logo

Genes within 1Mb (chr12:89592746:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 1.01e-01 -0.118 0.0719 0.113 B L1
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 9.22e-01 0.00965 0.0981 0.113 B L1
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 3.92e-01 0.0865 0.101 0.113 B L1
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 8.85e-01 0.0152 0.105 0.113 B L1
ENSG00000258216 AC009522.1 -119302 sc-eQTL 1.41e-01 0.166 0.112 0.113 B L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 9.21e-01 0.0126 0.128 0.113 B L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0449 0.0956 0.113 B L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0394 0.0724 0.113 CD4T L1
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0406 0.109 0.113 CD4T L1
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 6.48e-01 0.0432 0.0943 0.113 CD4T L1
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 8.62e-01 0.0182 0.105 0.113 CD4T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 5.82e-02 -0.226 0.118 0.113 CD4T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0842 0.111 0.113 CD4T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 1.21e-01 -0.137 0.088 0.113 CD8T L1
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 2.24e-01 -0.127 0.104 0.113 CD8T L1
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0641 0.112 0.113 CD8T L1
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 3.59e-01 -0.106 0.116 0.113 CD8T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 7.56e-01 0.0407 0.131 0.113 CD8T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0581 0.115 0.113 CD8T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 2.06e-01 0.124 0.0981 0.11 DC L1
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 7.64e-01 0.0268 0.0894 0.11 DC L1
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 2.12e-01 -0.177 0.142 0.11 DC L1
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 2.75e-01 -0.151 0.138 0.11 DC L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0876 0.126 0.11 DC L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 3.36e-02 0.2 0.0935 0.11 DC L1
ENSG00000274021 AC024909.1 241731 sc-eQTL 3.23e-01 0.114 0.115 0.11 DC L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 1.69e-01 0.0725 0.0525 0.113 Mono L1
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 5.98e-01 0.0472 0.0894 0.113 Mono L1
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 1.38e-01 0.177 0.119 0.113 Mono L1
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 9.69e-02 -0.177 0.106 0.113 Mono L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 8.49e-01 0.0175 0.0915 0.113 Mono L1
ENSG00000274021 AC024909.1 241731 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0179 0.0911 0.113 Mono L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 1.25e-04 -0.35 0.0896 0.114 NK L1
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 9.18e-02 -0.148 0.0871 0.114 NK L1
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 2.77e-01 0.121 0.111 0.114 NK L1
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0843 0.115 0.114 NK L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 3.64e-01 -0.118 0.13 0.114 NK L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 3.72e-02 -0.262 0.125 0.114 NK L1
ENSG00000274021 AC024909.1 241731 sc-eQTL 5.72e-02 -0.21 0.11 0.114 NK L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 1.05e-01 -0.182 0.111 0.113 Other_T L1
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0214 0.125 0.113 Other_T L1
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 2.20e-02 0.256 0.111 0.113 Other_T L1
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 1.60e-02 0.333 0.137 0.113 Other_T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 8.69e-01 0.0213 0.129 0.113 Other_T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0342 0.126 0.113 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0724 0.134 0.117 B_Activated L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 6.47e-01 0.0602 0.131 0.117 B_Activated L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0436 0.153 0.117 B_Activated L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 9.27e-01 0.0124 0.136 0.117 B_Activated L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -119302 sc-eQTL 8.23e-01 0.0322 0.144 0.117 B_Activated L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0817 0.117 0.117 B_Activated L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 1.41e-01 -0.233 0.158 0.117 B_Activated L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0887 0.12 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 6.49e-01 0.0586 0.128 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 4.73e-01 0.0976 0.136 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 4.53e-01 0.0959 0.128 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -119302 sc-eQTL 3.08e-01 0.125 0.122 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 8.39e-01 -0.029 0.142 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 9.64e-01 0.00498 0.11 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00795 0.0988 0.114 B_Memory L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0136 0.127 0.114 B_Memory L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 1.53e-01 0.189 0.132 0.114 B_Memory L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 3.14e-01 0.141 0.139 0.114 B_Memory L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -119302 sc-eQTL 3.09e-01 0.143 0.14 0.114 B_Memory L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 2.35e-01 -0.157 0.132 0.114 B_Memory L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 3.45e-01 0.11 0.117 0.114 B_Memory L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0673 0.0872 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 7.89e-01 0.0283 0.106 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 9.25e-01 0.0106 0.113 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0861 0.114 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -119302 sc-eQTL 9.52e-01 0.00723 0.12 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 7.94e-01 0.0328 0.125 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 9.73e-01 0.00346 0.101 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00122 0.104 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 8.81e-01 0.0195 0.13 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 7.20e-01 0.0477 0.133 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 8.67e-01 0.0228 0.136 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -119302 sc-eQTL 1.57e-02 0.336 0.138 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 3.44e-01 -0.131 0.138 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0642 0.131 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 4.72e-01 0.0964 0.134 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0118 0.131 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 3.12e-01 0.145 0.143 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00572 0.127 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0314 0.13 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 3.36e-01 -0.142 0.147 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0227 0.0791 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 6.30e-01 0.0584 0.121 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 5.53e-01 0.0651 0.11 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 8.19e-01 0.0269 0.118 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 7.03e-02 -0.221 0.121 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 5.65e-01 0.0605 0.105 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0893 0.0847 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0711 0.113 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 7.21e-02 -0.226 0.125 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0168 0.12 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 2.56e-01 -0.159 0.139 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 1.75e-01 -0.164 0.12 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 5.85e-01 0.0587 0.107 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 4.11e-02 -0.253 0.123 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 1.16e-01 0.227 0.144 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0235 0.126 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 5.81e-01 0.0763 0.138 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 1.27e-01 -0.201 0.131 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0375 0.108 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0528 0.13 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 4.39e-01 0.101 0.131 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 9.35e-01 0.0107 0.131 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 4.00e-01 0.111 0.132 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 1.33e-01 -0.196 0.13 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 6.62e-02 0.2 0.108 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0626 0.117 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0403 0.129 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 5.53e-02 -0.246 0.128 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 2.16e-01 0.163 0.131 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 5.68e-01 0.0627 0.11 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 3.57e-01 -0.112 0.122 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 4.19e-01 -0.114 0.141 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0781 0.149 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 7.85e-01 0.0358 0.131 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 9.69e-01 0.00511 0.13 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 6.62e-02 0.257 0.139 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 3.96e-01 -0.127 0.149 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0814 0.146 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 4.45e-01 0.114 0.149 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 1.56e-01 0.192 0.135 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 3.51e-01 -0.12 0.129 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 2.04e-01 -0.189 0.149 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 8.46e-02 -0.204 0.118 0.108 MAIT L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 4.94e-01 0.0896 0.131 0.108 MAIT L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 3.77e-03 0.391 0.133 0.108 MAIT L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 8.66e-03 0.348 0.131 0.108 MAIT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0641 0.134 0.108 MAIT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0795 0.13 0.108 MAIT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 2.59e-01 -0.135 0.119 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 7.92e-02 -0.221 0.125 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 2.99e-01 0.143 0.137 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 9.93e-01 0.0012 0.142 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0591 0.134 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0728 0.137 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000274021 AC024909.1 241731 sc-eQTL 1.66e-02 -0.297 0.123 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 5.91e-04 -0.352 0.101 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 2.41e-01 -0.112 0.0955 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0136 0.12 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 2.51e-01 -0.136 0.118 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0298 0.139 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 3.83e-01 -0.115 0.131 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000274021 AC024909.1 241731 sc-eQTL 1.30e-01 -0.177 0.116 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 2.17e-02 -0.293 0.127 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 4.20e-01 -0.107 0.132 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 2.63e-01 0.167 0.149 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 3.94e-01 -0.113 0.132 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 6.52e-01 0.058 0.129 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 3.77e-01 -0.129 0.146 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000274021 AC024909.1 241731 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0681 0.113 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 9.16e-04 -0.361 0.107 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0888 0.106 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 3.73e-01 0.113 0.127 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 3.08e-01 -0.132 0.129 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 1.35e-01 -0.189 0.126 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 1.69e-01 -0.182 0.132 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000274021 AC024909.1 241731 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0607 0.122 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 8.37e-01 0.0277 0.135 0.13 PB L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0666 0.165 0.13 PB L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 1.92e-01 -0.241 0.183 0.13 PB L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 3.18e-01 -0.185 0.184 0.13 PB L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -119302 sc-eQTL 6.05e-01 0.0866 0.167 0.13 PB L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 8.28e-02 0.278 0.159 0.13 PB L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0878 0.165 0.13 PB L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0237 0.129 0.111 Pro_T L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 1.64e-01 -0.175 0.126 0.111 Pro_T L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 5.12e-01 0.09 0.137 0.111 Pro_T L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0162 0.13 0.111 Pro_T L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 1.15e-01 0.181 0.114 0.111 Pro_T L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 5.92e-01 0.0738 0.138 0.111 Pro_T L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 9.78e-01 0.00321 0.114 0.113 Treg L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 6.01e-01 0.0661 0.126 0.113 Treg L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 2.22e-01 0.175 0.143 0.113 Treg L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 3.07e-01 0.136 0.133 0.113 Treg L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0799 0.125 0.113 Treg L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 8.14e-01 0.0288 0.122 0.113 Treg L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 1.89e-01 0.131 0.0992 0.11 cDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 6.65e-01 0.0423 0.0976 0.11 cDC L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0423 0.148 0.11 cDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 2.32e-01 -0.163 0.136 0.11 cDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 3.46e-01 -0.106 0.113 0.11 cDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 9.92e-02 0.182 0.11 0.11 cDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 241731 sc-eQTL 2.03e-01 0.153 0.12 0.11 cDC L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 1.45e-01 0.0894 0.0611 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 4.79e-01 0.0668 0.0942 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 4.03e-01 0.105 0.126 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 4.50e-01 -0.087 0.115 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 8.06e-01 0.0273 0.111 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000274021 AC024909.1 241731 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0526 0.0979 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 2.06e-01 0.0891 0.0701 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 2.80e-01 0.112 0.104 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 9.65e-01 0.00593 0.136 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 9.31e-02 -0.209 0.124 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 4.71e-01 0.0647 0.0897 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000274021 AC024909.1 241731 sc-eQTL 1.53e-01 -0.145 0.101 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 1.56e-01 -0.237 0.166 0.082 gdT L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 2.03e-01 0.213 0.167 0.082 gdT L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 3.65e-01 0.164 0.181 0.082 gdT L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 1.16e-01 0.273 0.172 0.082 gdT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 2.80e-01 0.173 0.159 0.082 gdT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 6.49e-01 0.0843 0.185 0.082 gdT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 8.89e-01 0.0117 0.0835 0.116 intMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0103 0.0957 0.116 intMono L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 7.54e-01 -0.045 0.143 0.116 intMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0218 0.13 0.116 intMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 1.37e-01 0.176 0.118 0.116 intMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 241731 sc-eQTL 5.99e-01 0.0625 0.119 0.116 intMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0381 0.076 0.111 ncMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 3.87e-01 0.0935 0.108 0.111 ncMono L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0119 0.135 0.111 ncMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0572 0.142 0.111 ncMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 5.20e-01 0.0724 0.112 0.111 ncMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 241731 sc-eQTL 3.76e-01 0.109 0.123 0.111 ncMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 4.17e-01 0.095 0.117 0.102 pDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 8.15e-01 0.0282 0.12 0.102 pDC L2
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 5.01e-01 -0.113 0.167 0.102 pDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0197 0.149 0.102 pDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 3.71e-01 0.12 0.134 0.102 pDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 2.64e-01 0.108 0.0964 0.102 pDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 241731 sc-eQTL 9.35e-01 0.00968 0.119 0.102 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 9.06e-01 -0.011 0.0929 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 7.09e-01 0.0492 0.132 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 3.30e-01 0.124 0.127 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 2.39e-01 0.149 0.126 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -119302 sc-eQTL 1.73e-01 0.174 0.127 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0419 0.144 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 5.01e-01 -0.067 0.0994 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0719 0.0804 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 8.13e-01 0.0238 0.1 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 6.13e-01 0.053 0.105 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 3.43e-01 -0.106 0.111 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -119302 sc-eQTL 4.45e-01 0.0924 0.121 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0263 0.127 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 8.12e-01 0.0231 0.0968 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 1.51e-01 0.082 0.0569 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 4.26e-01 0.074 0.0929 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 3.49e-01 0.112 0.12 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 1.53e-01 -0.158 0.11 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 9.66e-01 0.00381 0.0891 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 241731 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0833 0.0914 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 8.71e-01 0.0113 0.0696 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 8.46e-01 0.0172 0.0884 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0433 0.135 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0899 0.131 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 2.28e-01 0.139 0.115 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 241731 sc-eQTL 1.03e-01 0.182 0.111 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -116554 sc-eQTL 6.49e-06 -0.4 0.0865 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 240245 sc-eQTL 1.74e-01 -0.12 0.0879 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 66699 sc-eQTL 5.55e-01 0.0677 0.114 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 67950 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0971 0.114 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 68152 sc-eQTL 2.77e-01 -0.142 0.131 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 sc-eQTL 8.14e-02 -0.218 0.124 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 241731 sc-eQTL 1.59e-01 -0.156 0.11 0.114 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139323 POC1B 66699 eQTL 0.00377 0.075 0.0258 0.0 0.0 0.0996
ENSG00000246363 LINC02458 283180 eQTL 0.0457 0.0808 0.0404 0.0 0.0 0.0996
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 eQTL 0.0348 -0.0648 0.0307 0.0 0.0 0.0996

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139323 POC1B 66699 1.83e-05 2.05e-05 4.95e-06 9.77e-06 3.44e-06 8.4e-06 2.75e-05 3.39e-06 1.72e-05 8.28e-06 2.22e-05 8.71e-06 2.95e-05 7.44e-06 5.37e-06 1.03e-05 1.03e-05 1.51e-05 5.99e-06 4.38e-06 8.55e-06 1.97e-05 2.31e-05 5.39e-06 3.04e-05 5.31e-06 8.09e-06 7.68e-06 2.28e-05 1.38e-05 1.18e-05 1.23e-06 1.44e-06 4.02e-06 7.28e-06 3.9e-06 1.72e-06 2.7e-06 3.21e-06 2.27e-06 1.36e-06 3.02e-05 2.79e-06 2.36e-07 2.01e-06 2.74e-06 2.57e-06 1.24e-06 1.41e-06
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -116213 8.09e-06 9.27e-06 1.92e-06 4.71e-06 2.22e-06 4.24e-06 1.04e-05 1.46e-06 6.39e-06 4.42e-06 1.04e-05 4.98e-06 1.14e-05 3.89e-06 2.52e-06 5.68e-06 3.97e-06 5.37e-06 2.54e-06 2.53e-06 4.8e-06 8.16e-06 7.67e-06 2.87e-06 1.25e-05 2.37e-06 4.46e-06 2.82e-06 1.02e-05 7.61e-06 4.61e-06 9.59e-07 6.76e-07 2.78e-06 3.01e-06 2.09e-06 1.19e-06 1.87e-06 1.38e-06 1.01e-06 7.81e-07 1.29e-05 1.8e-06 1.65e-07 7.57e-07 1.32e-06 1.02e-06 7.32e-07 4.43e-07