logo

Genes within 1Mb (chr12:89593794:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 5.24e-02 -0.138 0.0709 0.12 B L1
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 6.01e-01 0.0508 0.097 0.12 B L1
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 5.24e-01 0.0637 0.0998 0.12 B L1
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0156 0.104 0.12 B L1
ENSG00000258216 AC009522.1 -118254 sc-eQTL 1.50e-01 0.161 0.111 0.12 B L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0232 0.126 0.12 B L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0428 0.0946 0.12 B L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 4.79e-01 -0.051 0.0719 0.12 CD4T L1
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00838 0.108 0.12 CD4T L1
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 5.39e-01 0.0576 0.0936 0.12 CD4T L1
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 8.46e-01 0.0202 0.104 0.12 CD4T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 5.10e-02 -0.231 0.117 0.12 CD4T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0956 0.11 0.12 CD4T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 5.99e-02 -0.164 0.0867 0.12 CD8T L1
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 3.19e-01 -0.103 0.103 0.12 CD8T L1
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0407 0.111 0.12 CD8T L1
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0914 0.114 0.12 CD8T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 5.00e-01 0.0871 0.129 0.12 CD8T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 3.38e-01 -0.109 0.113 0.12 CD8T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 1.81e-01 0.13 0.0971 0.115 DC L1
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 7.68e-01 0.0262 0.0885 0.115 DC L1
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 2.56e-01 -0.16 0.14 0.115 DC L1
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 1.59e-01 -0.193 0.136 0.115 DC L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0722 0.125 0.115 DC L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 2.36e-02 0.211 0.0925 0.115 DC L1
ENSG00000274021 AC024909.1 242779 sc-eQTL 2.96e-01 0.119 0.114 0.115 DC L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 1.34e-01 0.0778 0.0518 0.12 Mono L1
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 6.44e-01 0.0409 0.0883 0.12 Mono L1
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 7.62e-02 0.209 0.117 0.12 Mono L1
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 2.81e-02 -0.231 0.104 0.12 Mono L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 8.37e-01 0.0186 0.0903 0.12 Mono L1
ENSG00000274021 AC024909.1 242779 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0382 0.0898 0.12 Mono L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 2.16e-05 -0.383 0.0882 0.118 NK L1
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 1.29e-01 -0.132 0.0866 0.118 NK L1
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 2.64e-01 0.123 0.11 0.118 NK L1
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0728 0.115 0.118 NK L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 3.44e-01 -0.122 0.129 0.118 NK L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 1.70e-02 -0.297 0.124 0.118 NK L1
ENSG00000274021 AC024909.1 242779 sc-eQTL 5.35e-02 -0.212 0.109 0.118 NK L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 4.85e-02 -0.217 0.109 0.12 Other_T L1
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0063 0.123 0.12 Other_T L1
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 2.30e-02 0.249 0.109 0.12 Other_T L1
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 1.22e-02 0.341 0.135 0.12 Other_T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00891 0.127 0.12 Other_T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0399 0.124 0.12 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 5.58e-01 -0.078 0.133 0.125 B_Activated L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 8.36e-01 0.027 0.13 0.125 B_Activated L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0984 0.151 0.125 B_Activated L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 9.71e-01 0.00484 0.135 0.125 B_Activated L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -118254 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0151 0.143 0.125 B_Activated L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0981 0.116 0.125 B_Activated L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 1.33e-01 -0.235 0.156 0.125 B_Activated L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 3.03e-01 -0.122 0.118 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 4.29e-01 0.0999 0.126 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 6.19e-01 0.0666 0.134 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 3.22e-01 0.125 0.126 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -118254 sc-eQTL 3.72e-01 0.107 0.12 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0386 0.14 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00357 0.109 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 7.04e-01 -0.037 0.0971 0.121 B_Memory L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0576 0.125 0.121 B_Memory L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 1.38e-01 0.193 0.13 0.121 B_Memory L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 4.25e-01 0.11 0.137 0.121 B_Memory L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -118254 sc-eQTL 4.08e-01 0.114 0.138 0.121 B_Memory L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 1.33e-01 -0.195 0.129 0.121 B_Memory L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 4.96e-01 0.0782 0.115 0.121 B_Memory L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0836 0.0858 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 5.43e-01 0.0635 0.104 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 9.66e-01 -0.0047 0.111 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 2.31e-01 -0.134 0.112 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -118254 sc-eQTL 9.79e-01 0.00315 0.118 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 8.77e-01 0.0191 0.123 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00319 0.1 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 9.18e-01 0.0105 0.103 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 8.39e-01 0.0261 0.128 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 8.84e-01 0.0192 0.131 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 8.71e-01 0.0218 0.135 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -118254 sc-eQTL 1.39e-02 0.337 0.136 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 2.49e-01 -0.157 0.136 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0586 0.129 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00415 0.132 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 8.53e-01 0.0241 0.129 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 4.46e-01 0.108 0.141 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 7.95e-01 0.0326 0.125 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 9.70e-01 0.00482 0.128 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 4.61e-01 -0.108 0.146 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0369 0.0783 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 5.84e-01 0.0658 0.12 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 6.10e-01 0.0554 0.109 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 7.42e-01 0.0384 0.116 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 4.82e-02 -0.238 0.12 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 6.11e-01 0.0529 0.104 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 2.58e-01 -0.095 0.0838 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0563 0.112 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 1.43e-01 -0.182 0.124 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 6.24e-01 -0.058 0.118 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 2.99e-01 -0.144 0.138 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 1.92e-01 -0.156 0.119 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 7.53e-01 0.0334 0.106 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 1.04e-01 -0.199 0.122 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 1.29e-01 0.216 0.142 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0389 0.125 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 5.36e-01 0.0844 0.136 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 1.23e-01 -0.201 0.13 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0658 0.106 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0568 0.128 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 5.30e-01 0.0808 0.129 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00999 0.129 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 1.59e-01 0.182 0.129 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 1.03e-01 -0.209 0.128 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 1.18e-01 0.168 0.107 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0451 0.115 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 9.89e-01 0.00171 0.127 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 1.39e-01 -0.188 0.126 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 1.27e-01 0.197 0.129 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 7.95e-01 0.0282 0.108 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 3.11e-01 -0.122 0.12 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0906 0.139 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 4.95e-01 -0.1 0.147 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 8.79e-01 0.0198 0.129 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0133 0.128 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 1.63e-01 0.193 0.138 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 3.20e-01 -0.145 0.145 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0384 0.143 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 3.71e-01 0.13 0.145 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 3.92e-01 0.114 0.132 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 3.03e-01 -0.13 0.126 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 1.16e-01 -0.229 0.145 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 6.44e-02 -0.216 0.116 0.115 MAIT L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 4.76e-01 0.0921 0.129 0.115 MAIT L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 4.28e-03 0.38 0.132 0.115 MAIT L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 7.17e-03 0.352 0.13 0.115 MAIT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 5.60e-01 -0.077 0.132 0.115 MAIT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0963 0.129 0.115 MAIT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 1.47e-01 -0.171 0.117 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 8.30e-02 -0.215 0.124 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 3.75e-01 0.121 0.136 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0173 0.14 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0388 0.132 