logo

Genes within 1Mb (chr12:92457455:GAGT:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0513 0.0891 0.083 B L1
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0863 0.0713 0.083 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 3.59e-02 0.208 0.0985 0.083 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0906 0.0876 0.083 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 -245388 sc-eQTL 5.48e-01 0.0596 0.099 0.083 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 -8996 sc-eQTL 6.75e-01 0.0284 0.0676 0.083 B L1
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 7.97e-04 -0.322 0.0946 0.083 B L1
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 1.42e-01 -0.135 0.0913 0.083 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 -541763 sc-eQTL 4.52e-01 -0.103 0.136 0.083 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 93623 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0654 0.134 0.083 B L1
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 2.82e-01 0.0978 0.0908 0.083 CD4T L1
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 5.12e-01 0.0581 0.0885 0.083 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0845 0.0872 0.083 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0982 0.0808 0.083 CD4T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 4.26e-02 -0.245 0.12 0.083 CD4T L1
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 2.06e-01 -0.143 0.113 0.083 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0324 0.101 0.083 CD8T L1
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 5.21e-01 0.0548 0.0853 0.083 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0903 0.0835 0.083 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 8.69e-01 0.0172 0.104 0.083 CD8T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 2.46e-02 -0.248 0.11 0.083 CD8T L1
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0533 0.115 0.083 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 2.57e-02 0.297 0.132 0.086 DC L1
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 2.29e-01 -0.174 0.144 0.086 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 2.10e-01 -0.168 0.134 0.086 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 6.45e-01 0.0625 0.136 0.086 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 -8996 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0362 0.138 0.086 DC L1
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 3.14e-02 -0.335 0.155 0.086 DC L1
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 4.49e-01 -0.114 0.15 0.086 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 93623 sc-eQTL 4.36e-01 0.11 0.142 0.086 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0384 0.0802 0.083 Mono L1
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 1.78e-01 0.0913 0.0676 0.083 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 3.48e-01 -0.109 0.116 0.083 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 2.49e-01 -0.101 0.087 0.083 Mono L1
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0706 0.11 0.083 Mono L1
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0379 0.136 0.083 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00713 0.114 0.082 NK L1
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0824 0.0802 0.082 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0201 0.103 0.082 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000381 0.102 0.082 NK L1
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 1.80e-01 -0.15 0.111 0.082 NK L1
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 7.51e-01 0.0353 0.111 0.082 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 7.80e-02 0.256 0.145 0.083 Other_T L1
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0537 0.067 0.083 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 3.90e-01 0.0943 0.109 0.083 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 2.29e-01 0.122 0.101 0.083 Other_T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0996 0.142 0.083 Other_T L1
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0595 0.133 0.083 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 4.35e-01 -0.136 0.173 0.077 B_Activated L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 1.40e-01 -0.134 0.0902 0.077 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 3.65e-01 0.138 0.152 0.077 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 2.94e-01 -0.199 0.189 0.077 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 -245388 sc-eQTL 6.29e-01 0.0775 0.16 0.077 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 -8996 sc-eQTL 2.54e-02 -0.37 0.164 0.077 B_Activated L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 3.27e-01 -0.173 0.176 0.077 B_Activated L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 1.15e-01 -0.216 0.137 0.077 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 -541763 sc-eQTL 1.53e-01 0.254 0.177 0.077 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 93623 sc-eQTL 3.92e-01 -0.127 0.148 0.077 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 2.01e-01 0.171 0.133 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 1.32e-01 -0.129 0.0851 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 3.97e-01 0.111 0.131 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 8.39e-01 0.0272 0.134 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 -245388 sc-eQTL 9.69e-01 0.00567 0.148 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 -8996 sc-eQTL 4.43e-01 0.084 0.109 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 5.30e-02 -0.231 0.119 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 8.00e-01 0.0299 0.118 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 -541763 sc-eQTL 3.81e-01 -0.141 0.16 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 93623 sc-eQTL 5.69e-01 0.0878 0.154 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 2.98e-01 -0.143 0.137 0.084 B_Memory L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 1.82e-01 -0.106 0.0791 0.084 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 2.22e-01 0.148 0.121 0.084 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 1.31e-01 -0.164 0.108 0.084 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 -245388 sc-eQTL 9.78e-01 0.00377 0.138 0.084 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 -8996 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0517 0.134 0.084 B_Memory L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 3.45e-01 -0.133 0.141 0.084 B_Memory L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 2.82e-01 -0.136 0.126 0.084 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 -541763 sc-eQTL 4.74e-01 -0.115 0.161 0.084 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 93623 sc-eQTL 5.21e-01 0.0972 0.151 0.084 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 1.84e-01 0.169 0.127 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 1.09e-01 -0.128 0.0795 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 1.01e-01 0.195 0.118 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0629 0.128 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -245388 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0257 0.141 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 -8996 sc-eQTL 1.26e-01 0.131 0.0855 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 1.07e-03 -0.374 0.113 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 3.68e-01 -0.103 0.114 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -541763 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0365 0.156 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 93623 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0694 0.141 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 3.30e-01 -0.15 0.154 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0371 0.0777 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 3.75e-01 0.118 0.133 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 8.05e-02 -0.227 0.129 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -245388 sc-eQTL 3.19e-01 0.113 0.113 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 -8996 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0339 0.081 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 1.68e-01 -0.176 0.127 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 9.24e-01 0.0117 0.122 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -541763 sc-eQTL 6.61e-01 0.071 0.162 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 93623 sc-eQTL 9.90e-01 0.00187 0.151 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0312 0.162 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0579 0.107 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0939 0.155 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 7.62e-01 -0.048 0.158 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 3.09e-01 -0.171 0.167 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 3.97e-01 0.128 0.151 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 1.20e-01 0.148 0.0951 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 1.90e-01 0.117 0.0891 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 2.06e-01 -0.116 0.0913 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0664 0.0878 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 2.80e-01 -0.131 0.121 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0671 0.116 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 1.37e-01 0.195 0.131 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 8.74e-01 0.0134 0.0842 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0728 0.103 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 7.48e-02 -0.176 0.0981 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 5.68e-02 -0.24 0.125 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 2.78e-02 -0.238 0.108 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0183 0.152 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 7.28e-01 0.0366 0.105 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 8.62e-01 0.0227 0.131 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 9.06e-01 0.0158 0.134 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 6.54e-02 -0.284 0.153 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 6.20e-01 0.0737 0.148 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0288 0.138 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 3.51e-01 0.082 0.0877 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 8.20e-01 -0.028 0.123 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0133 0.142 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 3.34e-01 -0.14 0.144 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 7.52e-01 0.0412 0.13 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00925 0.127 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 6.02e-01 0.0575 0.11 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 2.70e-01 -0.124 0.112 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 6.83e-01 -0.05 0.122 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 4.30e-01 -0.108 0.136 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0933 0.139 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 2.25e-01 -0.2 0.165 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 8.60e-01 0.0206 0.116 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 2.29e-01 0.161 0.133 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 5.57e-01 0.0937 0.159 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 2.14e-02 -0.367 0.158 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 1.06e-01 0.258 0.159 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 7.71e-01 0.0482 0.165 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 7.52e-01 0.036 0.114 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 8.79e-01 0.0241 0.157 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0415 0.15 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 7.81e-01 0.047 0.169 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0403 0.156 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 2.86e-02 0.351 0.159 0.084 MAIT L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0172 0.101 0.084 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 5.32e-01 0.0779 0.125 0.084 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 9.36e-02 0.256 0.152 0.084 MAIT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 6.10e-01 0.0775 0.152 0.084 MAIT L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0428 0.147 0.084 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 1.38e-01 0.237 0.159 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0566 0.109 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 8.18e-02 0.273 0.156 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0403 0.167 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0439 0.155 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 9.99e-01 0.00018 0.16 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0361 0.134 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 2.02e-01 -0.104 0.0812 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 8.57e-01 0.0216 0.119 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 5.23e-01 0.0733 0.115 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 3.47e-01 -0.129 0.137 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 7.48e-01 0.041 0.127 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 7.53e-01 0.0495 0.157 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0717 0.108 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 2.80e-01 -0.157 0.145 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0909 0.163 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 3.62e-01 -0.151 0.165 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 7.07e-01 0.055 0.146 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 1.80e-01 -0.186 0.138 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00652 0.0846 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 3.38e-01 -0.113 0.117 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0752 0.135 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 1.94e-01 -0.163 0.125 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 4.25e-01 -0.102 0.128 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 3.39e-01 -0.19 0.198 0.093 PB L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0843 0.0977 0.093 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 9.99e-01 0.000112 0.16 0.093 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 2.75e-01 -0.153 0.14 0.093 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 -245388 sc-eQTL 4.56e-01 0.148 0.198 0.093 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 -8996 sc-eQTL 4.41e-01 -0.118 0.152 0.093 PB L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 1.12e-02 -0.425 0.165 0.093 PB L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 3.38e-01 0.177 0.184 0.093 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 -541763 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00804 0.187 0.093 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 93623 sc-eQTL 2.10e-01 -0.234 0.186 0.093 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 3.26e-01 0.161 0.163 0.08 Pro_T L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0161 0.0669 0.08 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 6.73e-01 0.0534 0.126 0.08 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 7.57e-01 0.0361 0.116 0.08 Pro_T