Genes within 1Mb (chr12:92405683:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0904 0.0933 0.075 B L1
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 3.97e-02 -0.154 0.0742 0.075 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 1.65e-01 -0.145 0.104 0.075 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 -297160 sc-eQTL 1.66e-01 -0.144 0.103 0.075 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 -60768 sc-eQTL 3.55e-02 0.148 0.0701 0.075 B L1
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 9.61e-02 -0.169 0.101 0.075 B L1
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 3.33e-01 0.0932 0.096 0.075 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 -593535 sc-eQTL 6.96e-01 -0.056 0.143 0.075 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 41851 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0204 0.14 0.075 B L1
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0133 0.0959 0.075 CD4T L1
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 8.00e-01 0.0236 0.0933 0.075 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0238 0.092 0.075 CD4T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 7.87e-01 0.0345 0.128 0.075 CD4T L1
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 2.34e-01 -0.142 0.119 0.075 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 1.74e-02 0.255 0.106 0.075 CD8T L1
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 2.58e-01 -0.102 0.0903 0.075 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0132 0.0888 0.075 CD8T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 8.78e-01 0.0181 0.118 0.075 CD8T L1
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 3.22e-01 -0.121 0.121 0.075 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 9.09e-01 0.0158 0.139 0.079 DC L1
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 7.57e-02 -0.265 0.148 0.079 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0566 0.139 0.079 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 -60768 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0214 0.143 0.079 DC L1
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 1.09e-01 -0.259 0.161 0.079 DC L1
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 7.53e-03 -0.412 0.153 0.079 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 41851 sc-eQTL 7.85e-02 -0.258 0.146 0.079 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 1.48e-02 0.202 0.0824 0.075 Mono L1
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0667 0.0706 0.075 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0427 0.121 0.075 Mono L1
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0297 0.115 0.075 Mono L1
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 9.12e-01 0.0157 0.142 0.075 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 3.66e-01 0.107 0.118 0.075 NK L1
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 1.35e-01 -0.125 0.0834 0.075 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 2.45e-01 -0.125 0.107 0.075 NK L1
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 3.28e-02 -0.247 0.115 0.075 NK L1
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 2.39e-01 -0.136 0.115 0.075 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 6.99e-02 0.282 0.155 0.075 Other_T L1
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0451 0.0716 0.075 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 2.74e-01 -0.128 0.117 0.075 Other_T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 4.14e-01 -0.124 0.151 0.075 Other_T L1
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 2.79e-01 -0.154 0.142 0.075 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0593 0.207 0.059 B_Activated L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 5.65e-02 -0.206 0.107 0.059 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0244 0.182 0.059 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 -297160 sc-eQTL 6.33e-01 0.0912 0.191 0.059 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 -60768 sc-eQTL 7.12e-01 0.0734 0.199 0.059 B_Activated L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 5.74e-01 0.119 0.211 0.059 B_Activated L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0839 0.164 0.059 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 -593535 sc-eQTL 2.46e-01 -0.246 0.212 0.059 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 41851 sc-eQTL 4.11e-01 -0.145 0.176 0.059 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0421 0.145 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0845 0.0929 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 3.38e-01 -0.137 0.142 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 -297160 sc-eQTL 2.51e-01 -0.185 0.161 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 -60768 sc-eQTL 1.36e-01 0.177 0.118 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 4.04e-01 -0.109 0.13 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0823 0.128 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 -593535 sc-eQTL 8.66e-01 0.0295 0.175 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 41851 sc-eQTL 9.23e-01 0.0163 0.168 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 4.41e-01 0.117 0.152 0.075 B_Memory L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0804 0.0875 0.075 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 1.68e-01 -0.185 0.133 0.075 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 -297160 sc-eQTL 4.26e-01 -0.121 0.152 0.075 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 -60768 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0122 0.148 0.075 B_Memory L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 2.86e-01 -0.166 0.155 0.075 B_Memory L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 3.85e-01 -0.121 0.139 0.075 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 -593535 sc-eQTL 4.59e-01 -0.132 0.178 0.075 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 41851 sc-eQTL 7.97e-01 0.043 0.167 0.075 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 3.55e-01 -0.125 0.135 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 1.40e-01 -0.125 0.0843 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0188 0.126 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -297160 sc-eQTL 3.85e-01 0.13 0.149 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 -60768 sc-eQTL 1.62e-01 0.127 0.0907 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 5.34e-02 -0.236 0.121 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 4.31e-01 0.0958 0.121 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -593535 sc-eQTL 5.23e-01 -0.106 0.166 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 41851 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0822 0.149 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 7.76e-03 -0.436 0.162 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0977 0.0826 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 9.05e-02 -0.24 0.141 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -297160 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0134 0.12 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 -60768 sc-eQTL 1.20e-02 0.216 0.0852 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0791 0.136 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0438 0.131 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -593535 sc-eQTL 8.19e-01 0.0396 0.173 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 41851 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0196 0.161 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 1.35e-01 0.261 0.174 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0979 0.115 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 7.38e-01 0.056 0.167 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 7.10e-01 0.0672 0.181 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0651 0.163 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0301 0.101 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 8.91e-01 0.013 0.0945 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 9.89e-01 0.00136 0.0967 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 9.42e-01 0.00932 0.128 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 1.12e-01 -0.195 0.122 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 1.17e-01 0.22 0.14 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 1.84e-01 0.12 0.0897 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 3.47e-01 -0.104 0.11 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 9.23e-01 0.0131 0.135 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 8.27e-01 0.0255 0.116 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 7.84e-01 0.0445 0.162 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 1.22e-01 -0.173 0.112 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 9.49e-01 -0.009 0.139 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 8.75e-01 -0.026 0.165 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 4.12e-02 -0.322 0.157 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 3.00e-01 0.149 0.143 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 2.11e-01 -0.114 0.0909 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0427 0.127 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 7.25e-01 0.0527 0.15 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 6.05e-01 -0.07 0.135 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 1.06e-03 0.436 0.131 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 7.90e-01 0.031 0.117 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0666 0.119 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 1.96e-01 0.187 0.144 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 3.35e-01 -0.142 0.147 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 5.54e-01 -0.11 0.185 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 3.91e-01 -0.112 0.13 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0954 0.15 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 5.71e-01 -0.102 0.179 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 8.08e-02 -0.312 0.178 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 4.93e-01 -0.118 0.172 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 7.56e-01 0.0369 0.118 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 8.11e-01 0.0392 0.164 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 1.63e-01 0.245 0.175 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 8.58e-01 -0.029 0.162 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 1.13e-01 0.271 0.17 0.076 MAIT L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 2.03e-01 -0.136 0.106 0.076 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 1.99e-01 -0.17 0.132 0.076 MAIT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 5.01e-01 0.108 0.161 0.076 MAIT L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00157 0.156 0.076 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 6.41e-01 0.0753 0.161 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 8.08e-02 -0.193 0.11 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 6.15e-01 -0.08 0.159 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 3.58e-02 -0.327 0.155 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 8.58e-01 -0.029 0.161 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 1.95e-01 0.182 0.14 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0736 0.0849 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0329 0.125 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 9.85e-01 0.00277 0.143 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 2.09e-01 -0.167 0.133 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0391 0.17 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0974 0.116 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 1.24e-01 -0.241 0.156 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0649 0.179 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 3.75e-01 -0.14 0.158 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 3.20e-01 -0.146 0.147 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 1.70e-01 -0.123 0.0892 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0368 0.125 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 2.88e-01 -0.142 0.133 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 4.00e-01 -0.114 0.135 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 1.56e-01 0.275 0.193 0.081 PB L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 7.97e-02 -0.168 0.0947 0.081 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00196 0.156 0.081 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 -297160 sc-eQTL 3.90e-01 0.167 0.193 0.081 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 -60768 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0798 0.15 0.081 PB L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 2.39e-01 -0.195 0.165 0.081 PB L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 7.30e-01 0.0626 0.181 0.081 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 -593535 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0377 0.183 0.081 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 41851 sc-eQTL 8.39e-02 -0.315 0.181 0.081 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 8.48e-01 0.0333 0.173 0.076 Pro_T L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 2.71e-02 -0.156 0.0701 0.076 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 8.74e-01 0.0213 0.134 0.076 Pro_T L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 8.28e-02 -0.275 0.158 0.076 Pro_T L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 2.87e-01 -0.157 0.147 0.076 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 2.67e-01 -0.166 