Genes within 1Mb (chr12:92399981:CA:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 1.00e+00 -3.06e-05 0.0806 0.12 B L1
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 5.03e-01 0.0433 0.0646 0.12 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0868 0.0897 0.12 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 -302862 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0686 0.0894 0.12 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 -66470 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0196 0.0611 0.12 B L1
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 1.18e-01 0.137 0.0873 0.12 B L1
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 1.32e-01 -0.125 0.0825 0.12 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 -599237 sc-eQTL 8.47e-01 0.0238 0.123 0.12 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 36149 sc-eQTL 1.97e-01 0.156 0.12 0.12 B L1
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0273 0.0829 0.12 CD4T L1
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0612 0.0806 0.12 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 4.73e-01 0.0572 0.0795 0.12 CD4T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 2.65e-01 -0.123 0.11 0.12 CD4T L1
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 1.32e-02 -0.254 0.102 0.12 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 5.37e-01 0.0572 0.0924 0.12 CD8T L1
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 4.64e-01 -0.057 0.0777 0.12 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 3.27e-01 0.0748 0.0761 0.12 CD8T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0787 0.101 0.12 CD8T L1
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 6.11e-02 -0.195 0.104 0.12 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0319 0.12 0.126 DC L1
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 1.50e-01 0.187 0.129 0.126 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 5.24e-01 -0.077 0.121 0.126 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 -66470 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00501 0.124 0.126 DC L1
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 6.65e-01 -0.061 0.141 0.126 DC L1
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 2.89e-01 0.143 0.134 0.126 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 36149 sc-eQTL 7.02e-01 0.0488 0.127 0.126 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 6.19e-01 0.0365 0.0733 0.12 Mono L1
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 5.26e-02 0.12 0.0615 0.12 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 8.19e-02 -0.184 0.106 0.12 Mono L1
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 8.99e-02 0.171 0.1 0.12 Mono L1
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 1.78e-01 0.167 0.124 0.12 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0639 0.103 0.12 NK L1
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0534 0.0725 0.12 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0126 0.093 0.12 NK L1
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 7.67e-01 0.0299 0.101 0.12 NK L1
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 6.01e-01 0.0525 0.1 0.12 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0948 0.132 0.12 Other_T L1
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 3.51e-02 -0.127 0.0599 0.12 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 4.33e-03 0.28 0.097 0.12 Other_T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0917 0.128 0.12 Other_T L1
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0759 0.12 0.12 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 3.94e-02 -0.31 0.149 0.12 B_Activated L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0204 0.079 0.12 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 6.66e-01 0.0574 0.133 0.12 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 -302862 sc-eQTL 5.78e-01 0.0776 0.139 0.12 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 -66470 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0832 0.145 0.12 B_Activated L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0777 0.154 0.12 B_Activated L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0914 0.12 0.12 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 -599237 sc-eQTL 4.60e-01 -0.115 0.155 0.12 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 36149 sc-eQTL 3.61e-01 0.118 0.128 0.12 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 9.04e-01 0.0146 0.121 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0421 0.0774 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0539 0.119 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 -302862 sc-eQTL 6.17e-01 -0.067 0.134 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 -66470 sc-eQTL 4.81e-01 0.0699 0.099 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0649 0.109 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 8.81e-01 -0.016 0.107 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 -599237 sc-eQTL 1.07e-01 0.234 0.145 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 36149 sc-eQTL 8.65e-01 0.0238 0.14 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 2.39e-01 -0.147 0.124 0.121 B_Memory L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00484 0.0718 0.121 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0471 0.11 0.121 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 -302862 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0262 0.125 0.121 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 -66470 sc-eQTL 2.96e-01 -0.127 0.121 0.121 B_Memory L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 4.55e-01 0.0954 0.127 0.121 B_Memory L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 4.80e-01 0.0808 0.114 0.121 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 -599237 sc-eQTL 8.42e-01 0.0292 0.146 0.121 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 36149 sc-eQTL 7.33e-01 0.0467 0.137 0.121 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 7.12e-02 0.211 0.116 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 4.17e-01 0.0596 0.0734 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0973 0.109 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -302862 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0418 0.13 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 -66470 sc-eQTL 8.31e-01 0.0168 0.079 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 2.82e-01 0.114 0.106 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 1.87e-01 -0.139 0.105 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -599237 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0639 0.144 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 36149 sc-eQTL 2.63e-01 0.145 0.129 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0072 0.14 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 3.29e-01 0.0688 0.0704 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 2.16e-01 -0.149 0.12 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -302862 sc-eQTL 3.24e-01 -0.101 0.102 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 -66470 sc-eQTL 9.47e-03 -0.19 0.0724 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 4.44e-01 0.0889 0.116 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 8.88e-01 0.0156 0.111 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -599237 sc-eQTL 3.33e-01 0.142 0.147 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 36149 sc-eQTL 3.62e-01 0.125 0.137 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 7.64e-01 0.0437 0.146 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 3.37e-01 0.0919 0.0955 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 4.23e-01 0.111 0.139 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 4.11e-01 -0.123 0.15 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 7.15e-01 0.0497 0.136 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0496 0.0871 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0572 0.0815 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 6.59e-01 0.0369 0.0835 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0782 0.11 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 4.37e-02 -0.213 0.105 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 6.56e-02 -0.223 0.121 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0253 0.078 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0237 0.0952 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 3.49e-01 -0.109 0.117 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 1.34e-02 -0.248 0.0994 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 1.85e-01 0.183 0.138 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0709 0.0955 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 5.85e-01 0.065 0.119 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0847 0.14 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 5.33e-02 -0.26 0.134 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0975 0.123 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 3.88e-02 -0.161 0.0775 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 5.80e-01 0.0605 0.109 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 7.20e-01 0.0461 0.128 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 6.79e-01 -0.048 0.116 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 5.23e-01 0.0732 0.115 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 7.62e-01 0.0301 0.0993 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 5.18e-01 0.0655 0.101 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 9.30e-01 0.0108 0.123 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0761 0.125 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 7.25e-01 0.0525 0.149 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0697 0.105 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0517 0.121 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 4.17e-04 -0.503 0.14 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0965 0.144 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0945 0.153 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00933 0.106 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 4.24e-02 0.296 0.145 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 1.84e-01 0.208 0.156 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 1.35e-01 -0.216 0.144 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0707 0.148 0.119 MAIT L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0622 0.0926 0.119 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 5.37e-02 0.221 0.114 0.119 MAIT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 1.28e-01 -0.212 0.139 0.119 MAIT L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0628 0.135 0.119 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 5.05e-01 0.095 0.142 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0218 0.0975 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 7.10e-01 -0.052 0.14 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 2.58e-01 0.156 0.137 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 1.92e-01 0.185 0.141 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0858 0.123 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0752 0.0742 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 4.02e-01 0.0914 0.109 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 5.18e-01 0.0808 0.125 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 6.94e-01 0.0458 0.116 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 1.75e-02 -0.34 0.142 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 7.92e-02 -0.173 0.0978 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 2.11e-01 -0.166 0.133 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0272 0.152 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 8.20e-01 0.0305 0.134 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0773 0.125 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0345 0.0765 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 6.01e-01 0.0558 0.106 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 8.67e-01 0.0191 0.114 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0721 0.116 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000673 0.189 0.115 PB L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 9.53e-01 0.00547 0.0932 0.115 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 6.79e-01 0.0629 0.152 0.115 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 -302862 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00563 0.188 0.115 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 -66470 sc-eQTL 4.85e-01 0.102 0.145 0.115 PB L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 1.25e-01 0.247 0.16 0.115 PB L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0277 0.176 0.115 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 -599237 sc-eQTL 2.66e-02 -0.392 0.174 0.115 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 36149 sc-eQTL 9.90e-01 0.00223 0.178 0.115 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 4.59e-01 -0.111 0.149 0.12 Pro_T L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 1.58e-01 -0.0862 0.0608 0.12 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 4.86e-01 0.0805 0.115 0.12 Pro_T L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 3.15e-01 0.137 0.136 0.12 Pro_T L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 2.58e-01 -0.144 0.127 0.12 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0196 0.128 0.12 Treg L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 7.34e-02 -0.188 0.105 0.12 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 6.84e-01 0.0444 0.109 0.12 Treg L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 3.48e-01 -0.124 0.132 0.12 Treg L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 4.25e-02 -0.294 0.144 0.12 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0828 0.13 0.124 cDC L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 4.26e-01 0.0921 0.115 0.124 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00131 0.151 0.124 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 -66470 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0535 0.0914 0.124 cDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 5.01e-01 -0.1 0.149 0.124 cDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 1.52e-01 0.199 0.138 0.124 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 36149 sc-eQTL 9.24e-01 0.0129 0.134 0.124 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 7.97e-01 0.0219 0.085 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 9.30e-02 0.118 0.0702 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0942 0.109 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 2.38e-01 0.131 0.111 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 4.96e-01 0.0926 0.136 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0514 0.109 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 2.84e-02 0.177 0.0802 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 4.27e-02 -0.253 0.124 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 3.35e-01 0.113 0.117 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 2.37e-01 0.167 0.141 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 3.79e-01 -0.157 0.178 0.133 gdT L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0138 0.0951 0.133 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 7.08e-01 0.0604 0.161 0.133 gdT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0179 0.153 0.133 gdT L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 9.30e-01 0.0142 0.161 0.133 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0761 0.133 0.118 intMono L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 6.45e-01 0.0389 0.0842 0.118 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0122 0.136 0.118 intMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 5.03e-01 0.0895 0.133 0.118 intMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0771 0.138 0.118 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0231 0.113 0.124 ncMono L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 8.99e-01 -0.01 0.0785 0.124 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00123 0.129 0.124 ncMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0247 0.125 0.124 ncMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 2.05e-02 -0.303 0.13 0.124 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 8.24e-01 0.0347 0.156 0.13 pDC L2
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 2.94e-01 0.161 0.153 0.13 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0435 0.131 0.13 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 -66470 sc-eQTL 9.92e-01 0.00135 0.141 0.13 pDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 9.32e-01 0.0123 0.143 0.13 pDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 4.21e-01 -0.108 0.134 0.13 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 36149 sc-eQTL 3.47e-01 0.108 0.114 0.13 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 2.58e-01 -0.115 0.101 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0249 0.0674 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000922 0.0916 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -302862 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000674 0.108 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 -66470 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0282 0.0946 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00635 0.0982 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0684 0.0939 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -599237 sc-eQTL 4.56e-01 0.106 0.141 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 36149 sc-eQTL 6.83e-01 0.0584 0.143 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 2.21e-01 0.139 0.113 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 2.96e-01 0.0679 0.0648 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 2.72e-01 -0.118 0.107 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -302862 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0998 0.135 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 -66470 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0821 0.0639 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 9.74e-02 0.162 0.0973 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 2.30e-01 -0.115 0.095 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -599237 sc-eQTL 9.47e-01 0.00929 0.14 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 36149 sc-eQTL 1.82e-01 0.173 0.129 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 8.00e-01 -0.02 0.0787 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 6.28e-02 0.125 0.0666 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 1.29e-01 -0.163 0.107 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 1.54e-01 0.151 0.106 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 1.77e-01 0.178 0.132 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 5.86e-01 0.0578 0.106 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 6.13e-01 0.0344 0.068 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0654 0.12 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 9.76e-01 0.00356 0.118 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 1.93e-01 -0.182 0.139 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -529350 sc-eQTL 2.54e-01 -0.121 0.106 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 254135 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0319 0.0694 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 sc-eQTL 6.44e-01 0.0443 0.0958 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 254408 sc-eQTL 7.04e-01 0.0393 0.103 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 257067 sc-eQTL 7.08e-01 0.0381 0.102 0.121 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 eQTL 0.0183 0.0627 0.0265 0.00292 0.0 0.138
ENSG00000257322 AC138123.1 -815698 eQTL 0.0337 0.0768 0.0361 0.0 0.0 0.138


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000173598 NUDT4 -977902 6.33e-07 1.27e-07 3.69e-08 1.83e-07 9.65e-08 8.45e-08 1.73e-07 5.33e-08 1.45e-07 4.57e-08 1.66e-07 8.36e-08 1.41e-07 6.21e-08 5.44e-08 7.26e-08 4.94e-08 1.14e-07 5.21e-08 3.74e-08 1.05e-07 1.27e-07 1.34e-07 4.67e-08 1.33e-07 1.15e-07 1.1e-07 9.15e-08 1.12e-07 1.58e-07 9.7e-08 3.19e-08 2.74e-08 8.55e-08 8.94e-08 3.94e-08 4.75e-08 8.28e-08 8.42e-08 3.74e-08 3.58e-08 1.5e-07 5.22e-08 1.53e-08 1.01e-07 1.74e-08 1.25e-07 4.82e-09 4.72e-08
ENSG00000277851 \N 36149 0.00013 3.3e-05 1.82e-06 1.13e-05 2.96e-06 1.26e-05 2.91e-05 2.43e-06 1.74e-05 6.01e-06 2.68e-05 7.98e-06 2.99e-05 4.48e-06 3.21e-06 8.94e-06 1.12e-05 1.21e-05 4.19e-06 3.2e-06 6.66e-06 1.35e-05 1.69e-05 5.15e-06 2.58e-05 6.43e-06 4.8e-06 5.28e-06 2.3e-05 2.45e-05 1.28e-05 5.26e-07 1.88e-06 4.07e-06 8.64e-06 5.51e-06 1.72e-06 2.03e-06 2.06e-06 7.28e-07 1.03e-06 2.55e-05 4.23e-06 4.33e-07 7.6e-07 1.67e-06 3.11e-06 7.04e-07 4.23e-07