logo

Genes within 1Mb (chr12:89520484:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 6.80e-01 0.0329 0.0794 0.098 B L1
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 9.23e-01 0.0104 0.108 0.098 B L1
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 1.69e-02 -0.263 0.109 0.098 B L1
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 3.48e-01 -0.108 0.115 0.098 B L1
ENSG00000258216 AC009522.1 -191564 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0321 0.124 0.098 B L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 3.41e-02 0.296 0.139 0.098 B L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 1.44e-01 0.153 0.105 0.098 B L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 1.97e-01 -0.102 0.0786 0.098 CD4T L1
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 2.45e-03 0.356 0.116 0.098 CD4T L1
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 8.17e-01 0.0237 0.103 0.098 CD4T L1
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 2.01e-03 0.348 0.111 0.098 CD4T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 8.76e-03 0.338 0.128 0.098 CD4T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 3.39e-01 0.115 0.12 0.098 CD4T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 9.26e-02 0.159 0.094 0.098 CD8T L1
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 3.57e-01 0.103 0.111 0.098 CD8T L1
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 3.94e-02 -0.246 0.119 0.098 CD8T L1
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 5.17e-01 0.0804 0.124 0.098 CD8T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 6.16e-02 0.26 0.139 0.098 CD8T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 9.83e-01 0.00266 0.123 0.098 CD8T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 8.06e-01 0.026 0.106 0.097 DC L1
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0348 0.096 0.097 DC L1
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0437 0.153 0.097 DC L1
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 9.76e-01 0.00448 0.148 0.097 DC L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0184 0.136 0.097 DC L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 2.40e-01 -0.119 0.101 0.097 DC L1
ENSG00000274021 AC024909.1 169469 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0213 0.124 0.097 DC L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 2.47e-01 -0.067 0.0577 0.098 Mono L1
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 7.67e-01 0.0292 0.0983 0.098 Mono L1
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 4.13e-01 -0.108 0.131 0.098 Mono L1
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00524 0.118 0.098 Mono L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0618 0.1 0.098 Mono L1
ENSG00000274021 AC024909.1 169469 sc-eQTL 5.24e-01 0.0638 0.1 0.098 Mono L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 6.17e-01 0.0507 0.101 0.097 NK L1
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 1.16e-02 0.24 0.0944 0.097 NK L1
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 2.17e-01 -0.15 0.121 0.097 NK L1
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 9.22e-01 0.0124 0.126 0.097 NK L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 3.22e-02 0.303 0.141 0.097 NK L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 7.16e-01 0.0503 0.138 0.097 NK L1
ENSG00000274021 AC024909.1 169469 sc-eQTL 8.27e-01 0.0265 0.121 0.097 NK L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 3.67e-01 0.111 0.122 0.098 Other_T L1
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 9.60e-01 0.00681 0.136 0.098 Other_T L1
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 9.77e-02 -0.203 0.122 0.098 Other_T L1
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 5.90e-02 0.287 0.151 0.098 Other_T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 6.47e-02 0.26 0.14 0.098 Other_T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 4.84e-01 0.0962 0.137 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00229 0.144 0.099 B_Activated L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 8.02e-01 0.0354 0.141 0.099 B_Activated L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 1.89e-01 0.216 0.164 0.099 B_Activated L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 9.79e-01 0.00379 0.146 0.099 B_Activated L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -191564 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0103 0.154 0.099 B_Activated L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 2.11e-02 0.288 0.124 0.099 B_Activated L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 7.26e-01 0.0597 0.17 0.099 B_Activated L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 1.52e-01 0.184 0.128 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 1.69e-01 -0.189 0.137 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0508 0.145 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 7.71e-01 0.0398 0.137 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -191564 sc-eQTL 6.93e-01 0.0516 0.131 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 1.90e-01 0.199 0.151 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 4.47e-02 0.236 0.117 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0189 0.105 0.099 B_Memory L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 7.96e-01 0.0351 0.136 0.099 B_Memory L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00653 0.141 0.099 B_Memory L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 6.45e-01 0.0687 0.149 0.099 B_Memory L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -191564 sc-eQTL 6.14e-01 