Genes within 1Mb (chr12:92399901:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 6.95e-01 0.0217 0.0553 0.284 B L1
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0106 0.0444 0.284 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 9.24e-01 0.00588 0.0618 0.284 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 -302942 sc-eQTL 5.77e-01 0.0343 0.0614 0.284 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 -66550 sc-eQTL 4.42e-01 0.0323 0.0419 0.284 B L1
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 1.33e-01 -0.0905 0.06 0.284 B L1
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0597 0.0568 0.284 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 -599317 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0843 0.0844 0.284 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 36069 sc-eQTL 5.15e-02 -0.161 0.0823 0.284 B L1
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 6.37e-01 0.0273 0.0578 0.284 CD4T L1
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 9.25e-01 0.00532 0.0563 0.284 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 9.29e-01 0.00496 0.0555 0.284 CD4T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 1.80e-01 -0.103 0.0766 0.284 CD4T L1
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0773 0.0716 0.284 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 6.74e-02 0.116 0.0631 0.284 CD8T L1
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0092 0.0534 0.284 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 5.68e-01 -0.03 0.0524 0.284 CD8T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0802 0.0693 0.284 CD8T L1
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 4.70e-01 -0.052 0.0718 0.284 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0532 0.0874 0.295 DC L1
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0723 0.0942 0.295 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 8.15e-01 0.0205 0.0877 0.295 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 -66550 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00215 0.0899 0.295 DC L1
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 2.73e-01 -0.112 0.102 0.295 DC L1
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0831 0.0977 0.295 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 36069 sc-eQTL 1.65e-01 -0.128 0.0922 0.295 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 4.26e-01 0.0404 0.0508 0.284 Mono L1
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 2.75e-04 -0.154 0.0417 0.284 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 2.39e-01 0.0868 0.0734 0.284 Mono L1
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 4.45e-02 -0.14 0.0694 0.284 Mono L1
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 1.37e-01 -0.128 0.0857 0.284 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 2.90e-01 0.0754 0.0711 0.285 NK L1
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0521 0.0503 0.285 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 7.00e-01 0.0249 0.0646 0.285 NK L1
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 1.88e-02 -0.163 0.0691 0.285 NK L1
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 2.39e-02 -0.157 0.0688 0.285 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 4.50e-01 0.0703 0.0929 0.284 Other_T L1
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 8.70e-01 0.00701 0.0428 0.284 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0908 0.0696 0.284 Other_T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 6.10e-02 -0.169 0.0898 0.284 Other_T L1
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0769 0.0849 0.284 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00329 0.107 0.273 B_Activated L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 8.88e-01 -0.00795 0.0562 0.273 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 2.55e-01 0.107 0.0942 0.273 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 -302942 sc-eQTL 3.01e-01 0.103 0.0988 0.273 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 -66550 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0964 0.103 0.273 B_Activated L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 1.66e-01 -0.151 0.109 0.273 B_Activated L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0564 0.0851 0.273 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 -599317 sc-eQTL 1.60e-01 0.155 0.11 0.273 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 36069 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0756 0.0914 0.273 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00325 0.0868 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 7.88e-01 -0.015 0.0555 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00855 0.0852 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 -302942 sc-eQTL 2.96e-01 0.1 0.0959 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 -66550 sc-eQTL 3.02e-01 0.0734 0.0709 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0327 0.0779 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0696 0.0763 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 -599317 sc-eQTL 3.97e-01 0.0883 0.104 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 36069 sc-eQTL 6.53e-01 -0.045 0.1 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 4.93e-01 0.0607 0.0884 0.284 B_Memory L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 7.22e-01 0.0182 0.0511 0.284 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0539 0.0779 0.284 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 -302942 sc-eQTL 5.64e-01 0.0514 0.0888 0.284 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 -66550 sc-eQTL 4.30e-01 0.0681 0.0862 0.284 B_Memory L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0681 0.0906 0.284 B_Memory L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0582 0.0811 0.284 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 -599317 sc-eQTL 2.54e-02 -0.23 0.102 0.284 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 36069 sc-eQTL 3.34e-01 0.0941 0.0971 0.284 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0731 0.082 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 5.40e-01 0.0316 0.0515 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 3.67e-01 0.0692 0.0765 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -302942 sc-eQTL 1.76e-01 0.123 0.0907 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 -66550 sc-eQTL 4.17e-01 0.0451 0.0554 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0302 0.0745 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0572 0.0739 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -599317 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0189 0.101 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 36069 sc-eQTL 7.34e-03 -0.242 0.0894 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0278 0.0985 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00332 0.0495 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0435 0.0847 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -302942 sc-eQTL 4.77e-01 0.0512 0.0719 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 -66550 sc-eQTL 2.20e-01 0.0634 0.0515 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0447 0.0814 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0258 0.078 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -599317 sc-eQTL 2.52e-01 -0.118 0.103 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 36069 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0699 0.0964 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 3.88e-03 0.287 0.0983 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 1.10e-01 -0.105 0.0656 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 9.62e-02 0.159 0.0951 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 2.76e-01 -0.113 0.103 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 1.89e-01 -0.123 0.0933 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 8.44e-01 0.0119 0.0601 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 8.99e-01 0.00712 0.0563 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0158 0.0576 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0873 0.076 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 3.54e-01 -0.068 0.0731 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 4.48e-01 0.0648 0.0851 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 6.77e-01 0.0228 0.0547 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 2.03e-01 -0.0849 0.0665 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 1.36e-01 -0.122 0.0816 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0299 0.0707 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 9.05e-01 0.0114 0.0956 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 6.40e-01 -0.031 0.0661 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0268 0.0821 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0881 0.0968 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 6.21e-02 -0.173 0.0924 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 6.99e-02 0.153 0.084 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0388 0.0537 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0479 0.075 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 2.41e-01 -0.103 0.088 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 6.83e-02 -0.145 0.0791 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 5.46e-01 0.0477 0.0789 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 8.88e-01 0.00966 0.0684 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0735 0.0695 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 4.58e-01 -0.063 0.0847 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0894 0.086 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 3.40e-01 -0.103 0.108 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0883 0.0759 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 6.99e-01 -0.034 0.0877 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 6.83e-01 0.043 0.105 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0577 0.105 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 3.11e-01 0.108 0.106 0.295 CD8_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 1.74e-01 -0.0996 0.0729 0.295 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0843 0.101 0.295 CD8_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00505 0.109 0.295 CD8_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 4.53e-01 0.0753 0.1 0.295 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 2.00e-01 0.133 0.103 0.288 MAIT L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0541 0.0646 0.288 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 1.50e-01 -0.115 0.0797 0.288 MAIT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 5.77e-02 -0.185 0.0967 0.288 MAIT L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0801 0.0941 0.288 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 4.85e-01 0.068 0.0973 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 9.40e-02 -0.112 0.0663 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 7.90e-01 0.0255 0.0959 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 5.40e-02 -0.181 0.0935 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 9.92e-01 0.001 0.0973 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 6.60e-02 0.155 0.0839 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0423 0.0512 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 2.91e-01 0.0793 0.075 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0942 0.0859 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 1.34e-01 -0.12 0.0798 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 1.22e-01 0.156 0.1 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0153 0.0692 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 7.07e-01 0.0351 0.0933 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0269 0.106 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 8.66e-01 0.0159 0.0939 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 9.84e-02 -0.148 0.0889 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 3.32e-01 -0.053 0.0545 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0328 0.076 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 6.89e-02 -0.147 0.0807 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 3.70e-02 -0.171 0.0816 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 9.95e-01 0.000705 0.112 0.281 PB L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0201 0.0551 0.281 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0726 0.0896 0.281 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 -302942 sc-eQTL 2.33e-01 0.133 0.111 0.281 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 -66550 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0215 0.086 0.281 PB L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 4.98e-02 -0.186 0.0939 0.281 PB L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 1.08e-01 0.167 0.103 0.281 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 -599317 sc-eQTL 7.31e-01 0.0363 0.105 0.281 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 36069 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00314 0.105 0.281 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 2.66e-01 -0.115 0.103 0.285 Pro_T L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0472 0.042 0.285 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0494 0.0795 0.285 Pro_T L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 1.97e-01 -0.122 0.094 0.285 Pro_T L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 1.00e+00 -4.91e-06 0.0876 0.285 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 8.14e-01 0.0215 0.091 0.284 Treg L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0744 0.0746 0.284 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00695 0.0773 0.284 Treg L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 6.62e-01 0.0409 0.0936 0.284 Treg L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 3.29e-01 -0.101 0.103 0.284 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 1.28e-01 -0.146 0.0952 0.295 cDC L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0778 0.0848 0.295 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 1.27e-01 0.169 0.11 0.295 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 -66550 sc-eQTL 2.86e-01 0.0716 0.067 0.295 cDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0646 0.109 0.295 cDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 1.11e-01 -0.162 0.101 0.295 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 36069 sc-eQTL 1.07e-01 -0.159 0.0981 0.295 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 6.75e-01 0.0248 0.0589 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 1.08e-03 -0.158 0.0477 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 1.62e-01 0.105 0.0752 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 1.42e-01 -0.113 0.0765 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 3.29e-02 -0.2 0.0932 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0306 0.0758 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 2.54e-02 -0.126 0.0558 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00116 0.0872 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 8.35e-02 -0.141 0.0811 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0887 0.0983 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0687 0.142 0.276 gdT L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 3.03e-02 -0.163 0.0743 0.276 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0592 0.128 0.276 gdT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 8.25e-03 -0.319 0.119 0.276 gdT L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 1.08e-01 -0.206 0.127 0.276 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 1.62e-01 0.128 0.0914 0.287 intMono L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 1.85e-01 -0.0767 0.0577 0.287 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 7.49e-01 0.03 0.0937 0.287 intMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 9.80e-01 0.00226 0.0918 0.287 intMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00502 0.0953 0.287 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 4.12e-01 0.0655 0.0796 0.287 ncMono L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 6.38e-02 -0.102 0.0548 0.287 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 9.34e-01 0.00759 0.091 0.287 ncMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0761 0.0877 0.287 ncMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 3.81e-01 0.0811 0.0924 0.287 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 9.11e-01 0.0138 0.123 0.302 pDC L2
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 3.15e-01 -0.121 0.12 0.302 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0192 0.103 0.302 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 -66550 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0195 0.111 0.302 pDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 9.22e-01 0.0111 0.113 0.302 pDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0441 0.105 0.302 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 36069 sc-eQTL 6.51e-01 0.0407 0.09 0.302 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0174 0.0719 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0345 0.0475 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0547 0.0645 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -302942 sc-eQTL 3.75e-01 0.0674 0.0758 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 -66550 sc-eQTL 8.59e-01 0.0118 0.0668 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0683 0.0692 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0531 0.0663 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -599317 sc-eQTL 3.63e-01 -0.091 0.0998 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 36069 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0172 0.101 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0331 0.0799 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 5.75e-01 0.0256 0.0456 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 7.32e-01 0.0259 0.0756 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -302942 sc-eQTL 1.44e-01 0.138 0.0942 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 -66550 sc-eQTL 2.00e-01 0.0578 0.0449 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0808 0.0686 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0929 0.0667 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -599317 sc-eQTL 9.98e-01 0.000231 0.0981 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 36069 sc-eQTL 1.31e-02 -0.224 0.0896 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 6.55e-01 0.0243 0.0544 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 2.28e-03 -0.14 0.0454 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 1.92e-01 0.0971 0.0741 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 6.84e-02 -0.133 0.0728 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 1.86e-02 -0.214 0.0901 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 5.13e-01 0.0483 0.0736 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 1.92e-02 -0.11 0.0467 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 5.59e-01 0.0488 0.0833 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0659 0.0819 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 6.20e-01 0.0482 0.0971 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -529430 sc-eQTL 2.89e-01 0.0778 0.0732 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 254055 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0306 0.0481 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -977982 sc-eQTL 5.19e-01 0.0429 0.0663 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 254328 sc-eQTL 9.62e-02 -0.119 0.0711 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 256987 sc-eQTL 2.59e-02 -0.156 0.0696 0.287 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000277851 LINC02391 36069 eQTL 0.00783 0.107 0.0403 0.0 0.0 0.273


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina