logo

Genes within 1Mb (chr12:89631693:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0562 0.072 0.1 B L1
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0643 0.0977 0.1 B L1
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0165 0.101 0.1 B L1
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0163 0.105 0.1 B L1
ENSG00000258216 AC009522.1 -80355 sc-eQTL 9.79e-01 0.00299 0.113 0.1 B L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 1.55e-01 0.181 0.127 0.1 B L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0773 0.0952 0.1 B L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 6.23e-01 -0.035 0.0712 0.1 CD4T L1
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 2.84e-01 -0.115 0.107 0.1 CD4T L1
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 7.30e-01 -0.032 0.0927 0.1 CD4T L1
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0669 0.103 0.1 CD4T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 2.37e-01 0.139 0.117 0.1 CD4T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 8.29e-02 -0.188 0.108 0.1 CD4T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 3.25e-01 -0.084 0.0851 0.1 CD8T L1
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 7.84e-01 0.0276 0.1 0.1 CD8T L1
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0875 0.108 0.1 CD8T L1
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 6.25e-01 0.0546 0.112 0.1 CD8T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 7.79e-04 0.418 0.123 0.1 CD8T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 7.20e-02 -0.198 0.11 0.1 CD8T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0388 0.104 0.092 DC L1
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0476 0.0945 0.092 DC L1
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0273 0.15 0.092 DC L1
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 9.72e-01 0.00518 0.146 0.092 DC L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0295 0.134 0.092 DC L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 2.50e-01 -0.115 0.0998 0.092 DC L1
ENSG00000274021 AC024909.1 280678 sc-eQTL 4.06e-01 -0.101 0.122 0.092 DC L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 2.30e-01 0.0635 0.0528 0.1 Mono L1
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0989 0.0896 0.1 Mono L1
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 7.92e-02 -0.21 0.119 0.1 Mono L1
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 4.31e-01 0.0847 0.107 0.1 Mono L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00501 0.0919 0.1 Mono L1
ENSG00000274021 AC024909.1 280678 sc-eQTL 4.97e-02 -0.179 0.0906 0.1 Mono L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 2.56e-02 -0.209 0.0929 0.101 NK L1
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 3.96e-02 -0.182 0.0879 0.101 NK L1
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 1.97e-01 -0.145 0.112 0.101 NK L1
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 3.71e-01 0.105 0.117 0.101 NK L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 5.49e-01 0.079 0.132 0.101 NK L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 4.79e-02 -0.252 0.127 0.101 NK L1
ENSG00000274021 AC024909.1 280678 sc-eQTL 1.17e-01 0.176 0.112 0.101 NK L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 3.31e-01 -0.11 0.113 0.1 Other_T L1
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 2.14e-01 -0.156 0.125 0.1 Other_T L1
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 3.64e-01 -0.102 0.112 0.1 Other_T L1
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 8.50e-01 0.0264 0.14 0.1 Other_T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 6.98e-02 -0.235 0.129 0.1 Other_T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 8.75e-02 -0.215 0.125 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 2.00e-01 -0.172 0.134 0.105 B_Activated L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0739 0.132 0.105 B_Activated L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 3.64e-01 -0.139 0.153 0.105 B_Activated L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 7.80e-01 0.0382 0.136 0.105 B_Activated L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -80355 sc-eQTL 9.03e-01 0.0176 0.144 0.105 B_Activated L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 2.72e-01 0.129 0.117 0.105 B_Activated L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0396 0.159 0.105 B_Activated L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 5.81e-01 0.0659 0.119 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 2.80e-01 -0.137 0.127 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0326 0.135 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 2.88e-01 -0.135 0.126 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -80355 sc-eQTL 2.66e-01 0.134 0.121 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 7.93e-01 0.0371 0.141 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 7.79e-01 0.0307 0.109 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 2.49e-01 -0.114 0.0984 0.101 B_Memory L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 7.30e-01 0.0439 0.127 0.101 B_Memory L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 2.69e-01 0.147 0.132 0.101 B_Memory L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 6.50e-01 0.0635 0.14 0.101 B_Memory L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -80355 sc-eQTL 1.39e-01 0.207 0.14 0.101 B_Memory L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 2.00e-03 0.404 0.129 0.101 B_Memory L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 5.46e-01 