Genes within 1Mb (chr12:89526956:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 4.64e-01 0.0602 0.082 0.09 B L1
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 6.42e-01 0.0518 0.111 0.09 B L1
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 2.47e-02 -0.256 0.113 0.09 B L1
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 3.99e-01 -0.101 0.119 0.09 B L1
ENSG00000258216 AC009522.1 -185092 sc-eQTL 6.62e-01 0.0561 0.128 0.09 B L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 5.16e-02 0.281 0.144 0.09 B L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 8.02e-02 0.189 0.108 0.09 B L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0945 0.0815 0.09 CD4T L1
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 2.80e-03 0.364 0.12 0.09 CD4T L1
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0667 0.106 0.09 CD4T L1
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 4.19e-03 0.335 0.116 0.09 CD4T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 6.08e-03 0.367 0.132 0.09 CD4T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 4.53e-01 0.0938 0.125 0.09 CD4T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 1.33e-01 0.145 0.0966 0.09 CD8T L1
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 3.68e-01 0.103 0.114 0.09 CD8T L1
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 6.56e-02 -0.226 0.122 0.09 CD8T L1
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 5.13e-01 0.0833 0.127 0.09 CD8T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 4.19e-02 0.291 0.142 0.09 CD8T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 8.33e-01 0.0265 0.126 0.09 CD8T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 8.34e-01 0.0229 0.109 0.088 DC L1
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0162 0.0988 0.088 DC L1
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0656 0.157 0.088 DC L1
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0264 0.153 0.088 DC L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 7.73e-01 0.0403 0.14 0.088 DC L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0735 0.105 0.088 DC L1
ENSG00000274021 AC024909.1 175941 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00641 0.127 0.088 DC L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0442 0.0597 0.09 Mono L1
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 6.07e-01 0.0523 0.101 0.09 Mono L1
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 4.31e-01 -0.107 0.135 0.09 Mono L1
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0234 0.121 0.09 Mono L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00675 0.104 0.09 Mono L1
ENSG00000274021 AC024909.1 175941 sc-eQTL 3.49e-01 0.0967 0.103 0.09 Mono L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 4.16e-01 0.0851 0.104 0.088 NK L1
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 2.19e-02 0.226 0.0976 0.088 NK L1
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 1.20e-01 -0.194 0.124 0.088 NK L1
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 6.76e-01 0.0544 0.13 0.088 NK L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 3.98e-02 0.3 0.145 0.088 NK L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 5.48e-01 0.0856 0.142 0.088 NK L1
ENSG00000274021 AC024909.1 175941 sc-eQTL 5.94e-01 0.0668 0.125 0.088 NK L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 5.82e-01 0.0694 0.126 0.09 Other_T L1
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 8.71e-01 0.0227 0.14 0.09 Other_T L1
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 5.27e-02 -0.243 0.125 0.09 Other_T L1
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 1.53e-01 0.223 0.156 0.09 Other_T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 8.01e-02 0.253 0.144 0.09 Other_T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 6.16e-01 0.0709 0.141 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00718 0.148 0.094 B_Activated L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 6.19e-01 0.0723 0.145 0.094 B_Activated L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 3.09e-01 0.172 0.169 0.094 B_Activated L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00501 0.15 0.094 B_Activated L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -185092 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0234 0.159 0.094 B_Activated L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 1.70e-02 0.307 0.127 0.094 B_Activated L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 7.92e-01 0.0463 0.175 0.094 B_Activated L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 8.00e-02 0.232 0.132 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0924 0.142 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0261 0.15 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 5.75e-01 0.0792 0.141 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -185092 sc-eQTL 4.51e-01 0.102 0.135 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 4.87e-01 0.109 0.157 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 1.29e-01 0.185 0.121 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0317 0.108 0.091 B_Memory L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 7.04e-01 0.0531 0.14 0.091 B_Memory L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 9.73e-01 0.00486 0.146 0.091 B_Memory L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 4.65e-01 0.112 0.153 0.091 B_Memory L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -185092 sc-eQTL 4.76e-01 0.11 0.154 0.091 B_Memory L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 5.07e-01 0.0964 0.145 0.091 B_Memory L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 6.32e-01 0.0615 0.128 0.091 B_Memory L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 3.15e-01 0.0992 0.0986 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 5.08e-01 0.0794 0.12 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 3.20e-04 -0.454 0.124 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0514 0.129 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -185092 sc-eQTL 3.93e-01 0.116 0.135 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 4.99e-01 0.0961 0.142 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 7.94e-01 0.0301 0.115 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 9.14e-01 0.0123 0.114 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 4.29e-01 0.113 0.142 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0809 0.146 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 1.36e-02 -0.367 0.147 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -185092 sc-eQTL 3.30e-01 -0.149 0.153 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 5.78e-01 0.0842 0.151 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 1.01e-01 0.235 0.142 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 8.35e-02 0.249 0.143 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0246 0.141 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 1.50e-01 -0.222 0.153 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 5.19e-01 0.0882 0.137 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 1.42e-01 0.205 0.139 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0748 0.159 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0638 0.0883 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 8.44e-04 0.447 0.132 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0705 0.122 