logo

Genes within 1Mb (chr12:92457127:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00954 0.0711 0.13 B L1
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 8.88e-01 0.00805 0.057 0.13 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 8.70e-01 0.013 0.0794 0.13 B L1
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 4.97e-02 -0.137 0.0694 0.13 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 -245716 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0558 0.0789 0.13 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 -9324 sc-eQTL 4.50e-03 0.152 0.0529 0.13 B L1
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 9.01e-01 0.00964 0.0775 0.13 B L1
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 3.72e-01 0.0654 0.0731 0.13 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 -542091 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0563 0.109 0.13 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 93295 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0349 0.107 0.13 B L1
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 9.95e-01 0.000461 0.0736 0.13 CD4T L1
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 8.04e-01 0.0178 0.0716 0.13 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0369 0.0706 0.13 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0114 0.0656 0.13 CD4T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 6.03e-02 0.183 0.0971 0.13 CD4T L1
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00551 0.0914 0.13 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 2.84e-01 0.0879 0.0819 0.13 CD8T L1
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 3.00e-01 0.0715 0.0689 0.13 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 2.18e-01 0.0834 0.0675 0.13 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0824 0.0841 0.13 CD8T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 5.65e-01 0.0517 0.0898 0.13 CD8T L1
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 5.90e-01 0.0501 0.0927 0.13 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00586 0.109 0.131 DC L1
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 1.73e-01 0.16 0.117 0.131 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 4.76e-01 0.0781 0.109 0.131 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 5.03e-01 0.074 0.11 0.131 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 -9324 sc-eQTL 7.35e-01 0.0381 0.112 0.131 DC L1
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0994 0.127 0.131 DC L1
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0685 0.122 0.131 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 93295 sc-eQTL 8.23e-01 0.0259 0.116 0.131 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0455 0.0651 0.13 Mono L1
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 9.27e-01 0.00508 0.0551 0.13 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 5.03e-01 0.0632 0.0943 0.13 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0122 0.0708 0.13 Mono L1
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 2.74e-01 0.0982 0.0895 0.13 Mono L1
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 5.96e-01 0.0586 0.11 0.13 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 4.55e-01 0.0678 0.0907 0.131 NK L1
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 2.60e-01 0.0723 0.064 0.131 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 3.62e-01 0.0751 0.0822 0.131 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 6.86e-01 0.033 0.0814 0.131 NK L1
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 1.44e-02 0.217 0.0879 0.131 NK L1
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 9.85e-01 0.00171 0.0887 0.131 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0652 0.116 0.13 Other_T L1
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 8.78e-01 0.00816 0.0533 0.13 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 3.76e-02 -0.18 0.0862 0.13 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0267 0.0807 0.13 Other_T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 4.47e-01 0.0859 0.113 0.13 Other_T L1
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 5.19e-01 0.0684 0.106 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 9.81e-01 0.00318 0.136 0.13 B_Activated L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0553 0.071 0.13 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 9.83e-01 -0.0025 0.12 0.13 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 1.94e-01 0.193 0.148 0.13 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 -245716 sc-eQTL 2.57e-01 -0.142 0.125 0.13 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 -9324 sc-eQTL 8.83e-02 0.222 0.13 0.13 B_Activated L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 8.38e-01 0.0284 0.139 0.13 B_Activated L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 1.44e-01 0.157 0.107 0.13 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 -542091 sc-eQTL 2.47e-01 0.162 0.139 0.13 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 93295 sc-eQTL 8.64e-01 0.0199 0.116 0.13 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 9.68e-01 0.00439 0.108 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0077 0.069 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 8.72e-01 0.0171 0.106 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0435 0.108 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 -245716 sc-eQTL 7.31e-01 0.0412 0.119 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 -9324 sc-eQTL 1.40e-01 0.13 0.0879 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 8.21e-01 -0.022 0.0969 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 4.87e-01 0.0661 0.095 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 -542091 sc-eQTL 3.51e-01 -0.121 0.129 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 93295 sc-eQTL 6.38e-02 -0.23 0.123 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 3.69e-01 0.0997 0.111 0.129 B_Memory L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 7.56e-01 