logo

Genes within 1Mb (chr12:91607671:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0745 0.069 0.092 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 -858780 sc-eQTL 1.96e-02 -0.152 0.0645 0.092 B L1
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 3.99e-02 -0.192 0.093 0.092 B L1
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00268 0.0888 0.092 B L1
ENSG00000277851 LINC02391 -756161 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0911 0.129 0.092 B L1
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00865 0.0863 0.092 CD4T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 7.50e-01 0.0377 0.118 0.092 CD4T L1
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 3.50e-01 0.103 0.11 0.092 CD4T L1
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0626 0.0841 0.092 CD8T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 5.03e-01 0.0734 0.109 0.092 CD8T L1
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 2.25e-01 0.137 0.113 0.092 CD8T L1
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0986 0.148 0.088 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 -858780 sc-eQTL 8.60e-02 -0.241 0.14 0.088 DC L1
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 9.97e-01 0.000616 0.16 0.088 DC L1
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 1.73e-02 -0.363 0.151 0.088 DC L1
ENSG00000277851 LINC02391 -756161 sc-eQTL 7.56e-01 0.0451 0.145 0.088 DC L1
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 6.89e-02 -0.123 0.0675 0.092 Mono L1
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 2.81e-02 -0.242 0.109 0.092 Mono L1
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0581 0.136 0.092 Mono L1
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0855 0.0779 0.092 NK L1
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 1.39e-01 -0.16 0.108 0.092 NK L1
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 9.34e-01 0.00893 0.108 0.092 NK L1
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 7.40e-01 0.0218 0.0655 0.092 Other_T L1
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 9.27e-01 0.0127 0.139 0.092 Other_T L1
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 2.30e-01 0.156 0.13 0.092 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0874 0.0897 0.087 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 -858780 sc-eQTL 6.66e-01 0.0712 0.165 0.087 B_Activated L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 3.37e-01 -0.168 0.175 0.087 B_Activated L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0596 0.136 0.087 B_Activated L2
ENSG00000277851 LINC02391 -756161 sc-eQTL 8.46e-01 0.0286 0.146 0.087 B_Activated L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 1.63e-01 -0.118 0.0842 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 -858780 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0397 0.108 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 9.42e-02 -0.198 0.118 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 5.79e-01 0.0647 0.116 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000277851 LINC02391 -756161 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0669 0.152 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0801 0.0775 0.093 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 -858780 sc-eQTL 5.89e-01 0.0711 0.131 0.093 B_Memory L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0455 0.138 0.093 B_Memory L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0247 0.124 0.093 B_Memory L2
ENSG00000277851 LINC02391 -756161 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0361 0.148 0.093 B_Memory L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 1.78e-01 -0.107 0.0793 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 -858780 sc-eQTL 1.74e-01 -0.116 0.0852 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 6.70e-02 -0.21 0.114 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 7.15e-01 0.0417 0.114 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000277851 LINC02391 -756161 sc-eQTL 7.83e-02 -0.246 0.139 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 8.93e-02 -0.13 0.0759 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 -858780 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0342 0.0797 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 1.06e-01 -0.203 0.125 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 8.31e-01 0.0257 0.12 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000277851 LINC02391 -756161 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0728 0.149 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 9.11e-01 0.0119 0.106 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 9.10e-01 0.0188 0.166 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0365 0.15 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 6.29e-01 0.0427 0.0883 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 8.99e-01 0.0152 0.12 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 3.41e-01 0.109 0.115 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 8.73e-01 0.0134 0.0838 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 6.80e-01 0.052 0.126 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 9.93e-02 0.178 0.108 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 6.36e-01 -0.049 0.103 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 3.21e-01 0.151 0.151 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 6.90e-02 0.264 0.145 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 1.32e-01 -0.129 0.0855 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 5.09e-01 0.0932 0.141 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 5.93e-01 0.0683 0.127 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0956 0.108 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 8.52e-01 0.0251 0.134 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 1.18e-01 0.212 0.135 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 9.25e-01 0.0107 0.114 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 8.18e-01 0.0362 0.157 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 3.34e-01 0.151 0.156 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 7.01e-01 0.043 0.112 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 2.55e-01 0.189 0.166 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 5.76e-01 0.0859 0.153 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 9.80e-01 -0.0025 0.0997 0.093 MAIT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 6.37e-01 0.071 0.15 0.093 MAIT L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 7.48e-02 0.258 0.144 0.093 MAIT L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0275 0.105 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 6.10e-01 0.076 0.149 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 4.53e-01 0.115 0.153 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0943 0.0793 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 1.33e-01 -0.2 0.133 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00632 0.124 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 4.94e-01 0.071 0.104 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 6.63e-02 -0.292 0.158 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 1.85e-01 -0.187 0.14 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0644 0.0824 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0772 0.123 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 8.80e-01 0.0188 0.125 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 9.91e-01 0.00109 0.102 0.085 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 -858780 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0834 0.159 0.085 PB L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 3.34e-01 0.171 0.176 0.085 PB L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 7.39e-02 0.342 0.19 0.085 PB L2
ENSG00000277851 LINC02391 -756161 sc-eQTL 5.27e-02 0.375 0.191 0.085 PB L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 1.74e-01 -0.0908 0.0665 0.091 Pro_T L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0681 0.149 0.091 Pro_T L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 1.10e-01 -0.221 0.138 0.091 Pro_T L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 4.75e-01 0.0823 0.115 0.092 Treg L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 3.13e-01 0.145 0.144 0.092 Treg L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 5.37e-01 0.0981 0.159 0.092 Treg L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 1.06e-01 -0.214 0.132 0.083 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 -858780 sc-eQTL 5.59e-02 -0.2 0.104 0.083 cDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 9.22e-01 0.0168 0.171 0.083 cDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 1.63e-01 -0.222 0.158 0.083 cDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 -756161 sc-eQTL 9.74e-01 0.00507 0.154 0.083 cDC L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0875 0.0772 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 1.33e-01 -0.183 0.121 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0881 0.149 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 1.28e-01 -0.136 0.0892 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 1.20e-01 -0.201 0.129 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 7.75e-01 0.0447 0.156 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 1.97e-01 -0.146 0.113 0.082 gdT L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 8.87e-01 0.0261 0.183 0.082 gdT L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 3.28e-01 0.188 0.191 0.082 gdT L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 2.17e-01 -0.113 0.0913 0.091 intMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0356 0.145 0.091 intMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0402 0.151 0.091 intMono L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 9.88e-01 0.00128 0.0872 0.088 ncMono L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0282 0.139 0.088 ncMono L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 2.70e-01 0.161 0.146 0.088 ncMono L2
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0667 0.182 0.076 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 -858780 sc-eQTL 1.15e-01 -0.264 0.166 0.076 pDC L2
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 4.76e-01 0.121 0.17 0.076 pDC L2
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 2.36e-01 -0.189 0.159 0.076 pDC L2
ENSG00000277851 LINC02391 -756161 sc-eQTL 1.71e-01 -0.186 0.135 0.076 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0742 0.0738 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 -858780 sc-eQTL 9.37e-01 0.00827 0.104 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 9.68e-02 -0.179 0.107 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0502 0.103 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 -756161 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0305 0.157 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0971 0.0697 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 -858780 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0884 0.0689 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 1.41e-02 -0.258 0.104 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 7.17e-01 0.0373 0.103 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000277851 LINC02391 -756161 sc-eQTL 1.11e-01 -0.222 0.138 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0893 0.0728 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 1.02e-01 -0.189 0.115 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0278 0.144 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0511 0.0747 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0705 0.13 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 5.71e-01 0.0872 0.153 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000133639 BTG1 -538175 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0788 0.074 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 sc-eQTL 8.02e-02 -0.193 0.11 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257242 LINC01619 -535243 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0252 0.109 0.093 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000245904 AC025164.1 -537902 eQTL 0.0172 0.0821 0.0344 0.00254 0.0 0.0918

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina