Genes within 1Mb (chr12:89539669:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0408 0.0675 0.13 B L1
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 7.37e-01 0.0308 0.0915 0.13 B L1
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0937 0.0941 0.13 B L1
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 1.16e-01 -0.154 0.0976 0.13 B L1
ENSG00000258216 AC009522.1 -172379 sc-eQTL 6.47e-01 0.0482 0.105 0.13 B L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 4.45e-01 0.0912 0.119 0.13 B L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 3.35e-01 0.0861 0.0891 0.13 B L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 4.51e-02 -0.134 0.0666 0.13 CD4T L1
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 3.54e-03 0.292 0.0991 0.13 CD4T L1
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 3.04e-01 -0.09 0.0874 0.13 CD4T L1
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 5.43e-02 0.186 0.0962 0.13 CD4T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 9.09e-01 0.0127 0.111 0.13 CD4T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 2.37e-01 0.121 0.102 0.13 CD4T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 4.92e-01 0.0546 0.0793 0.13 CD8T L1
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 4.32e-01 0.0736 0.0934 0.13 CD8T L1
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 2.91e-01 -0.106 0.1 0.13 CD8T L1
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 6.54e-01 0.0466 0.104 0.13 CD8T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 8.05e-02 0.204 0.116 0.13 CD8T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 9.85e-01 0.00188 0.103 0.13 CD8T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00989 0.0899 0.128 DC L1
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 6.16e-01 0.041 0.0815 0.128 DC L1
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0232 0.13 0.128 DC L1
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0705 0.126 0.128 DC L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 8.48e-01 0.0222 0.115 0.128 DC L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0739 0.0862 0.128 DC L1
ENSG00000274021 AC024909.1 188654 sc-eQTL 9.67e-01 0.00439 0.105 0.128 DC L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0114 0.0499 0.13 Mono L1
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00134 0.0848 0.13 Mono L1
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 7.90e-02 -0.198 0.112 0.13 Mono L1
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 5.23e-01 0.0648 0.101 0.13 Mono L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 5.85e-01 0.0474 0.0866 0.13 Mono L1
ENSG00000274021 AC024909.1 188654 sc-eQTL 3.23e-01 0.0853 0.0861 0.13 Mono L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0465 0.0863 0.129 NK L1
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 1.13e-02 0.205 0.0803 0.129 NK L1
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 1.42e-01 -0.151 0.103 0.129 NK L1
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0751 0.107 0.129 NK L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 2.02e-02 0.28 0.119 0.129 NK L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 4.16e-01 0.0956 0.117 0.129 NK L1
ENSG00000274021 AC024909.1 188654 sc-eQTL 6.22e-01 0.0509 0.103 0.129 NK L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 7.43e-01 0.035 0.107 0.13 Other_T L1
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 3.75e-01 0.105 0.118 0.13 Other_T L1
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 1.41e-01 -0.157 0.106 0.13 Other_T L1
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 3.86e-01 0.115 0.132 0.13 Other_T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 3.35e-01 0.119 0.123 0.13 Other_T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 3.93e-01 0.102 0.119 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0339 0.131 0.122 B_Activated L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 5.50e-01 0.0767 0.128 0.122 B_Activated L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 2.96e-01 0.157 0.149 0.122 B_Activated L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0682 0.133 0.122 B_Activated L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -172379 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0687 0.141 0.122 B_Activated L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 2.78e-02 0.251 0.113 0.122 B_Activated L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 4.95e-01 0.106 0.155 0.122 B_Activated L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 5.31e-01 0.0708 0.113 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0315 0.12 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0201 0.128 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 8.21e-01 0.0271 0.12 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -172379 sc-eQTL 1.29e-01 0.174 0.114 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 9.95e-01 0.00085 0.133 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 9.74e-02 0.171 0.103 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0837 0.0904 0.131 B_Memory L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000558 0.117 0.131 B_Memory L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 4.06e-01 0.101 0.121 0.131 B_Memory L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 8.25e-01 0.0283 0.128 0.131 B_Memory L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -172379 sc-eQTL 1.61e-01 0.18 0.128 0.131 B_Memory L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 9.52e-01 0.00733 0.121 0.131 B_Memory