0.0756 0.15 0.099 B_Memory L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 8.76e-01 0.0221 0.141 0.099 B_Memory L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 7.35e-01 0.0422 0.125 0.099 B_Memory L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 4.59e-01 0.071 0.0957 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 7.02e-01 0.0445 0.116 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 7.86e-04 -0.411 0.121 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0213 0.125 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -191564 sc-eQTL 7.42e-01 0.0432 0.131 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 4.71e-01 0.0992 0.137 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0112 0.111 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0285 0.111 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 5.61e-01 0.0806 0.138 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 2.56e-01 -0.161 0.141 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 1.23e-02 -0.362 0.143 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -191564 sc-eQTL 2.96e-01 -0.156 0.149 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 4.73e-01 0.106 0.147 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 1.83e-01 0.185 0.139 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 1.15e-01 0.223 0.141 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0188 0.138 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 1.75e-01 -0.205 0.15 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 6.66e-01 0.0578 0.134 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 6.63e-02 0.251 0.136 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0935 0.156 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 2.41e-01 -0.1 0.0853 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 7.06e-04 0.439 0.128 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 7.87e-01 0.0321 0.119 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 2.73e-03 0.377 0.124 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 3.57e-02 0.277 0.131 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 1.50e-01 0.163 0.113 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0679 0.0924 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 6.02e-02 0.232 0.123 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 1.68e-01 0.189 0.136 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 2.42e-02 0.292 0.129 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 7.31e-03 0.406 0.15 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 6.41e-01 0.0613 0.131 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 1.64e-01 -0.16 0.114 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 7.91e-01 0.0353 0.133 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0688 0.155 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00169 0.135 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0379 0.148 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 5.82e-01 -0.078 0.141 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 2.47e-01 0.135 0.116 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 1.42e-01 0.207 0.14 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 1.43e-01 -0.208 0.141 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 7.49e-01 0.0455 0.142 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 5.43e-01 0.087 0.143 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 4.05e-01 -0.118 0.141 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 2.90e-01 0.127 0.12 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 6.35e-01 -0.061 0.128 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 3.68e-01 -0.127 0.141 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 1.29e-01 0.214 0.14 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 2.16e-01 0.178 0.144 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0513 0.12 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0957 0.125 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 5.64e-01 0.0841 0.145 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0267 0.153 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 2.75e-01 -0.147 0.135 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 4.69e-01 0.0968 0.133 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 7.33e-01 0.0493 0.144 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 8.48e-01 0.0295 0.154 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 7.13e-01 0.0556 0.151 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 2.50e-01 -0.177 0.153 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 8.47e-01 -0.027 0.14 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00424 0.133 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 9.91e-01 0.00169 0.154 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 2.01e-01 0.161 0.125 0.1 MAIT L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 1.63e-01 0.193 0.138 0.1 MAIT L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0582 0.144 0.1 MAIT L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 5.46e-02 0.272 0.14 0.1 MAIT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 6.24e-01 0.0695 0.142 0.1 MAIT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 9.11e-01 0.0155 0.139 0.1 MAIT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 2.86e-01 0.139 0.13 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 8.56e-01 0.0249 0.138 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 1.84e-01 -0.199 0.15 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 2.88e-01 0.164 0.154 