logo

Genes within 1Mb (chr12:92441142:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 3.64e-01 0.0512 0.0563 0.265 B L1
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0361 0.0452 0.265 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 2.11e-02 -0.144 0.0622 0.265 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 -261701 sc-eQTL 6.45e-01 0.0289 0.0627 0.265 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 -25309 sc-eQTL 3.26e-03 0.125 0.0419 0.265 B L1
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 4.70e-01 0.0444 0.0614 0.265 B L1
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0182 0.0581 0.265 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 -558076 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0572 0.0862 0.265 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 77310 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0884 0.0844 0.265 B L1
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 9.61e-01 0.00278 0.0575 0.265 CD4T L1
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0177 0.0559 0.265 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0239 0.0552 0.265 CD4T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 5.04e-01 0.0511 0.0764 0.265 CD4T L1
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0681 0.0713 0.265 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 5.27e-01 0.0413 0.0651 0.265 CD8T L1
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0671 0.0546 0.265 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0126 0.0537 0.265 CD8T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00868 0.0713 0.265 CD8T L1
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 2.32e-01 -0.088 0.0734 0.265 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 4.66e-01 0.0633 0.0867 0.266 DC L1
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 3.68e-01 0.0842 0.0934 0.266 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0426 0.087 0.266 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 -25309 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0336 0.0892 0.266 DC L1
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 3.42e-01 0.0965 0.101 0.266 DC L1
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0337 0.0972 0.266 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 77310 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0238 0.0919 0.266 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 6.70e-03 0.139 0.0508 0.265 Mono L1
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0232 0.0437 0.265 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0379 0.0749 0.265 Mono L1
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 5.82e-01 0.0393 0.0712 0.265 Mono L1
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 9.22e-01 0.00862 0.0875 0.265 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00695 0.0723 0.266 NK L1
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0542 0.051 0.266 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 1.12e-01 -0.104 0.0651 0.266 NK L1
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0204 0.0709 0.266 NK L1
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 8.48e-02 -0.121 0.0701 0.266 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 1.59e-01 0.13 0.0917 0.265 Other_T L1
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0242 0.0423 0.265 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 6.55e-01 0.0309 0.0691 0.265 Other_T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0555 0.0896 0.265 Other_T L1
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 9.46e-01 0.00572 0.0843 0.265 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 6.42e-01 0.0498 0.107 0.258 B_Activated L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00138 0.056 0.258 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 1.26e-01 0.144 0.0935 0.258 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 -261701 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0809 0.0986 0.258 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 -25309 sc-eQTL 6.34e-01 -0.049 0.103 0.258 B_Activated L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 4.15e-01 0.089 0.109 0.258 B_Activated L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 4.21e-01 0.0683 0.0847 0.258 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 -558076 sc-eQTL 3.10e-01 -0.112 0.11 0.258 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 77310 sc-eQTL 1.04e-01 0.148 0.0905 0.258 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 2.23e-01 0.105 0.0859 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0514 0.055 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 1.08e-01 -0.136 0.0841 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 -261701 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0264 0.0954 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 -25309 sc-eQTL 5.84e-01 0.0386 0.0705 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 1.62e-01 -0.108 0.077 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 6.51e-01 0.0344 0.0759 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 -558076 sc-eQTL 1.50e-01 -0.149 0.103 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 77310 sc-eQTL 9.40e-01 0.00743 0.0994 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 5.99e-02 0.167 0.0881 0.265 B_Memory L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0189 0.0513 0.265 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0612 0.0783 0.265 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 -261701 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0588 0.0892 0.265 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 -25309 sc-eQTL 7.36e-01 0.0292 0.0867 0.265 B_Memory L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 3.46e-01 0.0859 0.0909 0.265 B_Memory L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00435 0.0816 0.265 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 -558076 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0263 0.104 0.265 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 77310 sc-eQTL 3.46e-02 -0.206 0.0968 0.265 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 4.19e-01 0.0667 0.0825 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0541 0.0517 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0835 0.0769 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -261701 sc-eQTL 6.47e-01 0.0419 0.0915 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 -25309 sc-eQTL 2.66e-02 0.123 0.0551 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0308 0.0749 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0774 0.0742 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -558076 sc-eQTL 7.13e-01 0.0374 0.101 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 77310 sc-eQTL 9.70e-01 0.00341 0.0914 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0784 0.099 