L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 4.91e-01 0.0738 0.107 0.131 B_Memory L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 8.12e-01 0.0195 0.0816 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 4.44e-01 0.0759 0.0989 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 4.51e-03 -0.297 0.104 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0592 0.106 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -172379 sc-eQTL 3.43e-01 0.106 0.112 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 6.12e-01 0.0595 0.117 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 7.47e-01 0.0306 0.0949 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 9.17e-01 -0.01 0.0965 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 6.78e-01 0.05 0.12 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 9.71e-01 0.00445 0.123 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 1.10e-02 -0.32 0.125 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -172379 sc-eQTL 3.43e-01 -0.123 0.129 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0186 0.128 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 5.21e-01 0.078 0.121 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 6.70e-02 0.224 0.121 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 9.97e-01 0.000384 0.12 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 5.32e-02 -0.252 0.13 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 5.29e-01 0.073 0.116 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 1.70e-01 0.162 0.118 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0148 0.135 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 3.28e-02 -0.155 0.072 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 1.37e-03 0.353 0.109 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0806 0.101 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 2.75e-02 0.237 0.107 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 9.92e-01 0.00111 0.113 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 2.22e-01 0.118 0.0962 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0641 0.079 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 8.80e-02 0.18 0.105 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 4.91e-01 0.0809 0.117 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 3.35e-01 0.107 0.111 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 5.41e-01 0.0798 0.13 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 1.04e-01 0.182 0.112 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 1.13e-01 -0.157 0.0989 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 9.30e-02 0.193 0.114 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0161 0.134 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 6.87e-01 0.0472 0.117 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 1.34e-01 -0.191 0.127 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 8.16e-01 0.0285 0.122 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 7.84e-01 0.027 0.0985 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 3.04e-01 0.122 0.119 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 3.90e-01 -0.103 0.119 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0378 0.12 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 5.54e-01 0.0714 0.12 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0458 0.119 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 7.64e-01 0.0305 0.102 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 7.07e-01 -0.041 0.109 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 3.18e-01 -0.12 0.12 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 7.52e-02 0.212 0.119 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 2.47e-01 0.142 0.122 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00529 0.102 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 2.18e-01 -0.135 0.109 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 2.49e-01 0.147 0.127 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 9.34e-01 -0.011 0.134 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 2.48e-01 -0.136 0.118 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 5.89e-01 0.0632 0.117 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 4.09e-01 -0.104 0.126 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0655 0.132 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 8.93e-01 0.0174 0.129 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0847 0.132 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 9.30e-01 0.0105 0.12 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 4.20e-01 0.0918 0.114 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0461 0.132 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 2.82e-01 0.116 0.107 0.132 MAIT L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 2.02e-01 0.151 0.118 0.132 MAIT L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00247 0.124 0.132 MAIT L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 7.03e-01 0.0463 0.121 0.132 MAIT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0681 0.121 0.132 MAIT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 7.40e-01 0.0394 0.119 0.132 MAIT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 7.34e-01 0.0383 0.113 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 7.34e-01 0.0403 0.119 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0664 0.13 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 4.40e-01 0.103 0.133 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0309 0.126 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0693 0.129 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000274021 AC024909.1 188654 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00757 0.118 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0233 0.0976 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 2.70e-01 0.0994 0.0899 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 3.15e-02 -0.242 0.112 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 2.57e-01 -0.127 0.111 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 2.58e-02 0.29 0.129 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 8.04e-01 0.0307 0.124 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000274021 AC024909.1 188654 sc-eQTL 8.50e-01 0.0208 0.11 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 7.63e-01 0.0365 0.121 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 1.57e-02 0.299 0.123 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 9.97e-02 -0.231 0.14 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 8.21e-01 0.0281 0.124 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 2.50e-01 0.139 0.121 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 2.17e-01 0.17 0.137 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000274021 AC024909.1 188654 sc-eQTL 3.25e-02 0.228 0.106 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0713 0.106 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 4.43e-03 0.287 0.0996 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0179 0.122 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0385 0.124 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 4.99e-01 0.0821 0.121 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 4.43e-01 0.0973 0.127 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000274021 AC024909.1 188654 sc-eQTL 4.86e-01 0.0817 0.117 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 6.89e-01 0.0481 0.12 0.122 PB L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 4.86e-02 -0.288 0.145 0.122 PB L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 1.11e-01 0.261 0.163 0.122 PB L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 4.91e-01 0.114 0.164 0.122 PB L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -172379 sc-eQTL 4.43e-01 -0.114 0.149 0.122 PB L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 7.77e-02 -0.252 0.141 0.122 PB L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 3.18e-01 -0.147 0.147 0.122 PB L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0552 0.124 0.128 Pro_T L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 5.00e-01 0.0816 0.121 0.128 Pro_T L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0147 0.132 0.128 Pro_T L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 1.28e-02 0.309 0.123 0.128 Pro_T L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 3.06e-01 0.113 0.11 0.128 Pro_T L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 5.32e-01 0.0825 0.132 0.128 Pro_T L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 5.95e-01 -0.056 0.105 0.13 Treg L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 7.18e-01 0.0423 0.117 0.13 Treg L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 3.55e-01 -0.122 0.132 0.13 Treg L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 2.59e-01 -0.139 0.123 0.13 Treg L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0321 0.116 0.13 Treg L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 1.72e-01 0.154 0.112 0.13 Treg L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 7.70e-01 0.0272 0.0929 0.127 cDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0221 0.0911 0.127 cDC L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 8.22e-01 0.031 0.138 0.127 cDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 8.96e-01 0.0168 0.127 0.127 cDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 7.25e-01 -0.037 0.105 0.127 cDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 7.41e-01 -0.034 0.103 0.127 cDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 188654 sc-eQTL 5.21e-01 0.0721 0.112 0.127 cDC L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00237 0.0582 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 7.90e-01 0.0238 0.0893 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 2.75e-01 -0.13 0.119 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 2.46e-01 0.127 0.109 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 8.05e-01 0.026 0.105 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000274021 AC024909.1 188654 sc-eQTL 2.31e-01 0.111 0.0925 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0435 0.0676 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 9.98e-01 0.000199 0.1 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0653 0.13 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0477 0.12 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 2.19e-01 0.106 0.0859 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000274021 AC024909.1 188654 sc-eQTL 2.72e-01 0.107 0.0974 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 4.84e-01 -0.103 0.147 0.133 gdT L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 6.60e-01 0.0652 0.148 0.133 gdT L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 1.81e-02 -0.375 0.157 0.133 gdT L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 8.62e-01 0.0267 0.153 0.133 gdT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 2.94e-01 0.148 0.14 0.133 gdT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 3.13e-01 -0.164 0.162 0.133 gdT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0214 0.081 0.122 intMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 1.41e-01 -0.136 0.0923 0.122 intMono L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 7.41e-01 0.046 0.139 0.122 intMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 7.73e-01 0.0366 0.126 0.122 intMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0326 0.115 0.122 intMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 188654 sc-eQTL 8.72e-01 0.0185 0.115 0.122 intMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0248 0.0696 0.129 ncMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0772 0.0986 0.129 ncMono L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 5.77e-01 -0.069 0.124 0.129 ncMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0957 0.13 0.129 ncMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 5.91e-02 -0.194 0.102 0.129 ncMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 188654 sc-eQTL 9.88e-01 0.00175 0.112 0.129 ncMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00352 0.106 0.136 pDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0125 0.109 0.136 pDC L2
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0915 0.152 0.136 pDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 9.65e-01 0.00588 0.135 0.136 pDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 1.87e-01 0.161 0.121 0.136 pDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 2.45e-01 -0.102 0.0874 0.136 pDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 188654 sc-eQTL 5.04e-01 0.0723 0.108 0.136 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00735 0.0849 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 7.52e-01 -0.038 0.12 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 8.05e-01 0.0288 0.117 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 8.37e-01 0.0237 0.115 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -172379 sc-eQTL 8.90e-02 0.198 0.116 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 8.72e-01 0.0213 0.132 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 5.56e-02 0.174 0.0902 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 7.87e-01 0.0204 0.0754 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 4.01e-01 0.0789 0.0937 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 5.03e-02 -0.192 0.0973 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 3.27e-02 -0.221 0.103 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -172379 sc-eQTL 8.81e-01 0.0169 0.113 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 6.04e-01 0.062 0.119 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 3.72e-01 0.0808 0.0904 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00145 0.0544 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 9.34e-01 0.00736 0.0886 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 2.46e-01 -0.133 0.114 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 7.05e-01 0.0399 0.105 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 2.66e-01 0.0943 0.0846 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 188654 sc-eQTL 1.35e-01 0.13 0.0867 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0359 0.0649 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0918 0.0822 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 7.95e-01 0.0328 0.126 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 7.45e-01 0.0398 0.122 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 9.77e-02 -0.177 0.107 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 188654 sc-eQTL 6.36e-01 0.0495 0.105 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -169631 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0154 0.085 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 187168 sc-eQTL 2.50e-03 0.248 0.0809 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 13622 sc-eQTL 1.74e-01 -0.146 0.107 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 14873 sc-eQTL 2.56e-01 -0.122 0.107 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 15075 sc-eQTL 4.42e-02 0.246 0.121 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -169290 sc-eQTL 2.30e-01 0.141 0.117 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 188654 sc-eQTL 3.57e-01 0.0957 0.104 0.129 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139323 POC1B 13622 eQTL 8.78e-06 -0.0963 0.0215 0.0 0.0 0.142
ENSG00000246363 LINC02458 230103 eQTL 0.0538 0.0654 0.0339 0.0011 0.0 0.142
ENSG00000258302 AC025034.1 -21460 eQTL 0.011 0.07 0.0275 0.00141 0.0 0.142
ENSG00000270344 POC1B-AS1 14015 eQTL 4.7e-14 0.285 0.0373 0.0 0.0 0.142


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139323 POC1B 13622 3.86e-05 3.18e-05 5.99e-06 1.54e-05 5.71e-06 1.45e-05 4.44e-05 4.5e-06 3.05e-05 1.52e-05 3.66e-05 1.63e-05 4.65e-05 1.33e-05 6.78e-06 1.88e-05 1.7e-05 2.56e-05 7.62e-06 6.6e-06 1.45e-05 3.3e-05 3.15e-05 8.8e-06 4.38e-05 7.81e-06 1.38e-05 1.26e-05 3.11e-05 2.47e-05 1.9e-05 1.61e-06 2.48e-06 6.95e-06 1.14e-05 5.47e-06 2.93e-06 3.16e-06 4.54e-06 3.24e-06 1.74e-06 3.78e-05 3.64e-06 3.59e-07 2.48e-06 3.65e-06 4.09e-06 1.48e-06 1.53e-06
ENSG00000270344 POC1B-AS1 14015 3.86e-05 3.18e-05 6e-06 1.54e-05 5.65e-06 1.44e-05 4.4e-05 4.44e-06 3.01e-05 1.52e-05 3.66e-05 1.63e-05 4.65e-05 1.33e-05 6.69e-06 1.86e-05 1.7e-05 2.56e-05 7.56e-06 6.57e-06 1.43e-05 3.27e-05 3.15e-05 8.69e-06 4.38e-05 7.81e-06 1.35e-05 1.24e-05 3.09e-05 2.47e-05 1.87e-05 1.61e-06 2.45e-06 6.84e-06 1.12e-05 5.47e-06 2.85e-06 3.13e-06 4.54e-06 3.22e-06 1.72e-06 3.71e-05 3.58e-06 3.6e-07 2.49e-06 3.59e-06 4.04e-06 1.45e-06 1.56e-06