0.149 0.075 Treg L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0892 0.123 0.075 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 7.57e-01 0.0394 0.127 0.075 Treg L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 4.85e-01 0.108 0.154 0.075 Treg L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0672 0.17 0.075 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 2.96e-01 -0.156 0.148 0.078 cDC L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 3.52e-01 -0.123 0.132 0.078 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 4.19e-01 -0.139 0.172 0.078 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 -60768 sc-eQTL 7.43e-01 0.0343 0.104 0.078 cDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 4.27e-01 -0.135 0.17 0.078 cDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 8.00e-03 -0.416 0.155 0.078 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 41851 sc-eQTL 1.06e-01 -0.247 0.152 0.078 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 3.06e-02 0.21 0.0965 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0246 0.081 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 6.41e-01 0.0583 0.125 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0704 0.127 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 9.59e-01 0.00802 0.156 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 1.08e-01 0.2 0.124 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0407 0.0927 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 1.12e-01 -0.227 0.142 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0785 0.134 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0822 0.162 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0728 0.229 0.07 gdT L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 2.18e-03 -0.368 0.118 0.07 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 1.36e-01 -0.308 0.205 0.07 gdT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0982 0.197 0.07 gdT L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 2.10e-01 -0.259 0.206 0.07 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 6.79e-01 0.0619 0.149 0.076 intMono L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0532 0.0942 0.076 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 4.70e-01 0.11 0.152 0.076 intMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 4.20e-01 -0.121 0.149 0.076 intMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0417 0.155 0.076 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0234 0.13 0.075 ncMono L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 3.37e-03 -0.262 0.0883 0.075 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 6.44e-01 0.0688 0.149 0.075 ncMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0712 0.143 0.075 ncMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 4.65e-01 -0.111 0.151 0.075 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 4.13e-01 0.145 0.177 0.085 pDC L2
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 3.29e-02 -0.368 0.171 0.085 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 7.63e-01 0.045 0.149 0.085 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 -60768 sc-eQTL 4.55e-01 0.12 0.16 0.085 pDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 4.67e-01 -0.118 0.162 0.085 pDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 1.71e-01 -0.207 0.151 0.085 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 41851 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0491 0.129 0.085 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 9.53e-01 0.0072 0.121 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0627 0.0803 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 1.12e-01 -0.173 0.109 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -297160 sc-eQTL 2.39e-01 -0.151 0.128 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 -60768 sc-eQTL 2.37e-01 0.133 0.112 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0772 0.117 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 9.27e-01 0.0102 0.112 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -593535 sc-eQTL 2.11e-01 -0.211 0.168 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 41851 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0679 0.171 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 7.41e-02 -0.235 0.131 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0938 0.075 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 3.82e-01 -0.109 0.124 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -297160 sc-eQTL 2.12e-01 0.195 0.155 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 -60768 sc-eQTL 8.54e-02 0.128 0.0738 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 2.53e-02 -0.253 0.112 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 5.78e-01 0.0615 0.11 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -593535 sc-eQTL 7.91e-01 0.043 0.162 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 41851 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0568 0.15 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 1.26e-02 0.223 0.0888 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0129 0.0768 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0826 0.123 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0543 0.121 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0306 0.151 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0427 0.119 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 1.11e-02 -0.193 0.0751 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 7.25e-01 0.0474 0.135 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0886 0.132 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0459 0.157 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -523648 sc-eQTL 5.21e-01 0.0781 0.122 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 259837 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0829 0.0796 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -972200 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0914 0.11 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 260110 sc-eQTL 2.73e-01 -0.13 0.118 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 262769 sc-eQTL 1.97e-01 -0.151 0.116 0.075 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000257345 LINC02413 -593535 eQTL 0.0032 -0.207 0.0699 0.00541 0.00218 0.081


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000257242 \N 262769 7.87e-07 4.93e-07 1.12e-07 3.71e-07 1.05e-07 2.12e-07 5.54e-07 1.38e-07 3.62e-07 2.14e-07 5.29e-07 3.36e-07 6.98e-07 1.17e-07 1.26e-07 2.08e-07 1.69e-07 3.04e-07 2.17e-07 2.02e-07 1.91e-07 2.99e-07 3.03e-07 1.76e-07 7.94e-07 2.4e-07 3.1e-07 2.44e-07 2.76e-07 4.51e-07 2.6e-07 3.31e-08 5.19e-08 1.5e-07 3.37e-07 1.36e-07 1.82e-07 1.06e-07 8.52e-08 2.28e-08 2.11e-07 4.42e-07 4.71e-08 8.08e-08 1.48e-07 1.75e-08 7.36e-08 5.79e-08 6.26e-08