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0535 0.136 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000274021 AC024909.1 242779 sc-eQTL 2.72e-02 -0.271 0.122 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 1.27e-04 -0.388 0.0993 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0968 0.0948 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00108 0.119 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 2.73e-01 -0.129 0.117 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0507 0.138 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 3.22e-01 -0.129 0.13 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000274021 AC024909.1 242779 sc-eQTL 1.41e-01 -0.17 0.115 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 1.94e-02 -0.295 0.125 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0925 0.131 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 2.37e-01 0.175 0.147 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 4.36e-01 -0.102 0.13 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 4.11e-01 0.105 0.127 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 2.99e-01 -0.15 0.144 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000274021 AC024909.1 242779 sc-eQTL 3.98e-01 -0.095 0.112 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 7.73e-04 -0.363 0.106 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0725 0.105 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 4.11e-01 0.104 0.126 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 3.82e-01 -0.112 0.128 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 9.71e-02 -0.208 0.125 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 6.57e-02 -0.241 0.13 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000274021 AC024909.1 242779 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0766 0.121 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 9.19e-01 0.0137 0.134 0.137 PB L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 8.70e-01 -0.027 0.164 0.137 PB L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 2.49e-01 -0.211 0.182 0.137 PB L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 1.80e-01 -0.246 0.182 0.137 PB L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -118254 sc-eQTL 6.29e-01 0.0804 0.166 0.137 PB L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 1.01e-01 0.261 0.158 0.137 PB L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 4.05e-01 -0.137 0.164 0.137 PB L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00492 0.127 0.117 Pro_T L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 8.79e-02 -0.211 0.123 0.117 Pro_T L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 3.95e-01 0.115 0.135 0.117 Pro_T L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 6.14e-01 0.0646 0.128 0.117 Pro_T L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 1.80e-01 0.151 0.112 0.117 Pro_T L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 4.40e-01 0.105 0.135 0.117 Pro_T L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 9.91e-01 0.00122 0.112 0.12 Treg L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 6.23e-01 0.0613 0.124 0.12 Treg L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 2.40e-01 0.166 0.141 0.12 Treg L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 2.69e-01 0.145 0.131 0.12 Treg L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0506 0.124 0.12 Treg L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0311 0.12 0.12 Treg L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 1.69e-01 0.135 0.0981 0.115 cDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 7.74e-01 0.0278 0.0966 0.115 cDC L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0252 0.146 0.115 cDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 9.93e-02 -0.222 0.134 0.115 cDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0717 0.112 0.115 cDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 7.25e-02 0.196 0.108 0.115 cDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 242779 sc-eQTL 1.90e-01 0.156 0.119 0.115 cDC L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 1.29e-01 0.0919 0.0603 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 5.40e-01 0.057 0.093 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 3.26e-01 0.122 0.124 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 2.34e-01 -0.135 0.113 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 8.97e-01 0.0143 0.11 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000274021 AC024909.1 242779 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0533 0.0967 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 1.93e-01 0.0905 0.0693 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 3.47e-01 0.0967 0.103 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 8.25e-01 0.0296 0.134 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 5.67e-02 -0.235 0.122 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 5.33e-01 0.0553 0.0886 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000274021 AC024909.1 242779 sc-eQTL 8.59e-02 -0.172 0.0998 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 5.12e-02 -0.318 0.162 0.088 gdT L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 2.07e-01 0.208 0.164 0.088 gdT L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 5.53e-01 0.106 0.178 0.088 gdT L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 1.51e-01 0.245 0.169 0.088 gdT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 2.71e-01 0.173 0.156 0.088 gdT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 6.50e-01 0.0826 0.181 0.088 gdT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 9.19e-01 0.00847 0.0828 0.12 intMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0509 0.0947 0.12 intMono L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0363 0.142 0.12 intMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0187 0.129 0.12 intMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 9.58e-02 0.195 0.117 0.12 intMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 242779 sc-eQTL 7.61e-01 0.0358 0.118 0.12 intMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0238 0.075 0.115 ncMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 3.72e-01 0.0951 0.106 0.115 ncMono L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 9.12e-01 0.0147 0.133 0.115 ncMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 4.49e-01 -0.106 0.14 0.115 ncMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 4.66e-01 0.081 0.111 0.115 ncMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 242779 sc-eQTL 4.81e-01 0.0855 0.121 0.115 ncMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 5.05e-01 0.077 0.115 0.107 pDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 7.73e-01 0.0342 0.119 0.107 pDC L2
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 4.79e-01 -0.117 0.165 0.107 pDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0415 0.147 0.107 pDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 4.38e-01 0.103 0.132 0.107 pDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 2.31e-01 0.114 0.095 0.107 pDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 242779 sc-eQTL 9.42e-01 0.00862 0.118 0.107 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0485 0.0911 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 6.35e-01 0.0613 0.129 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 4.17e-01 0.102 0.125 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 2.78e-01 0.134 0.123 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -118254 sc-eQTL 2.15e-01 0.155 0.125 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0886 0.141 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 4.86e-01 -0.068 0.0975 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0769 0.0791 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 5.56e-01 0.0582 0.0986 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 7.59e-01 0.0318 0.103 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 1.79e-01 -0.147 0.109 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -118254 sc-eQTL 4.37e-01 0.0926 0.119 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0542 0.125 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 8.53e-01 0.0176 0.0952 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 1.23e-01 0.0869 0.056 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 4.72e-01 0.066 0.0916 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 2.48e-01 0.137 0.118 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 5.68e-02 -0.207 0.108 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 9.63e-01 0.00408 0.0878 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 242779 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0991 0.09 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 8.15e-01 0.0161 0.0687 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 9.79e-01 0.00235 0.0872 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0234 0.134 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 4.03e-01 -0.108 0.129 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 1.82e-01 0.151 0.113 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 242779 sc-eQTL 1.40e-01 0.163 0.11 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -115506 sc-eQTL 1.29e-06 -0.425 0.0853 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 241293 sc-eQTL 2.41e-01 -0.103 0.0874 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 67747 sc-eQTL 5.16e-01 0.074 0.114 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 68998 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0816 0.114 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 69200 sc-eQTL 2.25e-01 -0.158 0.129 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 sc-eQTL 3.56e-02 -0.26 0.123 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 242779 sc-eQTL 1.39e-01 -0.163 0.11 0.119 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139323 POC1B 67747 eQTL 0.00326 0.0754 0.0256 0.0 0.0 0.101
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 eQTL 0.0381 -0.0631 0.0304 0.0 0.0 0.101

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139323 POC1B 67747 1.98e-05 1.09e-05 2.31e-06 6.53e-06 2.4e-06 6.12e-06 1.19e-05 1.79e-06 1.06e-05 5.52e-06 1.29e-05 5.26e-06 1.71e-05 3.97e-06 2.77e-06 7.94e-06 4.31e-06 9.99e-06 2.99e-06 2.8e-06 6.52e-06 1.1e-05 9.11e-06 3.38e-06 1.65e-05 3.86e-06 6.39e-06 4.8e-06 1.16e-05 9.18e-06 6.53e-06 9.99e-07 1.29e-06 3.29e-06 3.88e-06 2.65e-06 1.72e-06 1.83e-06 1.64e-06 1.01e-06 8.85e-07 1.71e-05 1.84e-06 1.59e-07 7.14e-07 1.57e-06 1.73e-06 7.11e-07 4.49e-07
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -115165 9.7e-06 6.73e-06 1.26e-06 3.98e-06 1.73e-06 3.41e-06 8.88e-06 9.98e-07 5.33e-06 3.42e-06 8.09e-06 3.27e-06 1.01e-05 3.14e-06 9.51e-07 5.73e-06 2.6e-06 4.11e-06 2.15e-06 1.4e-06 4.18e-06 7.72e-06 4.78e-06 1.99e-06 1.01e-05 2.12e-06 3.56e-06 2.27e-06 6.35e-06 6.65e-06 3.36e-06 4.34e-07 7.75e-07 2.78e-06 2.06e-06 1.3e-06 1.12e-06 4.72e-07 8.26e-07 8.18e-07 7.54e-07 1.19e-05 1.26e-06 1.53e-07 4.86e-07 1.13e-06 1.03e-06 2.87e-07 3.43e-07