logo

Genes within 1Mb (chr12:92464271:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00954 0.0711 0.13 B L1
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 8.88e-01 0.00805 0.057 0.13 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 8.70e-01 0.013 0.0794 0.13 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 4.97e-02 -0.137 0.0694 0.13 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 -238572 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0558 0.0789 0.13 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 -2180 sc-eQTL 4.50e-03 0.152 0.0529 0.13 B L1
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 9.01e-01 0.00964 0.0775 0.13 B L1
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 3.72e-01 0.0654 0.0731 0.13 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 -534947 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0563 0.109 0.13 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 100439 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0349 0.107 0.13 B L1
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 9.95e-01 0.000461 0.0736 0.13 CD4T L1
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 8.04e-01 0.0178 0.0716 0.13 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0369 0.0706 0.13 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0114 0.0656 0.13 CD4T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 6.03e-02 0.183 0.0971 0.13 CD4T L1
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00551 0.0914 0.13 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 2.84e-01 0.0879 0.0819 0.13 CD8T L1
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 3.00e-01 0.0715 0.0689 0.13 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 2.18e-01 0.0834 0.0675 0.13 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0824 0.0841 0.13 CD8T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 5.65e-01 0.0517 0.0898 0.13 CD8T L1
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 5.90e-01 0.0501 0.0927 0.13 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00586 0.109 0.131 DC L1
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 1.73e-01 0.16 0.117 0.131 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 4.76e-01 0.0781 0.109 0.131 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 5.03e-01 0.074 0.11 0.131 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 -2180 sc-eQTL 7.35e-01 0.0381 0.112 0.131 DC L1
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0994 0.127 0.131 DC L1
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0685 0.122 0.131 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 100439 sc-eQTL 8.23e-01 0.0259 0.116 0.131 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0455 0.0651 0.13 Mono L1
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 9.27e-01 0.00508 0.0551 0.13 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 5.03e-01 0.0632 0.0943 0.13 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0122 0.0708 0.13 Mono L1
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 2.74e-01 0.0982 0.0895 0.13 Mono L1
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 5.96e-01 0.0586 0.11 0.13 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 4.55e-01 0.0678 0.0907 0.131 NK L1
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 2.60e-01 0.0723 0.064 0.131 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 3.62e-01 0.0751 0.0822 0.131 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 6.86e-01 0.033 0.0814 0.131 NK L1
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 1.44e-02 0.217 0.0879 0.131 NK L1
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 9.85e-01 0.00171 0.0887 0.131 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0652 0.116 0.13 Other_T L1
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 8.78e-01 0.00816 0.0533 0.13 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 3.76e-02 -0.18 0.0862 0.13 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0267 0.0807 0.13 Other_T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 4.47e-01 0.0859 0.113 0.13 Other_T L1
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 5.19e-01 0.0684 0.106 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 9.81e-01 0.00318 0.136 0.13 B_Activated L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0553 0.071 0.13 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 9.83e-01 -0.0025 0.12 0.13 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 1.94e-01 0.193 0.148 0.13 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 -238572 sc-eQTL 2.57e-01 -0.142 0.125 0.13 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 -2180 sc-eQTL 8.83e-02 0.222 0.13 0.13 B_Activated L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 8.38e-01 0.0284 0.139 0.13 B_Activated L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 1.44e-01 0.157 0.107 0.13 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 -534947 sc-eQTL 2.47e-01 0.162 0.139 0.13 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 100439 sc-eQTL 8.64e-01 0.0199 0.116 0.13 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 9.68e-01 0.00439 0.108 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0077 0.069 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 8.72e-01 0.0171 0.106 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0435 0.108 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 -238572 sc-eQTL 7.31e-01 0.0412 0.119 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 -2180 sc-eQTL 1.40e-01 0.13 0.0879 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 8.21e-01 -0.022 0.0969 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 4.87e-01 0.0661 0.095 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 -534947 sc-eQTL 3.51e-01 -0.121 0.129 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 100439 sc-eQTL 6.38e-02 -0.23 0.123 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 3.69e-01 0.0997 0.111 0.129 B_Memory L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 7.56e-01 0.0199 0.064 0.129 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0318 0.0978 0.129 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 7.44e-01 0.0286 0.0875 0.129 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 -238572 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0425 0.111 0.129 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 -2180 sc-eQTL 2.96e-02 0.234 0.107 0.129 B_Memory L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00093 0.114 0.129 B_Memory L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 2.41e-01 -0.119 0.102 0.129 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 -534947 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0118 0.13 0.129 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 100439 sc-eQTL 1.20e-01 -0.189 0.121 0.129 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 9.69e-01 0.00399 0.103 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 2.00e-01 0.0828 0.0644 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0669 0.0959 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 1.30e-02 -0.255 0.102 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -238572 sc-eQTL 5.69e-01 -0.065 0.114 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 -2180 sc-eQTL 1.63e-02 0.166 0.0686 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 3.53e-01 0.0869 0.0932 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00236 0.0927 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -534947 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0616 0.126 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 100439 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0215 0.114 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 1.04e-01 -0.202 0.123 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0689 0.0623 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 2.94e-01 0.112 0.107 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0111 0.105 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -238572 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0603 0.0907 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 -2180 sc-eQTL 3.10e-02 0.14 0.0644 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 8.20e-02 -0.178 0.102 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 1.89e-01 0.129 0.098 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -534947 sc-eQTL 1.61e-01 0.182 0.13 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 100439 sc-eQTL 8.92e-01 0.0166 0.122 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0771 0.126 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 9.16e-01 0.00874 0.083 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 4.84e-01 0.0842 0.12 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 1.80e-01 -0.165 0.122 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 8.58e-01 0.0233 0.13 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 6.66e-01 0.0508 0.118 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 5.23e-01 0.0492 0.077 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 9.29e-01 0.00643 0.0721 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00337 0.0739 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0334 0.0709 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 6.10e-02 0.183 0.0969 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00559 0.0939 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 2.04e-01 0.135 0.106 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 2.09e-01 0.0858 0.0681 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0397 0.0833 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 8.52e-01 -0.015 0.0802 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 2.80e-01 0.111 0.102 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00924 0.0883 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 6.14e-02 -0.227 0.121 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 8.32e-01 0.0178 0.0841 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0792 0.104 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0166 0.107 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 2.50e-01 -0.142 0.123 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 9.83e-01 0.00251 0.119 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 3.78e-01 0.0974 0.11 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 3.26e-01 0.0689 0.07 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 2.10e-01 0.123 0.0976 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 3.54e-01 -0.105 0.113 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 9.33e-01 0.00963 0.115 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 6.23e-01 0.0512 0.104 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 1.35e-01 0.152 0.101 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 4.85e-01 0.0614 0.0879 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 5.30e-01 0.0564 0.0896 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 8.37e-01 0.0202 0.0979 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 3.06e-01 -0.112 0.109 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0325 0.111 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 5.33e-01 0.0822 0.132 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00144 0.0927 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 3.87e-01 0.0925 0.107 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0371 0.127 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 1.71e-02 0.303 0.126 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0185 0.128 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0365 0.135 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0192 0.0929 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 8.94e-01 0.0172 0.129 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0596 0.123 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 1.48e-01 0.199 0.137 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 8.49e-02 0.219 0.126 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0836 0.128 0.13 MAIT L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0184 0.0799 0.13 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0292 0.0989 0.13 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 8.50e-01 -0.023 0.121 0.13 MAIT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 4.43e-01 0.0925 0.12 0.13 MAIT L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0178 0.117 0.13 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 1.78e-01 -0.167 0.123 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 3.17e-01 0.085 0.0847 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 1.72e-01 -0.166 0.121 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 4.33e-01 -0.101 0.129 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 1.80e-01 0.161 0.119 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0617 0.124 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 9.13e-01 0.0118 0.108 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 2.13e-01 0.0813 0.0651 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 4.46e-01 -0.073 0.0956 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 6.21e-01 0.0455 0.0919 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 1.21e-02 0.273 0.108 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0155 0.102 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 5.00e-01 -0.085 0.126 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 5.36e-01 0.0534 0.0861 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 8.00e-01 0.0295 0.116 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 2.72e-01 -0.143 0.13 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 6.56e-02 0.243 0.131 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00846 0.117 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 4.54e-01 0.0838 0.112 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 3.44e-01 0.0647 0.0682 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 5.95e-03 0.26 0.0934 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 3.40e-01 0.104 0.109 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 6.66e-02 0.186 0.101 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 5.85e-01 0.0564 0.103 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 9.82e-02 0.271 0.162 0.137 PB L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0171 0.0812 0.137 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 8.35e-01 0.0277 0.132 0.137 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 4.98e-01 0.0791 0.116 0.137 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 -238572 sc-eQTL 1.68e-01 -0.226 0.163 0.137 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 -2180 sc-eQTL 2.05e-01 -0.16 0.126 0.137 PB L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 4.32e-02 -0.282 0.138 0.137 PB L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0291 0.153 0.137 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 -534947 sc-eQTL 2.53e-01 -0.177 0.154 0.137 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 100439 sc-eQTL 1.50e-01 -0.223 0.154 0.137 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0711 0.131 0.133 Pro_T L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 9.55e-01 0.00305 0.0535 0.133 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 3.86e-02 -0.208 0.1 0.133 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 4.22e-01 0.0748 0.0929 0.133 Pro_T L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 5.70e-01 0.0681 0.12 0.133 Pro_T L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 3.84e-01 0.0968 0.111 0.133 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 8.56e-01 0.0208 0.115 0.13 Treg L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 7.71e-01 0.0275 0.0944 0.13 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0474 0.0975 0.13 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 3.20e-01 -0.105 0.105 0.13 Treg L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 1.70e-02 0.28 0.117 0.13 Treg L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 9.49e-01 0.0084 0.13 0.13 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 3.49e-01 -0.111 0.118 0.127 cDC L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 3.56e-01 -0.097 0.105 0.127 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 2.80e-01 0.148 0.136 0.127 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 9.79e-01 0.00321 0.119 0.127 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 -2180 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0529 0.083 0.127 cDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0436 0.135 0.127 cDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 7.83e-01 0.0347 0.126 0.127 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 100439 sc-eQTL 1.04e-01 0.198 0.121 0.127 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 7.51e-01 0.0238 0.075 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 6.35e-01 0.0296 0.0622 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 1.61e-01 0.134 0.0956 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 6.81e-01 -0.031 0.0753 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 4.56e-01 0.073 0.0977 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 4.53e-01 0.09 0.12 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0483 0.0964 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0852 0.0716 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0734 0.111 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0861 0.0963 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 3.09e-01 0.106 0.104 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 8.12e-01 0.0298 0.125 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0414 0.148 0.148 gdT L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00728 0.079 0.148 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 2.41e-01 -0.157 0.133 0.148 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 4.00e-01 -0.124 0.146 0.148 gdT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00973 