0.0199 0.064 0.129 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0318 0.0978 0.129 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 7.44e-01 0.0286 0.0875 0.129 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 -245716 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0425 0.111 0.129 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 -9324 sc-eQTL 2.96e-02 0.234 0.107 0.129 B_Memory L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00093 0.114 0.129 B_Memory L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 2.41e-01 -0.119 0.102 0.129 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 -542091 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0118 0.13 0.129 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 93295 sc-eQTL 1.20e-01 -0.189 0.121 0.129 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 9.69e-01 0.00399 0.103 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 2.00e-01 0.0828 0.0644 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0669 0.0959 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 1.30e-02 -0.255 0.102 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -245716 sc-eQTL 5.69e-01 -0.065 0.114 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 -9324 sc-eQTL 1.63e-02 0.166 0.0686 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 3.53e-01 0.0869 0.0932 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00236 0.0927 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -542091 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0616 0.126 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 93295 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0215 0.114 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 1.04e-01 -0.202 0.123 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0689 0.0623 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 2.94e-01 0.112 0.107 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0111 0.105 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -245716 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0603 0.0907 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 -9324 sc-eQTL 3.10e-02 0.14 0.0644 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 8.20e-02 -0.178 0.102 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 1.89e-01 0.129 0.098 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -542091 sc-eQTL 1.61e-01 0.182 0.13 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 93295 sc-eQTL 8.92e-01 0.0166 0.122 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0771 0.126 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 9.16e-01 0.00874 0.083 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 4.84e-01 0.0842 0.12 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 1.80e-01 -0.165 0.122 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 8.58e-01 0.0233 0.13 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 6.66e-01 0.0508 0.118 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 5.23e-01 0.0492 0.077 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 9.29e-01 0.00643 0.0721 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00337 0.0739 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0334 0.0709 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 6.10e-02 0.183 0.0969 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00559 0.0939 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 2.04e-01 0.135 0.106 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 2.09e-01 0.0858 0.0681 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0397 0.0833 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 8.52e-01 -0.015 0.0802 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 2.80e-01 0.111 0.102 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00924 0.0883 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 6.14e-02 -0.227 0.121 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 8.32e-01 0.0178 0.0841 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0792 0.104 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0166 0.107 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 2.50e-01 -0.142 0.123 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 9.83e-01 0.00251 0.119 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 3.78e-01 0.0974 0.11 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 3.26e-01 0.0689 0.07 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 2.10e-01 0.123 0.0976 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 3.54e-01 -0.105 0.113 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 9.33e-01 0.00963 0.115 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 6.23e-01 0.0512 0.104 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 1.35e-01 0.152 0.101 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 4.85e-01 0.0614 0.0879 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 5.30e-01 0.0564 0.0896 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 8.37e-01 0.0202 0.0979 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 3.06e-01 -0.112 0.109 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0325 0.111 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 5.33e-01 0.0822 0.132 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00144 0.0927 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 3.87e-01 0.0925 0.107 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0371 0.127 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 1.71e-02 0.303 0.126 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0185 0.128 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0365 0.135 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0192 0.0929 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 8.94e-01 0.0172 0.129 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0596 0.123 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 1.48e-01 0.199 0.137 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 8.49e-02 0.219 0.126 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0836 