L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 3.15e-01 -0.15 0.149 0.08 Pro_T L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 3.60e-01 -0.127 0.139 0.08 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 2.37e-01 -0.168 0.142 0.083 Treg L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 3.16e-01 -0.117 0.116 0.083 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 4.53e-01 0.0906 0.121 0.083 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 9.20e-01 0.013 0.13 0.083 Treg L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 4.86e-01 -0.102 0.146 0.083 Treg L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 4.42e-01 0.124 0.161 0.083 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 6.49e-01 0.0656 0.144 0.083 cDC L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 2.17e-01 -0.158 0.127 0.083 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 2.68e-01 -0.184 0.166 0.083 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 8.68e-02 0.247 0.143 0.083 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 -8996 sc-eQTL 2.87e-01 -0.108 0.101 0.083 cDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 1.27e-01 -0.25 0.163 0.083 cDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 4.65e-01 -0.112 0.153 0.083 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 93623 sc-eQTL 9.52e-01 0.00902 0.148 0.083 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 4.12e-01 -0.076 0.0926 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 6.19e-02 0.143 0.0764 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0892 0.119 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 8.36e-01 0.0193 0.0931 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0611 0.121 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 1.02e-01 -0.242 0.147 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 7.07e-01 0.0448 0.119 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00164 0.0889 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 6.64e-01 0.0597 0.137 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 3.23e-01 -0.118 0.119 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 3.06e-01 -0.132 0.128 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 3.95e-01 0.132 0.155 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0621 0.198 0.082 gdT L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 1.22e-01 -0.163 0.104 0.082 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000711 0.179 0.082 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0303 0.195 0.082 gdT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 8.44e-01 0.0335 0.17 0.082 gdT L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0956 0.179 0.082 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 2.51e-01 0.165 0.143 0.084 intMono L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0614 0.0905 0.084 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 2.77e-01 -0.159 0.146 0.084 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0797 0.139 0.084 intMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 9.80e-01 0.00362 0.144 0.084 intMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0102 0.149 0.084 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 6.88e-01 0.0516 0.128 0.077 ncMono L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0935 0.0887 0.077 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 9.77e-02 -0.242 0.145 0.077 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 3.63e-01 -0.13 0.142 0.077 ncMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 3.75e-02 -0.293 0.14 0.077 ncMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 3.59e-02 0.311 0.147 0.077 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 6.39e-03 0.474 0.172 0.085 pDC L2
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 7.05e-01 0.0653 0.172 0.085 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 7.96e-01 0.0382 0.148 0.085 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 1.42e-01 -0.257 0.174 0.085 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 -8996 sc-eQTL 3.80e-01 0.14 0.158 0.085 pDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 5.22e-01 -0.103 0.161 0.085 pDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0247 0.151 0.085 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 93623 sc-eQTL 2.67e-01 0.143 0.128 0.085 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 9.96e-01 0.000604 0.113 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 1.39e-01 -0.111 0.0746 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 2.65e-01 0.114 0.102 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 1.67e-01 -0.128 0.0924 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -245388 sc-eQTL 9.60e-01 0.00601 0.12 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 -8996 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00145 0.105 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 5.66e-02 -0.208 0.108 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 2.30e-01 -0.125 0.104 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -541763 sc-eQTL 1.07e-01 -0.254 0.157 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 93623 sc-eQTL 3.42e-01 0.151 0.159 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 8.89e-01 0.0174 0.124 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0783 0.0709 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 1.19e-01 0.183 0.117 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 2.08e-01 -0.152 0.12 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -245388 sc-eQTL 7.77e-01 0.0418 0.147 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 -8996 sc-eQTL 2.45e-01 0.0816 0.07 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 2.36e-03 -0.323 0.105 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0807 0.104 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -541763 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0677 0.153 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 93623 sc-eQTL 3.89e-01 -0.122 0.141 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 6.75e-01 -0.036 0.0857 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 1.30e-01 0.111 0.0727 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0365 0.117 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0113 0.0883 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0483 0.116 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 4.56e-01 -0.107 0.144 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 6.60e-01 0.0515 0.117 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0581 0.0748 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 2.07e-02 -0.304 0.131 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 3.87e-02 -0.273 0.131 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 1.29e-01 -0.197 0.129 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 1.39e-01 0.228 0.153 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -471876 sc-eQTL 3.13e-01 -0.118 0.116 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 311609 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0831 0.0763 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -920428 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0604 0.105 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -984492 sc-eQTL 6.40e-01 0.0477 0.102 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 311882 sc-eQTL 2.28e-01 -0.137 0.113 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 314541 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00394 0.112 0.082 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000205056 LINC02397 -8996 eQTL 0.000721 -0.101 0.0298 0.0 0.0 0.0849

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina