Genes within 1Mb (chr12:92398956:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 4.84e-01 0.0408 0.0582 0.254 B L1
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0216 0.0467 0.254 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 4.42e-01 0.0499 0.0649 0.254 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 -303887 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0305 0.0646 0.254 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 -67495 sc-eQTL 4.92e-01 0.0303 0.0441 0.254 B L1
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 1.55e-01 -0.0902 0.0631 0.254 B L1
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0509 0.0598 0.254 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 -600262 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0638 0.0889 0.254 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 35124 sc-eQTL 6.67e-02 -0.16 0.0867 0.254 B L1
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 5.89e-01 0.0329 0.0609 0.254 CD4T L1
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 8.55e-01 0.0109 0.0593 0.254 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 8.42e-01 0.0117 0.0585 0.254 CD4T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0791 0.0809 0.254 CD4T L1
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0503 0.0756 0.254 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 6.85e-02 0.122 0.0668 0.254 CD8T L1
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00354 0.0566 0.254 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0118 0.0555 0.254 CD8T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0787 0.0735 0.254 CD8T L1
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00678 0.0761 0.254 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0552 0.091 0.264 DC L1
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 6.30e-02 -0.182 0.0973 0.264 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0572 0.0912 0.264 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 -67495 sc-eQTL 2.45e-01 -0.109 0.0933 0.264 DC L1
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0606 0.106 0.264 DC L1
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 6.98e-02 -0.184 0.101 0.264 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 35124 sc-eQTL 1.72e-01 -0.131 0.0959 0.264 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 4.48e-01 0.0407 0.0536 0.254 Mono L1
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 1.39e-02 -0.111 0.0448 0.254 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 4.10e-01 0.0641 0.0777 0.254 Mono L1
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 1.41e-01 -0.109 0.0736 0.254 Mono L1
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0615 0.0908 0.254 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 2.99e-01 0.0785 0.0754 0.255 NK L1
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 4.43e-01 -0.041 0.0534 0.255 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 7.86e-01 0.0186 0.0685 0.255 NK L1
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 2.46e-02 -0.166 0.0733 0.255 NK L1
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0955 0.0735 0.255 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 7.73e-01 0.0281 0.0969 0.254 Other_T L1
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 8.35e-01 0.00929 0.0446 0.254 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 1.55e-01 -0.103 0.0725 0.254 Other_T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 1.67e-01 -0.13 0.094 0.254 Other_T L1
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 2.14e-01 -0.11 0.0884 0.254 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 9.39e-01 0.00874 0.114 0.245 B_Activated L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0205 0.0598 0.245 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 3.97e-01 0.0854 0.1 0.245 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 -303887 sc-eQTL 3.69e-01 0.0949 0.105 0.245 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 -67495 sc-eQTL 2.76e-01 -0.12 0.109 0.245 B_Activated L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0729 0.116 0.245 B_Activated L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 5.82e-01 0.0499 0.0906 0.245 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 -600262 sc-eQTL 1.15e-01 0.185 0.117 0.245 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 35124 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0261 0.0975 0.245 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0119 0.0924 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 9.58e-01 0.00309 0.0591 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 3.49e-01 0.085 0.0905 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 -303887 sc-eQTL 2.67e-01 0.114 0.102 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 -67495 sc-eQTL 3.54e-01 0.0702 0.0755 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 9.54e-01 0.00477 0.083 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 6.42e-01 -0.038 0.0814 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 -600262 sc-eQTL 5.32e-01 0.0695 0.111 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 35124 sc-eQTL 9.38e-01 0.0083 0.107 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 3.40e-01 0.0897 0.0938 0.254 B_Memory L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 5.88e-01 0.0294 0.0542 0.254 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 9.26e-01 0.00775 0.0829 0.254 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 -303887 sc-eQTL 9.81e-01 0.00225 0.0944 0.254 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 -67495 sc-eQTL 6.39e-01 0.043 0.0916 0.254 B_Memory L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0845 0.0962 0.254 B_Memory L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 8.37e-01 0.0178 0.0863 0.254 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 -600262 sc-eQTL 8.68e-02 -0.188 0.109 0.254 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 35124 sc-eQTL 6.17e-01 0.0518 0.103 0.254 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0689 0.0859 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 6.88e-01 0.0217 0.054 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 1.37e-01 0.119 0.0799 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -303887 sc-eQTL 2.99e-01 0.099 0.0951 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 -67495 sc-eQTL 3.23e-01 0.0574 0.058 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0237 0.0781 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0885 0.0772 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -600262 sc-eQTL 7.35e-01 0.0359 0.106 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 35124 sc-eQTL 1.46e-02 -0.231 0.0939 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 9.08e-01 -0.012 0.104 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 9.43e-01 0.00373 0.0522 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 8.75e-01 0.0141 0.0894 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 -303887 sc-eQTL 4.11e-01 0.0625 0.0758 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 -67495 sc-eQTL 6.05e-01 0.0282 0.0545 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0622 0.0858 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0631 0.0822 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 -600262 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0522 0.109 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 35124 sc-eQTL 2.32e-01 -0.122 0.101 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 1.57e-03 0.331 0.103 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 1.26e-01 -0.107 0.0692 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 1.44e-01 0.147 0.1 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 1.05e-01 -0.177 0.109 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 1.27e-01 -0.15 0.0982 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 7.78e-01 0.018 0.0635 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 9.98e-01 -0.00013 0.0594 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 8.71e-01 0.00993 0.0608 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0457 0.0804 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0452 0.0773 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 9.56e-01 0.00492 0.0896 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 5.38e-01 0.0354 0.0574 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 1.69e-01 -0.0964 0.0698 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 2.13e-01 -0.107 0.0859 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 8.30e-01 0.016 0.0742 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 9.57e-01 0.00547 0.101 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00594 0.0701 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0201 0.0871 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0859 0.103 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 1.97e-01 -0.127 0.0984 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 7.62e-02 0.159 0.089 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0269 0.0569 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0517 0.0794 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0948 0.0933 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 6.70e-02 -0.154 0.0838 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 5.46e-01 0.0505 0.0835 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 8.98e-01 0.0093 0.0724 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0576 0.0737 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0712 0.0897 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0249 0.0912 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 1.31e-01 -0.171 0.113 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0905 0.0798 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 5.02e-01 -0.062 0.0921 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0368 0.11 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0777 0.11 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 8.75e-01 0.0175 0.111 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0594 0.0767 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 9.79e-01 0.00283 0.106 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 2.91e-01 0.12 0.113 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 8.28e-01 0.0228 0.105 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 1.80e-01 0.145 0.108 0.258 MAIT L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0312 0.0676 0.258 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 1.98e-01 -0.108 0.0834 0.258 MAIT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 1.53e-01 -0.145 0.102 0.258 MAIT L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0579 0.0985 0.258 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 6.47e-01 0.047 0.102 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 7.44e-02 -0.125 0.0697 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00851 0.101 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 5.90e-02 -0.187 0.0984 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 8.20e-01 0.0233 0.102 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 1.34e-02 0.219 0.0879 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0327 0.0541 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 2.53e-01 0.0907 0.079 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 2.38e-01 -0.107 0.0905 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0492 0.0846 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 4.95e-02 0.205 0.104 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00764 0.0716 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0247 0.0966 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0672 0.11 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 7.79e-01 0.0273 0.0972 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 9.65e-03 -0.241 0.0922 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0308 0.0572 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0369 0.0796 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0628 0.0851 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 5.32e-02 -0.167 0.0857 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 3.29e-01 0.12 0.123 0.237 PB L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0682 0.0605 0.237 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 1.32e-01 -0.149 0.0981 0.237 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 -303887 sc-eQTL 2.40e-01 0.144 0.122 0.237 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 -67495 sc-eQTL 8.90e-01 0.0131 0.0949 0.237 PB L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 1.43e-02 -0.255 0.103 0.237 PB L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 3.14e-01 0.116 0.114 0.237 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 -600262 sc-eQTL 8.17e-01 0.0269 0.116 0.237 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 35124 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0965 0.116 0.237 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 8.92e-02 -0.185 0.108 0.254 Pro_T L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0546 0.0445 0.254 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0626 0.0843 0.254 Pro_T L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0739 0.0998 0.254 Pro_T L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0844 0.0926 0.254 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0144 0.0958 0.254 Treg L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0704 0.0786 0.254 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0096 0.0815 0.254 Treg L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 7.59e-01 0.0303 0.0987 0.254 Treg L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0715 0.109 0.254 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 4.54e-02 -0.198 0.0981 0.263 cDC L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 1.35e-01 -0.131 0.0875 0.263 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 4.64e-01 0.0839 0.114 0.263 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 -67495 sc-eQTL 4.71e-01 0.0502 0.0695 0.263 cDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0557 0.113 0.263 cDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 2.50e-02 -0.235 0.104 0.263 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 35124 sc-eQTL 1.19e-01 -0.159 0.102 0.263 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 5.00e-01 0.0421 0.0624 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 3.21e-02 -0.111 0.0513 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 1.11e-01 0.127 0.0796 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0776 0.0814 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 1.44e-01 -0.146 0.0993 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0375 0.0806 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0658 0.0599 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 3.53e-01 -0.086 0.0925 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 7.09e-02 -0.156 0.0861 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0117 0.105 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 9.73e-01 0.00464 0.139 0.264 gdT L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 2.86e-02 -0.161 0.0728 0.264 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0615 0.125 0.264 gdT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 1.12e-02 -0.3 0.117 0.264 gdT L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 3.84e-02 -0.259 0.124 0.264 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 3.76e-01 0.0864 0.0975 0.256 intMono L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0414 0.0615 0.256 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 7.52e-01 0.0315 0.0996 0.256 intMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 5.67e-01 0.0559 0.0976 0.256 intMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 8.05e-01 0.0251 0.101 0.256 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 5.95e-01 0.0442 0.0831 0.256 ncMono L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 2.42e-02 -0.129 0.0569 0.256 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 9.33e-01 0.00801 0.0948 0.256 ncMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0886 0.0913 0.256 ncMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 7.01e-01 0.037 0.0964 0.256 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 9.12e-01 0.0138 0.124 0.274 pDC L2
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 1.33e-01 -0.182 0.121 0.274 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0253 0.104 0.274 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 -67495 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0692 0.112 0.274 pDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0115 0.114 0.274 pDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0914 0.106 0.274 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 35124 sc-eQTL 5.18e-01 0.0589 0.0908 0.274 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 9.85e-01 0.00144 0.0762 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0237 0.0504 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 7.05e-01 0.026 0.0685 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -303887 sc-eQTL 6.71e-01 0.0342 0.0805 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 -67495 sc-eQTL 6.88e-01 0.0285 0.0708 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 6.83e-01 -0.03 0.0735 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 7.51e-01 0.0224 0.0704 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -600262 sc-eQTL 3.40e-01 -0.101 0.106 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 35124 sc-eQTL 9.77e-01 0.00305 0.107 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0241 0.0834 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 7.21e-01 0.017 0.0476 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 3.08e-01 0.0805 0.0787 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 -303887 sc-eQTL 1.13e-01 0.156 0.0982 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 -67495 sc-eQTL 3.34e-01 0.0454 0.047 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0853 0.0716 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 9.48e-02 -0.117 0.0695 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 -600262 sc-eQTL 5.81e-01 0.0566 0.102 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 35124 sc-eQTL 1.08e-02 -0.24 0.0934 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 6.07e-01 0.0296 0.0576 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 8.47e-02 -0.0845 0.0488 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 3.67e-01 0.0711 0.0786 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 1.74e-01 -0.106 0.0773 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 1.64e-01 -0.134 0.0962 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 7.15e-01 0.0283 0.0774 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 2.50e-02 -0.111 0.049 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 5.85e-01 0.0478 0.0875 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0619 0.086 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 5.54e-01 0.0605 0.102 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 -530375 sc-eQTL 2.60e-01 0.0875 0.0775 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 253110 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0128 0.051 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 -978927 sc-eQTL 7.06e-01 0.0266 0.0703 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 253383 sc-eQTL 1.57e-01 -0.107 0.0755 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 256042 sc-eQTL 1.41e-01 -0.11 0.0743 0.256 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000257345 LINC02413 -600262 eQTL 0.0522 -0.0813 0.0418 0.00124 0.0 0.251
ENSG00000277851 LINC02391 35124 eQTL 0.00354 0.12 0.0409 0.0 0.0 0.251


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000277851 LINC02391 35124 0.000173 9.44e-06 1.35e-06 4e-06 1.63e-06 1.29e-05 8.6e-06 6.83e-07 4.81e-06 2.83e-06 5.78e-06 1.98e-06 1.14e-05 1.75e-06 2.07e-06 5.94e-06 2.72e-06 9.67e-06 1.5e-06 9.89e-07 4.24e-06 7.66e-06 9.02e-06 1.72e-06 1.01e-05 2.43e-06 2.24e-06 2.21e-06 6.45e-06 4.18e-06 2.81e-06 2.69e-07 5.46e-07 2.24e-06 2.56e-06 9.19e-07 9.14e-07 4.24e-07 1.3e-06 6.54e-07 3.2e-07 1.92e-05 2.67e-06 6.51e-08 6.09e-07 1.07e-06 8.86e-07 8.15e-08 5.92e-07