Genes within 1Mb (chr12:89657770:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 4.51e-01 0.0405 0.0536 0.233 B L1
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0355 0.0727 0.233 B L1
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0995 0.0746 0.233 B L1
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0195 0.0779 0.233 B L1
ENSG00000258216 AC009522.1 -54278 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0609 0.0836 0.233 B L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0563 0.0946 0.233 B L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0575 0.0709 0.233 B L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 8.98e-01 0.00684 0.0533 0.233 CD4T L1
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0809 0.08 0.233 CD4T L1
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0226 0.0694 0.233 CD4T L1
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0466 0.0769 0.233 CD4T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0155 0.0879 0.233 CD4T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0731 0.0813 0.233 CD4T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0592 0.0641 0.233 CD8T L1
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 5.55e-01 0.0447 0.0756 0.233 CD8T L1
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00812 0.0815 0.233 CD8T L1
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0563 0.084 0.233 CD8T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 1.47e-01 0.137 0.0944 0.233 CD8T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 8.88e-02 -0.141 0.0826 0.233 CD8T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0515 0.0757 0.225 DC L1
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0823 0.0686 0.225 DC L1
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0155 0.11 0.225 DC L1
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 8.14e-01 0.025 0.106 0.225 DC L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0982 0.0972 0.225 DC L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 3.30e-02 -0.155 0.072 0.225 DC L1
ENSG00000274021 AC024909.1 306755 sc-eQTL 4.76e-02 -0.175 0.0878 0.225 DC L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 4.83e-01 0.0282 0.0401 0.233 Mono L1
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 8.49e-01 0.013 0.0681 0.233 Mono L1
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0632 0.0909 0.233 Mono L1
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 1.21e-01 0.126 0.081 0.233 Mono L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0278 0.0696 0.233 Mono L1
ENSG00000274021 AC024909.1 306755 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0567 0.0692 0.233 Mono L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0617 0.0711 0.234 NK L1
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 1.38e-01 -0.0997 0.0669 0.234 NK L1
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0479 0.085 0.234 NK L1
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 8.99e-01 0.0112 0.0886 0.234 NK L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0516 0.0998 0.234 NK L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 1.63e-02 -0.231 0.0955 0.234 NK L1
ENSG00000274021 AC024909.1 306755 sc-eQTL 1.33e-01 0.128 0.0847 0.234 NK L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0796 0.0858 0.233 Other_T L1
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0219 0.0955 0.233 Other_T L1
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0485 0.0859 0.233 Other_T L1
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0384 0.107 0.233 Other_T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 1.99e-01 -0.127 0.0986 0.233 Other_T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 2.89e-03 -0.284 0.0943 0.233 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0821 0.106 0.235 B_Activated L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 2.68e-01 -0.116 0.104 0.235 B_Activated L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 1.59e-01 -0.171 0.121 0.235 B_Activated L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 3.64e-01 0.0982 0.108 0.235 B_Activated L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -54278 sc-eQTL 3.43e-01 -0.108 0.114 0.235 B_Activated L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 4.98e-01 0.0631 0.0929 0.235 B_Activated L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 7.16e-02 -0.226 0.125 0.235 B_Activated L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 7.54e-01 0.028 0.089 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 1.22e-01 -0.147 0.0944 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 2.98e-01 0.105 0.1 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0761 0.0944 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -54278 sc-eQTL 8.70e-01 0.0149 0.0903 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0306 0.105 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 6.53e-01 0.0368 0.0816 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0412 0.0754 0.235 B_Memory L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0674 0.097 0.235 B_Memory L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0383 0.101 0.235 B_Memory L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 2.24e-01 -0.13 0.106 0.235 B_Memory L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -54278 sc-eQTL 3.35e-01 0.103 0.107 0.235 B_Memory L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 4.48e-03 0.284 0.099 0.235 B_Memory L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0428 0.0892 0.235 B_Memory L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 1.36e-01 0.098 0.0654 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0201 0.0798 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 7.72e-01 0.0247 0.0851 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000751 0.0859 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -54278 sc-eQTL 5.56e-01 -0.053 0.09 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 1.16e-01 -0.148 0.0939 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 1.28e-01 -0.116 0.076 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 2.97e-01 0.0801 0.0767 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 7.45e-01 0.0313 0.096 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 1.03e-01 -0.16 0.0976 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0556 0.101 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -54278 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0105 0.103 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 2.56e-01 0.116 0.102 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 3.57e-01 0.0891 0.0965 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 9.69e-01 0.0038 0.0974 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0313 0.0952 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 3.75e-01 0.0924 0.104 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 1.51e-01 -0.132 0.0917 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 8.71e-01 0.0153 0.0943 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 5.85e-01 0.0587 0.107 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 4.04e-01 0.0488 0.0584 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 