0.127 0.148 gdT L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 7.22e-01 0.0478 0.134 0.148 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 4.83e-01 -0.08 0.114 0.136 intMono L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0569 0.0719 0.136 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 7.66e-01 0.0346 0.116 0.136 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 9.66e-03 0.285 0.109 0.136 intMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 7.60e-01 0.0349 0.114 0.136 intMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0636 0.118 0.136 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 6.36e-02 -0.184 0.0985 0.136 ncMono L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 8.40e-01 0.0139 0.0689 0.136 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00929 0.113 0.136 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 3.59e-01 -0.101 0.11 0.136 ncMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 3.54e-02 0.229 0.108 0.136 ncMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 9.32e-01 0.0099 0.115 0.136 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0503 0.14 0.136 pDC L2
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 2.25e-01 0.166 0.136 0.136 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 9.64e-01 0.00537 0.117 0.136 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 5.62e-01 0.0808 0.139 0.136 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 -2180 sc-eQTL 6.64e-01 0.0549 0.126 0.136 pDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 5.80e-01 -0.071 0.128 0.136 pDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 1.04e-01 -0.194 0.119 0.136 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 100439 sc-eQTL 1.26e-01 -0.156 0.101 0.136 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 4.98e-01 0.0619 0.0912 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 8.86e-01 -0.00869 0.0604 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0207 0.0821 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00705 0.0748 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -238572 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0425 0.0964 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 -2180 sc-eQTL 4.40e-02 0.17 0.084 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 9.98e-01 0.000231 0.0881 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 3.81e-01 0.0739 0.0842 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -534947 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0262 0.127 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 100439 sc-eQTL 9.69e-02 -0.213 0.127 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0905 0.0999 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 3.76e-01 0.0506 0.0571 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00744 0.0946 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 3.23e-02 -0.207 0.096 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -238572 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0379 0.118 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 -2180 sc-eQTL 9.60e-03 0.145 0.0556 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 8.80e-01 0.013 0.0862 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 8.61e-01 0.0147 0.0839 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -534947 sc-eQTL 5.70e-01 0.0698 0.123 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 100439 sc-eQTL 6.04e-01 0.059 0.114 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 9.89e-01 -0.000967 0.0697 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 8.11e-01 0.0142 0.0594 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 4.74e-01 0.0683 0.0952 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0646 0.0716 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 3.77e-01 0.083 0.0938 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 4.20e-01 0.0944 0.117 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 5.84e-02 -0.174 0.0915 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0265 0.0591 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 5.46e-01 0.063 0.104 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 5.08e-01 0.0693 0.104 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 1.49e-01 0.148 0.102 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0532 0.122 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -465060 sc-eQTL 3.27e-01 0.0912 0.0928 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 318425 sc-eQTL 2.46e-01 0.0708 0.0608 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -913612 sc-eQTL 1.60e-01 0.118 0.0838 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -977676 sc-eQTL 6.24e-01 0.0399 0.0814 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 318698 sc-eQTL 4.93e-03 0.253 0.0891 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 321357 sc-eQTL 8.68e-01 0.0149 0.0893 0.131 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000205056 LINC02397 -2180 eQTL 7.71e-14 0.185 0.0244 0.00271 0.00894 0.135

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000205056 LINC02397 -2180 4.62e-05 4.02e-05 7.63e-06 1.87e-05 8.09e-06 1.86e-05 5.68e-05 6.98e-06 4.58e-05 2.24e-05 5.7e-05 2.45e-05 6.54e-05 1.9e-05 9.51e-06 2.92e-05 2.47e-05 3.49e-05 1.07e-05 9.54e-06 2.32e-05 4.73e-05 3.95e-05 1.25e-05 6.07e-05 1.29e-05 2.07e-05 1.84e-05 4.14e-05 3.56e-05 2.98e-05 2.6e-06 4.74e-06 8.73e-06 1.56e-05 8.08e-06 4.49e-06 4.48e-06 7.07e-06 4.15e-06 1.9e-06 4.74e-05 4.93e-06 5.07e-07 3.46e-06 5.28e-06 5.63e-06 2.48e-06 1.78e-06
ENSG00000277851 \N 100439 1e-05 1.18e-05 1.04e-06 6.41e-06 1.85e-06 4.9e-06 1.05e-05 1.69e-06 9.27e-06 4.89e-06 1.3e-05 5.48e-06 1.38e-05 3.56e-06 1.86e-06 6.47e-06 4.02e-06 6.08e-06 2.28e-06 2.52e-06 4.67e-06 8.14e-06 7.15e-06 2.82e-06 1.7e-05 2.92e-06 5.33e-06 3.74e-06 8.33e-06 7.74e-06 4.92e-06 1.01e-06 8.03e-07 2.99e-06 4.76e-06 1.84e-06 1.63e-06 9.43e-07 1.4e-06 1.01e-06 7.24e-07 1.24e-05 1.52e-06 1.92e-07 7.75e-07 1.32e-06 1.3e-06 8.43e-07 6.03e-07