logo

Genes within 1Mb (chr12:89490517:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 4.60e-01 0.0597 0.0806 0.094 B L1
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 6.96e-01 0.0428 0.109 0.094 B L1
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 2.31e-02 -0.255 0.111 0.094 B L1
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0849 0.117 0.094 B L1
ENSG00000258216 AC009522.1 -221531 sc-eQTL 8.06e-01 0.031 0.126 0.094 B L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 2.66e-02 0.314 0.141 0.094 B L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 1.11e-01 0.17 0.106 0.094 B L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0927 0.08 0.094 CD4T L1
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 1.16e-03 0.387 0.118 0.094 CD4T L1
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00699 0.104 0.094 CD4T L1
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 1.09e-03 0.374 0.113 0.094 CD4T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 5.42e-03 0.365 0.13 0.094 CD4T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 3.71e-01 0.11 0.122 0.094 CD4T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 7.61e-02 0.17 0.0953 0.094 CD8T L1
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 3.24e-01 0.112 0.113 0.094 CD8T L1
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 2.25e-02 -0.276 0.12 0.094 CD8T L1
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 3.04e-01 0.129 0.125 0.094 CD8T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 5.05e-02 0.276 0.14 0.094 CD8T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 9.44e-01 0.00872 0.124 0.094 CD8T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 9.40e-01 0.00809 0.107 0.092 DC L1
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 9.02e-01 -0.012 0.0973 0.092 DC L1
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0995 0.155 0.092 DC L1
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 9.37e-01 -0.012 0.15 0.092 DC L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 8.77e-01 0.0213 0.138 0.092 DC L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0989 0.103 0.092 DC L1
ENSG00000274021 AC024909.1 139502 sc-eQTL 8.26e-01 0.0276 0.125 0.092 DC L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0621 0.0587 0.094 Mono L1
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 6.44e-01 0.0463 0.0999 0.094 Mono L1
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0863 0.133 0.094 Mono L1
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0263 0.12 0.094 Mono L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0293 0.102 0.094 Mono L1
ENSG00000274021 AC024909.1 139502 sc-eQTL 4.18e-01 0.0824 0.102 0.094 Mono L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 5.70e-01 0.0584 0.103 0.092 NK L1
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 1.36e-02 0.238 0.0957 0.092 NK L1
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 1.71e-01 -0.168 0.122 0.092 NK L1
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 8.32e-01 0.0272 0.128 0.092 NK L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 3.25e-02 0.307 0.142 0.092 NK L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 6.19e-01 0.0696 0.14 0.092 NK L1
ENSG00000274021 AC024909.1 139502 sc-eQTL 7.38e-01 0.0412 0.123 0.092 NK L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 3.42e-01 0.118 0.124 0.094 Other_T L1
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 9.41e-01 0.0103 0.138 0.094 Other_T L1
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 4.09e-02 -0.253 0.123 0.094 Other_T L1
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 7.03e-02 0.279 0.153 0.094 Other_T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 5.12e-02 0.278 0.142 0.094 Other_T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 4.76e-01 0.0993 0.139 0.094 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00229 0.144 0.099 B_Activated L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 8.02e-01 0.0354 0.141 0.099 B_Activated L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 1.89e-01 0.216 0.164 0.099 B_Activated L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 9.79e-01 0.00379 0.146 0.099 B_Activated L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -221531 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0103 0.154 0.099 B_Activated L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 2.11e-02 0.288 0.124 0.099 B_Activated L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 7.26e-01 0.0597 0.17 0.099 B_Activated L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 1.18e-01 0.204 0.13 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 2.94e-01 -0.146 0.139 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0435 0.147 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 5.84e-01 0.0759 0.139 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -221531 sc-eQTL 4.02e-01 0.111 0.132 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 3.88e-01 0.133 0.154 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 7.41e-02 0.213 0.119 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00832 0.107 0.095 B_Memory L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 8.35e-01 0.0287 0.138 0.095 B_Memory L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 9.80e-01 0.00368 0.143 0.095 B_Memory L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 4.24e-01 0.121 0.151 0.095 B_Memory L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -221531 sc-eQTL 6.30e-01 0.0732 0.152 0.095 B_Memory L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 5.94e-01 0.0763 0.143 0.095 B_Memory L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 6.28e-01 0.0612 0.126 0.095 B_Memory L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 2.47e-01 0.113 0.0969 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 5.65e-01 0.0679 0.118 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 4.52e-04 -0.435 0.122 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0382 0.127 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -221531 sc-eQTL 4.23e-01 0.107 0.133 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 2.99e-01 0.145 0.139 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 9.17e-01 0.0117 0.113 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0106 0.112 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 4.02e-01 0.118 0.14 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 3.80e-01 -0.126 0.143 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 2.60e-02 -0.327 0.146 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -221531 sc-eQTL 2.93e-01 -0.159 0.151 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 5.55e-01 0.088 0.149 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 1.15e-01 0.223 0.141 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 5.57e-02 0.274 0.142 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 8.82e-01 0.0209 0.14 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 1.10e-01 -0.244 0.152 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 6.33e-01 0.065 0.136 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 1.20e-01 0.216 0.138 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0935 0.158 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0708 0.087 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 2.80e-04 0.478 0.129 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 9.46e-01 0.00814 0.121 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 2.16e-03 0.393 0.127 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 9.68e-03 0.346 0.133 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 1.88e-01 0.152 0.115 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0582 0.0936 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 2.89e-02 0.273 0.124 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 1.51e-01 0.199 0.138 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 1.79e-02 0.311 0.13 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 1.56e-02 0.371 0.152 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 5.17e-01 0.0863 0.133 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 2.26e-01 -0.141 0.116 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 7.89e-01 0.0362 0.135 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 4.54e-01 -0.118 0.157 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 8.85e-01 0.0199 0.137 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0153 0.15 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0553 0.144 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 3.01e-01 0.122 0.118 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 1.38e-01 0.212 0.142 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 9.50e-02 -0.239 0.143 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 6.06e-01 0.0742 0.144 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 6.90e-01 0.0578 0.145 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 3.07e-01 -0.146 0.143 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 1.97e-01 0.157 0.121 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0589 0.13 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 3.80e-01 -0.126 0.143 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 7.73e-02 0.252 0.142 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 1.56e-01 0.207 0.145 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0519 0.122 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 5.88e-01 -0.069 0.127 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 6.09e-01 0.0756 0.148 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0774 0.155 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 1.84e-01 -0.182 0.136 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 4.39e-01 0.105 0.135 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 5.65e-01 0.0845 0.147 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 8.74e-01 0.0248 0.157 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 7.41e-01 0.0508 0.153 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 1.43e-01 -0.229 0.156 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 8.85e-01 0.0207 0.142 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00174 0.135 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 6.55e-01 0.07 0.157 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 1.84e-01 0.169 0.127 0.095 MAIT L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 1.29e-01 0.214 0.14 0.095 MAIT L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 4.78e-01 -0.104 0.146 0.095 MAIT L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 8.07e-02 0.251 0.143 0.095 MAIT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 6.35e-01 0.0684 0.144 0.095 MAIT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 9.82e-01 0.00326 0.141 0.095 MAIT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 2.40e-01 0.155 0.132 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0491 0.14 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 2.02e-01 -0.194 0.152 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 1.26e-01 0.24 0.156 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0371 0.148 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0792 0.152 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000274021 AC024909.1 139502 sc-eQTL 8.10e-01 0.0333 0.138 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 3.88e-01 0.0996 0.115 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 1.97e-01 0.137 0.106 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 1.87e-02 -0.312 0.132 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 4.03e-01 -0.11 0.132 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 1.09e-01 0.247 0.154 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0439 0.146 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000274021 AC024909.1 139502 sc-eQTL 5.89e-01 0.0703 0.13 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 9.08e-01 0.0162 0.14 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 5.42e-01 0.0883 0.145 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 1.70e-01 -0.224 0.162 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 4.76e-01 0.103 0.144 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 3.75e-01 0.125 0.14 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 8.19e-02 0.277 0.158 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000274021 AC024909.1 139502 sc-eQTL 6.67e-03 0.333 0.122 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00518 0.122 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 2.07e-03 0.359 0.115 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 7.67e-01 0.0418 0.141 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 8.77e-01 0.0222 0.143 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 2.78e-01 0.153 0.14 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 3.86e-01 0.127 0.147 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000274021 AC024909.1 139502 sc-eQTL 6.48e-01 -0.062 0.136 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 6.14e-01 0.0717 0.142 0.096 PB L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 7.32e-02 -0.31 0.171 0.096 PB L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 2.12e-02 0.443 0.19 0.096 PB L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 3.58e-01 0.179 0.194 0.096 PB L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -221531 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0804 0.176 0.096 PB L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 1.40e-01 -0.249 0.168 0.096 PB L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 5.34e-01 -0.109 0.174 0.096 PB L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 9.11e-01 0.0162 0.144 0.093 Pro_T L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0222 0.14 0.093 Pro_T L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 5.08e-01 -0.101 0.152 0.093 Pro_T L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 3.17e-03 0.423 0.142 0.093 Pro_T L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 2.20e-01 0.157 0.127 0.093 Pro_T L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 3.79e-01 0.135 0.153 0.093 Pro_T L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0596 0.126 0.094 Treg L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 9.09e-01 0.016 0.14 0.094 Treg L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 1.61e-01 -0.222 0.157 0.094 Treg L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 8.23e-01 -0.033 0.147 0.094 Treg L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0269 0.139 0.094 Treg L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 2.98e-01 0.14 0.135 0.094 Treg L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 8.95e-01 -0.015 0.113 0.09 cDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0897 0.11 0.09 cDC L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0921 0.167 0.09 cDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 3.74e-01 0.137 0.154 0.09 cDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0388 0.128 0.09 cDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 6.54e-01 -0.056 0.125 0.09 cDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 139502 sc-eQTL 6.96e-01 0.0534 0.136 0.09 cDC L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0736 0.0689 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 5.29e-01 0.0668 0.106 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0125 0.142 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0108 0.13 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0543 0.125 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000274021 AC024909.1 139502 sc-eQTL 6.75e-01 0.0463 0.11 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0673 0.0798 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 6.51e-01 0.0535 0.118 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0665 0.154 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 9.42e-01 0.0104 0.142 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 3.18e-01 0.102 0.102 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000274021 AC024909.1 139502 sc-eQTL 2.17e-01 0.142 0.115 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 9.50e-01 0.0103 0.163 0.1 gdT L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 5.38e-01 0.101 0.163 0.1 gdT L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 4.69e-02 -0.349 0.174 0.1 gdT L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 6.92e-01 0.0671 0.169 0.1 gdT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 2.51e-01 0.179 0.155 0.1 gdT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 5.28e-01 -0.114 0.18 0.1 gdT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 2.91e-01 -0.102 0.0965 0.087 intMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 1.02e-01 -0.181 0.11 0.087 intMono L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0586 0.166 0.087 intMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 9.34e-01 0.0126 0.151 0.087 intMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 4.72e-01 -0.099 0.137 0.087 intMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 139502 sc-eQTL 8.65e-01 0.0234 0.137 0.087 intMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 6.73e-01 0.0346 0.082 0.093 ncMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0319 0.116 0.093 ncMono L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0246 0.146 0.093 ncMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 2.07e-01 -0.193 0.152 0.093 ncMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 5.19e-02 -0.235 0.12 0.093 ncMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 139502 sc-eQTL 6.95e-01 0.0519 0.132 0.093 ncMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 9.51e-01 0.00795 0.13 0.096 pDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0449 0.133 0.096 pDC L2
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 3.09e-01 -0.189 0.185 0.096 pDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 8.35e-01 0.0346 0.166 0.096 pDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 2.71e-01 0.164 0.148 0.096 pDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 2.19e-01 -0.132 0.107 0.096 pDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 139502 sc-eQTL 4.75e-01 0.0945 0.132 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 3.06e-01 0.103 0.1 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 3.59e-01 -0.131 0.142 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 9.79e-01 0.00356 0.138 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 3.80e-01 0.12 0.136 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -221531 sc-eQTL 3.21e-01 0.137 0.138 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 2.47e-01 0.181 0.155 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 1.49e-01 0.155 0.107 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 2.45e-01 0.104 0.0895 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 6.47e-01 0.0512 0.112 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 3.52e-03 -0.338 0.115 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 8.96e-02 -0.21 0.123 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -221531 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0116 0.135 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 1.38e-01 0.21 0.141 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 2.93e-01 0.113 0.108 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0647 0.0639 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 6.82e-01 0.0427 0.104 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0291 0.135 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0717 0.124 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 8.63e-01 0.0173 0.0998 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 139502 sc-eQTL 3.07e-01 0.105 0.102 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0921 0.0769 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0743 0.0979 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0202 0.15 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0341 0.145 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 3.67e-02 -0.265 0.126 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 139502 sc-eQTL 4.26e-01 0.0991 0.124 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -218783 sc-eQTL 6.87e-01 0.0405 0.1 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 138016 sc-eQTL 2.75e-03 0.289 0.0955 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B -35530 sc-eQTL 2.74e-01 -0.138 0.126 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 -34279 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0387 0.127 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -34077 sc-eQTL 3.04e-02 0.312 0.143 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -218442 sc-eQTL 5.22e-01 0.0888 0.138 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 139502 sc-eQTL 6.51e-01 0.0555 0.123 0.093 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139323 POC1B -35530 eQTL 3.13e-10 -0.152 0.0238 0.0193 0.0197 0.107
ENSG00000246363 LINC02458 180951 eQTL 0.0111 0.0963 0.0379 0.00195 0.0 0.107
ENSG00000258302 AC025034.1 -70612 eQTL 0.00345 0.0901 0.0307 0.00298 0.00122 0.107
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -35137 eQTL 1.6e-19 0.38 0.0411 0.0118 0.0123 0.107

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139323 POC1B -35530 2.43e-05 2.74e-05 3.83e-06 1.33e-05 3.53e-06 1.07e-05 3.16e-05 3.71e-06 2.17e-05 1.02e-05 2.88e-05 1.13e-05 3.88e-05 1e-05 5.35e-06 1.14e-05 1.22e-05 1.77e-05 6.02e-06 5.26e-06 9.54e-06 2.26e-05 2.27e-05 6.12e-06 3.32e-05 5.53e-06 8.52e-06 8.71e-06 2.28e-05 1.89e-05 1.46e-05 1.42e-06 1.89e-06 4.87e-06 9.06e-06 4.22e-06 2.15e-06 2.74e-06 3.35e-06 2.44e-06 1.44e-06 3.1e-05 2.63e-06 2.62e-07 1.84e-06 2.69e-06 3.37e-06 1.16e-06 1.01e-06
ENSG00000270344 POC1B-AS1 -35137 2.47e-05 2.76e-05 3.89e-06 1.33e-05 3.6e-06 1.09e-05 3.18e-05 3.73e-06 2.17e-05 1.03e-05 2.88e-05 1.14e-05 3.88e-05 1.02e-05 5.45e-06 1.14e-05 1.24e-05 1.78e-05 6.06e-06 5.3e-06 9.59e-06 2.28e-05 2.27e-05 6.21e-06 3.32e-05 5.57e-06 8.66e-06 8.79e-06 2.28e-05 1.91e-05 1.47e-05 1.45e-06 1.91e-06 4.84e-06 9.06e-06 4.22e-06 2.18e-06 2.72e-06 3.4e-06 2.49e-06 1.44e-06 3.1e-05 2.67e-06 2.62e-07 1.85e-06 2.69e-06 3.43e-06 1.2e-06 9.89e-07