0.128 0.13 MAIT L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0184 0.0799 0.13 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0292 0.0989 0.13 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 8.50e-01 -0.023 0.121 0.13 MAIT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 4.43e-01 0.0925 0.12 0.13 MAIT L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0178 0.117 0.13 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 1.78e-01 -0.167 0.123 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 3.17e-01 0.085 0.0847 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 1.72e-01 -0.166 0.121 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 4.33e-01 -0.101 0.129 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 1.80e-01 0.161 0.119 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0617 0.124 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 9.13e-01 0.0118 0.108 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 2.13e-01 0.0813 0.0651 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 4.46e-01 -0.073 0.0956 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 6.21e-01 0.0455 0.0919 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 1.21e-02 0.273 0.108 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0155 0.102 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 5.00e-01 -0.085 0.126 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 5.36e-01 0.0534 0.0861 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 8.00e-01 0.0295 0.116 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 2.72e-01 -0.143 0.13 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 6.56e-02 0.243 0.131 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00846 0.117 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 4.54e-01 0.0838 0.112 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 3.44e-01 0.0647 0.0682 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 5.95e-03 0.26 0.0934 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 3.40e-01 0.104 0.109 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 6.66e-02 0.186 0.101 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 5.85e-01 0.0564 0.103 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 9.82e-02 0.271 0.162 0.137 PB L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0171 0.0812 0.137 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 8.35e-01 0.0277 0.132 0.137 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 4.98e-01 0.0791 0.116 0.137 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 -245716 sc-eQTL 1.68e-01 -0.226 0.163 0.137 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 -9324 sc-eQTL 2.05e-01 -0.16 0.126 0.137 PB L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 4.32e-02 -0.282 0.138 0.137 PB L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0291 0.153 0.137 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 -542091 sc-eQTL 2.53e-01 -0.177 0.154 0.137 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 93295 sc-eQTL 1.50e-01 -0.223 0.154 0.137 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0711 0.131 0.133 Pro_T L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 9.55e-01 0.00305 0.0535 0.133 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 3.86e-02 -0.208 0.1 0.133 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 4.22e-01 0.0748 0.0929 0.133 Pro_T L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 5.70e-01 0.0681 0.12 0.133 Pro_T L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 3.84e-01 0.0968 0.111 0.133 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 8.56e-01 0.0208 0.115 0.13 Treg L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 7.71e-01 0.0275 0.0944 0.13 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0474 0.0975 0.13 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 3.20e-01 -0.105 0.105 0.13 Treg L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 1.70e-02 0.28 0.117 0.13 Treg L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 9.49e-01 0.0084 0.13 0.13 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 3.49e-01 -0.111 0.118 0.127 cDC L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 3.56e-01 -0.097 0.105 0.127 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 2.80e-01 0.148 0.136 0.127 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 9.79e-01 0.00321 0.119 0.127 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 -9324 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0529 0.083 0.127 cDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0436 0.135 0.127 cDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 7.83e-01 0.0347 0.126 0.127 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 93295 sc-eQTL 1.04e-01 0.198 0.121 0.127 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 7.51e-01 0.0238 0.075 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 6.35e-01 0.0296 0.0622 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 1.61e-01 0.134 0.0956 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 6.81e-01 -0.031 0.0753 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 4.56e-01 0.073 0.0977 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 4.53e-01 0.09 0.12 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0483 0.0964 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0852 0.0716 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0734 0.111 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0861 0.0963 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 3.09e-01 0.106 0.104 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 8.12e-01 0.0298 0.125 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0414 0.148 0.148 gdT L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00728 0.079 0.148 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 2.41e-01 -0.157 0.133 0.148 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 4.00e-01 -0.124 0.146 0.148 gdT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00973 0.127 0.148 gdT L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 7.22e-01 0.0478 0.134 0.148 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 4.83e-01 -0.08 0.114 0.136 intMono L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0569 0.0719 0.136 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 7.66e-01 0.0346 0.116 0.136 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 9.66e-03 0.285 0.109 0.136 intMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 7.60e-01 0.0349 0.114 0.136 intMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0636 0.118 0.136 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 6.36e-02 -0.184 0.0985 0.136 ncMono L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 8.40e-01 0.0139 0.0689 0.136 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00929 0.113 0.136 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 3.59e-01 -0.101 0.11 0.136 ncMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 3.54e-02 0.229 0.108 0.136 ncMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 9.32e-01 0.0099 0.115 0.136 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0503 0.14 0.136 pDC L2
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 2.25e-01 0.166 0.136 0.136 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 9.64e-01 0.00537 0.117 0.136 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 5.62e-01 0.0808 0.139 0.136 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 -9324 sc-eQTL 6.64e-01 0.0549 0.126 0.136 pDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 5.80e-01 -0.071 0.128 0.136 pDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 1.04e-01 -0.194 0.119 0.136 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 93295 sc-eQTL 1.26e-01 -0.156 0.101 0.136 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 4.98e-01 0.0619 0.0912 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 8.86e-01 -0.00869 0.0604 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0207 0.0821 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00705 0.0748 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -245716 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0425 0.0964 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 -9324 sc-eQTL 4.40e-02 0.17 0.084 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 9.98e-01 0.000231 0.0881 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 3.81e-01 0.0739 0.0842 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -542091 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0262 0.127 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 93295 sc-eQTL 9.69e-02 -0.213 0.127 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0905 0.0999 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 3.76e-01 0.0506 0.0571 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00744 0.0946 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 3.23e-02 -0.207 0.096 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -245716 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0379 0.118 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 -9324 sc-eQTL 9.60e-03 0.145 0.0556 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 8.80e-01 0.013 0.0862 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 8.61e-01 0.0147 0.0839 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -542091 sc-eQTL 5.70e-01 0.0698 0.123 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 93295 sc-eQTL 6.04e-01 0.059 0.114 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 9.89e-01 -0.000967 0.0697 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 8.11e-01 0.0142 0.0594 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 4.74e-01 0.0683 0.0952 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0646 0.0716 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 3.77e-01 0.083 0.0938 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 4.20e-01 0.0944 0.117 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 5.84e-02 -0.174 0.0915 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0265 0.0591 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 5.46e-01 0.063 0.104 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 5.08e-01 0.0693 0.104 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 1.49e-01 0.148 0.102 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0532 0.122 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -472204 sc-eQTL 3.27e-01 0.0912 0.0928 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 311281 sc-eQTL 2.46e-01 0.0708 0.0608 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -920756 sc-eQTL 1.60e-01 0.118 0.0838 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N -984820 sc-eQTL 6.24e-01 0.0399 0.0814 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 311554 sc-eQTL 4.93e-03 0.253 0.0891 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 314213 sc-eQTL 8.68e-01 0.0149 0.0893 0.131 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000205056 LINC02397 -9324 eQTL 2.33e-14 0.188 0.0243 0.00384 0.0213 0.138

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000205056 LINC02397 -9324 2.73e-05 2.73e-05 4.47e-06 1.33e-05 4e-06 1.12e-05 3.36e-05 3.72e-06 2.12e-05 1.13e-05 2.99e-05 1.23e-05 3.88e-05 1.15e-05 5.98e-06 1.34e-05 1.32e-05 1.97e-05 6.32e-06 5.63e-06 1.13e-05 2.52e-05 2.49e-05 6.97e-06 3.39e-05 6.14e-06 1.01e-05 9.35e-06 2.47e-05 2.21e-05 1.46e-05 1.61e-06 2.29e-06 5.89e-06 9.11e-06 4.55e-06 2.42e-06 2.98e-06 3.71e-06 2.86e-06 1.64e-06 3.18e-05 3.13e-06 2.03e-07 2.06e-06 2.98e-06 3.59e-06 1.4e-06 1.3e-06
ENSG00000277851 \N 93295 4.7e-06 4.7e-06 5.15e-07 1.92e-06 8.63e-07 1.19e-06 2.62e-06 8.83e-07 2.78e-06 1.6e-06 4.34e-06 2.85e-06 6.58e-06 1.66e-06 1.02e-06 2.42e-06 1.72e-06 2.38e-06 1.53e-06 1.26e-06 1.99e-06 4.26e-06 3.47e-06 1.66e-06 4.68e-06 1.29e-06 2.15e-06 1.48e-06 3.55e-06 3.11e-06 2.05e-06 3.45e-07 6.64e-07 1.36e-06 1.82e-06 9.53e-07 8.91e-07 3.61e-07 1.11e-06 3.8e-07 1.67e-07 4.93e-06 3.83e-07 1.41e-07 3.65e-07 3.6e-07 8.3e-07 2.07e-07 2.04e-07