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00269 0.0499 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 1.84e-01 -0.113 0.085 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -261701 sc-eQTL 1.71e-01 -0.0992 0.0722 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 -25309 sc-eQTL 7.62e-02 0.092 0.0516 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 1.91e-01 0.107 0.0817 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 6.84e-01 -0.032 0.0785 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -558076 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0262 0.104 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 77310 sc-eQTL 9.50e-01 0.00615 0.0972 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 3.41e-01 0.098 0.103 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 3.90e-01 0.0582 0.0675 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 4.63e-01 0.0721 0.098 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 1.17e-01 0.166 0.105 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0797 0.0958 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00614 0.0607 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0113 0.0568 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0204 0.0581 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 5.78e-01 0.0428 0.0768 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0646 0.0737 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 8.97e-01 0.0109 0.084 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0439 0.0538 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0158 0.0657 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 7.10e-01 0.03 0.0808 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0574 0.0695 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 5.14e-01 0.0637 0.0975 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00135 0.0675 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 5.30e-01 0.0527 0.0838 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0759 0.099 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 5.63e-01 0.0551 0.0951 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 9.17e-01 0.00923 0.0884 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0504 0.0561 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 3.39e-01 0.075 0.0782 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0299 0.0922 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0939 0.083 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 7.15e-01 0.0296 0.0809 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 8.56e-01 0.0127 0.07 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 4.50e-01 -0.054 0.0713 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 1.45e-01 0.126 0.0864 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0292 0.0883 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 3.67e-02 0.221 0.105 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 9.24e-01 0.00712 0.0749 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 1.69e-01 -0.118 0.0859 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0499 0.103 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 4.91e-01 -0.071 0.103 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 4.22e-01 0.0844 0.105 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 2.01e-01 0.0926 0.0721 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 2.02e-01 0.128 0.0998 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 7.39e-01 0.0358 0.107 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0843 0.099 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 3.17e-01 0.102 0.102 0.264 MAIT L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0429 0.0638 0.264 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 3.56e-01 0.0729 0.0789 0.264 MAIT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 2.67e-01 -0.107 0.096 0.264 MAIT L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 2.14e-01 0.116 0.0927 0.264 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 3.13e-01 0.0986 0.0974 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0583 0.0669 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 1.16e-01 -0.151 0.0956 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0053 0.0947 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0431 0.0975 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 5.94e-01 0.0454 0.085 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0275 0.0515 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0654 0.0754 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0475 0.0865 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 3.68e-02 -0.168 0.0798 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0131 0.101 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0559 0.0692 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 8.09e-01 0.0227 0.0936 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 3.43e-01 -0.101 0.106 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 8.15e-01 0.0221 0.0941 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 6.35e-01 0.0422 0.0888 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0611 0.0541 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00881 0.0755 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0149 0.0808 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00364 0.0819 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 3.03e-01 -0.131 0.127 0.259 PB L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 4.45e-01 0.048 0.0627 0.259 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0215 0.102 0.259 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 -261701 sc-eQTL 7.10e-01 0.0473 0.127 0.259 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 -25309 sc-eQTL 7.64e-01 0.0295 0.098 0.259 PB L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 2.72e-01 0.119 0.108 0.259 PB L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 6.50e-01 0.0539 0.118 0.259 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 -558076 sc-eQTL 9.37e-01 0.00957 0.12 0.259 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 77310 sc-eQTL 6.97e-01 0.0467 0.12 0.259 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 4.36e-01 0.0797 0.102 0.265 Pro_T L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 4.03e-01 -0.035 0.0418 0.265 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0167 0.0791 0.265 Pro_T L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 8.88e-01 0.0132 0.0937 0.265 Pro_T L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 1.74e-01 -0.118 0.0866 0.265 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 8.61e-02 0.154 0.0893 0.265 Treg L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0359 0.0739 0.265 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0293 0.0764 0.265 Treg L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0299 0.0926 0.265 Treg L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 1.42e-01 -0.15 0.102 0.265 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 4.90e-02 0.179 0.0902 0.276 cDC L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 4.90e-01 0.0559 0.0808 0.276 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 7.69e-01 0.031 0.105 0.276 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 -25309 sc-eQTL 1.20e-01 -0.0992 0.0636 0.276 cDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 5.68e-01 0.0595 0.104 0.276 cDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 2.17e-01 -0.12 0.0966 0.276 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 77310 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0868 0.0938 0.276 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 2.55e-02 0.131 0.0584 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00401 0.0491 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0232 0.0757 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 2.49e-01 0.0889 0.0769 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 6.82e-01 0.0388 0.0944 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 3.90e-01 0.0659 0.0765 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 6.33e-01 0.0273 0.057 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0415 0.088 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 3.20e-01 0.0819 0.0822 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 9.27e-01 0.0091 0.0995 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0649 0.129 0.248 gdT L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 2.25e-01 0.0833 0.0684 0.248 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 2.85e-01 -0.125 0.116 0.248 gdT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 2.71e-01 0.122 0.11 0.248 gdT L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 5.59e-01 0.0682 0.116 0.248 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00357 0.0919 0.264 intMono L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 7.30e-01 0.02 0.058 0.264 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0655 0.0937 0.264 intMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 5.72e-01 -0.052 0.0918 0.264 intMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 7.59e-01 0.0293 0.0953 0.264 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 4.70e-02 0.158 0.0788 0.274 ncMono L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 1.18e-01 0.086 0.0548 0.274 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0613 0.0907 0.274 ncMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 2.15e-01 0.109 0.0873 0.274 ncMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0486 0.0923 0.274 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0155 0.11 0.28 pDC L2
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 1.17e-01 0.169 0.107 0.28 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0127 0.0927 0.28 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 -25309 sc-eQTL 1.00e+00 -1.69e-05 0.0996 0.28 pDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 5.66e-02 0.192 0.1 0.28 pDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 1.43e-01 0.138 0.0939 0.28 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 77310 sc-eQTL 6.68e-01 0.0347 0.0806 0.28 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 1.51e-02 0.173 0.0706 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 6.89e-01 0.019 0.0474 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0558 0.0643 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -261701 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0252 0.0756 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 -25309 sc-eQTL 1.09e-01 0.106 0.0661 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 9.47e-01 0.00462 0.069 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 6.86e-01 0.0267 0.0661 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -558076 sc-eQTL 1.88e-01 -0.131 0.0992 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 77310 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0934 0.1 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0125 0.0801 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0309 0.0457 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 9.41e-02 -0.127 0.0752 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -261701 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0176 0.0948 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 -25309 sc-eQTL 2.10e-03 0.138 0.0442 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 5.84e-01 0.0378 0.0689 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0544 0.067 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -558076 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0493 0.0982 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 77310 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0224 0.091 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 7.53e-03 0.145 0.0538 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 9.92e-01 0.00048 0.0467 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0177 0.0749 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 3.16e-01 0.0741 0.0737 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 6.61e-01 0.0404 0.0918 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 1.45e-01 0.107 0.073 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 3.84e-01 0.041 0.047 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0718 0.0829 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 4.91e-01 0.0563 0.0816 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0228 0.0967 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -488189 sc-eQTL 9.24e-01 0.00709 0.074 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 295296 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0596 0.0484 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -936741 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0814 0.0667 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 295569 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0454 0.0722 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 298228 sc-eQTL 1.13e-01 -0.112 0.0707 0.265 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000205056 LINC02397 -25309 eQTL 0.0112 0.0509 0.02 0.0 0.0 0.232
ENSG00000257345 LINC02413 -558076 eQTL 0.0521 -0.087 0.0447 0.00119 0.0 0.232

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000205056 LINC02397 -25309 2.34e-05 2.22e-05 3.55e-06 1.24e-05 3.42e-06 8.57e-06 2.83e-05 3.5e-06 1.94e-05 9.85e-06 2.51e-05 1.07e-05 3.19e-05 8.55e-06 5.99e-06 1.15e-05 1.08e-05 1.75e-05 5.66e-06 4.38e-06 9.08e-06 2.08e-05 2.19e-05 5.93e-06 3.26e-05 5.77e-06 8.23e-06 8.05e-06 2.16e-05 1.68e-05 1.29e-05 1.56e-06 1.87e-06 5.21e-06 8.76e-06 4.43e-06 2.02e-06 2.76e-06 3.74e-06 2.18e-06 1.63e-06 2.57e-05 2.67e-06 2.96e-07 1.59e-06 2.96e-06 3.33e-06 1.36e-06 9.75e-07