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 2.80e-03 0.389 0.129 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 5.65e-03 0.375 0.134 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 2.18e-01 0.144 0.117 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0477 0.0951 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 2.93e-02 0.276 0.126 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 1.29e-01 0.214 0.14 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 8.75e-02 0.229 0.133 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 3.05e-02 0.338 0.155 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 5.35e-01 0.084 0.135 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 2.25e-01 -0.144 0.118 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 9.37e-01 0.0108 0.137 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 2.92e-01 -0.168 0.159 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 7.14e-01 0.0513 0.14 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0663 0.153 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00958 0.146 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 5.54e-01 0.0703 0.119 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 1.27e-01 0.218 0.143 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 3.36e-01 -0.139 0.144 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 9.69e-01 0.0056 0.145 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 5.58e-01 0.0851 0.145 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 3.75e-01 -0.128 0.144 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 2.01e-01 0.157 0.122 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0693 0.131 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 3.24e-01 -0.143 0.145 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 1.23e-01 0.222 0.144 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 1.77e-01 0.199 0.147 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0409 0.123 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0625 0.128 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 6.53e-01 0.0671 0.149 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0714 0.157 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 1.73e-01 -0.188 0.138 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 4.82e-01 0.0961 0.137 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 5.72e-01 0.0837 0.148 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0232 0.159 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0315 0.155 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 1.50e-01 -0.228 0.158 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 7.66e-01 0.0431 0.144 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0134 0.137 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 6.87e-01 0.064 0.159 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 2.33e-01 0.154 0.129 0.091 MAIT L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 1.25e-01 0.218 0.142 0.091 MAIT L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0976 0.148 0.091 MAIT L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 2.43e-01 0.17 0.145 0.091 MAIT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 5.50e-01 0.0874 0.146 0.091 MAIT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 8.39e-01 0.029 0.142 0.091 MAIT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 1.74e-01 0.182 0.133 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0452 0.141 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 1.09e-01 -0.246 0.153 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 1.10e-01 0.253 0.158 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 9.74e-01 0.00495 0.15 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0386 0.154 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000274021 AC024909.1 175941 sc-eQTL 8.21e-01 0.0317 0.14 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 3.64e-01 0.107 0.117 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 2.73e-01 0.119 0.108 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 2.24e-02 -0.308 0.134 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0935 0.134 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 8.87e-02 0.267 0.156 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0335 0.149 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000274021 AC024909.1 175941 sc-eQTL 5.66e-01 0.0759 0.132 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 6.05e-01 0.0737 0.142 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 3.10e-01 0.15 0.147 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 1.20e-01 -0.258 0.165 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 3.13e-01 0.148 0.146 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 2.45e-01 0.166 0.142 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 1.10e-01 0.259 0.161 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000274021 AC024909.1 175941 sc-eQTL 2.04e-02 0.291 0.124 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 7.94e-01 0.0325 0.124 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 3.76e-03 0.343 0.117 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 8.81e-01 0.0215 0.143 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 7.29e-01 0.0505 0.145 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 5.00e-01 0.0964 0.143 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 4.33e-01 0.117 0.149 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000274021 AC024909.1 175941 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0359 0.138 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 5.91e-01 0.0781 0.145 0.089 PB L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 8.65e-02 -0.304 0.176 0.089 PB L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 5.12e-02 0.386 0.196 0.089 PB L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 3.31e-01 0.194 0.198 0.089 PB L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -185092 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0874 0.18 0.089 PB L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 1.59e-01 -0.244 0.172 0.089 PB L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 4.10e-01 -0.147 0.178 0.089 PB L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0519 0.146 0.091 Pro_T L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00139 0.143 0.091 Pro_T L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0967 0.155 0.091 Pro_T L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 9.48e-03 0.379 0.145 0.091 Pro_T L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 4.07e-01 0.108 0.13 0.091 Pro_T L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 6.31e-01 0.0748 0.155 0.091 Pro_T L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0286 0.128 0.09 Treg L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 8.79e-01 0.0217 0.142 0.09 Treg L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 9.84e-02 -0.265 0.159 0.09 Treg L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0967 0.149 0.09 Treg L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0754 0.141 0.09 Treg L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 2.49e-01 0.158 0.137 0.09 Treg L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 9.83e-01 0.00251 0.115 0.085 cDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 3.58e-01 -0.103 0.112 0.085 cDC L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0675 0.17 0.085 cDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 5.24e-01 0.1 0.157 0.085 cDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0438 0.13 0.085 cDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 9.66e-01 0.00538 0.127 0.085 cDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 175941 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00262 0.139 0.085 cDC L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0487 0.0702 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 4.18e-01 0.0875 0.108 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 8.62e-01 -0.025 0.144 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 8.04e-01 0.0327 0.132 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 8.02e-01 -0.032 0.127 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000274021 AC024909.1 175941 sc-eQTL 5.87e-01 0.061 0.112 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0447 0.0815 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 6.51e-01 0.0545 0.12 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0724 0.157 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0398 0.145 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 2.17e-01 0.128 0.104 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000274021 AC024909.1 175941 sc-eQTL 2.37e-01 0.139 0.117 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 9.50e-01 0.0103 0.163 0.1 gdT L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 5.38e-01 0.101 0.163 0.1 gdT L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 4.69e-02 -0.349 0.174 0.1 gdT L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 6.92e-01 0.0671 0.169 0.1 gdT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 2.51e-01 0.179 0.155 0.1 gdT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 5.28e-01 -0.114 0.18 0.1 gdT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0904 0.0985 0.082 intMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 8.14e-02 -0.196 0.112 0.082 intMono L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0841 0.169 0.082 intMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00674 0.154 0.082 intMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 7.01e-01 -0.054 0.14 0.082 intMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 175941 sc-eQTL 7.75e-01 0.04 0.14 0.082 intMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 4.39e-01 0.0646 0.0833 0.088 ncMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0508 0.118 0.088 ncMono L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0204 0.148 0.088 ncMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 1.91e-01 -0.203 0.155 0.088 ncMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 8.48e-02 -0.212 0.123 0.088 ncMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 175941 sc-eQTL 5.45e-01 0.0815 0.135 0.088 ncMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 8.09e-01 0.032 0.132 0.09 pDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0571 0.136 0.09 pDC L2
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 4.20e-01 -0.152 0.188 0.09 pDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 6.85e-01 0.0685 0.168 0.09 pDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 1.63e-01 0.211 0.151 0.09 pDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 3.57e-01 -0.101 0.109 0.09 pDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 175941 sc-eQTL 7.69e-01 0.0396 0.134 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 3.48e-01 0.0961 0.102 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0869 0.145 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 9.87e-01 0.00234 0.141 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 4.49e-01 0.105 0.139 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -185092 sc-eQTL 2.26e-01 0.17 0.14 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 2.80e-01 0.172 0.158 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 1.59e-01 0.154 0.109 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 2.42e-01 0.106 0.0908 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 6.01e-01 0.0594 0.113 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 5.03e-03 -0.33 0.116 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 5.29e-02 -0.243 0.125 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -185092 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000545 0.137 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 2.37e-01 0.17 0.144 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 2.09e-01 0.137 0.109 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 4.99e-01 -0.044 0.0651 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 5.98e-01 0.0559 0.106 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0418 0.137 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 5.78e-01 -0.07 0.126 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 7.33e-01 0.0347 0.102 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 175941 sc-eQTL 2.91e-01 0.11 0.104 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0708 0.0783 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0887 0.0994 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 7.73e-01 -0.044 0.153 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0493 0.148 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 7.27e-02 -0.232 0.129 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 175941 sc-eQTL 2.97e-01 0.132 0.126 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -182344 sc-eQTL 5.08e-01 0.0677 0.102 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 174455 sc-eQTL 5.21e-03 0.275 0.0975 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 909 sc-eQTL 2.18e-01 -0.159 0.128 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 2160 sc-eQTL 9.64e-01 -0.0059 0.129 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2362 sc-eQTL 4.42e-02 0.295 0.146 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -182003 sc-eQTL 4.77e-01 0.1 0.141 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 175941 sc-eQTL 5.83e-01 0.0685 0.125 0.088 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139323 POC1B 909 eQTL 5.89e-10 -0.151 0.0241 0.0129 0.0118 0.105
ENSG00000246363 LINC02458 217390 eQTL 0.0223 0.0875 0.0382 0.00136 0.0 0.105
ENSG00000258302 AC025034.1 -34173 eQTL 0.00449 0.0884 0.031 0.00258 0.0 0.105
ENSG00000270344 POC1B-AS1 1302 eQTL 4.7e-20 0.389 0.0415 0.0306 0.0318 0.105


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139323 POC1B 909 0.000305 0.00041 7.15e-05 0.000198 0.000171 0.000153 0.000413 0.000138 0.000415 0.000261 0.00047 0.000226 0.000547 0.000201 0.000102 0.000281 0.000192 0.000303 0.000144 0.000144 0.000257 0.000452 0.000344 0.00014 0.000491 0.000194 0.000259 0.00025 0.000363 0.000169 0.000249 5.51e-05 6.92e-05 0.000112 0.000119 8.8e-05 6.57e-05 7.91e-05 0.000104 6.97e-05 3.93e-05 0.000423 5.69e-05 7.77e-06 6.7e-05 0.000114 9e-05 0.000103 6.7e-05
ENSG00000270344 POC1B-AS1 1302 0.000212 0.000317 6.02e-05 0.000136 0.000107 0.000124 0.000338 9.31e-05 0.000339 0.000203 0.000405 0.00019 0.000454 0.000158 8.27e-05 0.000248 0.000161 0.000263 0.000101 8.86e-05 0.000212 0.000373 0.00029 0.0001 0.000405 0.000146 0.000198 0.000179 0.000298 0.000132 0.000211 3.57e-05 4.59e-05 7.76e-05 9.36e-05 6.28e-05 4.79e-05 4.93e-05 6.66e-05 4.44e-05 2.81e-05 0.000314 4.23e-05 6.03e-06 5.25e-05 6.34e-05 6.4e-05 4.55e-05 3.55e-05