6.56e-01 -0.04 0.0896 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 5.79e-01 -0.045 0.081 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 9.63e-01 -0.004 0.0869 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0213 0.0904 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0335 0.0775 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0118 0.0631 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0759 0.0843 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 5.29e-01 0.0589 0.0935 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 8.42e-02 -0.153 0.0883 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 5.18e-01 0.0673 0.104 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 2.01e-01 -0.115 0.0894 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 7.23e-01 0.0286 0.0804 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0961 0.0929 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0904 0.108 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0408 0.0947 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0526 0.103 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 2.53e-01 -0.113 0.0987 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 2.50e-02 -0.176 0.0779 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 3.31e-01 0.0927 0.0951 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 3.05e-01 0.0982 0.0956 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 9.64e-01 0.00434 0.096 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 4.34e-02 0.194 0.0956 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 7.67e-02 -0.169 0.095 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 1.58e-01 -0.115 0.0812 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0154 0.0874 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0491 0.0962 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0819 0.096 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 7.24e-01 0.0347 0.0982 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 2.18e-01 -0.101 0.0817 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 4.44e-01 0.0674 0.088 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 1.59e-02 -0.245 0.101 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0288 0.108 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 2.25e-01 0.115 0.0945 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 4.85e-01 0.0656 0.0937 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 1.14e-01 -0.16 0.101 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0525 0.105 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0284 0.103 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0266 0.105 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0571 0.0958 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 4.24e-01 0.0728 0.0909 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 8.00e-01 0.0267 0.105 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 1.87e-01 -0.115 0.0866 0.234 MAIT L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00765 0.096 0.234 MAIT L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0736 0.0998 0.234 MAIT L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 4.63e-01 0.0721 0.098 0.234 MAIT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 9.87e-01 0.00157 0.0982 0.234 MAIT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 1.94e-02 -0.223 0.0946 0.234 MAIT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 9.41e-02 -0.153 0.0907 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0378 0.0964 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 6.85e-01 0.0428 0.105 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 1.81e-01 -0.145 0.108 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 1.66e-01 0.142 0.102 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 1.84e-01 -0.139 0.105 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000274021 AC024909.1 306755 sc-eQTL 3.06e-01 0.0977 0.0951 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00971 0.0807 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 9.59e-02 -0.124 0.074 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 9.12e-01 0.0103 0.0932 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0655 0.0923 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0678 0.108 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 2.23e-02 -0.233 0.101 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000274021 AC024909.1 306755 sc-eQTL 2.77e-01 0.0987 0.0906 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 8.33e-01 -0.021 0.0997 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0694 0.103 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0793 0.116 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 9.08e-01 0.0118 0.103 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0202 0.1 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 1.34e-01 -0.17 0.113 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000274021 AC024909.1 306755 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0252 0.0882 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 6.92e-02 -0.155 0.0848 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0467 0.0822 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0519 0.0986 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 6.62e-02 0.183 0.0994 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 8.93e-01 0.0132 0.0983 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 1.65e-02 -0.245 0.101 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000274021 AC024909.1 306755 sc-eQTL 6.60e-01 0.0417 0.0948 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 6.58e-01 -0.042 0.0946 0.233 PB L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0958 0.116 0.233 PB L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 8.73e-01 0.0209 0.13 0.233 PB L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 7.20e-01 0.0466 0.13 0.233 PB L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -54278 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0682 0.117 0.233 PB L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0497 0.113 0.233 PB L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 9.28e-01 0.0106 0.116 0.233 PB L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0514 0.0994 0.237 Pro_T L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 9.01e-01 0.0121 0.097 0.237 Pro_T L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 2.86e-01 0.113 0.105 0.237 Pro_T L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 6.52e-02 -0.184 0.0992 0.237 Pro_T L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 2.39e-01 -0.104 0.0879 0.237 Pro_T L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0869 0.106 0.237 Pro_T L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0498 0.0865 0.233 Treg L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0952 0.0957 0.233 Treg L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 9.76e-02 -0.18 0.108 0.233 Treg L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 3.42e-01 0.0959 0.101 0.233 Treg L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00316 0.0954 0.233 Treg L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 4.57e-01 0.069 0.0926 0.233 Treg L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 1.30e-01 -0.118 0.0773 0.222 cDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0118 0.0762 0.222 cDC L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0501 0.115 0.222 cDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0823 0.106 0.222 cDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0178 0.0881 0.222 cDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 1.61e-01 -0.121 0.0857 0.222 cDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 306755 sc-eQTL 1.32e-02 -0.231 0.0924 0.222 cDC L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 5.48e-01 0.028 0.0466 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0239 0.0716 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 4.60e-01 0.0708 0.0955 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 3.91e-01 0.075 0.0873 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 1.34e-01 -0.126 0.0839 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000274021 AC024909.1 306755 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0576 0.0743 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 3.80e-01 0.0474 0.0539 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0637 0.0797 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0475 0.104 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 2.93e-01 0.101 0.0955 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 4.88e-01 0.0478 0.0687 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000274021 AC024909.1 306755 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0538 0.0779 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0769 0.119 0.23 gdT L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 4.90e-02 -0.235 0.118 0.23 gdT L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 6.00e-01 -0.068 0.129 0.23 gdT L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0297 0.124 0.23 gdT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 2.00e-01 0.146 0.114 0.23 gdT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 8.55e-03 -0.344 0.129 0.23 gdT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 4.53e-01 0.0485 0.0645 0.227 intMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 2.83e-01 0.0795 0.0738 0.227 intMono L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 4.32e-01 0.0871 0.111 0.227 intMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0671 0.101 0.227 intMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0129 0.0918 0.227 intMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 306755 sc-eQTL 3.05e-01 0.0941 0.0915 0.227 intMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0214 0.0592 0.224 ncMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0989 0.0837 0.224 ncMono L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 9.29e-01 0.00938 0.105 0.224 ncMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 6.86e-01 0.0446 0.11 0.224 ncMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00704 0.0875 0.224 ncMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 306755 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0809 0.0954 0.224 ncMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 1.64e-01 0.13 0.0929 0.198 pDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 1.93e-01 -0.125 0.0956 0.198 pDC L2
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 4.91e-01 0.0923 0.134 0.198 pDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0112 0.119 0.198 pDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0933 0.107 0.198 pDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0703 0.0772 0.198 pDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 306755 sc-eQTL 1.30e-01 -0.144 0.0946 0.198 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0264 0.0685 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0384 0.0971 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00862 0.0942 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0233 0.0931 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -54278 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00986 0.0943 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 2.63e-01 0.119 0.106 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0215 0.0734 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 1.65e-01 0.0837 0.0601 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0145 0.0751 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0613 0.0785 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00866 0.0834 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -54278 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0631 0.0905 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0864 0.0954 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0492 0.0724 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 3.98e-01 0.0367 0.0433 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 8.50e-01 0.0134 0.0707 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 8.72e-01 0.0147 0.0913 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 2.15e-01 0.104 0.0836 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0355 0.0676 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 306755 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0268 0.0695 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 9.96e-01 0.000282 0.0536 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0337 0.0681 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00525 0.104 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0292 0.101 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0309 0.0886 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 306755 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0904 0.0862 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0654 0.0699 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 305269 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0891 0.0678 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 131723 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0561 0.0883 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 132974 sc-eQTL 5.97e-01 0.0467 0.0883 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 133176 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0358 0.101 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -51189 sc-eQTL 9.73e-03 -0.248 0.0952 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 306755 sc-eQTL 3.32e-01 0.0831 0.0854 0.233 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000070961 ATP2B1 -51530 eQTL 0.0481 -0.0332 0.0168 0.0 0.0 0.229
ENSG00000139323 POC1B 131723 eQTL 0.00456 0.0516 0.0181 0.0 0.0 0.229


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139323 POC1B 131723 1.59e-06 2.19e-06 2.66e-07 1.22e-06 3.92e-07 6.43e-07 1.24e-06 4.08e-07 1.71e-06 7.14e-07 1.9e-06 9.81e-07 2.64e-06 5.83e-07 4.26e-07 9.95e-07 1.07e-06 1.16e-06 5.95e-07 4.94e-07 6.44e-07 1.88e-06 1.6e-06 7.85e-07 2.63e-06 7.64e-07 1.03e-06 9.82e-07 1.75e-06 1.63e-06 7.6e-07 2.8e-07 3.49e-07 6.15e-07 7.4e-07 6.33e-07 7.36e-07 3.42e-07 5.39e-07 2.08e-07 2.87e-07 2.79e-06 9.42e-08 2.07e-07 2.96e-07 2.16e-07 2.94e-07 3.75e-08 1.93e-07