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0304 0.146 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0922 0.15 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000274021 AC024909.1 169469 sc-eQTL 7.85e-01 0.0372 0.136 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 3.66e-01 0.103 0.113 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 1.85e-01 0.139 0.105 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 4.92e-02 -0.258 0.13 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0904 0.13 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 1.27e-01 0.232 0.151 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0592 0.144 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000274021 AC024909.1 169469 sc-eQTL 7.55e-01 0.0399 0.128 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00769 0.138 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 3.79e-01 0.125 0.142 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 1.80e-01 -0.215 0.16 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 4.05e-01 0.118 0.142 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 2.42e-01 0.162 0.138 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 7.29e-02 0.281 0.156 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000274021 AC024909.1 169469 sc-eQTL 7.87e-03 0.322 0.12 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0147 0.121 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 3.46e-03 0.337 0.114 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 8.46e-01 0.0271 0.139 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00114 0.141 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 2.38e-01 0.164 0.138 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 5.29e-01 0.0913 0.145 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000274021 AC024909.1 169469 sc-eQTL 6.71e-01 -0.057 0.134 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 6.14e-01 0.0717 0.142 0.096 PB L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 7.32e-02 -0.31 0.171 0.096 PB L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 2.12e-02 0.443 0.19 0.096 PB L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 3.58e-01 0.179 0.194 0.096 PB L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -191564 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0804 0.176 0.096 PB L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 1.40e-01 -0.249 0.168 0.096 PB L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 5.34e-01 -0.109 0.174 0.096 PB L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00675 0.142 0.098 Pro_T L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 9.06e-01 0.0164 0.138 0.098 Pro_T L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 9.25e-01 0.0142 0.151 0.098 Pro_T L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 7.82e-03 0.377 0.14 0.098 Pro_T L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 2.68e-01 0.139 0.126 0.098 Pro_T L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 5.81e-01 0.0835 0.151 0.098 Pro_T L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0507 0.124 0.098 Treg L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0225 0.137 0.098 Treg L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 1.70e-01 -0.213 0.155 0.098 Treg L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0574 0.145 0.098 Treg L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0104 0.137 0.098 Treg L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 2.49e-01 0.153 0.132 0.098 Treg L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 9.64e-01 0.005 0.111 0.095 cDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0896 0.108 0.095 cDC L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0323 0.164 0.095 cDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 3.95e-01 0.129 0.152 0.095 cDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0432 0.125 0.095 cDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0916 0.122 0.095 cDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 169469 sc-eQTL 8.41e-01 0.0268 0.134 0.095 cDC L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0778 0.0676 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 7.16e-01 0.0379 0.104 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0602 0.139 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 9.81e-01 0.00304 0.127 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 4.02e-01 -0.103 0.123 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000274021 AC024909.1 169469 sc-eQTL 9.24e-01 0.0103 0.108 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0698 0.0783 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 7.20e-01 0.0416 0.116 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0487 0.151 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 8.76e-01 0.0217 0.139 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 5.23e-01 0.0639 0.0999 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000274021 AC024909.1 169469 sc-eQTL 1.95e-01 0.147 0.113 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 9.62e-01 0.00764 0.161 0.106 gdT L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 5.95e-01 0.0857 0.161 0.106 gdT L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 5.86e-02 -0.328 0.172 0.106 gdT L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 6.83e-01 0.0683 0.167 0.106 gdT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 2.44e-01 0.179 0.153 0.106 gdT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 5.27e-01 -0.112 0.177 0.106 gdT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 2.00e-01 -0.122 0.0946 0.091 intMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 1.14e-01 -0.172 0.108 0.091 intMono L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0188 0.163 0.091 intMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 6.95e-01 0.0582 0.148 0.091 intMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 3.68e-01 -0.121 0.135 0.091 intMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 169469 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0127 0.135 0.091 intMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 6.97e-01 0.0314 0.0807 0.097 ncMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 7.47e-01 -0.037 0.114 0.097 ncMono L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0187 0.143 0.097 ncMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 1.54e-01 -0.214 0.15 0.097 ncMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 4.47e-02 -0.239 0.118 0.097 ncMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 169469 sc-eQTL 6.42e-01 0.0606 0.13 0.097 ncMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00417 0.129 0.102 pDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0667 0.132 0.102 pDC L2
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 5.22e-01 -0.118 0.184 0.102 pDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 7.84e-01 0.045 0.164 0.102 pDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 3.47e-01 0.139 0.147 0.102 pDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 2.09e-01 -0.133 0.106 0.102 pDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 169469 sc-eQTL 6.86e-01 0.0531 0.131 0.102 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 4.31e-01 0.0783 0.0991 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 2.37e-01 -0.166 0.14 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00257 0.136 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 6.20e-01 0.0669 0.135 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -191564 sc-eQTL 4.71e-01 0.0985 0.136 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 1.79e-01 0.207 0.153 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 1.46e-01 0.154 0.106 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 3.78e-01 0.078 0.0882 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 8.57e-01 0.0198 0.11 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 2.59e-03 -0.343 0.113 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 8.66e-02 -0.209 0.121 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -191564 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0646 0.133 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 1.97e-01 0.18 0.139 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 3.82e-01 0.0929 0.106 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0653 0.0627 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 8.11e-01 0.0245 0.102 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0588 0.132 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0466 0.121 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0152 0.098 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 169469 sc-eQTL 3.65e-01 0.0912 0.101 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 2.06e-01 -0.096 0.0756 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0664 0.0963 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0112 0.148 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0268 0.143 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 2.75e-02 -0.275 0.124 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 169469 sc-eQTL 5.26e-01 0.0776 0.122 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -188816 sc-eQTL 7.30e-01 0.0342 0.099 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 167983 sc-eQTL 3.28e-03 0.28 0.0943 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -5563 sc-eQTL 3.36e-01 -0.12 0.125 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -4312 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0378 0.125 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -4110 sc-eQTL 3.00e-02 0.308 0.141 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -188475 sc-eQTL 6.07e-01 0.0704 0.137 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 169469 sc-eQTL 7.57e-01 0.0375 0.121 0.097 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139323 POC1B -5563 eQTL 2.3e-09 -0.142 0.0236 0.0 0.0 0.111
ENSG00000246363 LINC02458 210918 eQTL 0.0172 0.0894 0.0374 0.00156 0.0 0.111
ENSG00000258302 AC025034.1 -40645 eQTL 0.00268 0.0914 0.0304 0.0035 0.00151 0.111
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -5170 eQTL 1.07e-18 0.367 0.0408 0.00705 0.00643 0.111

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139323 POC1B -5563 4.04e-05 3.51e-05 6.45e-06 1.61e-05 6.28e-06 1.52e-05 4.75e-05 4.92e-06 3.43e-05 1.64e-05 4.15e-05 1.87e-05 5.21e-05 1.49e-05 7.4e-06 2.07e-05 1.89e-05 2.74e-05 8.18e-06 7.07e-06 1.69e-05 3.68e-05 3.42e-05 9.54e-06 4.78e-05 8.49e-06 1.51e-05 1.39e-05 3.47e-05 2.64e-05 2.17e-05 1.64e-06 2.61e-06 7.33e-06 1.24e-05 5.99e-06 3.19e-06 3.17e-06 4.95e-06 3.36e-06 1.66e-06 4.09e-05 3.98e-06 3.73e-07 2.7e-06 4.28e-06 4.14e-06 1.66e-06 1.53e-06
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -5170 4.1e-05 3.54e-05 6.44e-06 1.6e-05 6.21e-06 1.54e-05 4.75e-05 4.86e-06 3.43e-05 1.66e-05 4.22e-05 1.87e-05 5.27e-05 1.5e-05 7.4e-06 2.1e-05 1.89e-05 2.76e-05 8.23e-06 7.1e-06 1.71e-05 3.68e-05 3.45e-05 9.6e-06 4.81e-05 8.55e-06 1.53e-05 1.4e-05 3.49e-05 2.64e-05 2.2e-05 1.63e-06 2.68e-06 7.33e-06 1.25e-05 5.98e-06 3.19e-06 3.21e-06 5e-06 3.36e-06 1.67e-06 4.15e-05 3.99e-06 3.73e-07 2.7e-06 4.34e-06 4.23e-06 1.64e-06 1.54e-06