 sc-eQTL 5.16e-01 0.0463 0.0711 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 1.23e-01 -0.12 0.0776 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 8.60e-01 0.0135 0.0766 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 -533125 sc-eQTL 1.02e-01 -0.17 0.104 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 102261 sc-eQTL 9.04e-01 0.0121 0.1 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 8.34e-02 0.155 0.0889 0.263 B_Memory L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0256 0.0517 0.263 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 1.92e-01 -0.103 0.0787 0.263 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0325 0.0706 0.263 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 -236750 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0927 0.0898 0.263 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 -358 sc-eQTL 5.22e-01 0.0559 0.0873 0.263 B_Memory L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 4.07e-01 0.0762 0.0917 0.263 B_Memory L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00564 0.0822 0.263 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 -533125 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0591 0.105 0.263 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 102261 sc-eQTL 4.14e-02 -0.2 0.0976 0.263 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 5.32e-01 0.0521 0.0833 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 2.42e-01 -0.0613 0.0522 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0785 0.0776 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 4.53e-02 0.167 0.0829 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -236750 sc-eQTL 8.95e-01 0.0122 0.0924 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 -358 sc-eQTL 8.03e-03 0.148 0.0554 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0483 0.0756 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0665 0.0749 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -533125 sc-eQTL 8.58e-01 0.0184 0.102 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 102261 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00606 0.0922 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0788 0.1 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00291 0.0505 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 1.78e-01 -0.116 0.086 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 5.92e-01 0.0454 0.0845 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -236750 sc-eQTL 1.13e-01 -0.116 0.0729 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 -358 sc-eQTL 1.30e-02 0.13 0.0519 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 3.22e-01 0.0822 0.0828 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0202 0.0795 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -533125 sc-eQTL 9.02e-01 -0.013 0.105 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 102261 sc-eQTL 9.27e-01 0.00907 0.0984 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 4.05e-01 0.0868 0.104 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 3.74e-01 0.0609 0.0683 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 4.66e-01 0.0725 0.0992 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 5.72e-01 0.0574 0.101 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 1.64e-01 0.149 0.107 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0833 0.0969 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 9.35e-01 0.00499 0.0611 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0231 0.0571 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 8.51e-01 -0.011 0.0585 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 2.76e-01 0.0612 0.056 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 8.72e-01 0.0125 0.0774 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0633 0.0742 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0289 0.0846 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0542 0.0541 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0247 0.0662 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 6.79e-01 0.0264 0.0637 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 7.17e-01 0.0295 0.0814 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0655 0.07 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 4.01e-01 0.083 0.0986 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 8.85e-01 -0.00986 0.0683 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 4.67e-01 0.0618 0.0847 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0799 0.087 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0747 0.1 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 6.05e-01 0.0498 0.0962 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00967 0.0888 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0389 0.0563 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 4.66e-01 0.0574 0.0786 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00651 0.0914 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0541 0.0925 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0989 0.0833 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 6.79e-01 0.0338 0.0814 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000679 0.0705 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0553 0.0718 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 4.93e-01 0.0538 0.0783 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 3.03e-01 0.09 0.0873 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 9.44e-01 0.00628 0.0889 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 7.91e-02 0.189 0.107 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 9.39e-01 0.0058 0.076 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0955 0.0872 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 2.31e-01 0.125 0.104 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0393 0.105 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0386 0.105 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 4.20e-01 0.0856 0.106 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 1.15e-01 0.115 0.0727 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 2.95e-01 0.106 0.101 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 4.51e-01 0.0729 0.0966 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0022 0.108 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0522 0.1 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 2.93e-01 0.108 0.103 0.262 MAIT L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0542 0.0641 0.262 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 2.76e-01 0.0866 0.0792 0.262 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 3.84e-01 0.0849 0.0973 0.262 MAIT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0959 0.0966 0.262 MAIT L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 2.99e-01 0.0972 0.0933 0.262 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 1.84e-01 0.131 0.098 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0606 0.0674 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 1.42e-01 -0.142 0.0964 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 3.94e-01 0.0877 0.103 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0504 0.0953 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 9.77e-01 0.00285 0.0983 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 8.56e-01 0.0157 0.086 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0239 0.0521 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0752 0.0762 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 2.58e-01 -0.083 0.0732 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0668 0.0874 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 7.42e-02 -0.145 0.0809 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 8.79e-01 0.0153 0.101 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0591 0.0688 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 7.02e-01 0.0356 0.093 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 1.82e-01 0.139 0.104 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0981 0.106 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 7.17e-01 0.0339 0.0936 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 7.86e-01 0.0242 0.0894 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0706 0.0543 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 6.42e-01 0.0354 0.0759 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 9.37e-01 0.00687 0.0874 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0397 0.0812 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0341 0.0824 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0861 0.126 0.263 PB L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 6.83e-01 0.0256 0.0626 0.263 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 9.26e-01 0.00944 0.102 0.263 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 6.89e-01 -0.036 0.0898 0.263 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 -236750 sc-eQTL 6.40e-01 0.0593 0.126 0.263 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 -358 sc-eQTL 6.62e-01 0.0428 0.0976 0.263 PB L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 3.58e-01 0.0997 0.108 0.263 PB L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 5.36e-01 0.0734 0.118 0.263 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 -533125 sc-eQTL 7.80e-01 0.0334 0.12 0.263 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 102261 sc-eQTL 7.02e-01 0.0458 0.119 0.263 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 3.71e-01 0.0926 0.103 0.265 Pro_T L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0447 0.0422 0.265 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0129 0.0799 0.265 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 7.66e-01 -0.022 0.0736 0.265 Pro_T L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 9.39e-01 0.00727 0.0947 0.265 Pro_T L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0944 0.0876 0.265 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 1.33e-01 0.136 0.0903 0.263 Treg L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 5.38e-01 -0.046 0.0745 0.263 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0253 0.0771 0.263 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 5.88e-01 0.0451 0.0832 0.263 Treg L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0307 0.0934 0.263 Treg L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 1.58e-01 -0.145 0.102 0.263 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 1.43e-01 0.135 0.0914 0.276 cDC L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 2.38e-01 0.0962 0.0813 0.276 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 9.92e-01 0.00112 0.106 0.276 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0401 0.0923 0.276 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 -358 sc-eQTL 1.32e-01 -0.0969 0.0641 0.276 cDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 4.87e-01 0.073 0.105 0.276 cDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0874 0.0976 0.276 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 102261 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0334 0.0948 0.276 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 7.11e-02 0.107 0.0592 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 9.35e-01 0.00406 0.0495 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0195 0.0764 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 3.75e-01 0.0531 0.0598 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 2.40e-01 0.0914 0.0776 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 5.85e-01 0.0521 0.0952 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 3.00e-01 0.0799 0.077 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 5.88e-01 0.0311 0.0574 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0701 0.0886 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 3.43e-01 0.0733 0.077 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 3.38e-01 0.0795 0.0828 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00602 0.1 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 6.37e-01 -0.062 0.131 0.245 gdT L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 3.82e-01 0.0611 0.0697 0.245 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0481 0.118 0.245 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 4.54e-01 0.0972 0.129 0.245 gdT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 4.16e-01 0.0917 0.112 0.245 gdT L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 8.49e-01 0.0225 0.119 0.245 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00571 0.0926 0.262 intMono L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 7.64e-01 0.0176 0.0584 0.262 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0557 0.0944 0.262 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 6.75e-01 0.0377 0.0899 0.262 intMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0811 0.0924 0.262 intMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 8.65e-01 0.0164 0.096 0.262 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 3.87e-02 0.165 0.0795 0.269 ncMono L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 7.25e-02 0.0997 0.0552 0.269 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0663 0.0916 0.269 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0828 0.0892 0.269 ncMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 1.21e-01 0.137 0.088 0.269 ncMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0586 0.0932 0.269 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0079 0.111 0.274 pDC L2
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 1.84e-01 0.145 0.109 0.274 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0114 0.0937 0.274 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 7.27e-02 0.199 0.11 0.274 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 -358 sc-eQTL 8.66e-01 0.0171 0.101 0.274 pDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 5.60e-02 0.195 0.101 0.274 pDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 1.45e-01 0.139 0.095 0.274 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 102261 sc-eQTL 6.28e-01 0.0396 0.0815 0.274 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 4.63e-02 0.143 0.0715 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 7.68e-01 0.0141 0.0478 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 1.59e-01 -0.0913 0.0646 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0338 0.0591 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -236750 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0565 0.0762 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 -358 sc-eQTL 7.42e-02 0.119 0.0666 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00448 0.0696 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 9.08e-01 0.00774 0.0667 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -533125 sc-eQTL 1.10e-01 -0.16 0.0999 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 102261 sc-eQTL 3.29e-01 -0.099 0.101 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0184 0.0808 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0326 0.0461 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 1.21e-01 -0.118 0.076 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 8.12e-02 0.136 0.0778 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -236750 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0364 0.0957 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 -358 sc-eQTL 3.54e-04 0.161 0.0442 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 8.90e-01 0.00968 0.0696 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0602 0.0676 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -533125 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0496 0.0991 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 102261 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0247 0.0919 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 1.41e-02 0.135 0.0544 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 9.53e-01 0.00277 0.0471 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0275 0.0754 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 1.41e-01 0.0837 0.0566 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 3.01e-01 0.077 0.0742 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 6.63e-01 0.0404 0.0925 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 1.73e-01 0.101 0.0737 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 2.72e-01 0.0521 0.0473 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 3.96e-01 -0.071 0.0835 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0217 0.0838 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 5.03e-01 0.0551 0.0823 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0334 0.0975 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -463238 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0126 0.0746 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 320247 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0635 0.0487 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -911790 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0625 0.0674 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -975854 sc-eQTL 3.35e-01 -0.063 0.0652 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 320520 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0618 0.0727 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 323179 sc-eQTL 9.84e-02 -0.118 0.0712 0.263 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000205056 LINC02397 -358 eQTL 0.00463 0.0567 0.02 0.0 0.0 0.226
ENSG00000257345 LINC02413 -533125 eQTL 0.059 -0.0844 0.0446 0.00112 0.0 0.226


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000205056 LINC02397 -358 0.000205 0.00027 4.73e-05 0.000103 7.14e-05 9.4e-05 0.000275 6.56e-05 0.000277 0.000168 0.000355 0.000153 0.000402 0.000122 7.17e-05 0.000214 0.00012 0.000211 7.57e-05 6.6e-05 0.000168 0.000315 0.000219 8.62e-05 0.00036 0.000117 0.000165 0.000127 0.000241 0.000128 0.000177 2.75e-05 3.19e-05 6.49e-05 7.42e-05 5.09e-05 3.32e-05 3.38e-05 5.15e-05 2.81e-05 2.19e-05 0.000292 3.02e-05 5.63e-06 3.74e-05 4.7e-05 4.68e-05 2.48e-05 1.92e-05
ENSG00000257345 LINC02413 -533125 1.29e-06 1.84e-06 2.9e-07 1.91e-06 3.92e-07 8.03e-07 1.23e-06 4.23e-07 1.38e-06 6.61e-07 1.93e-06 1.32e-06 3.47e-06 1.04e-06 4.37e-07 9.92e-07 1.09e-06 1.16e-06 7.09e-07 5.11e-07 8.02e-07 1.98e-06 1.09e-06 6.41e-07 2.39e-06 7.38e-07 1.03e-06 1.1e-06 1.61e-06 1.68e-06 8.83e-07 2.43e-07 2.88e-07 1.23e-06 1.02e-06 6.18e-07 9.07e-07 3.5e-07 1.18e-06 7.33e-07 3.5e-07 1.77e-06 1.66e-07 1.99e-07 2.47e-07 3.14e-07 2.8e-07 2.49e-07 8.09e-08