0.0705 0.117 0.101 B_Memory L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0122 0.0876 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 6.38e-01 -0.05 0.106 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 5.50e-01 0.0679 0.113 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 9.05e-01 0.0137 0.114 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -80355 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0233 0.12 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0287 0.126 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0958 0.102 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0586 0.1 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0138 0.125 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0472 0.128 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 4.75e-01 -0.094 0.131 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -80355 sc-eQTL 4.27e-01 -0.107 0.135 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 1.80e-01 0.178 0.132 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0496 0.126 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 7.25e-01 0.0461 0.131 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0146 0.128 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 9.86e-01 0.00241 0.14 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0315 0.124 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 4.28e-01 -0.101 0.126 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0714 0.144 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 8.39e-01 0.0159 0.0779 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 7.41e-01 0.0395 0.119 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0878 0.108 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 6.37e-01 0.0547 0.116 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 1.31e-01 0.181 0.12 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 2.36e-01 -0.122 0.103 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0535 0.0845 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0587 0.113 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 5.69e-01 0.0714 0.125 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 2.10e-01 -0.149 0.119 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 8.16e-01 0.0324 0.139 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 1.64e-01 -0.167 0.12 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0391 0.106 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 5.45e-02 -0.235 0.122 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0462 0.143 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 2.25e-01 -0.151 0.124 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0549 0.136 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 2.93e-02 -0.283 0.129 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 7.94e-03 -0.279 0.104 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 2.61e-01 0.144 0.128 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 2.58e-01 0.145 0.128 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 7.96e-01 0.0334 0.129 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 2.92e-01 0.137 0.129 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 4.05e-03 -0.366 0.126 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0528 0.109 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0265 0.117 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 1.28e-01 -0.196 0.128 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 3.61e-01 0.118 0.129 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 1.61e-03 0.411 0.129 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 1.29e-01 -0.167 0.109 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 7.03e-01 0.0447 0.117 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 5.62e-03 -0.373 0.133 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0898 0.143 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 7.00e-01 0.0487 0.126 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 1.29e-01 0.189 0.124 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 2.88e-01 -0.143 0.135 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 1.85e-01 -0.184 0.138 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 2.03e-01 -0.173 0.135 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 9.05e-01 0.0165 0.139 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 5.03e-01 0.0846 0.126 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 6.04e-01 0.0622 0.12 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 8.97e-01 0.0179 0.139 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0607 0.115 0.1 MAIT L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 8.70e-01 0.0208 0.127 0.1 MAIT L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0769 0.132 0.1 MAIT L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 3.25e-01 0.128 0.13 0.1 MAIT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0819 0.13 0.1 MAIT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 3.45e-01 -0.12 0.127 0.1 MAIT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 8.66e-02 -0.207 0.12 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0626 0.128 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 2.27e-01 0.168 0.139 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 7.33e-01 -0.049 0.144 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 5.25e-01 0.0862 0.136 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 3.85e-02 -0.287 0.138 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000274021 AC024909.1 280678 sc-eQTL 8.05e-02 0.22 0.125 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0607 0.106 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 6.99e-02 -0.178 0.0975 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 1.72e-01 -0.168 0.122 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0674 0.122 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 7.79e-01 0.04 0.142 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 1.77e-01 -0.182 0.134 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000274021 AC024909.1 280678 sc-eQTL 2.99e-01 0.125 0.119 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0113 0.137 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0621 0.141 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 4.09e-01 -0.132 0.159 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 7.28e-01 -0.049 0.141 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 4.67e-01 -0.1 0.137 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 4.01e-01 -0.131 0.156 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000274021 AC024909.1 280678 sc-eQTL 8.23e-02 0.21 0.12 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 3.77e-02 -0.231 0.111 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 1.12e-01 -0.171 0.107 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 2.47e-01 -0.149 0.128 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 1.28e-01 0.199 0.13 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 3.81e-01 0.112 0.128 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 4.38e-02 -0.269 0.133 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000274021 AC024909.1 280678 sc-eQTL 6.54e-01 0.0555 0.124 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0423 0.129 0.1 PB L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 5.14e-01 -0.103 0.158 0.1 PB L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0351 0.177 0.1 PB L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 4.11e-01 0.146 0.176 0.1 PB L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -80355 sc-eQTL 2.59e-01 -0.18 0.159 0.1 PB L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 7.28e-01 0.0537 0.154 0.1 PB L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 3.59e-01 -0.145 0.158 0.1 PB L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 3.46e-02 -0.274 0.129 0.102 Pro_T L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0188 0.127 0.102 Pro_T L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 6.87e-01 0.0557 0.138 0.102 Pro_T L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 6.92e-01 0.0519 0.131 0.102 Pro_T L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 3.16e-01 -0.116 0.115 0.102 Pro_T L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 4.22e-01 -0.111 0.138 0.102 Pro_T L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0221 0.116 0.1 Treg L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 9.31e-03 -0.331 0.126 0.1 Treg L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 9.81e-02 -0.24 0.144 0.1 Treg L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 7.73e-01 -0.039 0.135 0.1 Treg L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00417 0.128 0.1 Treg L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 9.32e-01 0.0107 0.124 0.1 Treg L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0721 0.107 0.085 cDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0957 0.105 0.085 cDC L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 2.19e-01 -0.196 0.159 0.085 cDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 8.55e-01 0.027 0.147 0.085 cDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0615 0.122 0.085 cDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0684 0.119 0.085 cDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 280678 sc-eQTL 8.48e-02 -0.223 0.129 0.085 cDC L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 2.38e-01 0.0732 0.0618 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0547 0.0951 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0895 0.127 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00908 0.116 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0205 0.112 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000274021 AC024909.1 280678 sc-eQTL 1.59e-01 -0.139 0.0984 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 2.69e-01 0.0796 0.0717 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 1.29e-01 -0.161 0.106 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 4.36e-01 -0.108 0.138 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 3.26e-01 0.125 0.127 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 3.47e-01 0.0863 0.0915 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000274021 AC024909.1 280678 sc-eQTL 2.19e-01 -0.128 0.104 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0868 0.155 0.103 gdT L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 9.99e-02 -0.255 0.154 0.103 gdT L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 1.63e-01 -0.234 0.167 0.103 gdT L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0484 0.161 0.103 gdT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 3.98e-01 0.125 0.148 0.103 gdT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 3.57e-02 -0.357 0.169 0.103 gdT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 2.61e-02 0.19 0.0846 0.093 intMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0614 0.098 0.093 intMono L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 8.66e-01 0.0247 0.147 0.093 intMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 4.01e-01 -0.112 0.133 0.093 intMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0272 0.122 0.093 intMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 280678 sc-eQTL 8.61e-01 0.0213 0.122 0.093 intMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0464 0.0804 0.093 ncMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 8.24e-03 -0.299 0.112 0.093 ncMono L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0796 0.143 0.093 ncMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 9.47e-01 0.0101 0.15 0.093 ncMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0658 0.119 0.093 ncMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 280678 sc-eQTL 1.62e-01 -0.181 0.129 0.093 ncMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 1.47e-01 0.194 0.133 0.076 pDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00335 0.138 0.076 pDC L2
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 4.91e-01 0.132 0.191 0.076 pDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0779 0.171 0.076 pDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 9.89e-01 0.00203 0.154 0.076 pDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 9.86e-02 -0.182 0.11 0.076 pDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 280678 sc-eQTL 8.71e-01 0.0222 0.136 0.076 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0436 0.0909 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00841 0.129 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 9.12e-01 0.0138 0.125 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0138 0.124 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -80355 sc-eQTL 3.49e-01 0.117 0.125 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 2.37e-02 0.318 0.139 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 6.90e-01 0.0389 0.0974 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0452 0.0808 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0491 0.101 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 7.01e-01 0.0405 0.105 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00251 0.112 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -80355 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0435 0.121 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 3.66e-01 0.116 0.128 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0733 0.0971 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 1.53e-01 0.082 0.0573 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0765 0.0935 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 2.71e-01 -0.133 0.121 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 7.68e-01 0.0328 0.111 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 7.75e-01 0.0256 0.0897 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 280678 sc-eQTL 7.96e-02 -0.161 0.0915 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 3.99e-01 0.0595 0.0704 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 1.73e-02 -0.212 0.0883 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0916 0.137 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0227 0.133 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 3.66e-01 -0.105 0.116 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 280678 sc-eQTL 3.37e-01 -0.109 0.113 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -77607 sc-eQTL 9.00e-02 -0.157 0.092 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 279192 sc-eQTL 8.46e-02 -0.155 0.0894 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 105646 sc-eQTL 8.32e-02 -0.202 0.116 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 106897 sc-eQTL 5.01e-01 0.0787 0.117 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 107099 sc-eQTL 3.40e-01 0.127 0.133 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -77266 sc-eQTL 5.98e-02 -0.24 0.127 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 280678 sc-eQTL 3.06e-01 0.116 0.113 0.101 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000258302 AC025034.1 70564 eQTL 0.0226 -0.0727 0.0318 0.00139 0.0 0.106

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139318 \N 279192 2.67e-07 1.36e-07 5.14e-08 1.82e-07 9.16e-08 9.57e-08 1.49e-07 5.2e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.57e-07 7.75e-08 1.52e-07 6.76e-08 5.55e-08 7.17e-08 4.09e-08 1.21e-07 6.92e-08 4.07e-08 1.19e-07 1.27e-07 1.34e-07 2.95e-08 1.4e-07 1.14e-07 1.06e-07 9.36e-08 1.05e-07 1.07e-07 1.02e-07 3.66e-08 2.91e-08 8.49e-08 8.74e-08 3.6e-08 5.02e-08 9.25e-08 6.56e-08 3.8e-08 4.45e-08 1.33e-07 4.19e-08 1.23e-08 2.64e-08 1.83e-08 1.23e-07 3.86e-09 4.9e-08
ENSG00000139323 \N 105646 1.55e-06 2.63e-06 3.47e-07 1.54e-06 4.59e-07 6.4e-07 1.3e-06 3.86e-07 1.86e-06 9.61e-07 2.48e-06 1.26e-06 3.5e-06 8.78e-07 4.26e-07 1.04e-06 9.43e-07 1.09e-06 8.1e-07 6.26e-07 6.34e-07 1.95e-06 1.61e-06 7.82e-07 2.58e-06 8.55e-07 1.04e-06 8.09e-07 1.64e-06 1.65e-06 1.83e-06 2.56e-07 2.24e-07 5.59e-07 8.29e-07 6.79e-07 7.83e-07 2.88e-07 4.73e-07 2.8e-07 2.38e-07 2.82e-06 3.51e-07 1.06e-07 2.81e-07 3.29e-07 2.29e-07 2.44e-07 2.46e-07
ENSG00000274021 \N 280678 2.67e-07 1.36e-07 4.91e-08 1.82e-07 9.16e-08 9.57e-08 1.49e-07 5.19e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.52e-07 7.88e-08 1.52e-07 6.56e-08 5.55e-08 7.17e-08 4.09e-08 1.21e-07 6.75e-08 4.07e-08 1.13e-07 1.27e-07 1.34e-07 2.95e-08 1.4e-07 1.16e-07 1.06e-07 9.36e-08 1.05e-07 1.07e-07 1.02e-07 3.66e-08 2.91e-08 8.65e-08 8.94e-08 3.6e-08 4.62e-08 9.25e-08 6.78e-08 3.76e-08 4.45e-08 1.33e-07 4.19e-08 1.24e-08 2.82e-08 1.99e-08 1.26e-07 3.89e-09 4.9e-08