logo

Genes within 1Mb (chr12:90265306:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0191 0.0914 0.068 B L1
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 3.84e-01 0.108 0.124 0.068 B L1
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0518 0.128 0.068 B L1
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0115 0.133 0.068 B L1
ENSG00000258216 AC009522.1 553258 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0289 0.143 0.068 B L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 8.98e-01 0.0208 0.161 0.068 B L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 4.53e-01 0.0907 0.121 0.068 B L1
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0518 0.0916 0.068 CD4T L1
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 5.42e-01 0.084 0.138 0.068 CD4T L1
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0753 0.119 0.068 CD4T L1
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0931 0.132 0.068 CD4T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 5.26e-01 0.0958 0.151 0.068 CD4T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 2.92e-01 0.147 0.14 0.068 CD4T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 1.24e-01 0.163 0.106 0.068 CD8T L1
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 2.03e-01 0.159 0.125 0.068 CD8T L1
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 9.30e-01 0.0118 0.135 0.068 CD8T L1
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0171 0.139 0.068 CD8T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00323 0.157 0.068 CD8T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 1.34e-02 0.338 0.136 0.068 CD8T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00936 0.118 0.07 DC L1
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 3.76e-02 -0.222 0.106 0.07 DC L1
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 1.20e-01 0.265 0.169 0.07 DC L1
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0999 0.165 0.07 DC L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 3.30e-01 -0.148 0.151 0.07 DC L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0287 0.113 0.07 DC L1
ENSG00000274021 AC024909.1 914291 sc-eQTL 5.93e-01 0.0738 0.138 0.07 DC L1
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 7.05e-01 0.0249 0.0657 0.068 Mono L1
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 2.23e-01 -0.136 0.111 0.068 Mono L1
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 4.08e-01 -0.123 0.149 0.068 Mono L1
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 9.81e-01 0.00321 0.133 0.068 Mono L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 1.00e+00 -5.31e-05 0.114 0.068 Mono L1
ENSG00000274021 AC024909.1 914291 sc-eQTL 1.28e-01 -0.172 0.113 0.068 Mono L1
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 4.32e-01 0.0895 0.114 0.069 NK L1
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 6.14e-02 0.201 0.107 0.069 NK L1
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0286 0.136 0.069 NK L1
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 6.69e-01 0.0606 0.142 0.069 NK L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 4.41e-01 -0.123 0.159 0.069 NK L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 3.68e-03 0.445 0.152 0.069 NK L1
ENSG00000274021 AC024909.1 914291 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0799 0.136 0.069 NK L1
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 1.75e-01 0.186 0.137 0.068 Other_T L1
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0376 0.153 0.068 Other_T L1
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 2.42e-01 -0.161 0.137 0.068 Other_T L1
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 6.85e-01 0.0694 0.171 0.068 Other_T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 1.83e-01 0.211 0.158 0.068 Other_T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 3.43e-01 0.146 0.154 0.068 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 4.18e-01 0.131 0.162 0.077 B_Activated L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 2.43e-01 -0.185 0.158 0.077 B_Activated L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 8.59e-01 -0.033 0.185 0.077 B_Activated L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 5.72e-01 0.0931 0.164 0.077 B_Activated L2
ENSG00000258216 AC009522.1 553258 sc-eQTL 3.84e-01 0.151 0.173 0.077 B_Activated L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 5.03e-01 0.0949 0.141 0.077 B_Activated L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 1.29e-01 0.29 0.19 0.077 B_Activated L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 4.83e-01 0.102 0.145 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 5.14e-01 0.101 0.155 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 1.09e-01 -0.262 0.163 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 8.24e-01 0.0343 0.154 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000258216 AC009522.1 553258 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0807 0.147 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 5.04e-01 -0.115 0.171 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00823 0.133 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 7.59e-01 -0.037 0.12 0.069 B_Memory L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 2.56e-01 0.176 0.154 0.069 B_Memory L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 2.44e-01 -0.188 0.161 0.069 B_Memory L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 6.53e-01 0.0766 0.17 0.069 B_Memory L2
ENSG00000258216 AC009522.1 553258 sc-eQTL 4.49e-01 0.13 0.171 0.069 B_Memory L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 3.10e-01 -0.163 0.161 0.069 B_Memory L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 2.39e-01 0.168 0.142 0.069 B_Memory L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 3.59e-01 0.101 0.11 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 4.22e-01 0.107 0.133 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 1.45e-01 -0.207 0.141 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 6.18e-01 0.0715 0.143 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 553258 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0734 0.15 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 6.91e-01 0.0627 0.158 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 5.22e-01 0.0819 0.128 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 7.41e-01 0.0412 0.124 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 3.62e-01 -0.142 0.155 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 6.36e-01 0.0753 0.159 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 8.61e-01 0.0286 0.163 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 553258 sc-eQTL 5.66e-01 -0.096 0.167 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 9.55e-01 0.00927 0.165 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 3.43e-01 0.148 0.156 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 4.76e-01 -0.114 0.16 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 6.05e-01 0.0812 0.157 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 5.29e-01 -0.108 0.171 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 4.66e-01 -0.111 0.152 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 4.83e-01 0.109 0.155 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 8.79e-01 0.0269 0.177 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 7.22e-01 0.0357 0.1 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 1.34e-01 0.23 0.153 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 8.42e-01 0.0277 0.139 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00734 0.149 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 6.04e-01 0.0806 0.155 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 2.02e-01 0.17 0.133 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0154 0.107 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 9.79e-01 -0.0037 0.143 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 6.84e-01 0.0647 0.159 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0169 0.151 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0232 0.176 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 1.88e-01 0.2 0.151 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 6.42e-01 0.0599 0.129 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 4.77e-01 0.106 0.149 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 8.75e-02 -0.296 0.172 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 9.26e-01 0.0142 0.152 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 8.30e-02 -0.287 0.165 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 2.96e-01 0.166 0.158 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 1.87e-01 0.171 0.129 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 4.47e-01 0.119 0.156 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 3.52e-01 -0.146 0.157 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 7.87e-01 0.0427 0.158 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 7.32e-01 0.0543 0.158 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 7.23e-02 0.281 0.156 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 1.89e-01 0.177 0.134 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 3.02e-01 0.149 0.144 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 3.23e-01 0.157 0.159 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 9.15e-01 0.017 0.159 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0313 0.162 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 7.15e-02 0.244 0.135 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 2.73e-01 -0.166 0.151 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 2.45e-01 0.205 0.175 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 3.05e-01 0.19 0.185 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 6.69e-01 0.07 0.163 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0937 0.162 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 2.30e-01 0.21 0.174 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00268 0.168 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 2.39e-01 0.193 0.164 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0616 0.168 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 4.59e-01 -0.113 0.152 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 3.94e-01 -0.123 0.145 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 8.02e-01 0.0422 0.168 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 3.50e-02 0.296 0.139 0.069 MAIT L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 6.09e-01 0.0797 0.155 0.069 MAIT L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0322 0.162 0.069 MAIT L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 6.30e-01 0.0766 0.159 0.069 MAIT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 1.59e-01 0.223 0.158 0.069 MAIT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 3.29e-01 0.152 0.155 0.069 MAIT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0369 0.151 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0506 0.16 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 9.07e-01 0.0204 0.174 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 4.22e-01 0.144 0.179 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 4.29e-01 -0.134 0.169 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 2.44e-02 0.39 0.172 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000274021 AC024909.1 914291 sc-eQTL 9.48e-01 0.0102 0.158 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 3.93e-01 0.109 0.127 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 1.16e-01 0.185 0.117 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 3.59e-01 -0.135 0.147 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0514 0.146 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 4.81e-01 -0.121 0.171 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 1.86e-02 0.379 0.16 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000274021 AC024909.1 914291 sc-eQTL 1.95e-01 -0.186 0.143 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 1.30e-01 0.235 0.154 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 4.26e-03 0.454 0.157 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 5.47e-01 -0.109 0.181 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0241 0.16 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0116 0.156 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 1.51e-01 0.254 0.176 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000274021 AC024909.1 914291 sc-eQTL 5.98e-02 0.258 0.136 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 5.35e-01 0.0832 0.134 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 2.88e-01 0.137 0.129 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 6.23e-01 0.0762 0.155 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 1.43e-01 0.23 0.156 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 4.14e-01 0.126 0.154 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 4.16e-02 0.327 0.159 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000274021 AC024909.1 914291 sc-eQTL 3.37e-01 -0.143 0.148 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 9.75e-01 0.00582 0.183 0.056 PB L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 2.36e-01 -0.266 0.223 0.056 PB L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 3.86e-01 0.217 0.25 0.056 PB L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 3.53e-01 0.233 0.25 0.056 PB L2
ENSG00000258216 AC009522.1 553258 sc-eQTL 6.02e-01 0.119 0.227 0.056 PB L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0978 0.218 0.056 PB L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 3.84e-01 -0.196 0.224 0.056 PB L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 4.77e-01 -0.113 0.158 0.07 Pro_T L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 6.66e-01 -0.067 0.155 0.07 Pro_T L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00514 0.168 0.07 Pro_T L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0944 0.16 0.07 Pro_T L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 1.46e-02 0.342 0.139 0.07 Pro_T L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00646 0.169 0.07 Pro_T L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 2.62e-01 -0.159 0.141 0.068 Treg L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0919 0.157 0.068 Treg L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0256 0.178 0.068 Treg L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 4.91e-01 -0.114 0.165 0.068 Treg L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0141 0.156 0.068 Treg L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 1.87e-01 0.2 0.151 0.068 Treg L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 6.27e-01 -0.061 0.125 0.073 cDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 8.30e-02 -0.212 0.122 0.073 cDC L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 1.49e-01 0.268 0.185 0.073 cDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 9.07e-01 0.02 0.172 0.073 cDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 1.74e-01 -0.193 0.141 0.073 cDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 3.41e-01 -0.132 0.138 0.073 cDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 914291 sc-eQTL 4.04e-01 0.126 0.151 0.073 cDC L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0125 0.0763 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 3.48e-01 -0.11 0.117 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 3.40e-01 -0.149 0.156 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 5.49e-01 0.0857 0.143 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 5.63e-01 0.08 0.138 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000274021 AC024909.1 914291 sc-eQTL 1.47e-01 -0.176 0.121 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 4.33e-01 0.0706 0.0899 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 1.03e-01 -0.216 0.132 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 9.64e-01 0.00789 0.173 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 9.25e-01 -0.015 0.16 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 9.41e-01 0.00846 0.115 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000274021 AC024909.1 914291 sc-eQTL 3.06e-01 -0.133 0.13 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 2.14e-01 0.233 0.186 0.073 gdT L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 7.81e-01 0.0523 0.188 0.073 gdT L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 2.26e-01 -0.245 0.202 0.073 gdT L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 7.04e-01 0.0741 0.195 0.073 gdT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 1.34e-01 -0.268 0.178 0.073 gdT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 1.16e-01 0.324 0.205 0.073 gdT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 1.32e-01 -0.166 0.11 0.064 intMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 1.09e-01 -0.203 0.126 0.064 intMono L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0109 0.19 0.064 intMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 6.77e-02 -0.314 0.171 0.064 intMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 9.75e-01 0.0049 0.157 0.064 intMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 914291 sc-eQTL 3.35e-01 -0.151 0.157 0.064 intMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 8.83e-01 0.0131 0.089 0.07 ncMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 9.02e-01 0.0156 0.126 0.07 ncMono L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 2.92e-01 -0.167 0.158 0.07 ncMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 6.78e-01 0.0689 0.166 0.07 ncMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0447 0.132 0.07 ncMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 914291 sc-eQTL 1.35e-01 -0.214 0.143 0.07 ncMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0878 0.134 0.073 pDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0665 0.138 0.073 pDC L2
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0646 0.192 0.073 pDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0966 0.171 0.073 pDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 5.75e-01 0.0863 0.154 0.073 pDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 5.50e-01 0.0664 0.111 0.073 pDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 914291 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0527 0.137 0.073 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 5.49e-01 0.0671 0.112 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 6.81e-01 0.0652 0.158 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 1.21e-01 -0.237 0.153 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 6.27e-01 0.0739 0.152 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 553258 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0744 0.154 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 3.67e-01 -0.157 0.173 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 4.17e-01 0.0972 0.119 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 6.51e-01 0.0457 0.101 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 6.53e-01 0.0565 0.126 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0748 0.131 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0293 0.139 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 553258 sc-eQTL 3.79e-01 -0.133 0.151 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 9.09e-01 0.0182 0.16 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 4.63e-01 0.0891 0.121 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 6.31e-01 0.0343 0.0711 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 1.38e-01 -0.172 0.115 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 3.27e-01 -0.147 0.149 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 9.61e-01 0.0068 0.137 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 9.38e-01 0.00858 0.111 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 914291 sc-eQTL 1.26e-01 -0.174 0.113 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00385 0.0845 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0415 0.107 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0788 0.164 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 9.77e-01 0.00465 0.159 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0668 0.139 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 914291 sc-eQTL 1.89e-01 -0.179 0.136 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 556006 sc-eQTL 2.82e-01 0.12 0.111 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 912805 sc-eQTL 3.84e-02 0.223 0.107 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 739259 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0708 0.14 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 740510 sc-eQTL 7.88e-01 0.0377 0.14 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 740712 sc-eQTL 8.57e-01 -0.029 0.16 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 sc-eQTL 3.20e-03 0.449 0.15 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 914291 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0774 0.136 0.069 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000011465 DCN -917518 pQTL 0.0352 -0.0692 0.0328 0.0 0.0 0.0704
ENSG00000257594 GALNT4 740510 eQTL 0.0339 0.0806 0.0379 0.00162 0.0 0.0692
ENSG00000258302 AC025034.1 704177 eQTL 0.0475 0.0768 0.0387 0.0 0.0 0.0692
ENSG00000270344 POC1B-AS1 739652 eQTL 0.00325 0.159 0.0538 0.0 0.0 0.0692
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 eQTL 0.047 0.072 0.0362 0.0 0.0 0.0692

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000270344 POC1B-AS1 739652 2.74e-07 1.5e-07 4.98e-08 2.26e-07 9.24e-08 8.45e-08 1.67e-07 5.48e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.55e-07 8.68e-08 1.87e-07 8e-08 6.25e-08 7.49e-08 4.09e-08 1.33e-07 6.92e-08 4.92e-08 1.26e-07 1.26e-07 1.58e-07 2.91e-08 1.72e-07 1.25e-07 1.07e-07 9.74e-08 1.23e-07 1.07e-07 1.08e-07 3.93e-08 4.02e-08 8.7e-08 2.97e-08 3.28e-08 4.43e-08 8.71e-08 6.39e-08 4.24e-08 5.33e-08 1.59e-07 5.2e-08 1.88e-08 5.7e-08 1.65e-08 1.19e-07 1.88e-09 4.9e-08
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 556347 3.21e-07 3.12e-07 6.57e-08 3.57e-07 1.05e-07 1.25e-07 3.25e-07 6.2e-08 2.01e-07 1.11e-07 1.96e-07 1.37e-07 4.27e-07 1.01e-07 7.79e-08 1.06e-07 6.17e-08 2.15e-07 9.19e-08 8.31e-08 1.34e-07 2.06e-07 2.11e-07 3.41e-08 3.98e-07 1.65e-07 1.29e-07 1.44e-07 1.48e-07 1.46e-07 1.59e-07 5.46e-08 4.27e-08 1.01e-07 1.39e-07 4.6e-08 8.87e-08 6.66e-08 6.08e-08 7.89e-08 3.68e-08 3.06e-07 3.59e-08 1.08e-08 3.2e-08 8.94e-09 8.67e-08 2.23e-09 4.94e-08